EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022293 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2878 bases
Position: chrCCOE01000939.1:183696-186573
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

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ENSACIP00000028801	zf-met	PF12874.7	1.4e-35	6	6

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029567	-	1773	-	ENSACIP00000028801	590 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000022293	-	91	51.556	ENSACIG00000006806	-	61	51.556
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ENSACIG00000022293	-	91	46.429	ENSACIG00000019815	-	82	46.429
ENSACIG00000022293	-	91	44.106	ENSACIG00000023794	-	83	44.106
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ENSACIG00000022293	-	92	53.061	ENSACIG00000017298	sall4	58	52.830
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ENSACIG00000022293	-	97	41.991	ENSACIG00000017683	-	77	41.991
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ENSACIG00000022293	-	97	56.014	ENSACIG00000018440	-	99	56.014
ENSACIG00000022293	-	96	35.433	ENSACIG00000002944	-	89	35.433
ENSACIG00000022293	-	99	40.260	ENSACIG00000013149	-	81	40.260
ENSACIG00000022293	-	96	34.773	ENSACIG00000015411	-	83	34.773
ENSACIG00000022293	-	94	43.478	ENSACIG00000009128	-	81	43.478
ENSACIG00000022293	-	95	53.043	ENSACIG00000018059	-	67	52.066
ENSACIG00000022293	-	97	57.270	ENSACIG00000019791	-	92	56.126
ENSACIG00000022293	-	89	42.353	ENSACIG00000011318	snai1a	61	42.353
ENSACIG00000022293	-	95	59.890	ENSACIG00000000311	-	65	59.887
ENSACIG00000022293	-	90	45.455	ENSACIG00000018641	snai2	52	45.455

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022293	-	96	35.677	ENSAPOG00000018586	-	80	38.340	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000022293	-	97	47.810	ENSGACG00000010051	-	99	47.794	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000022293	-	95	41.000	ENSHBUG00000012432	-	70	41.000	Haplochromis_burtoni
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ENSACIG00000022293	-	95	38.413	ENSHCOG00000015237	-	66	38.413	Hippocampus_comes
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ENSACIG00000022293	-	91	40.936	ENSIPUG00000019706	-	63	40.936	Ictalurus_punctatus
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