EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022355 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3219 bases
Position: chrCCOE01001894.1:5020-8238
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028872	MMR_HSR1	PF01926.23	6.3e-10	1	1
ENSACIP00000028876	MMR_HSR1	PF01926.23	6.4e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029639	-	876	-	ENSACIP00000028872	291 (aa)	-	-
ENSACIT00000029643	-	885	-	ENSACIP00000028876	294 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000022355	-	81	47.679	ENSACIG00000016888	-	75	47.679
ENSACIG00000022355	-	79	48.485	ENSACIG00000001070	-	81	48.485
ENSACIG00000022355	-	55	46.875	ENSACIG00000000976	-	78	46.875
ENSACIG00000022355	-	76	47.085	ENSACIG00000007494	-	72	47.982
ENSACIG00000022355	-	66	39.500	ENSACIG00000007725	-	70	39.500
ENSACIG00000022355	-	78	48.230	ENSACIG00000003582	-	72	48.230
ENSACIG00000022355	-	63	35.135	ENSACIG00000003050	-	81	35.135
ENSACIG00000022355	-	74	45.581	ENSACIG00000004040	-	83	45.581
ENSACIG00000022355	-	94	85.870	ENSACIG00000016635	-	92	90.698
ENSACIG00000022355	-	63	72.283	ENSACIG00000005223	-	70	72.283
ENSACIG00000022355	-	87	53.360	ENSACIG00000022222	-	96	48.013
ENSACIG00000022355	-	58	50.581	ENSACIG00000000631	-	59	50.581
ENSACIG00000022355	-	64	35.602	ENSACIG00000009811	-	78	35.602
ENSACIG00000022355	-	72	43.333	ENSACIG00000014680	-	92	43.192
ENSACIG00000022355	-	90	53.612	ENSACIG00000007191	-	73	53.612
ENSACIG00000022355	-	58	71.006	ENSACIG00000012204	-	73	71.006
ENSACIG00000022355	-	75	40.306	ENSACIG00000005573	-	91	40.306
ENSACIG00000022355	-	69	48.000	ENSACIG00000014634	zgc:113625	93	43.590
ENSACIG00000022355	-	74	46.154	ENSACIG00000006503	-	68	46.154
ENSACIG00000022355	-	83	39.643	ENSACIG00000000893	-	81	46.117
ENSACIG00000022355	-	68	46.231	ENSACIG00000014745	-	89	46.231
ENSACIG00000022355	-	88	65.504	ENSACIG00000005198	-	52	62.369
ENSACIG00000022355	-	71	71.014	ENSACIG00000006478	-	77	71.014
ENSACIG00000022355	-	81	47.234	ENSACIG00000012159	-	66	45.211
ENSACIG00000022355	-	79	54.545	ENSACIG00000002263	-	81	54.545
ENSACIG00000022355	-	61	48.876	ENSACIG00000008666	-	85	48.876
ENSACIG00000022355	-	65	61.702	ENSACIG00000007178	-	65	61.702
ENSACIG00000022355	-	73	53.555	ENSACIG00000008045	-	75	54.726
ENSACIG00000022355	-	87	48.221	ENSACIG00000012718	-	87	58.373
ENSACIG00000022355	-	86	39.768	ENSACIG00000012714	-	85	39.768
ENSACIG00000022355	-	73	52.113	ENSACIG00000022362	-	76	52.113
ENSACIG00000022355	-	76	51.965	ENSACIG00000022366	-	82	51.965
ENSACIG00000022355	-	88	69.412	ENSACIG00000019149	-	78	69.412
ENSACIG00000022355	-	86	67.068	ENSACIG00000002950	-	67	67.068
ENSACIG00000022355	-	73	54.245	ENSACIG00000023381	-	83	54.245
ENSACIG00000022355	-	69	44.279	ENSACIG00000014716	-	80	44.279
ENSACIG00000022355	-	91	92.164	ENSACIG00000012648	-	90	92.164
ENSACIG00000022355	-	73	51.659	ENSACIG00000001455	-	77	51.659
ENSACIG00000022355	-	73	49.533	ENSACIG00000004245	-	75	49.533
ENSACIG00000022355	-	73	51.185	ENSACIG00000007466	-	64	51.185
ENSACIG00000022355	-	81	44.583	ENSACIG00000014690	-	91	44.583
ENSACIG00000022355	-	73	49.528	ENSACIG00000019524	-	87	49.528
ENSACIG00000022355	-	71	44.444	ENSACIG00000020234	-	72	44.444
ENSACIG00000022355	-	73	49.057	ENSACIG00000014646	zgc:113625	82	49.057
ENSACIG00000022355	-	68	61.856	ENSACIG00000007158	-	65	59.788
ENSACIG00000022355	-	80	41.453	ENSACIG00000016502	-	99	41.453
ENSACIG00000022355	-	84	53.441	ENSACIG00000016313	-	76	53.441
ENSACIG00000022355	-	68	32.353	ENSACIG00000003906	-	66	32.353
ENSACIG00000022355	-	62	36.264	ENSACIG00000007737	-	71	36.508
ENSACIG00000022355	-	92	62.593	ENSACIG00000005780	-	85	59.649
ENSACIG00000022355	-	63	37.368	ENSACIG00000014737	-	86	37.368
ENSACIG00000022355	-	63	40.741	ENSACIG00000014670	-	71	40.741
ENSACIG00000022355	-	74	47.465	ENSACIG00000020244	-	90	47.465
ENSACIG00000022355	-	69	58.209	ENSACIG00000012707	-	76	58.209
ENSACIG00000022355	-	75	53.211	ENSACIG00000022370	-	80	51.948
ENSACIG00000022355	-	56	73.620	ENSACIG00000022374	-	83	73.620
ENSACIG00000022355	-	76	51.131	ENSACIG00000022377	-	79	51.131
ENSACIG00000022355	-	73	41.629	ENSACIG00000012061	-	65	41.629
ENSACIG00000022355	-	74	41.071	ENSACIG00000005587	-	78	40.265
ENSACIG00000022355	-	69	46.535	ENSACIG00000014703	-	83	46.535
ENSACIG00000022355	-	66	35.602	ENSACIG00000019509	-	88	35.602
ENSACIG00000022355	-	64	45.989	ENSACIG00000015088	-	74	45.989
ENSACIG00000022355	-	67	31.050	ENSACIG00000009149	-	73	31.050
ENSACIG00000022355	-	86	49.612	ENSACIG00000008001	-	94	49.612
ENSACIG00000022355	-	68	47.783	ENSACIG00000001596	-	80	47.573
ENSACIG00000022355	-	69	49.010	ENSACIG00000020225	-	79	44.672
ENSACIG00000022355	-	73	45.972	ENSACIG00000014662	-	86	45.755
ENSACIG00000022355	-	72	45.714	ENSACIG00000014655	-	78	45.714
ENSACIG00000022355	-	89	63.178	ENSACIG00000006484	-	78	63.178
ENSACIG00000022355	-	55	71.875	ENSACIG00000012761	-	90	71.875

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022355	-	80	36.047	ENSAPOG00000009288	-	95	36.047	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	69	66.832	ENSAPOG00000007123	-	73	68.020	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	74	38.785	ENSAPOG00000008529	-	82	38.785	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	69	41.791	ENSAPOG00000007181	-	57	37.329	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	67	73.514	ENSAPOG00000009059	-	91	73.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	71	38.462	ENSAPOG00000002517	-	75	38.462	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	75	67.742	ENSAPOG00000001075	-	99	67.742	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	76	34.599	ENSAPOG00000002527	-	74	34.599	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	86	52.000	ENSAPOG00000010738	-	77	52.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	73	47.222	ENSAPOG00000000066	-	72	44.151	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	68	71.066	ENSAPOG00000018915	-	84	71.066	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	90	43.774	ENSAPOG00000020108	-	74	44.318	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	66	32.995	ENSAPOG00000008819	-	85	33.503	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	73	58.757	ENSAPOG00000022321	-	85	58.757	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	83	42.975	ENSAPOG00000021365	-	75	42.975	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	57	75.000	ENSAPOG00000007631	-	78	75.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	91	68.846	ENSAPOG00000002337	-	75	68.846	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022355	-	66	65.625	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	76	65.625	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022355	-	57	50.602	ENSAOCG00000007815	-	61	50.299	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022355	-	94	32.632	ENSAOCG00000016082	-	62	32.632	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022355	-	65	41.414	ENSAOCG00000016099	-	86	41.414	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022355	-	81	40.496	ENSAOCG00000013326	-	87	40.323	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022355	-	91	40.149	ENSAOCG00000015984	-	84	40.149	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022355	-	71	35.616	ENSAPEG00000002163	-	73	35.616	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022355	-	57	50.909	ENSAPEG00000013378	-	59	50.909	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022355	-	80	42.128	ENSAPEG00000019003	-	91	42.128	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022355	-	71	42.233	ENSAPEG00000013508	-	86	42.233	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022355	-	65	41.414	ENSAPEG00000002121	-	86	41.414	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022355	-	91	41.264	ENSAPEG00000003513	-	83	54.545	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022355	-	68	35.567	ENSAPEG00000008662	-	52	35.567	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022355	-	67	42.051	ENSAPEG00000013532	-	98	42.051	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022355	-	83	58.848	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	93	58.848	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022355	-	64	45.455	ENSATEG00000009383	-	73	39.916	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	56	72.393	ENSATEG00000011978	-	82	72.393	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	68	72.589	ENSATEG00000011979	-	92	72.589	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	70	71.220	ENSATEG00000011720	-	76	70.673	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	89	65.116	ENSATEG00000011837	-	83	65.517	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	55	72.671	ENSATEG00000012017	-	85	72.671	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	79	71.765	ENSATEG00000011635	-	74	70.455	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	71	70.531	ENSATEG00000011820	-	74	70.531	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	67	39.706	ENSATEG00000010966	-	86	39.706	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	73	73.113	ENSATEG00000011918	-	84	68.775	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	97	37.209	ENSATEG00000019504	-	95	37.209	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	90	50.958	ENSATEG00000011789	-	70	52.800	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	89	68.217	ENSATEG00000011814	-	82	69.020	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	89	53.091	ENSATEG00000011594	-	84	55.417	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	82	38.057	ENSATEG00000010901	-	60	38.057	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	63	38.251	ENSATEG00000020398	-	52	38.251	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	69	70.149	ENSATEG00000011931	-	81	70.149	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	68	39.806	ENSATEG00000010978	-	78	39.806	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	70	67.805	ENSATEG00000011712	-	79	67.805	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	89	67.054	ENSATEG00000011953	-	72	67.578	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	76	39.301	ENSATEG00000010991	-	86	39.301	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	85	58.300	ENSATEG00000011341	-	52	56.226	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	77	40.086	ENSATEG00000017209	-	87	40.086	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	76	36.957	ENSATEG00000011021	-	65	37.118	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022355	-	77	38.462	ENSACLG00000017422	-	65	38.462	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022355	-	78	40.506	ENSACLG00000001886	-	75	40.506	Astatotilapia_calliptera
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