EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022595 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10717 bases
Position: chrCCOE01001927.1:29465-40181
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000029183	Endonuclease_NS	PF01223.23	1.1e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029957	-	756	-	ENSACIP00000029183	251 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000022595	-	86	36.522	ENSACIG00000015751	-	78	36.522
ENSACIG00000022595	-	82	34.529	ENSACIG00000008317	-	73	34.529
ENSACIG00000022595	-	67	39.080	ENSACIG00000006055	-	53	39.080
ENSACIG00000022595	-	88	38.075	ENSACIG00000008299	-	76	38.075
ENSACIG00000022595	-	75	38.350	ENSACIG00000009432	-	75	38.350
ENSACIG00000022595	-	67	37.079	ENSACIG00000012712	-	54	37.079
ENSACIG00000022595	-	88	37.288	ENSACIG00000014265	-	76	37.288
ENSACIG00000022595	-	81	34.632	ENSACIG00000022024	si:dkey-85k7.11	72	34.632
ENSACIG00000022595	-	76	34.673	ENSACIG00000023171	-	64	34.673
ENSACIG00000022595	-	69	36.667	ENSACIG00000022027	-	77	34.483
ENSACIG00000022595	-	84	47.248	ENSACIG00000016021	si:dkey-243k1.3	81	47.248
ENSACIG00000022595	-	82	32.579	ENSACIG00000007813	-	71	33.484
ENSACIG00000022595	-	88	37.815	ENSACIG00000001431	-	81	37.815

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022595	-	88	33.898	ENSAPOG00000010299	-	78	33.898	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022595	-	87	32.314	ENSAPOG00000013654	-	69	32.314	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022595	-	67	39.429	ENSAPOG00000022205	-	53	39.429	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022595	-	88	36.441	ENSAPOG00000008291	-	77	36.441	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022595	-	83	32.000	ENSAPOG00000023293	-	73	32.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022595	-	88	35.714	ENSAPOG00000008666	-	77	35.714	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022595	-	67	33.708	ENSAPOG00000012244	-	54	33.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022595	-	69	33.152	ENSAPOG00000022923	-	62	30.846	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022595	-	80	33.482	ENSAPOG00000010331	si:dkey-85k7.11	74	33.482	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022595	-	84	41.935	ENSAPOG00000006928	si:dkey-243k1.3	73	41.935	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022595	-	66	41.011	ENSAPOG00000022953	-	52	41.011	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022595	-	76	34.300	ENSAOCG00000007227	-	67	34.300	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022595	-	86	31.466	ENSAOCG00000008016	si:ch211-133n4.4	68	31.466	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022595	-	71	38.043	ENSAOCG00000000850	-	56	38.043	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022595	-	86	47.297	ENSAOCG00000015199	-	78	47.297	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022595	-	88	34.874	ENSAOCG00000013137	-	77	34.874	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022595	-	86	37.553	ENSAOCG00000021283	si:dkey-85k7.10	77	37.553	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022595	-	80	34.389	ENSAOCG00000021316	si:dkey-85k7.11	71	34.389	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022595	-	88	36.864	ENSAOCG00000005015	-	76	36.864	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022595	-	86	46.154	ENSAOCG00000002456	si:dkey-243k1.3	78	46.154	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022595	-	88	36.017	ENSAOCG00000021294	-	76	36.017	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022595	-	88	35.169	ENSAPEG00000018878	-	78	35.169	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022595	-	71	38.043	ENSAPEG00000018986	-	56	38.043	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022595	-	88	36.864	ENSAPEG00000008708	-	76	36.864	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022595	-	86	48.649	ENSAPEG00000024402	-	78	48.649	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022595	-	86	46.154	ENSAPEG00000024409	si:dkey-243k1.3	80	46.154	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022595	-	88	34.874	ENSAPEG00000007291	-	77	34.874	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022595	-	75	32.512	ENSAPEG00000023828	-	67	32.512	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022595	-	71	37.500	ENSAPEG00000012445	-	56	37.500	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022595	-	80	33.937	ENSAPEG00000018889	si:dkey-85k7.11	78	33.937	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022595	-	83	32.444	ENSAPEG00000013928	-	73	32.444	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022595	-	86	37.553	ENSAPEG00000018856	si:dkey-85k7.10	77	37.553	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022595	-	75	33.500	ENSATEG00000014542	-	56	34.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	87	34.583	ENSATEG00000014573	-	68	34.583	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	74	34.031	ENSATEG00000014484	-	55	34.031	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	85	31.667	ENSATEG00000014635	-	69	31.667	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	81	37.156	ENSATEG00000019243	-	71	37.156	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	76	36.765	ENSATEG00000014526	-	54	36.765	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	80	34.562	ENSATEG00000014520	-	58	34.562	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	80	34.842	ENSATEG00000017500	si:dkey-85k7.11	69	34.842	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	81	33.796	ENSATEG00000014589	-	66	33.796	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	82	32.273	ENSATEG00000014621	-	73	32.273	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	88	35.443	ENSATEG00000017521	-	78	35.443	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	73	35.233	ENSATEG00000009957	-	61	35.233	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	72	37.374	ENSATEG00000014672	-	65	37.374	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	84	49.541	ENSATEG00000022068	si:dkey-243k1.3	76	49.541	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	67	41.714	ENSATEG00000011941	-	54	41.714	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	88	37.553	ENSATEG00000008791	-	75	37.553	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	80	36.744	ENSATEG00000014512	-	54	36.744	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	80	36.150	ENSATEG00000014514	-	59	36.150	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	82	35.484	ENSATEG00000014652	-	73	35.484	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022595	-	81	39.130	ENSAPLG00000004064	-	73	39.130	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000022595	-	87	38.914	ENSACAG00000005411	-	78	38.914	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000022595	-	81	39.024	ENSACAG00000005752	-	73	39.024	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000022595	-	81	35.945	ENSACLG00000018928	-	74	35.945	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022595	-	73	36.269	ENSACLG00000021771	-	57	36.269	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022595	-	80	36.866	ENSACLG00000018957	si:dkey-85k7.11	69	36.866	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022595	-	85	35.808	ENSACLG00000001104	-	77	35.808	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022595	-	81	39.091	ENSACLG00000026586	-	71	39.091	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022595	-	68	37.569	ENSACLG00000017744	-	59	37.569	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022595	-	88	36.441	ENSACLG00000008439	-	76	36.441	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022595	-	86	39.331	ENSACLG00000018914	si:dkey-85k7.10	77	39.331	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022595	-	67	40.571	ENSACLG00000013353	-	54	40.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022595	-	75	34.171	ENSACLG00000017798	-	60	34.171	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022595	-	75	32.828	ENSACLG00000017724	-	63	32.828	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022595	-	84	48.624	ENSACLG00000011404	si:dkey-243k1.3	77	48.624	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022595	-	91	56.667	ENSACLG00000016915	-	80	56.667	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022595	-	81	48.804	ENSAMXG00000007611	si:dkey-243k1.3	73	48.804	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	88	37.657	ENSAMXG00000003411	-	77	37.657	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	87	35.983	ENSAMXG00000019995	zgc:172339	77	35.983	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	88	37.288	ENSAMXG00000019998	-	76	37.288	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	67	36.464	ENSAMXG00000019466	-	57	36.464	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	62	32.903	ENSAMXG00000043591	-	55	32.903	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	75	34.804	ENSAMXG00000036403	-	67	34.314	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	86	36.820	ENSAMXG00000037726	si:dkey-85k7.10	78	36.820	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	75	31.707	ENSAMXG00000029128	-	64	32.487	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	78	32.558	ENSAMXG00000035215	-	72	32.558	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	81	34.951	ENSAMXG00000040929	-	71	34.951	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	82	32.273	ENSAMXG00000040926	-	73	32.273	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	89	31.197	ENSAMXG00000030013	-	90	31.197	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	75	35.266	ENSAMXG00000040657	-	71	35.266	Astyanax_mexicanus
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ENSACIG00000022595	-	73	33.000	ENSAMXG00000010981	-	66	33.000	Astyanax_mexicanus
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ENSACIG00000022595	-	86	37.288	ENSAMXG00000032585	-	80	37.288	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	74	35.938	ENSAMXG00000038214	-	60	35.938	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	66	32.203	ENSAMXG00000037387	-	55	32.203	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	75	30.476	ENSAMXG00000034695	-	70	30.476	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022595	-	76	43.523	ENSCPBG00000019841	-	78	41.176	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000022595	-	76	32.524	ENSCSEG00000002613	-	64	32.524	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000022595	-	67	39.306	ENSCSEG00000006632	-	53	39.306	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000022595	-	82	34.842	ENSCVAG00000016710	-	72	34.842	Cyprinodon_variegatus
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