EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022222 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8190 bases
Position: chrCCOE01001632.1:20877-29066
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028693	MMR_HSR1	PF01926.23	2.2e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029453	-	939	-	ENSACIP00000028693	312 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000022222	-	74	42.017	ENSACIG00000012714	-	79	42.017
ENSACIG00000022222	-	85	51.648	ENSACIG00000016635	-	98	51.648
ENSACIG00000022222	-	74	48.718	ENSACIG00000023381	-	91	48.718
ENSACIG00000022222	-	85	53.704	ENSACIG00000019149	-	91	53.333
ENSACIG00000022222	-	60	35.079	ENSACIG00000014670	-	73	35.079
ENSACIG00000022222	-	71	46.018	ENSACIG00000008001	-	91	47.418
ENSACIG00000022222	-	59	35.938	ENSACIG00000014737	-	88	35.938
ENSACIG00000022222	-	78	52.653	ENSACIG00000006484	-	74	52.653
ENSACIG00000022222	-	61	43.684	ENSACIG00000015088	-	76	43.523
ENSACIG00000022222	-	57	35.519	ENSACIG00000007725	-	66	34.973
ENSACIG00000022222	-	61	33.962	ENSACIG00000009149	-	71	33.962
ENSACIG00000022222	-	69	50.000	ENSACIG00000001455	-	79	50.000
ENSACIG00000022222	-	83	37.417	ENSACIG00000000893	-	84	45.238
ENSACIG00000022222	-	79	54.980	ENSACIG00000007191	-	71	54.980
ENSACIG00000022222	-	66	44.976	ENSACIG00000014646	zgc:113625	80	44.976
ENSACIG00000022222	-	70	50.909	ENSACIG00000002263	-	84	48.319
ENSACIG00000022222	-	74	46.154	ENSACIG00000016888	-	76	46.154
ENSACIG00000022222	-	53	59.880	ENSACIG00000012761	-	73	59.880
ENSACIG00000022222	-	62	33.000	ENSACIG00000009811	-	81	33.000
ENSACIG00000022222	-	72	47.577	ENSACIG00000022366	-	81	47.577
ENSACIG00000022222	-	82	42.529	ENSACIG00000022362	-	83	46.781
ENSACIG00000022222	-	81	76.562	ENSACIG00000016313	-	81	76.562
ENSACIG00000022222	-	72	46.696	ENSACIG00000004245	-	79	46.696
ENSACIG00000022222	-	82	52.290	ENSACIG00000005198	-	53	52.365
ENSACIG00000022222	-	75	43.515	ENSACIG00000007494	-	77	43.933
ENSACIG00000022222	-	52	47.853	ENSACIG00000000631	-	56	47.853
ENSACIG00000022222	-	71	50.000	ENSACIG00000004040	-	87	50.000
ENSACIG00000022222	-	70	45.291	ENSACIG00000014690	-	85	45.291
ENSACIG00000022222	-	66	42.056	ENSACIG00000005573	-	89	42.056
ENSACIG00000022222	-	64	45.098	ENSACIG00000014716	-	81	44.608
ENSACIG00000022222	-	52	44.444	ENSACIG00000000976	-	80	44.444
ENSACIG00000022222	-	55	58.382	ENSACIG00000012204	-	74	58.382
ENSACIG00000022222	-	59	58.065	ENSACIG00000005223	-	71	58.065
ENSACIG00000022222	-	67	44.131	ENSACIG00000014662	-	85	44.340
ENSACIG00000022222	-	61	63.684	ENSACIG00000007178	-	66	63.684
ENSACIG00000022222	-	72	46.930	ENSACIG00000003582	-	74	46.753
ENSACIG00000022222	-	65	78.218	ENSACIG00000012707	-	77	78.218
ENSACIG00000022222	-	63	45.274	ENSACIG00000014745	-	89	45.274
ENSACIG00000022222	-	61	35.079	ENSACIG00000003050	-	84	35.079
ENSACIG00000022222	-	58	32.418	ENSACIG00000007737	-	72	32.984
ENSACIG00000022222	-	58	36.413	ENSACIG00000019509	-	84	36.413
ENSACIG00000022222	-	73	39.912	ENSACIG00000016502	-	97	40.088
ENSACIG00000022222	-	67	39.545	ENSACIG00000012061	-	65	39.545
ENSACIG00000022222	-	64	45.771	ENSACIG00000020225	-	75	44.541
ENSACIG00000022222	-	64	45.545	ENSACIG00000014634	zgc:113625	86	43.439
ENSACIG00000022222	-	87	52.555	ENSACIG00000002950	-	82	53.247
ENSACIG00000022222	-	68	50.935	ENSACIG00000008045	-	89	47.718
ENSACIG00000022222	-	96	48.013	ENSACIG00000022355	-	87	53.360
ENSACIG00000022222	-	63	62.755	ENSACIG00000007158	-	74	54.887
ENSACIG00000022222	-	63	45.274	ENSACIG00000014680	-	86	45.274
ENSACIG00000022222	-	88	50.181	ENSACIG00000005780	-	77	53.150
ENSACIG00000022222	-	67	40.000	ENSACIG00000005587	-	76	40.000
ENSACIG00000022222	-	58	44.565	ENSACIG00000001596	-	72	44.565
ENSACIG00000022222	-	64	44.776	ENSACIG00000019524	-	84	44.776
ENSACIG00000022222	-	66	55.769	ENSACIG00000006478	-	77	55.769
ENSACIG00000022222	-	69	49.309	ENSACIG00000001070	-	77	49.309
ENSACIG00000022222	-	79	55.422	ENSACIG00000012648	-	84	55.422
ENSACIG00000022222	-	67	45.327	ENSACIG00000020244	-	90	45.327
ENSACIG00000022222	-	64	45.588	ENSACIG00000014655	-	75	45.588
ENSACIG00000022222	-	69	45.161	ENSACIG00000006503	-	67	45.161
ENSACIG00000022222	-	86	67.647	ENSACIG00000012718	-	89	77.725
ENSACIG00000022222	-	69	49.074	ENSACIG00000022370	-	81	47.807
ENSACIG00000022222	-	54	55.882	ENSACIG00000022374	-	87	55.882
ENSACIG00000022222	-	69	47.907	ENSACIG00000022377	-	83	46.087
ENSACIG00000022222	-	66	46.860	ENSACIG00000020234	-	72	46.860
ENSACIG00000022222	-	57	45.810	ENSACIG00000008666	-	86	45.810
ENSACIG00000022222	-	72	52.155	ENSACIG00000012159	-	70	48.708
ENSACIG00000022222	-	67	47.393	ENSACIG00000007466	-	72	44.492
ENSACIG00000022222	-	64	44.878	ENSACIG00000014703	-	83	44.878

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022222	-	66	35.616	ENSAPOG00000002527	-	70	35.616	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	77	39.147	ENSAPOG00000021365	-	84	40.310	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	71	54.054	ENSAPOG00000020108	-	75	50.195	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	57	58.857	ENSAPOG00000009059	-	92	58.857	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	75	42.259	ENSAPOG00000000066	-	62	43.556	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	67	37.557	ENSAPOG00000002517	-	76	37.557	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	69	58.986	ENSAPOG00000001075	-	99	58.986	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	63	59.296	ENSAPOG00000018915	-	85	59.296	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	93	51.203	ENSAPOG00000010738	-	82	56.126	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	53	61.310	ENSAPOG00000007631	-	78	61.310	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	68	66.298	ENSAPOG00000022321	-	87	66.298	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	93	65.424	ENSAPOG00000017667	-	54	66.780	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	94	51.864	ENSAPOG00000001444	-	51	52.881	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	68	34.906	ENSAPOG00000008529	-	82	34.906	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	64	59.204	ENSAPOG00000007123	-	74	59.204	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	85	55.678	ENSAPOG00000002337	-	80	56.667	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	65	40.845	ENSAPOG00000009288	-	78	40.845	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022222	-	73	34.855	ENSAOCG00000016082	-	56	34.855	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022222	-	67	54.762	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	73	54.762	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022222	-	51	44.444	ENSAOCG00000007815	-	59	44.444	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022222	-	61	38.000	ENSAOCG00000016099	-	88	38.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022222	-	75	39.526	ENSAOCG00000015984	-	83	39.526	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022222	-	73	43.404	ENSAOCG00000013326	-	88	43.874	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022222	-	61	38.000	ENSAPEG00000002121	-	88	38.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022222	-	62	35.233	ENSAPEG00000013532	-	98	35.233	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022222	-	65	36.275	ENSAPEG00000013508	-	86	36.275	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022222	-	79	41.700	ENSAPEG00000019003	-	95	41.700	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022222	-	63	37.561	ENSAPEG00000002163	-	70	37.561	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022222	-	54	43.529	ENSAPEG00000013378	-	61	43.529	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022222	-	63	33.333	ENSAPEG00000008662	-	50	33.333	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022222	-	93	52.234	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	91	65.106	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022222	-	77	40.856	ENSAPEG00000003513	-	93	40.784	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022222	-	53	55.952	ENSATEG00000012017	-	69	55.952	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	63	40.000	ENSATEG00000010978	-	78	40.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	66	51.691	ENSATEG00000011712	-	80	51.691	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	58	37.500	ENSATEG00000020398	-	52	37.500	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	66	57.692	ENSATEG00000011820	-	74	57.692	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	72	39.381	ENSATEG00000017209	-	82	39.381	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	67	39.352	ENSATEG00000010901	-	58	37.607	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	65	59.024	ENSATEG00000011931	-	82	59.024	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	73	35.950	ENSATEG00000011021	-	68	35.950	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	85	53.704	ENSATEG00000011837	-	82	54.444	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	97	55.592	ENSATEG00000011341	-	59	55.592	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	62	43.842	ENSATEG00000010966	-	86	43.842	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	83	56.391	ENSATEG00000011814	-	96	55.333	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	69	58.333	ENSATEG00000011918	-	86	56.809	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	97	47.419	ENSATEG00000011594	-	85	59.239	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	86	42.066	ENSATEG00000019504	-	79	44.068	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	63	60.914	ENSATEG00000011979	-	92	60.914	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	53	56.886	ENSATEG00000011978	-	84	56.886	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	96	65.552	ENSATEG00000011789	-	83	67.354	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	59	43.316	ENSATEG00000009383	-	73	40.708	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	65	41.315	ENSATEG00000010991	-	81	41.315	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	93	71.525	ENSATEG00000011635	-	80	73.504	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	64	57.143	ENSATEG00000011720	-	74	57.143	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	86	55.109	ENSATEG00000011953	-	76	55.926	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022222	-	71	37.931	ENSACLG00000017422	-	64	37.069	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022222	-	68	38.667	ENSACLG00000006534	-	60	38.667	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022222	-	65	39.706	ENSACLG00000003393	-	80	39.706	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022222	-	58	35.870	ENSACLG00000023539	-	65	35.870	Astatotilapia_calliptera
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