EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022362 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2334 bases
Position: chrCCOE01001303.1:162910-165243
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028871	MMR_HSR1	PF01926.23	3.7e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029638	-	837	-	ENSACIP00000028871	278 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000022362	-	72	49.261	ENSACIG00000020225	-	88	42.424
ENSACIG00000022362	-	71	37.864	ENSACIG00000003906	-	66	37.864
ENSACIG00000022362	-	68	33.649	ENSACIG00000009149	-	71	33.649
ENSACIG00000022362	-	64	66.854	ENSACIG00000008666	-	86	66.854
ENSACIG00000022362	-	68	44.737	ENSACIG00000015088	-	75	44.737
ENSACIG00000022362	-	75	39.487	ENSACIG00000005573	-	89	39.487
ENSACIG00000022362	-	83	58.696	ENSACIG00000006503	-	88	54.122
ENSACIG00000022362	-	82	58.696	ENSACIG00000008001	-	93	58.605
ENSACIG00000022362	-	74	50.962	ENSACIG00000006478	-	77	50.962
ENSACIG00000022362	-	58	47.205	ENSACIG00000000631	-	79	39.837
ENSACIG00000022362	-	75	47.170	ENSACIG00000014655	-	79	47.170
ENSACIG00000022362	-	88	68.571	ENSACIG00000002263	-	90	68.273
ENSACIG00000022362	-	76	49.057	ENSACIG00000014680	-	91	49.057
ENSACIG00000022362	-	67	32.105	ENSACIG00000019509	-	88	32.105
ENSACIG00000022362	-	73	50.495	ENSACIG00000019524	-	84	50.495
ENSACIG00000022362	-	96	68.657	ENSACIG00000022366	-	97	68.657
ENSACIG00000022362	-	81	37.607	ENSACIG00000005587	-	81	37.607
ENSACIG00000022362	-	67	61.828	ENSACIG00000001596	-	74	61.828
ENSACIG00000022362	-	52	37.013	ENSACIG00000014730	zgc:172131	76	37.013
ENSACIG00000022362	-	65	38.095	ENSACIG00000014737	-	87	38.095
ENSACIG00000022362	-	91	67.063	ENSACIG00000003582	-	96	62.838
ENSACIG00000022362	-	70	46.000	ENSACIG00000007178	-	70	46.000
ENSACIG00000022362	-	78	44.595	ENSACIG00000020244	-	94	44.595
ENSACIG00000022362	-	69	48.744	ENSACIG00000007158	-	64	46.561
ENSACIG00000022362	-	74	35.849	ENSACIG00000007725	-	74	35.849
ENSACIG00000022362	-	60	48.795	ENSACIG00000000976	-	81	48.795
ENSACIG00000022362	-	76	52.113	ENSACIG00000022355	-	73	52.113
ENSACIG00000022362	-	75	50.481	ENSACIG00000004040	-	82	50.481
ENSACIG00000022362	-	67	38.144	ENSACIG00000014670	-	73	38.144
ENSACIG00000022362	-	71	39.904	ENSACIG00000012061	-	77	35.000
ENSACIG00000022362	-	72	48.259	ENSACIG00000014745	-	91	48.259
ENSACIG00000022362	-	77	51.852	ENSACIG00000016635	-	81	51.852
ENSACIG00000022362	-	79	39.556	ENSACIG00000012159	-	58	39.556
ENSACIG00000022362	-	88	64.228	ENSACIG00000001070	-	88	64.228
ENSACIG00000022362	-	83	63.793	ENSACIG00000023381	-	91	63.793
ENSACIG00000022362	-	88	59.016	ENSACIG00000007466	-	94	59.016
ENSACIG00000022362	-	74	48.558	ENSACIG00000014716	-	83	48.558
ENSACIG00000022362	-	75	45.972	ENSACIG00000012714	-	70	45.972
ENSACIG00000022362	-	74	49.528	ENSACIG00000012718	-	88	49.528
ENSACIG00000022362	-	81	46.903	ENSACIG00000014690	-	86	46.903
ENSACIG00000022362	-	99	67.636	ENSACIG00000022370	-	98	67.636
ENSACIG00000022362	-	88	67.886	ENSACIG00000022377	-	96	67.300
ENSACIG00000022362	-	60	50.296	ENSACIG00000022374	-	87	50.296
ENSACIG00000022362	-	82	41.126	ENSACIG00000016502	-	94	41.126
ENSACIG00000022362	-	84	47.679	ENSACIG00000005780	-	71	47.679
ENSACIG00000022362	-	74	59.420	ENSACIG00000008045	-	77	59.901
ENSACIG00000022362	-	57	55.000	ENSACIG00000012761	-	70	55.000
ENSACIG00000022362	-	76	47.907	ENSACIG00000019149	-	66	47.907
ENSACIG00000022362	-	73	45.366	ENSACIG00000020234	-	72	45.366
ENSACIG00000022362	-	91	54.380	ENSACIG00000007494	-	92	55.872
ENSACIG00000022362	-	82	46.186	ENSACIG00000016313	-	72	46.186
ENSACIG00000022362	-	75	53.081	ENSACIG00000012648	-	71	53.081
ENSACIG00000022362	-	85	53.617	ENSACIG00000016888	-	77	53.617
ENSACIG00000022362	-	68	33.505	ENSACIG00000003050	-	84	33.505
ENSACIG00000022362	-	73	46.569	ENSACIG00000014646	zgc:113625	80	46.569
ENSACIG00000022362	-	85	65.957	ENSACIG00000001455	-	86	65.957
ENSACIG00000022362	-	65	52.717	ENSACIG00000005223	-	70	52.717
ENSACIG00000022362	-	79	46.364	ENSACIG00000007191	-	62	46.364
ENSACIG00000022362	-	81	48.458	ENSACIG00000006484	-	68	48.458
ENSACIG00000022362	-	70	50.769	ENSACIG00000014634	zgc:113625	78	50.769
ENSACIG00000022362	-	83	46.781	ENSACIG00000022222	-	82	42.529
ENSACIG00000022362	-	72	48.000	ENSACIG00000014703	-	83	48.000
ENSACIG00000022362	-	72	50.000	ENSACIG00000012707	-	77	50.000
ENSACIG00000022362	-	63	32.768	ENSACIG00000007737	-	70	32.065
ENSACIG00000022362	-	80	49.778	ENSACIG00000002950	-	60	49.561
ENSACIG00000022362	-	72	34.300	ENSACIG00000009811	-	85	34.300
ENSACIG00000022362	-	84	39.194	ENSACIG00000000893	-	84	47.368
ENSACIG00000022362	-	59	52.695	ENSACIG00000012204	-	72	52.695
ENSACIG00000022362	-	78	49.107	ENSACIG00000014662	-	91	49.107
ENSACIG00000022362	-	85	63.404	ENSACIG00000004245	-	94	59.398

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022362	-	91	64.032	ENSAPOG00000021159	-	92	61.348	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	70	48.223	ENSAPOG00000014243	-	81	48.223	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	94	42.761	ENSAPOG00000014759	-	98	42.761	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	66	51.630	ENSAPOG00000001262	-	88	51.630	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	85	42.322	ENSAPOG00000001268	-	69	42.322	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	74	50.244	ENSAPOG00000006169	-	61	48.444	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	72	49.261	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	71	49.261	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	94	62.452	ENSAPOG00000008063	-	84	62.452	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	98	38.276	ENSAPOG00000007322	-	91	40.214	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	85	62.553	ENSAPOG00000012716	-	93	59.636	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	74	50.244	ENSAPOG00000006488	-	85	48.444	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	71	48.744	ENSAPOG00000022240	-	57	48.744	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	75	45.933	ENSAPOG00000020897	-	89	42.797	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	86	39.004	ENSAPOG00000001315	-	73	39.004	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	72	49.254	ENSAPOG00000011509	-	73	47.511	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	72	49.261	ENSAPOG00000007333	-	59	49.261	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	82	46.288	ENSAPOG00000006177	-	50	46.288	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022362	-	86	47.059	ENSAOCG00000001993	-	90	47.059	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022362	-	82	46.930	ENSAOCG00000008522	-	75	46.930	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022362	-	83	47.845	ENSAOCG00000008525	-	67	47.845	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022362	-	78	41.014	ENSAOCG00000011794	-	65	41.014	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022362	-	84	46.781	ENSAOCG00000023240	-	83	46.781	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022362	-	72	49.261	ENSAOCG00000011155	-	59	49.261	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022362	-	68	50.526	ENSAOCG00000011167	-	63	50.526	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022362	-	86	54.622	ENSAOCG00000014702	-	76	54.622	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022362	-	95	42.532	ENSAOCG00000021905	-	93	43.182	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022362	-	72	44.828	ENSAOCG00000012651	-	84	45.320	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022362	-	81	48.444	ENSAOCG00000023255	-	78	48.444	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022362	-	50	46.259	ENSAOCG00000011143	-	85	46.259	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022362	-	72	48.768	ENSAPEG00000012184	-	59	48.768	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022362	-	68	50.526	ENSAPEG00000012179	-	65	50.526	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022362	-	86	54.622	ENSAPEG00000016533	-	77	54.622	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022362	-	72	46.078	ENSAPEG00000012191	-	69	46.078	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022362	-	82	46.053	ENSAPEG00000004217	-	78	46.053	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022362	-	73	64.039	ENSAPEG00000022386	-	77	64.039	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022362	-	92	61.328	ENSAPEG00000022374	-	90	61.069	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000022362	-	95	56.827	ENSAPEG00000022382	-	92	56.827	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022362	-	73	41.748	ENSAPEG00000013651	-	81	41.748	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022362	-	94	42.671	ENSAPEG00000015763	-	92	43.322	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022362	-	78	41.014	ENSAPEG00000000770	-	65	41.014	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022362	-	98	50.719	ENSAPEG00000003884	-	91	50.719	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022362	-	72	48.768	ENSATEG00000017193	-	58	48.768	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022362	-	74	45.894	ENSATEG00000017198	-	69	45.894	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022362	-	69	58.854	ENSATEG00000016536	-	58	58.854	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022362	-	82	52.838	ENSATEG00000014013	si:ch211-113e8.5	91	47.682	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022362	-	71	45.274	ENSATEG00000017202	-	72	41.111	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022362	-	74	46.602	ENSATEG00000020431	zgc:113625	81	46.602	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022362	-	83	48.276	ENSATEG00000019003	-	86	48.276	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022362	-	78	42.202	ENSATEG00000005844	-	64	42.202	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022362	-	88	57.959	ENSATEG00000014085	-	83	57.959	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022362	-	74	47.826	ENSATEG00000020391	-	85	47.826	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022362	-	97	56.272	ENSATEG00000013008	-	96	56.272	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022362	-	85	59.583	ENSATEG00000014028	-	75	59.583	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022362	-	69	51.282	ENSACLG00000003276	-	75	51.282	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022362	-	75	50.239	ENSACLG00000016872	-	85	46.667	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022362	-	73	65.517	ENSACLG00000016933	-	93	56.777	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022362	-	89	66.129	ENSACLG00000001976	-	94	65.428	Astatotilapia_calliptera
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