EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022269 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6172 bases
Position: chrCCOE01000939.1:42926-49097
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028757	MMR_HSR1	PF01926.23	3.3e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029520	-	1737	-	ENSACIP00000028757	578 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000022269	-	86	31.650	ENSACIG00000012148	-	93	31.068
ENSACIG00000022269	-	86	32.745	ENSACIG00000021889	-	90	32.500
ENSACIG00000022269	-	82	34.211	ENSACIG00000021882	-	90	34.211
ENSACIG00000022269	-	86	32.314	ENSACIG00000008256	-	94	33.207
ENSACIG00000022269	-	86	33.786	ENSACIG00000003888	-	94	33.786
ENSACIG00000022269	-	87	31.191	ENSACIG00000023726	-	96	32.000
ENSACIG00000022269	-	85	32.296	ENSACIG00000014982	-	94	31.774
ENSACIG00000022269	-	79	62.185	ENSACIG00000022228	-	81	61.053
ENSACIG00000022269	-	85	31.507	ENSACIG00000021449	-	92	31.507
ENSACIG00000022269	-	87	30.550	ENSACIG00000003168	-	96	30.550
ENSACIG00000022269	-	83	57.746	ENSACIG00000009923	-	80	57.948
ENSACIG00000022269	-	90	30.582	ENSACIG00000008246	-	95	30.582
ENSACIG00000022269	-	89	30.492	ENSACIG00000014961	-	93	30.492
ENSACIG00000022269	-	86	32.164	ENSACIG00000002240	-	94	31.641
ENSACIG00000022269	-	84	31.041	ENSACIG00000008585	-	96	31.041
ENSACIG00000022269	-	80	59.787	ENSACIG00000009814	-	85	59.787
ENSACIG00000022269	-	84	31.507	ENSACIG00000014898	-	91	31.783
ENSACIG00000022269	-	86	30.885	ENSACIG00000010569	-	94	30.769
ENSACIG00000022269	-	85	31.496	ENSACIG00000001022	-	93	31.250
ENSACIG00000022269	-	65	35.443	ENSACIG00000023712	-	95	35.443

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022269	-	83	33.136	ENSAPOG00000005749	-	89	32.347	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022269	-	85	33.203	ENSAPOG00000005726	-	91	33.075	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022269	-	85	32.108	ENSAPOG00000021040	-	82	31.721	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022269	-	83	55.110	ENSAPOG00000016636	-	98	55.110	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022269	-	85	32.613	ENSAPEG00000000062	-	92	32.613	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022269	-	81	33.402	ENSATEG00000023346	-	87	33.333	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022269	-	81	33.196	ENSATEG00000019965	-	88	32.990	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022269	-	84	32.213	ENSATEG00000012558	-	91	31.873	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022269	-	88	31.898	ENSACLG00000009261	-	96	31.703	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022269	-	54	35.423	ENSACLG00000006285	-	55	35.423	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022269	-	85	61.523	ENSACLG00000023126	-	95	61.523	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022269	-	82	35.913	ENSACLG00000006538	-	87	35.913	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022269	-	81	32.129	ENSACLG00000021761	-	89	32.129	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022269	-	67	32.763	ENSACLG00000015361	-	98	32.927	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022269	-	83	55.976	ENSACLG00000023468	-	85	55.976	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022269	-	75	33.630	ENSACLG00000010007	-	66	33.630	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022269	-	80	31.847	ENSACLG00000018599	-	89	31.635	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022269	-	82	32.121	ENSACLG00000018271	-	88	31.919	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022269	-	84	31.772	ENSACLG00000006543	-	92	31.589	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022269	-	64	61.358	ENSACLG00000023033	-	96	61.097	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022269	-	86	31.402	ENSAMXG00000034407	-	94	30.899	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022269	-	80	30.992	ENSAMXG00000033407	-	90	30.785	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022269	-	78	33.546	ENSAMXG00000029346	-	87	34.681	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022269	-	86	30.885	ENSAMXG00000032695	-	96	30.697	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022269	-	83	39.686	ENSAMXG00000035937	-	90	39.208	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022269	-	83	40.080	ENSAMXG00000036353	-	87	39.880	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022269	-	87	35.016	ENSAMXG00000030535	-	92	38.571	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022269	-	76	34.707	ENSCVAG00000005819	-	96	34.707	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	88	31.947	ENSCVAG00000007256	-	97	31.947	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	84	32.411	ENSCVAG00000007251	-	96	32.277	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	82	32.389	ENSCVAG00000007831	-	93	32.389	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	84	32.871	ENSCVAG00000007803	-	93	33.988	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	53	35.647	ENSCVAG00000022676	-	92	35.331	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	86	38.650	ENSCVAG00000007794	-	94	38.650	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	83	43.611	ENSCVAG00000008633	-	92	43.408	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	82	30.020	ENSCVAG00000013384	-	99	30.815	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	62	33.243	ENSCVAG00000014791	-	99	33.243	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	84	44.800	ENSCVAG00000011261	-	92	44.200	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	85	31.977	ENSCVAG00000007269	-	93	31.985	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	86	52.031	ENSCVAG00000015205	-	93	52.031	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	85	31.836	ENSCVAG00000008134	-	91	31.765	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	86	31.845	ENSCVAG00000009446	-	97	31.845	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	85	32.283	ENSCVAG00000004690	-	92	32.087	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022269	-	86	32.882	ENSCVAG00000008146	-	94	32.882	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000022269	-	80	30.642	ENSDARG00000104895	BX004857.1	80	30.642	Danio_rerio
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ENSACIG00000022269	-	86	45.261	ENSDARG00000100370	CT955963.1	82	45.261	Danio_rerio
ENSACIG00000022269	-	76	45.475	ENSEBUG00000008009	zgc:171695	81	45.033	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000022269	-	81	33.470	ENSELUG00000008430	-	89	33.470	Esox_lucius
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ENSACIG00000022269	-	85	34.911	ENSELUG00000009603	-	94	35.141	Esox_lucius
ENSACIG00000022269	-	85	48.425	ENSELUG00000000241	-	91	47.929	Esox_lucius
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ENSACIG00000022269	-	75	36.147	ENSELUG00000009611	-	90	36.501	Esox_lucius
ENSACIG00000022269	-	86	30.966	ENSFHEG00000006430	-	96	30.966	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022269	-	81	33.065	ENSFHEG00000016342	-	93	32.927	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022269	-	78	32.985	ENSFHEG00000012343	-	90	32.777	Fundulus_heteroclitus
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ENSACIG00000022269	-	81	52.567	ENSFHEG00000021963	-	91	52.567	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022269	-	80	33.610	ENSFHEG00000023034	-	91	33.610	Fundulus_heteroclitus
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ENSACIG00000022269	-	85	33.592	ENSFHEG00000006385	-	91	33.659	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022269	-	86	30.528	ENSFHEG00000006408	-	96	30.528	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022269	-	86	32.233	ENSFHEG00000006403	-	95	32.039	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022269	-	80	45.816	ENSGMOG00000019825	-	99	45.188	Gadus_morhua
ENSACIG00000022269	-	83	44.422	ENSGMOG00000011319	-	94	44.219	Gadus_morhua
ENSACIG00000022269	-	82	50.920	ENSGMOG00000019330	-	82	50.515	Gadus_morhua
ENSACIG00000022269	-	82	49.798	ENSGMOG00000005680	-	83	49.593	Gadus_morhua
ENSACIG00000022269	-	58	55.000	ENSGMOG00000019529	-	84	52.597	Gadus_morhua
ENSACIG00000022269	-	81	50.932	ENSGMOG00000017552	-	82	50.725	Gadus_morhua
ENSACIG00000022269	-	78	46.841	ENSGMOG00000008232	-	98	47.277	Gadus_morhua
ENSACIG00000022269	-	88	30.712	ENSGAFG00000005032	-	95	30.337	Gambusia_affinis
ENSACIG00000022269	-	91	32.231	ENSGAFG00000005023	-	96	31.915	Gambusia_affinis
ENSACIG00000022269	-	66	33.838	ENSGACG00000015437	-	97	33.586	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000022269	-	66	33.166	ENSGACG00000005035	-	97	32.746	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000022269	-	82	53.292	ENSGACG00000015788	-	82	53.909	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000022269	-	77	32.397	ENSGACG00000013484	-	90	31.533	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000022269	-	83	55.242	ENSHBUG00000021300	-	95	55.040	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022269	-	86	33.205	ENSHBUG00000011072	-	95	33.012	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022269	-	89	32.000	ENSHBUG00000008531	-	91	32.576	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022269	-	88	31.507	ENSHBUG00000023603	-	96	31.311	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022269	-	88	31.629	ENSHBUG00000007429	-	95	31.629	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022269	-	87	59.302	ENSHBUG00000020236	-	84	59.109	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022269	-	87	62.016	ENSHBUG00000004854	-	54	61.822	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022269	-	86	31.164	ENSHBUG00000012793	-	98	30.916	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022269	-	81	31.818	ENSIPUG00000000080	-	88	31.198	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000022269	-	81	32.645	ENSIPUG00000000081	-	88	32.025	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000022269	-	84	45.272	ENSIPUG00000005064	-	77	45.272	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000022269	-	60	31.429	ENSIPUG00000013512	-	81	31.429	Ictalurus_punctatus
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