EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022208 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6379 bases
Position: chrCCOE01000908.1:2439637-2446015
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028836	MMR_HSR1	PF01926.23	3.1e-06	1	1
ENSACIP00000028882	MMR_HSR1	PF01926.23	3.6e-06	1	1

Transcripts

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ENSACIT00000029604	-	405	-	ENSACIP00000028837	134 (aa)	-	-
ENSACIT00000029612	-	276	-	ENSACIP00000028845	91 (aa)	-	-
ENSACIT00000029649	-	630	-	ENSACIP00000028882	209 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSACIG00000022208	-	96	35.468	ENSACIG00000019803	rab25a	93	35.468
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ENSACIG00000022208	-	62	33.077	ENSACIG00000015128	si:ch73-116o1.2	66	34.752
ENSACIG00000022208	-	96	36.500	ENSACIG00000014094	rab6bb	94	36.500
ENSACIG00000022208	-	100	90.338	ENSACIG00000022381	-	100	90.338
ENSACIG00000022208	-	85	51.429	ENSACIG00000006558	-	87	51.429
ENSACIG00000022208	-	99	48.058	ENSACIG00000018043	rab9a	100	48.058
ENSACIG00000022208	-	79	38.415	ENSACIG00000014012	rab22a	82	38.415
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ENSACIG00000022208	-	84	32.778	ENSACIG00000006949	RAB17	77	32.778
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ENSACIG00000022208	-	78	42.331	ENSACIG00000024376	-	72	42.331
ENSACIG00000022208	-	89	39.785	ENSACIG00000024374	rab11ba	74	39.785
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ENSACIG00000022208	-	100	32.420	ENSACIG00000009306	RAB15	100	32.420
ENSACIG00000022208	-	83	37.572	ENSACIG00000000642	rab36	64	37.572
ENSACIG00000022208	-	85	38.068	ENSACIG00000009006	zgc:171927	80	38.068
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ENSACIG00000022208	-	79	38.554	ENSACIG00000023837	-	76	38.554
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ENSACIG00000022208	-	78	41.718	ENSACIG00000003092	rab11a	73	41.718
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ENSACIG00000022208	-	76	34.177	ENSACIG00000020496	rab23	83	34.682
ENSACIG00000022208	-	65	34.286	ENSACIG00000009617	rab18a	63	34.286
ENSACIG00000022208	-	91	30.000	ENSACIG00000018406	rasl11a	72	30.000
ENSACIG00000022208	-	58	31.008	ENSACIG00000009740	arfrp1	60	31.008
ENSACIG00000022208	-	84	33.714	ENSACIG00000010619	rab15	80	33.714
ENSACIG00000022208	-	85	55.932	ENSACIG00000011024	si:dkey-13a21.4	86	55.932
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ENSACIG00000022208	-	82	40.588	ENSACIG00000019251	rab5aa	78	40.588
ENSACIG00000022208	-	73	34.437	ENSACIG00000000100	kras	53	34.731
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ENSACIG00000022208	-	86	37.705	ENSACIG00000022520	rab33a	79	37.705
ENSACIG00000022208	-	91	34.921	ENSACIG00000008102	rab18b	89	34.921
ENSACIG00000022208	-	82	30.994	ENSACIG00000008211	rasd4	80	30.994
ENSACIG00000022208	-	76	40.506	ENSACIG00000003157	-	81	40.506
ENSACIG00000022208	-	95	37.755	ENSACIG00000019049	rab1ab	89	39.286
ENSACIG00000022208	-	81	36.686	ENSACIG00000000154	RAB39B	77	36.686
ENSACIG00000022208	-	59	30.081	ENSACIG00000009595	arl8bb	62	30.081
ENSACIG00000022208	-	71	35.374	ENSACIG00000017824	rras	78	35.849
ENSACIG00000022208	-	78	32.515	ENSACIG00000004859	rab34b	66	32.530
ENSACIG00000022208	-	84	37.634	ENSACIG00000021855	rab33ba	76	37.634
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ENSACIG00000022208	-	94	35.714	ENSACIG00000010914	RAB41	82	35.714
ENSACIG00000022208	-	81	38.462	ENSACIG00000020616	rab12	78	36.735

Orthologs

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ENSACIG00000022208	-	100	85.990	ENSG00000075785	RAB7A	100	94.667	Homo_sapiens
ENSACIG00000022208	-	100	87.440	ENSAPOG00000002585	RAB7A	100	87.440	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022208	-	100	87.440	ENSAPOG00000016091	-	100	87.440	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022208	-	100	85.990	ENSAMEG00000015249	RAB7A	100	85.990	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000022208	-	100	87.440	ENSAOCG00000005772	RAB7A	100	87.440	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022208	-	100	87.440	ENSAOCG00000008820	-	100	87.440	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022208	-	100	87.440	ENSAPEG00000000306	RAB7A	100	87.440	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022208	-	100	87.440	ENSAPEG00000017200	RAB7A	100	87.440	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000022208	-	100	87.440	ENSATEG00000002860	RAB7A	100	87.440	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000022208	-	100	85.990	ENSANAG00000029692	RAB7A	100	85.990	Aotus_nancymaae
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ENSACIG00000022208	-	100	75.238	ENSACLG00000024456	-	100	75.238	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022208	-	100	89.855	ENSACLG00000024502	-	100	89.855	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000022208	-	100	87.440	ENSAMXG00000032027	rab7a	100	87.440	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022208	-	100	84.541	ENSAMXG00000002254	-	100	84.541	Astyanax_mexicanus
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ENSACIG00000022208	-	100	85.990	ENSCAFG00000004157	RAB7A	100	85.990	Canis_familiaris
ENSACIG00000022208	-	100	85.990	ENSCAFG00020004847	RAB7A	100	85.990	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000022208	-	100	85.990	ENSCHIG00000001138	RAB7A	100	85.990	Capra_hircus
ENSACIG00000022208	-	100	85.990	ENSTSYG00000002313	RAB7A	100	85.990	Carlito_syrichta
ENSACIG00000022208	-	100	86.473	ENSCAPG00000010881	RAB7A	100	86.473	Cavia_aperea
ENSACIG00000022208	-	100	86.473	ENSCPOG00000034570	RAB7A	100	86.473	Cavia_porcellus
ENSACIG00000022208	-	100	85.990	ENSCCAG00000036322	RAB7A	100	85.990	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022208	-	100	64.251	ENSCLAG00000006333	RAB7A	100	64.251	Chinchilla_lanigera
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ENSACIG00000022208	-	100	85.990	ENSCPBG00000014343	RAB7A	100	85.990	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000022208	-	100	79.710	ENSCING00000007769	-	100	79.710	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000022208	-	100	78.744	ENSCSAVG00000011162	-	100	78.744	Ciona_savignyi
ENSACIG00000022208	-	100	85.990	ENSCANG00000041683	RAB7A	100	85.990	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000022208	-	100	85.990	ENSCGRG00001021807	Rab7	100	85.990	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000022208	-	100	85.990	ENSCGRG00000011649	Rab7	100	85.990	Cricetulus_griseus_crigri
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ENSACIG00000022208	-	100	87.440	ENSCVAG00000000281	RAB7A	100	87.440	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022208	-	100	87.440	ENSCVAG00000005429	-	100	87.440	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000022208	-	100	84.541	ENSDARG00000087243	zgc:100918	100	84.541	Danio_rerio
ENSACIG00000022208	-	100	85.990	ENSDORG00000027671	-	100	85.990	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000022208	-	100	74.396	FBgn0015795	Rab7	100	74.396	Drosophila_melanogaster
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ENSACIG00000022208	-	100	87.440	ENSGAFG00000021688	-	100	87.440	Gambusia_affinis
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