EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022228 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7686 bases
Position: chrCCOE01001633.1:2236-9921
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028698	MMR_HSR1	PF01926.23	1.5e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029458	-	1773	-	ENSACIP00000028698	590 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000022228	-	78	35.745	ENSACIG00000021449	-	84	35.745
ENSACIG00000022228	-	82	78.423	ENSACIG00000009814	-	85	78.423
ENSACIG00000022228	-	78	37.045	ENSACIG00000002240	-	85	37.045
ENSACIG00000022228	-	78	33.966	ENSACIG00000010569	-	86	33.966
ENSACIG00000022228	-	78	35.504	ENSACIG00000014982	-	85	35.504
ENSACIG00000022228	-	78	36.229	ENSACIG00000008256	-	85	36.229
ENSACIG00000022228	-	78	35.881	ENSACIG00000001022	-	85	35.881
ENSACIG00000022228	-	77	36.797	ENSACIG00000021889	-	80	36.797
ENSACIG00000022228	-	78	36.017	ENSACIG00000021882	-	85	36.017
ENSACIG00000022228	-	79	35.417	ENSACIG00000003888	-	86	36.192
ENSACIG00000022228	-	77	32.900	ENSACIG00000008585	-	87	32.900
ENSACIG00000022228	-	78	33.544	ENSACIG00000014961	-	83	33.544
ENSACIG00000022228	-	78	37.421	ENSACIG00000023726	-	85	37.421
ENSACIG00000022228	-	81	32.716	ENSACIG00000014898	-	86	32.716
ENSACIG00000022228	-	78	37.006	ENSACIG00000003168	-	85	36.798
ENSACIG00000022228	-	61	37.867	ENSACIG00000023712	-	88	37.867
ENSACIG00000022228	-	78	33.056	ENSACIG00000012148	-	84	33.817
ENSACIG00000022228	-	81	61.053	ENSACIG00000022269	-	79	62.185
ENSACIG00000022228	-	81	33.264	ENSACIG00000014973	-	88	33.264
ENSACIG00000022228	-	78	33.475	ENSACIG00000008246	-	81	33.475
ENSACIG00000022228	-	88	87.572	ENSACIG00000009923	-	84	87.572

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022228	-	84	63.286	ENSAPOG00000015784	-	81	63.286	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022228	-	83	63.340	ENSAPOG00000015792	-	87	63.340	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022228	-	85	71.657	ENSAPEG00000005793	-	93	71.657	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022228	-	84	71.371	ENSATEG00000009097	-	83	71.371	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022228	-	85	78.529	ENSACLG00000023481	-	90	78.529	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022228	-	85	79.920	ENSACLG00000023474	-	90	80.517	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022228	-	87	62.209	ENSCVAG00000018327	-	86	62.209	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022228	-	84	61.895	ENSFHEG00000008149	-	75	61.895	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022228	-	84	60.606	ENSFHEG00000011074	-	77	60.000	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022228	-	84	73.642	ENSFHEG00000021969	-	89	73.642	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022228	-	85	79.882	ENSHBUG00000012995	-	90	80.671	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022228	-	85	81.909	ENSHBUG00000021307	-	90	81.909	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022228	-	86	65.347	ENSKMAG00000016981	-	79	65.347	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000022228	-	97	66.060	ENSKMAG00000016903	-	80	66.060	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000022228	-	84	46.600	ENSLACG00000008367	-	96	47.200	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000022228	-	86	72.016	ENSMAMG00000015247	-	91	72.016	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000022228	-	86	69.667	ENSMAMG00000015097	-	91	69.667	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000022228	-	84	72.032	ENSMAMG00000015216	-	89	72.032	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000022228	-	85	80.517	ENSMZEG00005020274	-	90	81.113	Maylandia_zebra
ENSACIG00000022228	-	84	80.202	ENSMZEG00005020281	-	91	74.128	Maylandia_zebra
ENSACIG00000022228	-	83	77.935	ENSNBRG00000016799	-	86	78.138	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000022228	-	87	79.688	ENSNBRG00000022932	-	91	79.688	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000022228	-	84	81.947	ENSNBRG00000016760	-	97	81.947	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000022228	-	82	82.922	ENSONIG00000012363	-	99	82.922	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000022228	-	83	59.229	ENSPKIG00000011996	-	86	59.717	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000022228	-	88	59.125	ENSPKIG00000009271	-	87	59.506	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000022228	-	69	65.041	ENSPMGG00000000605	-	88	65.041	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000022228	-	84	71.888	ENSPFOG00000010758	-	78	72.289	Poecilia_formosa
ENSACIG00000022228	-	84	61.460	ENSPLAG00000005002	-	95	61.460	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000022228	-	84	63.232	ENSPLAG00000000406	-	91	63.232	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000022228	-	86	69.844	ENSPLAG00000010093	-	67	70.233	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000022228	-	84	63.434	ENSPMEG00000014712	-	75	63.434	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000022228	-	84	71.743	ENSPREG00000021204	-	92	72.144	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000022228	-	88	71.954	ENSSMAG00000004663	-	86	70.336	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000022228	-	87	73.450	ENSSDUG00000004257	-	93	73.450	Seriola_dumerili
ENSACIG00000022228	-	88	72.031	ENSSLDG00000021625	-	93	72.031	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000022228	-	84	74.245	ENSSPAG00000003320	-	84	75.252	Stegastes_partitus
ENSACIG00000022228	-	83	64.082	ENSXMAG00000023457	-	93	64.082	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000022228	-	84	63.710	ENSXMAG00000022709	-	75	63.710	Xiphophorus_maculatus