EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022298 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srp9
Alias: zgc:56668
Full Name: signal recognition particle 9
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2635 bases
Position: chrCCOE01001542.1:2753266-2755900
Accession: ZDB-GENE-040426-1106
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028795	SRP9-21	PF05486.12	4.9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029560	-	192	-	ENSACIP00000028795	63 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000022298's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000022298's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022298	srp9	100	56.977	ENSG00000143742	SRP9	100	56.977	Homo_sapiens
ENSACIG00000022298	srp9	100	72.093	ENSAPOG00000006089	srp9	100	72.093	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSAMEG00000014744	SRP9	100	59.302	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000022298	srp9	100	72.093	ENSAOCG00000014643	srp9	100	72.093	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022298	srp9	100	72.093	ENSAPEG00000004398	srp9	100	72.093	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022298	srp9	100	73.256	ENSATEG00000014339	srp9	100	73.256	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022298	srp9	71	73.333	ENSAPLG00000015368	SRP9	64	73.333	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000022298	srp9	100	56.977	ENSACAG00000005788	SRP9	100	56.977	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSANAG00000022626	SRP9	100	55.814	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000022298	srp9	100	73.256	ENSACLG00000018392	srp9	100	73.256	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022298	srp9	100	72.093	ENSAMXG00000010366	srp9	100	72.093	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSBTAG00000033322	SRP9	100	59.302	Bos_taurus
ENSACIG00000022298	srp9	84	39.474	WBGene00013984	ZK512.4	100	39.474	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSCJAG00000040095	SRP9	100	55.814	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSCAFG00000016162	SRP9	100	59.302	Canis_familiaris
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSCAFG00020003285	SRP9	100	59.302	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSCHIG00000006407	SRP9	100	59.302	Capra_hircus
ENSACIG00000022298	srp9	100	53.488	ENSTSYG00000026832	SRP9	100	53.488	Carlito_syrichta
ENSACIG00000022298	srp9	100	56.977	ENSCPOG00000033454	SRP9	100	56.977	Cavia_porcellus
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSCCAG00000034464	SRP9	100	55.814	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSCATG00000041813	SRP9	100	55.814	Cercocebus_atys
ENSACIG00000022298	srp9	98	51.765	ENSCLAG00000017687	-	99	51.765	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000022298	srp9	100	56.977	ENSCLAG00000001368	-	100	56.977	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000022298	srp9	71	71.111	ENSCHOG00000008435	-	90	71.111	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSCHOG00000006096	-	100	59.302	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000022298	srp9	100	39.535	ENSCHOG00000012912	-	100	39.535	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSCPBG00000011999	SRP9	100	59.302	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000022298	srp9	100	54.651	ENSCANG00000012015	-	100	54.651	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSCANG00000030765	-	100	55.814	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000022298	srp9	100	54.651	ENSCGRG00001008910	Srp9	100	54.651	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000022298	srp9	71	64.444	ENSCGRG00000009651	Srp9	59	64.444	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000022298	srp9	100	70.930	ENSCSEG00000018438	srp9	100	70.930	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000022298	srp9	100	72.093	ENSCVAG00000001083	srp9	100	72.093	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022298	srp9	100	71.084	ENSDARG00000042851	srp9	100	71.084	Danio_rerio
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSDNOG00000013412	-	100	59.302	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSETEG00000012291	SRP9	100	53.488	Echinops_telfairi
ENSACIG00000022298	srp9	97	50.000	ENSEBUG00000009080	srp9	100	50.000	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSECAG00000033839	SRP9	100	59.302	Equus_caballus
ENSACIG00000022298	srp9	100	53.488	ENSEEUG00000001344	SRP9	100	53.488	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000022298	srp9	100	70.930	ENSELUG00000001506	srp9	100	70.930	Esox_lucius
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSFCAG00000010275	SRP9	62	59.302	Felis_catus
ENSACIG00000022298	srp9	100	56.977	ENSFALG00000011689	SRP9	100	56.977	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSFDAG00000020469	SRP9	100	59.302	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000022298	srp9	100	72.093	ENSFHEG00000011666	srp9	100	72.093	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022298	srp9	100	67.442	ENSGMOG00000003565	srp9	100	67.442	Gadus_morhua
ENSACIG00000022298	srp9	100	58.140	ENSGALG00000026009	SRP9	100	58.140	Gallus_gallus
ENSACIG00000022298	srp9	100	70.930	ENSGAFG00000009506	srp9	100	70.930	Gambusia_affinis
ENSACIG00000022298	srp9	100	70.930	ENSGACG00000004110	srp9	100	70.930	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSGAGG00000017129	SRP9	100	59.302	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000022298	srp9	100	56.977	ENSGGOG00000011555	SRP9	100	56.977	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000022298	srp9	100	73.256	ENSHBUG00000021430	srp9	100	73.256	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022298	srp9	75	52.857	ENSHGLG00000019830	-	100	52.857	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022298	srp9	90	55.000	ENSHGLG00000020925	-	100	55.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022298	srp9	100	51.163	ENSHGLG00000020168	-	100	51.163	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022298	srp9	100	58.140	ENSHGLG00000002329	SRP9	100	58.140	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022298	srp9	97	50.000	ENSHGLG00000006535	-	99	50.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022298	srp9	97	50.000	ENSHGLG00100009760	-	99	50.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022298	srp9	100	48.837	ENSHGLG00100011806	-	100	48.837	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022298	srp9	94	54.878	ENSHGLG00100016521	-	100	54.878	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022298	srp9	100	51.163	ENSHGLG00100020800	-	100	51.163	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022298	srp9	100	58.140	ENSHGLG00100019986	-	100	58.140	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022298	srp9	100	98.413	ENSHCOG00000006978	srp9	100	98.413	Hippocampus_comes
ENSACIG00000022298	srp9	100	69.767	ENSIPUG00000020674	srp9	100	69.767	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSSTOG00000026827	SRP9	100	59.302	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSJJAG00000016583	Srp9	100	55.814	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000022298	srp9	100	69.767	ENSKMAG00000014117	srp9	100	69.767	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000022298	srp9	100	72.093	ENSLBEG00000020620	srp9	100	72.093	Labrus_bergylta
ENSACIG00000022298	srp9	100	63.953	ENSLACG00000007546	SRP9	100	63.953	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000022298	srp9	100	66.279	ENSLOCG00000015903	srp9	100	66.279	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000022298	srp9	100	58.140	ENSLAFG00000004081	SRP9	100	58.140	Loxodonta_africana
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSMFAG00000002641	SRP9	100	55.814	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSMMUG00000000134	SRP9	100	55.814	Macaca_mulatta
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSMNEG00000043512	SRP9	100	55.814	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSMLEG00000037309	SRP9	100	55.814	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000022298	srp9	100	73.256	ENSMAMG00000004755	srp9	100	73.256	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000022298	srp9	100	73.256	ENSMZEG00005015517	srp9	100	73.256	Maylandia_zebra
ENSACIG00000022298	srp9	100	58.140	ENSMGAG00000008061	SRP9	100	58.140	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000022298	srp9	100	54.651	ENSMAUG00000017552	Srp9	100	54.651	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000022298	srp9	100	56.977	ENSMICG00000030104	-	100	56.977	Microcebus_murinus
ENSACIG00000022298	srp9	100	54.651	ENSMOCG00000012590	Srp9	100	54.651	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000022298	srp9	100	71.264	ENSMMOG00000014838	srp9	100	71.264	Mola_mola
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSMODG00000025664	SRP9	100	59.302	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000022298	srp9	100	70.930	ENSMALG00000004262	srp9	100	70.930	Monopterus_albus
ENSACIG00000022298	srp9	100	54.651	MGP_CAROLIEiJ_G0014997	Srp9	100	54.651	Mus_caroli
ENSACIG00000022298	srp9	100	54.651	ENSMUSG00000026511	Srp9	100	54.651	Mus_musculus
ENSACIG00000022298	srp9	100	52.326	MGP_PahariEiJ_G0028229	Srp9	100	52.326	Mus_pahari
ENSACIG00000022298	srp9	100	54.651	MGP_SPRETEiJ_G0015797	Srp9	100	54.651	Mus_spretus
ENSACIG00000022298	srp9	100	58.140	ENSMLUG00000014914	SRP9	100	58.140	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSNGAG00000019936	Srp9	100	55.814	Nannospalax_galili
ENSACIG00000022298	srp9	100	73.256	ENSNBRG00000010915	srp9	100	73.256	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000022298	srp9	100	56.977	ENSNLEG00000013740	SRP9	100	56.977	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSOPRG00000012133	SRP9	100	59.302	Ochotona_princeps
ENSACIG00000022298	srp9	100	48.864	ENSODEG00000010125	-	76	48.864	Octodon_degus
ENSACIG00000022298	srp9	100	58.025	ENSODEG00000015075	-	100	58.025	Octodon_degus
ENSACIG00000022298	srp9	100	73.256	ENSONIG00000011409	srp9	100	73.256	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSOANG00000001472	SRP9	100	59.302	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSOCUG00000010791	SRP9	100	59.302	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000022298	srp9	100	69.767	ENSORLG00020003090	srp9	100	69.767	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000022298	srp9	100	69.767	ENSORLG00015001636	srp9	89	69.767	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000022298	srp9	100	69.767	ENSOMEG00000020548	srp9	100	69.767	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSOGAG00000031299	-	100	55.814	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSOGAG00000001752	-	100	55.814	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000022298	srp9	100	56.977	ENSPPAG00000042680	SRP9	100	56.977	Pan_paniscus
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSPPRG00000011732	SRP9	100	59.302	Panthera_pardus
ENSACIG00000022298	srp9	71	71.111	ENSPTIG00000014838	SRP9	52	71.111	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000022298	srp9	100	56.977	ENSPTRG00000002038	SRP9	100	56.977	Pan_troglodytes
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSPANG00000030164	SRP9	100	55.814	Papio_anubis
ENSACIG00000022298	srp9	100	66.279	ENSPKIG00000015012	srp9	100	66.279	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSPSIG00000014842	SRP9	100	59.302	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000022298	srp9	100	95.238	ENSPMGG00000002318	srp9	100	95.238	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSPEMG00000022774	Srp9	100	55.814	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSPCIG00000017399	SRP9	100	59.302	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000022298	srp9	100	70.930	ENSPREG00000020242	srp9	100	70.930	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000022298	srp9	95	56.627	ENSPPYG00000000174	SRP9	100	56.627	Pongo_abelii
ENSACIG00000022298	srp9	100	56.977	ENSPCAG00000014886	SRP9	100	56.977	Procavia_capensis
ENSACIG00000022298	srp9	100	50.562	ENSPCOG00000012531	-	100	50.562	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000022298	srp9	71	68.889	ENSPCOG00000021743	-	73	68.889	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSPVAG00000008142	SRP9	100	59.302	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000022298	srp9	100	73.256	ENSPNYG00000010536	srp9	100	73.256	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000022298	srp9	100	73.256	ENSPNAG00000008264	srp9	100	73.256	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000022298	srp9	100	56.977	ENSRNOG00000003211	Srp9	100	56.977	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSRBIG00000040480	SRP9	100	55.814	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSRROG00000028703	SRP9	100	55.814	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	ENSSBOG00000034573	SRP9	100	55.814	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSSHAG00000013504	SRP9	100	59.302	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000022298	srp9	100	63.953	ENSSFOG00015000310	srp9	100	63.953	Scleropages_formosus
ENSACIG00000022298	srp9	100	70.930	ENSSMAG00000001318	srp9	100	70.930	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000022298	srp9	100	72.093	ENSSDUG00000008772	srp9	100	72.093	Seriola_dumerili
ENSACIG00000022298	srp9	83	68.000	ENSSLDG00000019141	srp9	95	68.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000022298	srp9	100	46.053	ENSSPUG00000014436	SRP9	100	46.053	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000022298	srp9	100	73.256	ENSSPAG00000017244	srp9	100	73.256	Stegastes_partitus
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSSSCG00000031664	-	100	59.302	Sus_scrofa
ENSACIG00000022298	srp9	100	56.977	ENSTGUG00000004123	SRP9	100	56.977	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000022298	srp9	100	68.605	ENSTRUG00000024107	srp9	100	68.605	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000022298	srp9	100	68.605	ENSTNIG00000007254	srp9	100	68.605	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000022298	srp9	100	58.140	ENSTBEG00000005634	SRP9	100	58.140	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000022298	srp9	71	71.111	ENSTTRG00000010081	SRP9	73	71.111	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSUAMG00000020489	SRP9	100	59.302	Ursus_americanus
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSUMAG00000015908	SRP9	100	59.302	Ursus_maritimus
ENSACIG00000022298	srp9	71	71.111	ENSVPAG00000001698	SRP9	73	71.111	Vicugna_pacos
ENSACIG00000022298	srp9	100	59.302	ENSVVUG00000002065	SRP9	100	59.302	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000022298	srp9	100	69.767	ENSXCOG00000000662	srp9	100	69.767	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000022298	srp9	100	69.767	ENSXMAG00000029514	srp9	100	69.767	Xiphophorus_maculatus