EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022283 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: frg1
Alias: zgc:112426
Full Name: FSHD region gene 1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10080 bases
Position: chrCCOE01000628.1:45496-55575
Accession: ZDB-GENE-050417-324
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028798	FRG1	PF06229.12	1.1e-82	1	1
ENSACIP00000028807	FRG1	PF06229.12	4.5e-36	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029564	-	669	-	ENSACIP00000028798	222 (aa)	-	-
ENSACIT00000029573	-	384	-	ENSACIP00000028807	127 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.888	ENSG00000109536	FRG1	100	79.310	Homo_sapiens
ENSACIG00000022283	frg1	100	91.441	ENSAPOG00000001060	frg1	87	91.441	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022283	frg1	98	75.342	ENSAMEG00000013503	FRG1	86	75.336	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000022283	frg1	100	91.892	ENSAOCG00000024240	frg1	87	91.892	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022283	frg1	100	91.441	ENSAPEG00000002486	frg1	87	91.441	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022283	frg1	100	89.189	ENSATEG00000010414	frg1	89	91.080	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022283	frg1	100	76.126	ENSAPLG00000007785	-	87	76.126	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000022283	frg1	99	79.091	ENSACAG00000006877	-	86	79.091	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000022283	frg1	98	74.886	ENSANAG00000020876	FRG1	87	74.888	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000022283	frg1	96	92.056	ENSACLG00000027065	frg1	88	92.056	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022283	frg1	99	85.068	ENSAMXG00000032700	frg1	87	84.753	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022283	frg1	98	75.342	ENSBTAG00000007089	FRG1	86	75.336	Bos_taurus
ENSACIG00000022283	frg1	80	64.356	ENSBTAG00000046517	-	100	66.071	Bos_taurus
ENSACIG00000022283	frg1	95	42.291	WBGene00014177	frg-1	82	42.291	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000022283	frg1	98	74.886	ENSCJAG00000011272	FRG1	90	76.667	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022283	frg1	98	75.342	ENSCAFG00000007135	FRG1	86	75.336	Canis_familiaris
ENSACIG00000022283	frg1	95	75.943	ENSCAFG00020000082	-	85	75.943	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000022283	frg1	98	75.342	ENSCHIG00000011585	-	86	75.336	Capra_hircus
ENSACIG00000022283	frg1	80	51.485	ENSCHIG00000013157	-	88	53.571	Capra_hircus
ENSACIG00000022283	frg1	61	67.532	ENSCHIG00000013501	-	74	71.264	Capra_hircus
ENSACIG00000022283	frg1	100	52.466	ENSTSYG00000031599	-	87	52.466	Carlito_syrichta
ENSACIG00000022283	frg1	80	69.307	ENSTSYG00000010985	-	100	70.536	Carlito_syrichta
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.888	ENSCAPG00000016056	-	91	74.888	Cavia_aperea
ENSACIG00000022283	frg1	98	74.886	ENSCPOG00000022277	-	87	74.888	Cavia_porcellus
ENSACIG00000022283	frg1	98	74.886	ENSCCAG00000024627	FRG1	87	74.888	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.439	ENSCATG00000029230	FRG1	86	74.439	Cercocebus_atys
ENSACIG00000022283	frg1	98	61.644	ENSCLAG00000004960	-	85	62.780	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000022283	frg1	100	52.703	ENSCLAG00000006068	-	86	52.703	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000022283	frg1	98	74.886	ENSCLAG00000000370	-	87	74.888	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000022283	frg1	97	54.167	ENSCLAG00000009263	-	84	54.338	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000022283	frg1	96	71.628	ENSCSAG00000017729	-	99	71.628	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.439	ENSCSAG00000002899	FRG1	86	74.439	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000022283	frg1	55	80.165	ENSCHOG00000000773	-	75	80.165	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000022283	frg1	99	77.273	ENSCPBG00000009211	-	86	77.273	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000022283	frg1	97	51.142	ENSCING00000005161	-	82	51.142	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000022283	frg1	59	54.962	ENSCSAVG00000008018	-	75	52.899	Ciona_savignyi
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.439	ENSCANG00000020991	FRG1	86	74.439	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.888	ENSCGRG00001014998	Frg1	86	74.888	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000022283	frg1	100	59.641	ENSCGRG00000003902	-	81	59.641	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.888	ENSCGRG00000011860	-	86	74.888	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000022283	frg1	93	84.058	ENSCSEG00000015950	frg1	85	84.058	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000022283	frg1	100	87.838	ENSCVAG00000009985	frg1	87	89.252	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022283	frg1	99	86.364	ENSDARG00000056504	frg1	100	88.732	Danio_rerio
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.439	ENSDNOG00000014886	FRG1	86	74.439	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000022283	frg1	98	65.753	ENSDORG00000016190	Frg1	85	65.919	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000022283	frg1	96	51.869	FBgn0036964	FRG1	81	51.869	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000022283	frg1	100	73.094	ENSETEG00000012349	-	86	73.094	Echinops_telfairi
ENSACIG00000022283	frg1	80	60.396	ENSEBUG00000012359	FRG1	89	56.081	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000022283	frg1	55	60.976	ENSEBUG00000014053	frg1	67	60.976	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000022283	frg1	100	75.336	ENSEASG00005017497	FRG1	87	75.336	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000022283	frg1	100	75.336	ENSECAG00000003122	FRG1	87	75.336	Equus_caballus
ENSACIG00000022283	frg1	79	68.000	ENSEEUG00000000145	-	100	75.796	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000022283	frg1	100	84.234	ENSELUG00000021712	frg1	87	84.234	Esox_lucius
ENSACIG00000022283	frg1	61	63.636	ENSFCAG00000006586	-	71	63.750	Felis_catus
ENSACIG00000022283	frg1	98	75.342	ENSFCAG00000025737	FRG1	86	75.336	Felis_catus
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.775	ENSFALG00000011231	-	87	74.775	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000022283	frg1	98	63.927	ENSFDAG00000012697	-	82	70.391	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.439	ENSFDAG00000000962	-	87	74.439	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000022283	frg1	100	87.387	ENSFHEG00000010540	frg1	87	87.387	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022283	frg1	97	81.944	ENSGMOG00000000867	frg1	87	81.448	Gadus_morhua
ENSACIG00000022283	frg1	100	76.577	ENSGALG00000013590	-	87	76.577	Gallus_gallus
ENSACIG00000022283	frg1	78	82.759	ENSGAFG00000013855	frg1	84	82.759	Gambusia_affinis
ENSACIG00000022283	frg1	100	82.883	ENSGACG00000016888	frg1	87	82.883	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000022283	frg1	99	77.273	ENSGAGG00000025012	-	86	77.273	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000022283	frg1	79	61.000	ENSGGOG00000043183	-	88	61.000	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000022283	frg1	80	69.307	ENSGGOG00000040796	-	67	56.522	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000022283	frg1	78	68.966	ENSGGOG00000012888	-	88	68.966	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000022283	frg1	100	91.892	ENSHBUG00000010667	frg1	88	92.523	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022283	frg1	98	71.101	ENSHGLG00000020402	-	81	71.171	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022283	frg1	98	74.886	ENSHGLG00000005601	FRG1	87	74.888	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022283	frg1	98	64.840	ENSHGLG00000001211	-	88	64.574	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022283	frg1	98	70.642	ENSHGLG00000020943	-	86	70.721	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022283	frg1	98	61.187	ENSHGLG00100015285	-	91	61.187	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022283	frg1	80	63.366	ENSHGLG00100013169	-	92	64.078	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022283	frg1	98	65.297	ENSHGLG00100010674	-	88	65.022	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022283	frg1	98	75.342	ENSHGLG00100016261	-	87	75.336	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022283	frg1	98	70.642	ENSHGLG00100021211	-	86	70.721	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022283	frg1	100	83.408	ENSHCOG00000000224	frg1	95	83.408	Hippocampus_comes
ENSACIG00000022283	frg1	99	84.234	ENSIPUG00000022716	frg1	89	83.796	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.888	ENSSTOG00000002857	-	86	74.888	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000022283	frg1	98	75.342	ENSJJAG00000020625	Frg1	86	75.336	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000022283	frg1	100	87.387	ENSKMAG00000005841	frg1	87	87.387	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000022283	frg1	100	86.486	ENSLBEG00000001466	frg1	87	86.486	Labrus_bergylta
ENSACIG00000022283	frg1	100	66.814	ENSLACG00000010243	frg1	87	66.814	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000022283	frg1	100	81.081	ENSLOCG00000013868	frg1	87	81.081	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000022283	frg1	98	74.886	ENSLAFG00000011191	FRG1	86	74.439	Loxodonta_africana
ENSACIG00000022283	frg1	95	65.888	ENSMFAG00000042873	-	89	65.888	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.439	ENSMFAG00000031178	FRG1	86	74.439	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000022283	frg1	90	65.517	ENSMMUG00000047496	-	87	65.517	Macaca_mulatta
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.439	ENSMMUG00000001824	FRG1	93	75.000	Macaca_mulatta
ENSACIG00000022283	frg1	55	65.714	ENSMNEG00000013798	-	84	62.025	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000022283	frg1	95	69.811	ENSMNEG00000018620	FRG1	86	70.149	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.439	ENSMLEG00000028881	FRG1	86	74.439	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000022283	frg1	100	90.991	ENSMAMG00000012406	frg1	87	90.991	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000022283	frg1	100	91.441	ENSMZEG00005007549	frg1	88	92.056	Maylandia_zebra
ENSACIG00000022283	frg1	100	77.027	ENSMGAG00000011481	-	87	77.027	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.888	ENSMAUG00000000847	Frg1	86	74.888	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000022283	frg1	100	75.336	ENSMICG00000046816	FRG1	86	75.336	Microcebus_murinus
ENSACIG00000022283	frg1	100	68.018	ENSMOCG00000023000	Frg1	85	68.919	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000022283	frg1	100	88.288	ENSMMOG00000004008	frg1	94	88.288	Mola_mola
ENSACIG00000022283	frg1	98	75.342	ENSMODG00000019031	-	76	75.336	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000022283	frg1	100	88.739	ENSMALG00000018497	frg1	87	88.739	Monopterus_albus
ENSACIG00000022283	frg1	100	75.336	MGP_CAROLIEiJ_G0031006	Frg1	86	75.336	Mus_caroli
ENSACIG00000022283	frg1	100	75.336	ENSMUSG00000031590	Frg1	86	75.336	Mus_musculus
ENSACIG00000022283	frg1	100	75.785	MGP_PahariEiJ_G0021475	Frg1	86	75.785	Mus_pahari
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.888	MGP_SPRETEiJ_G0032120	Frg1	86	74.888	Mus_spretus
ENSACIG00000022283	frg1	98	75.342	ENSMPUG00000017962	FRG1	86	75.336	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000022283	frg1	100	75.336	ENSMLUG00000023179	FRG1	87	75.336	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000022283	frg1	100	74.888	ENSNGAG00000016411	Frg1	86	74.888	Nannospalax_galili
ENSACIG00000022283	frg1	75	92.771	ENSNBRG00000006806	frg1	78	92.771	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000022283	frg1	90	68.159	ENSNLEG00000036059	-	86	68.159	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000022283	frg1	99	62.054	ENSNLEG00000032333	-	86	62.054	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000022283	frg1	100	52.466	ENSNLEG00000032846	-	100	66.071	Nomascus_leucogenys
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