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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022614 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: dkc1
Alias: fc87a02|fi24a05|fv62a07|wu:fa28f10|wu:fc87a02|wu:fi24a05|wu:fv62a07|zgc:110395
Full Name: dyskeratosis congenita 1%2C dyskerin
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3923 bases
Position: chrCCOE01000401.1:7139-11061
Accession: ZDB-GENE-031118-120
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000029244	TruB_N	PF01509.18	9.1e-22	1	1
ENSACIP00000029217	TruB_N	PF01509.18	9.1e-14	1	1
ENSACIP00000029244	PUA	PF01472.20	1.2e-16	1	1
ENSACIP00000029217	DKCLD	PF08068.12	2.8e-31	1	1
ENSACIP00000029244	DKCLD	PF08068.12	7.1e-31	1	1
ENSACIP00000029253	DKCLD	PF08068.12	5.3e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029991	-	495	-	ENSACIP00000029217	164 (aa)	-	-
ENSACIT00000030019	-	1443	-	ENSACIP00000029244	480 (aa)	-	-
ENSACIT00000030028	-	429	-	ENSACIP00000029253	142 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022614	dkc1	89	82.284	ENSG00000130826	DKC1	99	88.835	Homo_sapiens
ENSACIG00000022614	dkc1	94	89.218	ENSAPOG00000007799	dkc1	92	89.339	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022614	dkc1	89	82.517	ENSAMEG00000002776	DKC1	88	79.955	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000022614	dkc1	94	90.171	ENSAOCG00000013159	dkc1	95	90.171	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022614	dkc1	94	90.171	ENSAPEG00000002284	dkc1	95	90.171	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022614	dkc1	94	86.929	ENSATEG00000013682	dkc1	97	86.089	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022614	dkc1	87	83.095	ENSACAG00000015600	DKC1	76	79.592	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000022614	dkc1	89	82.751	ENSANAG00000022732	DKC1	91	77.872	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000022614	dkc1	98	89.463	ENSACLG00000015605	dkc1	98	89.463	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022614	dkc1	94	85.333	ENSAMXG00000017108	dkc1	85	89.227	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022614	dkc1	90	81.106	ENSBTAG00000013045	DKC1	88	78.444	Bos_taurus
ENSACIG00000022614	dkc1	93	63.158	WBGene00010478	K01G5.5	94	64.200	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000022614	dkc1	86	80.909	ENSCJAG00000004210	DKC1	91	77.426	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022614	dkc1	89	72.685	ENSCAFG00000009311	-	78	77.468	Canis_familiaris
ENSACIG00000022614	dkc1	92	78.889	ENSCAFG00000019620	-	88	77.974	Canis_familiaris
ENSACIG00000022614	dkc1	89	72.430	ENSCAFG00020009379	-	75	76.709	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000022614	dkc1	92	78.889	ENSCAFG00020008918	-	88	77.974	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000022614	dkc1	93	80.134	ENSCHIG00000017392	DKC1	88	78.222	Capra_hircus
ENSACIG00000022614	dkc1	89	81.222	ENSTSYG00000007681	DKC1	86	78.936	Carlito_syrichta
ENSACIG00000022614	dkc1	81	83.590	ENSCAPG00000003342	DKC1	95	76.888	Cavia_aperea
ENSACIG00000022614	dkc1	87	80.135	ENSCPOG00000008825	DKC1	86	80.499	Cavia_porcellus
ENSACIG00000022614	dkc1	80	82.443	ENSCCAG00000027418	DKC1	84	71.429	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022614	dkc1	86	80.499	ENSCATG00000033602	DKC1	86	80.499	Cercocebus_atys
ENSACIG00000022614	dkc1	90	81.628	ENSCLAG00000000720	DKC1	93	77.542	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000022614	dkc1	89	82.051	ENSCSAG00000006706	DKC1	86	80.499	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000022614	dkc1	82	87.310	ENSCPBG00000005858	DKC1	86	86.318	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000022614	dkc1	82	80.407	ENSCING00000004599	-	76	80.000	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000022614	dkc1	81	80.563	ENSCSAVG00000010047	-	89	79.545	Ciona_savignyi
ENSACIG00000022614	dkc1	89	82.051	ENSCANG00000027987	DKC1	86	80.499	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000022614	dkc1	90	59.864	ENSCGRG00001016789	-	79	67.297	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000022614	dkc1	87	79.910	ENSCGRG00001014574	-	86	80.272	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000022614	dkc1	87	79.910	ENSCGRG00000016075	-	86	80.272	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000022614	dkc1	90	59.864	ENSCGRG00000014809	-	77	67.297	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000022614	dkc1	95	86.667	ENSCSEG00000012633	dkc1	97	86.710	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000022614	dkc1	88	89.655	ENSCVAG00000010155	dkc1	88	89.087	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022614	dkc1	83	93.216	ENSDARG00000016484	dkc1	93	83.227	Danio_rerio
ENSACIG00000022614	dkc1	90	81.903	ENSDNOG00000004218	DKC1	86	80.317	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000022614	dkc1	81	82.707	ENSDORG00000013566	-	92	73.381	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000022614	dkc1	87	70.892	FBgn0259937	Nop60B	88	70.500	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000022614	dkc1	86	79.412	ENSETEG00000016095	DKC1	90	79.412	Echinops_telfairi
ENSACIG00000022614	dkc1	85	73.381	ENSEBUG00000015962	dkc1	98	81.787	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000022614	dkc1	84	85.608	ENSEASG00005007484	DKC1	78	85.608	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000022614	dkc1	92	78.842	ENSECAG00000023524	DKC1	78	85.608	Equus_caballus
ENSACIG00000022614	dkc1	87	82.297	ENSEEUG00000003323	DKC1	91	87.113	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000022614	dkc1	91	88.838	ENSELUG00000014538	dkc1	85	91.190	Esox_lucius
ENSACIG00000022614	dkc1	83	86.181	ENSFCAG00000006577	DKC1	78	86.398	Felis_catus
ENSACIG00000022614	dkc1	90	82.151	ENSFALG00000011496	DKC1	85	81.306	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000022614	dkc1	90	81.206	ENSFDAG00000002516	DKC1	93	75.847	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000022614	dkc1	86	89.202	ENSFHEG00000004627	dkc1	86	88.605	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022614	dkc1	81	89.514	ENSGMOG00000017277	dkc1	100	89.514	Gadus_morhua
ENSACIG00000022614	dkc1	93	81.306	ENSGALG00000005054	DKC1	87	80.804	Gallus_gallus
ENSACIG00000022614	dkc1	87	90.255	ENSGAFG00000011486	dkc1	80	88.578	Gambusia_affinis
ENSACIG00000022614	dkc1	83	94.724	ENSGACG00000004373	dkc1	96	95.441	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000022614	dkc1	88	79.910	ENSGAGG00000011330	DKC1	84	81.567	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000022614	dkc1	89	82.284	ENSGGOG00000001045	DKC1	86	80.726	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000022614	dkc1	97	90.814	ENSHBUG00000012436	dkc1	95	90.814	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022614	dkc1	90	81.062	ENSHGLG00000000649	DKC1	77	86.616	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022614	dkc1	90	81.062	ENSHGLG00100001153	DKC1	77	86.616	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022614	dkc1	94	84.468	ENSHCOG00000021099	dkc1	82	89.855	Hippocampus_comes
ENSACIG00000022614	dkc1	85	90.580	ENSIPUG00000010309	dkc1	93	82.158	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000022614	dkc1	87	74.827	ENSSTOG00000020149	-	85	75.174	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000022614	dkc1	87	79.730	ENSSTOG00000001074	-	91	80.090	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000022614	dkc1	87	68.764	ENSSTOG00000011904	-	82	68.764	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000022614	dkc1	80	83.969	ENSJJAG00000010086	-	92	73.285	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000022614	dkc1	70	71.304	ENSJJAG00000008207	-	81	73.043	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000022614	dkc1	86	88.290	ENSKMAG00000008010	dkc1	91	87.445	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000022614	dkc1	86	90.187	ENSLBEG00000019122	dkc1	89	90.023	Labrus_bergylta
ENSACIG00000022614	dkc1	87	84.615	ENSLACG00000014025	DKC1	95	84.615	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000022614	dkc1	88	86.395	ENSLOCG00000013713	dkc1	88	88.152	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000022614	dkc1	90	81.206	ENSLAFG00000000221	DKC1	86	79.864	Loxodonta_africana
ENSACIG00000022614	dkc1	89	81.818	ENSMFAG00000032398	DKC1	74	80.272	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000022614	dkc1	89	82.051	ENSMMUG00000005768	DKC1	86	80.499	Macaca_mulatta
ENSACIG00000022614	dkc1	89	82.051	ENSMNEG00000034503	DKC1	86	80.499	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000022614	dkc1	89	82.051	ENSMLEG00000034422	DKC1	86	80.499	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000022614	dkc1	84	95.792	ENSMAMG00000005427	dkc1	89	96.231	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000022614	dkc1	97	91.023	ENSMZEG00005014503	dkc1	95	91.023	Maylandia_zebra
ENSACIG00000022614	dkc1	82	84.557	ENSMGAG00000009238	DKC1	90	81.884	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000022614	dkc1	81	81.955	ENSMAUG00000016454	-	92	72.662	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000022614	dkc1	76	76.438	ENSMICG00000002818	-	99	76.438	Microcebus_murinus
ENSACIG00000022614	dkc1	86	80.230	ENSMICG00000038751	-	87	80.230	Microcebus_murinus
ENSACIG00000022614	dkc1	81	80.451	ENSMOCG00000001169	-	91	69.065	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000022614	dkc1	83	95.750	ENSMMOG00000020348	dkc1	87	95.980	Mola_mola
ENSACIG00000022614	dkc1	92	80.682	ENSMODG00000009243	DKC1	68	86.768	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000022614	dkc1	97	86.157	ENSMALG00000009454	dkc1	95	85.062	Monopterus_albus
ENSACIG00000022614	dkc1	80	80.916	MGP_CAROLIEiJ_G0033191	Dkc1	86	82.540	Mus_caroli
ENSACIG00000022614	dkc1	83	86.683	ENSMUSG00000031403	Dkc1	92	73.381	Mus_musculus
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ENSACIG00000022614	dkc1	83	86.683	MGP_SPRETEiJ_G0034351	Dkc1	92	73.381	Mus_spretus
ENSACIG00000022614	dkc1	93	79.379	ENSMPUG00000016136	DKC1	73	86.869	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000022614	dkc1	93	75.501	ENSMLUG00000011918	DKC1	77	82.178	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000022614	dkc1	81	82.707	ENSNGAG00000015724	-	92	73.022	Nannospalax_galili
ENSACIG00000022614	dkc1	93	90.850	ENSNBRG00000005638	dkc1	83	96.852	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000022614	dkc1	89	82.284	ENSNLEG00000014323	DKC1	86	80.499	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000022614	dkc1	89	78.638	ENSMEUG00000001066	DKC1	87	82.828	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000022614	dkc1	73	80.460	ENSOPRG00000005248	DKC1	69	80.460	Ochotona_princeps
ENSACIG00000022614	dkc1	84	86.849	ENSODEG00000011816	-	79	86.849	Octodon_degus
ENSACIG00000022614	dkc1	81	81.955	ENSODEG00000000549	-	91	72.924	Octodon_degus
ENSACIG00000022614	dkc1	97	91.649	ENSONIG00000013889	dkc1	95	91.649	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000022614	dkc1	89	83.450	ENSOANG00000008713	-	91	81.982	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000022614	dkc1	50	70.120	ENSOANG00000022295	-	70	70.120	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000022614	dkc1	86	80.455	ENSOCUG00000012646	DKC1	86	80.455	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000022614	dkc1	91	87.583	ENSORLG00000018748	dkc1	84	88.679	Oryzias_latipes
ENSACIG00000022614	dkc1	90	85.714	ENSOMEG00000005786	dkc1	88	89.412	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000022614	dkc1	86	78.936	ENSOGAG00000003399	DKC1	86	78.936	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000022614	dkc1	93	80.357	ENSOARG00000003047	DKC1	88	78.444	Ovis_aries
ENSACIG00000022614	dkc1	89	82.629	ENSPPAG00000023820	DKC1	86	80.499	Pan_paniscus
ENSACIG00000022614	dkc1	83	86.181	ENSPPRG00000009104	DKC1	78	86.398	Panthera_pardus
ENSACIG00000022614	dkc1	89	80.135	ENSPTIG00000017469	DKC1	94	77.039	Panthera_tigris_altaica
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