EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022370 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 23886 bases
Position: chrCCOE01001303.1:196066-219951
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028878	MMR_HSR1	PF01926.23	7.8e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029645	-	840	-	ENSACIP00000028878	279 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000022370	-	80	47.556	ENSACIG00000014690	-	81	49.048
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ENSACIG00000022370	-	73	49.038	ENSACIG00000012718	-	87	49.038
ENSACIG00000022370	-	80	46.288	ENSACIG00000007191	-	59	47.418
ENSACIG00000022370	-	81	44.156	ENSACIG00000016313	-	68	45.833
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ENSACIG00000022370	-	59	52.663	ENSACIG00000012204	-	72	52.663
ENSACIG00000022370	-	98	67.636	ENSACIG00000022362	-	99	67.636
ENSACIG00000022370	-	62	45.455	ENSACIG00000000631	-	74	43.192
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ENSACIG00000022370	-	73	46.829	ENSACIG00000019524	-	86	46.829
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ENSACIG00000022370	-	87	57.490	ENSACIG00000007466	-	94	57.490
ENSACIG00000022370	-	68	46.316	ENSACIG00000015088	-	75	46.316
ENSACIG00000022370	-	68	48.980	ENSACIG00000007158	-	62	47.706
ENSACIG00000022370	-	81	58.952	ENSACIG00000023381	-	86	61.009
ENSACIG00000022370	-	75	52.381	ENSACIG00000000893	-	85	52.381
ENSACIG00000022370	-	91	61.176	ENSACIG00000003582	-	88	58.456
ENSACIG00000022370	-	82	50.431	ENSACIG00000019149	-	66	51.163
ENSACIG00000022370	-	86	52.917	ENSACIG00000008045	-	79	58.491
ENSACIG00000022370	-	87	61.382	ENSACIG00000001070	-	88	60.816
ENSACIG00000022370	-	54	36.420	ENSACIG00000014730	zgc:172131	81	35.802
ENSACIG00000022370	-	73	48.544	ENSACIG00000020244	-	87	48.544
ENSACIG00000022370	-	80	51.948	ENSACIG00000022355	-	75	53.211
ENSACIG00000022370	-	70	39.901	ENSACIG00000003906	-	66	39.901
ENSACIG00000022370	-	83	51.883	ENSACIG00000016635	-	83	54.128
ENSACIG00000022370	-	96	77.695	ENSACIG00000022366	-	98	77.695
ENSACIG00000022370	-	71	46.000	ENSACIG00000014703	-	83	46.000
ENSACIG00000022370	-	80	49.339	ENSACIG00000006484	-	66	49.537
ENSACIG00000022370	-	71	50.000	ENSACIG00000012707	-	76	50.000
ENSACIG00000022370	-	84	61.966	ENSACIG00000004245	-	91	58.984
ENSACIG00000022370	-	63	62.147	ENSACIG00000008666	-	86	62.147
ENSACIG00000022370	-	83	55.794	ENSACIG00000016888	-	72	55.909
ENSACIG00000022370	-	65	39.785	ENSACIG00000014670	-	71	39.785
ENSACIG00000022370	-	67	57.447	ENSACIG00000001596	-	74	57.447
ENSACIG00000022370	-	83	58.798	ENSACIG00000008001	-	94	58.525
ENSACIG00000022370	-	74	32.870	ENSACIG00000007725	-	79	32.877
ENSACIG00000022370	-	82	34.483	ENSACIG00000003050	-	87	37.245
ENSACIG00000022370	-	65	36.170	ENSACIG00000014737	-	87	36.170
ENSACIG00000022370	-	72	46.305	ENSACIG00000020234	-	72	46.305
ENSACIG00000022370	-	79	34.199	ENSACIG00000009811	-	88	34.211
ENSACIG00000022370	-	71	46.569	ENSACIG00000007178	-	70	46.569
ENSACIG00000022370	-	73	47.059	ENSACIG00000014646	zgc:113625	80	47.059
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ENSACIG00000022370	-	81	52.361	ENSACIG00000012648	-	73	54.167
ENSACIG00000022370	-	57	51.235	ENSACIG00000022374	-	83	51.235
ENSACIG00000022370	-	81	47.807	ENSACIG00000022222	-	69	49.074
ENSACIG00000022370	-	96	50.676	ENSACIG00000007494	-	88	53.903
ENSACIG00000022370	-	79	52.000	ENSACIG00000002950	-	58	52.074
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ENSACIG00000022370	-	83	50.633	ENSACIG00000005780	-	66	52.074
ENSACIG00000022370	-	78	41.146	ENSACIG00000005573	-	91	41.146
ENSACIG00000022370	-	75	43.128	ENSACIG00000016502	-	91	43.128

Orthologs

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ENSACIG00000022370	-	75	50.481	ENSAPOG00000020897	-	79	50.718	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022370	-	95	59.176	ENSAPOG00000008063	-	82	60.236	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022370	-	72	45.545	ENSAPOG00000007322	-	69	46.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022370	-	70	51.269	ENSAPOG00000022240	-	57	51.269	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022370	-	90	59.289	ENSAPOG00000021159	-	81	59.600	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022370	-	74	52.657	ENSAPOG00000006169	-	59	52.857	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022370	-	74	52.657	ENSAPOG00000006488	-	83	52.113	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022370	-	72	47.087	ENSAPOG00000014243	-	85	47.087	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022370	-	74	48.095	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	74	48.095	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022370	-	73	51.724	ENSAPOG00000011509	-	72	51.196	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022370	-	66	56.216	ENSAPOG00000001262	-	89	56.216	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022370	-	84	43.233	ENSAPOG00000001268	-	51	49.282	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022370	-	82	64.783	ENSAPOG00000012716	-	86	61.417	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022370	-	78	41.364	ENSAPOG00000001315	-	65	42.180	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022370	-	96	44.262	ENSAPOG00000014759	-	96	42.808	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022370	-	72	49.505	ENSAPOG00000007333	-	62	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000022370	-	71	44.059	ENSAOCG00000012651	-	86	44.390	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022370	-	86	45.522	ENSAOCG00000021905	-	89	42.857	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022370	-	84	50.427	ENSAOCG00000008522	-	72	52.294	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022370	-	85	56.118	ENSAOCG00000014702	-	69	59.330	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022370	-	81	50.000	ENSAOCG00000023240	-	78	51.905	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022370	-	92	43.910	ENSAOCG00000008525	-	62	54.502	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022370	-	77	43.519	ENSAOCG00000011794	-	65	43.519	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022370	-	69	55.959	ENSAOCG00000001993	-	81	53.810	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022370	-	72	50.000	ENSAOCG00000011155	-	62	50.472	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022370	-	86	45.489	ENSAPEG00000015763	-	88	42.808	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022370	-	69	56.477	ENSAPEG00000016554	-	80	54.286	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022370	-	93	42.537	ENSAPEG00000012191	-	70	48.058	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022370	-	99	52.482	ENSAPEG00000003884	-	72	58.108	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000022370	-	96	53.873	ENSAPEG00000022382	-	86	55.512	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000022370	-	91	57.812	ENSAPEG00000022374	-	86	57.600	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022370	-	75	52.857	ENSAPEG00000004217	-	72	52.857	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022370	-	72	44.554	ENSAPEG00000012179	-	69	45.000	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000022370	-	72	48.515	ENSATEG00000017198	-	67	49.246	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022370	-	72	49.261	ENSATEG00000017193	-	61	49.528	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022370	-	82	51.765	ENSATEG00000014013	si:ch211-113e8.5	84	50.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022370	-	83	53.247	ENSATEG00000019003	-	81	54.930	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022370	-	91	37.884	ENSATEG00000005844	-	63	44.076	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022370	-	97	58.484	ENSATEG00000013008	-	89	58.366	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022370	-	72	45.500	ENSATEG00000020431	zgc:113625	79	45.500	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022370	-	72	47.761	ENSATEG00000020391	-	83	47.761	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022370	-	68	57.292	ENSATEG00000016536	-	58	57.292	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022370	-	87	58.025	ENSATEG00000014085	-	83	58.025	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022370	-	71	48.000	ENSATEG00000017202	-	58	46.296	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022370	-	70	50.505	ENSACLG00000021976	-	63	50.233	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000022370	-	71	47.739	ENSACLG00000023555	-	84	47.739	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000022370	-	74	44.928	ENSACLG00000023747	-	87	44.928	Astatotilapia_calliptera
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