EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022330 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 801 bases
Position: chrCCOE01000939.1:273421-274221
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

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ENSACIP00000028833	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-27	2	4
ENSACIP00000028833	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-27	3	4
ENSACIP00000028833	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-27	4	4
ENSACIP00000028833	zf-met	PF12874.7	8e-07	1	1

Transcripts

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ENSACIT00000029599	-	801	-	ENSACIP00000028833	266 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSACIG00000022330	-	85	40.426	ENSACIG00000013149	-	81	40.426
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ENSACIG00000022330	-	85	37.363	ENSACIG00000017653	-	94	37.363
ENSACIG00000022330	-	88	35.465	ENSACIG00000007855	-	91	41.803
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ENSACIG00000022330	-	82	42.308	ENSACIG00000018641	snai2	52	42.308
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ENSACIG00000022330	-	97	44.643	ENSACIG00000011541	-	68	44.643
ENSACIG00000022330	-	83	51.163	ENSACIG00000022293	-	91	51.163
ENSACIG00000022330	-	83	46.821	ENSACIG00000004041	-	94	45.513
ENSACIG00000022330	-	85	43.956	ENSACIG00000011515	-	64	43.956
ENSACIG00000022330	-	83	43.750	ENSACIG00000016180	znf341	50	43.750
ENSACIG00000022330	-	98	44.344	ENSACIG00000016182	-	81	50.000
ENSACIG00000022330	-	69	59.375	ENSACIG00000010660	-	91	59.375
ENSACIG00000022330	-	88	40.113	ENSACIG00000017892	-	73	40.113
ENSACIG00000022330	-	85	43.556	ENSACIG00000023212	-	76	43.556
ENSACIG00000022330	-	82	45.033	ENSACIG00000019804	-	82	45.638
ENSACIG00000022330	-	92	36.719	ENSACIG00000009128	-	68	41.624
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Orthologs

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ENSACIG00000022330	-	79	35.849	ENSAPOG00000018480	-	63	35.220	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022330	-	85	38.991	ENSAMEG00000003802	-	99	38.991	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000022330	-	72	43.038	ENSAOCG00000024256	-	98	43.038	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022330	-	90	35.000	ENSAOCG00000015987	-	60	35.556	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022330	-	71	45.783	ENSAPEG00000005378	-	98	45.783	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022330	-	84	35.366	ENSAPEG00000018271	-	59	34.756	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022330	-	90	40.594	ENSATEG00000011221	-	64	49.367	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022330	-	94	42.282	ENSACLG00000003332	-	98	42.282	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022330	-	82	40.000	ENSACLG00000028002	-	85	40.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022330	-	85	41.743	ENSACLG00000015816	-	93	41.204	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022330	-	98	38.679	ENSACLG00000004663	-	74	45.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022330	-	83	46.821	ENSACLG00000023979	-	97	41.593	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022330	-	90	46.000	ENSACLG00000024308	-	99	46.606	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022330	-	85	50.307	ENSACLG00000024647	-	72	50.307	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022330	-	85	36.564	ENSACLG00000014176	-	84	38.788	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022330	-	94	46.193	ENSACLG00000011237	-	99	43.655	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022330	-	82	48.466	ENSACLG00000019094	-	83	48.466	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022330	-	77	39.103	ENSACLG00000013033	-	81	39.103	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022330	-	83	40.496	ENSACLG00000017849	-	62	46.667	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022330	-	98	82.946	ENSACLG00000022439	-	88	83.333	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022330	-	88	37.619	ENSACLG00000003679	-	79	38.764	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022330	-	86	45.699	ENSAMXG00000010930	-	83	45.699	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022330	-	83	48.026	ENSAMXG00000032212	-	86	48.026	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022330	-	83	46.316	ENSAMXG00000037760	-	96	46.316	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022330	-	83	49.206	ENSAMXG00000007092	-	98	49.206	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022330	-	83	48.214	ENSAMXG00000034958	-	91	48.214	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022330	-	83	48.344	ENSAMXG00000032457	-	91	48.344	Astyanax_mexicanus
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