EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022407 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: eefsec
Alias: zgc:123265
Full Name: eukaryotic elongation factor%2C selenocysteine-tRNA-specific
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9922 bases
Position: chrCCOE01000908.1:2562210-2572131
Accession: ZDB-GENE-051120-72
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028933	GTP_EFTU	PF00009.27	5.1e-30	1	1
ENSACIP00000028933	MMR_HSR1	PF01926.23	7.9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029700	-	1095	-	ENSACIP00000028933	364 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000022407's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000022407's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022407	eefsec	99	65.480	ENSG00000132394	EEFSEC	65	65.836	Homo_sapiens
ENSACIG00000022407	eefsec	99	97.233	ENSAPOG00000015931	eefsec	64	97.233	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	96.838	ENSAOCG00000008603	eefsec	64	96.838	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022407	eefsec	99	97.233	ENSAPEG00000017090	eefsec	62	97.233	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022407	eefsec	99	94.862	ENSATEG00000002753	eefsec	65	90.977	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022407	eefsec	58	76.364	ENSAPLG00000006745	EEFSEC	52	76.364	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.769	ENSANAG00000032691	EEFSEC	65	64.769	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000022407	eefsec	99	97.628	ENSACLG00000024565	eefsec	98	95.041	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022407	eefsec	99	82.869	ENSAMXG00000002260	eefsec	62	83.534	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	69.412	ENSBTAG00000030962	EEFSEC	99	66.667	Bos_taurus
ENSACIG00000022407	eefsec	87	38.956	WBGene00008133	efsc-1	55	43.137	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.413	ENSCJAG00000005387	EEFSEC	65	64.413	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.211	ENSCAFG00000004135	EEFSEC	52	64.211	Canis_familiaris
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.211	ENSCAFG00020004811	EEFSEC	65	64.211	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000022407	eefsec	99	68.627	ENSCHIG00000021838	EEFSEC	63	68.898	Capra_hircus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	65.125	ENSTSYG00000012922	EEFSEC	65	65.125	Carlito_syrichta
ENSACIG00000022407	eefsec	74	60.345	ENSCAPG00000000084	EEFSEC	54	60.000	Cavia_aperea
ENSACIG00000022407	eefsec	99	66.176	ENSCPOG00000024352	EEFSEC	99	70.896	Cavia_porcellus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.664	ENSCCAG00000031336	EEFSEC	65	64.664	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.664	ENSCATG00000019414	EEFSEC	65	64.664	Cercocebus_atys
ENSACIG00000022407	eefsec	99	66.176	ENSCLAG00000006973	EEFSEC	99	70.896	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.311	ENSCSAG00000008599	EEFSEC	65	64.311	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	69.613	ENSCPBG00000014356	EEFSEC	82	69.890	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000022407	eefsec	99	66.165	ENSCSAVG00000002208	-	83	55.212	Ciona_savignyi
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.413	ENSCANG00000031492	EEFSEC	64	64.769	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	66.790	ENSCGRG00001018089	Eefsec	64	66.790	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000022407	eefsec	98	66.418	ENSCGRG00000010063	Eefsec	98	71.591	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000022407	eefsec	99	93.676	ENSCSEG00000003008	eefsec	99	89.011	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000022407	eefsec	99	93.281	ENSCVAG00000005381	eefsec	65	89.474	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	84.861	ENSDARG00000004696	eefsec	63	84.861	Danio_rerio
ENSACIG00000022407	eefsec	99	65.704	ENSDNOG00000008925	EEFSEC	82	66.065	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000022407	eefsec	60	67.619	ENSDORG00000000264	Eefsec	84	47.393	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000022407	eefsec	84	58.704	FBgn0034627	eEFSec	57	58.704	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000022407	eefsec	91	63.571	ENSETEG00000007406	EEFSEC	51	72.222	Echinops_telfairi
ENSACIG00000022407	eefsec	55	73.469	ENSEBUG00000015029	eefsec	54	66.667	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.643	ENSEASG00005006786	EEFSEC	65	64.643	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.643	ENSECAG00000016565	EEFSEC	56	75.806	Equus_caballus
ENSACIG00000022407	eefsec	100	78.832	ENSELUG00000016632	eefsec	63	79.705	Esox_lucius
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.664	ENSFCAG00000006153	EEFSEC	65	65.371	Felis_catus
ENSACIG00000022407	eefsec	74	67.416	ENSFALG00000007901	EEFSEC	58	67.416	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000022407	eefsec	74	63.483	ENSFDAG00000010243	EEFSEC	87	70.142	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000022407	eefsec	99	94.071	ENSFHEG00000007155	eefsec	69	90.226	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	78.571	ENSGMOG00000007705	eefsec	66	78.571	Gadus_morhua
ENSACIG00000022407	eefsec	99	69.004	ENSGALG00000038684	EEFSEC	55	80.769	Gallus_gallus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	94.862	ENSGAFG00000021692	eefsec	65	90.977	Gambusia_affinis
ENSACIG00000022407	eefsec	99	92.829	ENSGACG00000000793	eefsec	65	89.015	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	67.897	ENSGAGG00000002059	EEFSEC	55	84.615	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000022407	eefsec	79	67.337	ENSGGOG00000001445	EEFSEC	58	67.337	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000022407	eefsec	99	97.628	ENSHBUG00000008917	eefsec	65	97.628	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022407	eefsec	99	66.544	ENSHGLG00000000094	EEFSEC	99	65.152	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022407	eefsec	98	66.544	ENSHGLG00100011393	EEFSEC	60	66.544	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022407	eefsec	99	87.218	ENSHCOG00000004193	eefsec	66	87.218	Hippocampus_comes
ENSACIG00000022407	eefsec	99	79.545	ENSIPUG00000017291	eefsec	60	86.538	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000022407	eefsec	74	64.607	ENSSTOG00000019802	EEFSEC	87	70.142	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000022407	eefsec	73	71.161	ENSJJAG00000020703	-	99	71.161	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	94.466	ENSKMAG00000019907	eefsec	63	94.466	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	94.071	ENSLBEG00000017908	eefsec	63	94.071	Labrus_bergylta
ENSACIG00000022407	eefsec	77	81.395	ENSLACG00000013137	EEFSEC	55	81.395	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000022407	eefsec	99	78.309	ENSLOCG00000014535	eefsec	64	78.309	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	63.370	ENSLAFG00000001997	EEFSEC	64	63.370	Loxodonta_africana
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.664	ENSMFAG00000042128	EEFSEC	65	64.664	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000022407	eefsec	72	61.628	ENSMMUG00000018663	EEFSEC	57	61.628	Macaca_mulatta
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.664	ENSMNEG00000028574	EEFSEC	65	64.664	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000022407	eefsec	75	62.842	ENSMLEG00000041771	EEFSEC	54	62.842	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000022407	eefsec	100	91.758	ENSMAMG00000023964	eefsec	100	92.033	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	95.041	ENSMZEG00005009380	eefsec	98	95.041	Maylandia_zebra
ENSACIG00000022407	eefsec	83	79.630	ENSMAUG00000011197	Eefsec	99	71.536	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	66.421	ENSMOCG00000017748	Eefsec	99	71.111	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000022407	eefsec	99	91.160	ENSMMOG00000021820	eefsec	99	91.160	Mola_mola
ENSACIG00000022407	eefsec	83	76.364	ENSMODG00000008034	EEFSEC	50	76.364	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000022407	eefsec	96	95.257	ENSMALG00000016211	eefsec	63	91.353	Monopterus_albus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	66.423	MGP_CAROLIEiJ_G0028627	Eefsec	99	71.481	Mus_caroli
ENSACIG00000022407	eefsec	99	66.423	ENSMUSG00000033216	Eefsec	99	71.481	Mus_musculus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	66.423	MGP_PahariEiJ_G0022366	Eefsec	99	71.481	Mus_pahari
ENSACIG00000022407	eefsec	99	66.423	MGP_SPRETEiJ_G0029640	Eefsec	99	71.481	Mus_spretus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.413	ENSMPUG00000017340	EEFSEC	62	64.769	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000022407	eefsec	75	62.069	ENSMLUG00000004261	EEFSEC	58	61.538	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000022407	eefsec	73	71.111	ENSNGAG00000023278	-	99	71.111	Nannospalax_galili
ENSACIG00000022407	eefsec	99	97.628	ENSNBRG00000002387	eefsec	98	95.592	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.769	ENSNLEG00000014303	EEFSEC	65	65.125	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000022407	eefsec	74	63.483	ENSMEUG00000005747	EEFSEC	58	63.483	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000022407	eefsec	99	65.818	ENSOPRG00000011276	EEFSEC	64	65.818	Ochotona_princeps
ENSACIG00000022407	eefsec	99	66.176	ENSODEG00000002928	EEFSEC	99	70.896	Octodon_degus
ENSACIG00000022407	eefsec	72	99.342	ENSONIG00000019038	eefsec	56	99.342	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000022407	eefsec	72	67.544	ENSOANG00000009108	EEFSEC	58	67.544	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	66.545	ENSOCUG00000016517	EEFSEC	70	66.545	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	90.514	ENSORLG00000001377	eefsec	99	89.532	Oryzias_latipes
ENSACIG00000022407	eefsec	99	90.514	ENSORLG00020000729	eefsec	99	89.256	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000022407	eefsec	99	90.514	ENSORLG00015001986	eefsec	65	86.842	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000022407	eefsec	74	81.395	ENSOMEG00000010071	eefsec	52	80.114	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000022407	eefsec	59	80.769	ENSOGAG00000014084	EEFSEC	50	80.769	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000022407	eefsec	99	65.125	ENSPPAG00000030936	EEFSEC	65	65.480	Pan_paniscus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	65.480	ENSPPRG00000002846	EEFSEC	65	65.480	Panthera_pardus
ENSACIG00000022407	eefsec	77	61.224	ENSPTIG00000013855	EEFSEC	54	61.224	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000022407	eefsec	99	65.125	ENSPTRG00000015353	EEFSEC	65	65.480	Pan_troglodytes
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.664	ENSPANG00000017041	EEFSEC	65	64.664	Papio_anubis
ENSACIG00000022407	eefsec	99	84.861	ENSPKIG00000005220	eefsec	97	80.663	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000022407	eefsec	82	82.692	ENSPSIG00000015135	EEFSEC	58	82.692	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000022407	eefsec	99	88.346	ENSPMGG00000020300	eefsec	66	88.346	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	66.790	ENSPEMG00000013677	Eefsec	99	71.910	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000022407	eefsec	84	73.432	ENSPMAG00000006779	eefsec	60	73.432	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000022407	eefsec	72	62.791	ENSPCIG00000020494	EEFSEC	58	62.791	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	93.281	ENSPFOG00000003748	eefsec	65	89.474	Poecilia_formosa
ENSACIG00000022407	eefsec	99	93.281	ENSPLAG00000018012	eefsec	65	89.474	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000022407	eefsec	99	93.281	ENSPMEG00000001202	eefsec	65	89.474	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000022407	eefsec	99	93.676	ENSPREG00000012235	eefsec	65	89.850	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.413	ENSPPYG00000013436	EEFSEC	65	64.769	Pongo_abelii
ENSACIG00000022407	eefsec	72	80.769	ENSPCAG00000005883	EEFSEC	51	80.769	Procavia_capensis
ENSACIG00000022407	eefsec	99	68.359	ENSPCOG00000023432	EEFSEC	63	68.359	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000022407	eefsec	99	67.181	ENSPVAG00000007070	EEFSEC	63	67.181	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	97.619	ENSPNYG00000005726	eefsec	98	95.041	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000022407	eefsec	99	78.788	ENSPNAG00000016724	eefsec	65	78.788	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000022407	eefsec	99	67.302	ENSRNOG00000012954	Eefsec	99	67.213	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.769	ENSRBIG00000032635	EEFSEC	65	65.125	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000022407	eefsec	69	70.120	ENSRROG00000030260	-	83	69.841	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000022407	eefsec	72	61.628	ENSSBOG00000031478	EEFSEC	57	61.628	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000022407	eefsec	72	63.793	ENSSHAG00000014760	EEFSEC	58	63.793	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000022407	eefsec	99	84.127	ENSSFOG00015021109	eefsec	67	84.127	Scleropages_formosus
ENSACIG00000022407	eefsec	100	93.281	ENSSMAG00000001454	eefsec	65	89.139	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	94.466	ENSSDUG00000007924	eefsec	99	92.068	Seriola_dumerili
ENSACIG00000022407	eefsec	96	94.071	ENSSLDG00000024985	eefsec	63	90.226	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000022407	eefsec	72	66.279	ENSSPUG00000004191	EEFSEC	57	66.279	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	96.443	ENSSPAG00000001320	eefsec	100	94.780	Stegastes_partitus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	71.146	ENSSSCG00000011619	EEFSEC	99	68.033	Sus_scrofa
ENSACIG00000022407	eefsec	100	71.654	ENSTGUG00000007895	EEFSEC	63	71.654	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000022407	eefsec	99	96.414	ENSTRUG00000010327	eefsec	63	96.414	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000022407	eefsec	99	93.625	ENSTNIG00000003225	eefsec	62	93.625	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000022407	eefsec	99	68.627	ENSTTRG00000000994	EEFSEC	62	68.627	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	65.480	ENSUAMG00000017283	EEFSEC	65	65.480	Ursus_americanus
ENSACIG00000022407	eefsec	74	70.111	ENSXETG00000002066	eefsec	55	70.111	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000022407	eefsec	99	94.071	ENSXCOG00000019916	eefsec	65	90.226	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000022407	eefsec	99	94.466	ENSXMAG00000001839	eefsec	65	90.602	Xiphophorus_maculatus