EuRBPDB

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022381 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3658 bases
Position: chrCCOE01000908.1:2461172-2464829
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028893	MMR_HSR1	PF01926.23	2.9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029660	-	624	-	ENSACIP00000028893	207 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000022381	-	96	33.493	ENSACIG00000023837	-	96	33.493
ENSACIG00000022381	-	100	32.420	ENSACIG00000009306	RAB15	100	32.420
ENSACIG00000022381	-	85	40.113	ENSACIG00000019251	rab5aa	80	40.113
ENSACIG00000022381	-	81	39.286	ENSACIG00000019049	rab1ab	80	41.071
ENSACIG00000022381	-	80	34.731	ENSACIG00000009139	dnajc27	61	34.731
ENSACIG00000022381	-	72	39.744	ENSACIG00000013119	-	75	38.462
ENSACIG00000022381	-	59	38.525	ENSACIG00000008620	rab34a	53	38.525
ENSACIG00000022381	-	78	31.902	ENSACIG00000004859	rab34b	66	31.928
ENSACIG00000022381	-	82	30.409	ENSACIG00000008211	rasd4	80	30.409
ENSACIG00000022381	-	76	39.873	ENSACIG00000003157	-	81	39.873
ENSACIG00000022381	-	96	35.961	ENSACIG00000014605	rab6a	94	35.961
ENSACIG00000022381	-	79	40.854	ENSACIG00000014012	rab22a	82	40.854
ENSACIG00000022381	-	79	34.337	ENSACIG00000003102	rab42a	74	34.337
ENSACIG00000022381	-	85	43.182	ENSACIG00000010896	rab5c	79	43.182
ENSACIG00000022381	-	96	36.500	ENSACIG00000014094	rab6bb	94	36.500
ENSACIG00000022381	-	84	34.286	ENSACIG00000010619	rab15	80	34.286
ENSACIG00000022381	-	95	36.041	ENSACIG00000014625	-	90	36.041
ENSACIG00000022381	-	79	38.095	ENSACIG00000022520	rab33a	73	38.095
ENSACIG00000022381	-	78	39.877	ENSACIG00000017403	rab11al	73	39.877
ENSACIG00000022381	-	82	31.176	ENSACIG00000006211	-	80	31.176
ENSACIG00000022381	-	62	33.077	ENSACIG00000015128	si:ch73-116o1.2	66	34.752
ENSACIG00000022381	-	92	30.198	ENSACIG00000018406	rasl11a	73	30.198
ENSACIG00000022381	-	96	36.000	ENSACIG00000010914	RAB41	92	36.000
ENSACIG00000022381	-	85	52.000	ENSACIG00000006558	-	87	52.000
ENSACIG00000022381	-	92	33.333	ENSACIG00000019803	rab25a	88	33.333
ENSACIG00000022381	-	66	38.406	ENSACIG00000019631	rab11bb	70	38.406
ENSACIG00000022381	-	99	52.683	ENSACIG00000007739	rab9b	99	52.683
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSACIG00000013630	RAB7A	100	95.169
ENSACIG00000022381	-	71	35.374	ENSACIG00000017824	rras	78	35.849
ENSACIG00000022381	-	100	90.338	ENSACIG00000022208	-	100	90.338
ENSACIG00000022381	-	81	37.126	ENSACIG00000008102	rab18b	80	37.126
ENSACIG00000022381	-	73	33.775	ENSACIG00000000699	hrasb	83	34.568
ENSACIG00000022381	-	98	49.268	ENSACIG00000018043	rab9a	99	49.268
ENSACIG00000022381	-	82	36.612	ENSACIG00000021855	rab33ba	75	36.612
ENSACIG00000022381	-	79	33.939	ENSACIG00000006949	RAB17	70	33.939
ENSACIG00000022381	-	89	37.696	ENSACIG00000021459	zgc:101559	81	37.696
ENSACIG00000022381	-	80	39.157	ENSACIG00000023222	-	70	39.157
ENSACIG00000022381	-	79	33.537	ENSACIG00000000100	kras	55	33.889
ENSACIG00000022381	-	96	34.123	ENSACIG00000009006	zgc:171927	97	34.123
ENSACIG00000022381	-	78	41.718	ENSACIG00000003092	rab11a	73	41.718
ENSACIG00000022381	-	76	34.810	ENSACIG00000020496	rab23	83	35.260
ENSACIG00000022381	-	81	31.737	ENSACIG00000009617	rab18a	77	31.737
ENSACIG00000022381	-	97	35.149	ENSACIG00000017414	rab25b	94	35.149
ENSACIG00000022381	-	81	37.278	ENSACIG00000020616	rab12	68	37.278
ENSACIG00000022381	-	93	34.359	ENSACIG00000000642	rab36	73	34.359
ENSACIG00000022381	-	78	39.877	ENSACIG00000024376	-	72	39.877
ENSACIG00000022381	-	89	38.172	ENSACIG00000024374	rab11ba	74	38.172
ENSACIG00000022381	-	96	32.057	ENSACIG00000000154	RAB39B	96	32.057
ENSACIG00000022381	-	87	33.871	ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	82	33.871
ENSACIG00000022381	-	81	31.737	ENSACIG00000000670	rabl2	72	31.737
ENSACIG00000022381	-	58	31.008	ENSACIG00000009740	arfrp1	60	31.008
ENSACIG00000022381	-	78	38.037	ENSACIG00000007154	rab6ba	74	38.037
ENSACIG00000022381	-	100	50.000	ENSACIG00000011024	si:dkey-13a21.4	100	50.000
ENSACIG00000022381	-	93	35.938	ENSACIG00000008584	rab13	90	35.938

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSG00000075785	RAB7A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSACIG00000022381	-	100	96.618	ENSAPOG00000016091	-	100	96.618	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022381	-	100	95.652	ENSAPOG00000002585	RAB7A	100	95.652	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSAMEG00000015249	RAB7A	100	95.169	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000022381	-	100	95.652	ENSAOCG00000005772	RAB7A	100	95.652	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022381	-	100	96.618	ENSAOCG00000008820	-	100	96.618	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022381	-	100	95.652	ENSAPEG00000000306	RAB7A	100	95.652	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022381	-	100	96.618	ENSAPEG00000017200	RAB7A	100	96.618	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022381	-	100	96.618	ENSATEG00000002860	RAB7A	100	96.618	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022381	-	100	95.652	ENSATEG00000017237	RAB7A	100	95.652	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022381	-	85	98.870	ENSAPLG00000004323	RAB7A	100	98.870	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000022381	-	100	95.652	ENSACAG00000005993	RAB7A	100	95.652	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSANAG00000029692	RAB7A	100	95.169	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000022381	-	100	78.095	ENSACLG00000024456	-	100	78.095	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022381	-	100	95.652	ENSACLG00000018847	RAB7A	100	95.652	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022381	-	100	99.034	ENSACLG00000024502	-	100	99.034	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022381	-	100	91.304	ENSAMXG00000031957	zgc:100918	100	91.304	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022381	-	100	93.237	ENSAMXG00000002254	-	100	93.237	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022381	-	100	96.135	ENSAMXG00000032027	rab7a	100	96.135	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSBTAG00000010193	RAB7A	100	95.169	Bos_taurus
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSCJAG00000017521	RAB7A	100	95.169	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSCAFG00000004157	RAB7A	100	95.169	Canis_familiaris
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSCAFG00020004847	RAB7A	100	95.169	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSCHIG00000001138	RAB7A	100	95.169	Capra_hircus
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSTSYG00000002313	RAB7A	100	95.169	Carlito_syrichta
ENSACIG00000022381	-	100	95.652	ENSCAPG00000010881	RAB7A	100	95.652	Cavia_aperea
ENSACIG00000022381	-	100	95.652	ENSCPOG00000034570	RAB7A	100	95.652	Cavia_porcellus
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSCCAG00000036322	RAB7A	100	95.169	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022381	-	100	72.947	ENSCLAG00000006333	RAB7A	100	72.947	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSCSAG00000008628	RAB7A	100	95.169	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000022381	-	85	98.864	ENSCHOG00000000365	RAB7A	100	98.864	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSCPBG00000014343	RAB7A	100	95.169	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000022381	-	100	83.092	ENSCING00000007769	-	100	83.092	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000022381	-	100	82.126	ENSCSAVG00000011162	-	100	82.126	Ciona_savignyi
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSCANG00000041683	RAB7A	100	95.169	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSCGRG00001021807	Rab7	100	95.169	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSCGRG00000011649	Rab7	100	95.169	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000022381	-	100	95.652	ENSCSEG00000005357	-	100	95.652	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000022381	-	100	91.787	ENSCSEG00000002970	RAB7A	93	91.787	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSCVAG00000000281	RAB7A	100	95.169	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022381	-	100	96.618	ENSCVAG00000005429	-	100	96.618	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022381	-	100	91.304	ENSDARG00000087243	zgc:100918	100	91.304	Danio_rerio
ENSACIG00000022381	-	100	89.372	ENSDARG00000021287	rab7b	100	89.372	Danio_rerio
ENSACIG00000022381	-	100	96.135	ENSDARG00000020497	rab7a	100	96.135	Danio_rerio
ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSDORG00000027671	-	100	95.169	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000022381	-	100	77.778	FBgn0015795	Rab7	100	77.778	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000022381	-	100	75.362	ENSEBUG00000003339	-	100	75.362	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000022381	-	100	94.686	ENSEASG00005006800	RAB7A	100	94.686	Equus_asinus_asinus
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ENSACIG00000022381	-	100	90.338	ENSELUG00000000175	zgc:100918	100	90.338	Esox_lucius
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ENSACIG00000022381	-	100	95.652	ENSFDAG00000008524	RAB7A	100	95.652	Fukomys_damarensis
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ENSACIG00000022381	-	100	95.652	ENSFHEG00000005588	RAB7A	88	95.652	Fundulus_heteroclitus
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ENSACIG00000022381	-	100	96.618	ENSGMOG00000007712	RAB7A	99	96.618	Gadus_morhua
ENSACIG00000022381	-	100	95.652	ENSGALG00000005902	RAB7A	100	95.652	Gallus_gallus
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ENSACIG00000022381	-	100	96.618	ENSGAFG00000021688	-	100	96.618	Gambusia_affinis
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ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSGAGG00000012234	RAB7A	100	95.169	Gopherus_agassizii
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ENSACIG00000022381	-	100	95.652	ENSHBUG00000010852	RAB7A	100	95.652	Haplochromis_burtoni
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ENSACIG00000022381	-	100	95.652	ENSHCOG00000016322	RAB7A	100	95.652	Hippocampus_comes
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ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSMUSG00000079477	Rab7	100	100.000	Mus_musculus
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ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSOCUG00000001645	RAB7A	100	95.169	Oryctolagus_cuniculus
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ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSORLG00015006820	-	100	95.169	Oryzias_latipes_hsok
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ENSACIG00000022381	-	100	95.169	ENSOGAG00000007885	RAB7A	100	95.169	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000022381	-	100	95.652	ENSOARG00000004002	RAB7A	100	95.652	Ovis_aries
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ENSACIG00000022381	-	100	90.821	ENSPNAG00000020583	zgc:100918	100	90.821	Pygocentrus_nattereri
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ENSACIG00000022381	-	100	96.135	ENSSFOG00015020012	rab7a	100	96.135	Scleropages_formosus
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ENSACIG00000022381	-	100	93.720	ENSXETG00000016176	rab7a	100	93.720	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000022381	-	100	96.618	ENSXCOG00000019921	rab7a	100	96.618	Xiphophorus_couchianus
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ENSACIG00000022381	-	100	94.686	ENSXMAG00000023285	RAB7A	100	94.686	Xiphophorus_maculatus