EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022645 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5179 bases
Position: chrCCOE01001638.1:40895-46073
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

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ENSACIP00000029247	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-26	1	5
ENSACIP00000029247	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-26	2	5
ENSACIP00000029247	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-26	3	5
ENSACIP00000029247	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-26	4	5
ENSACIP00000029247	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-26	5	5
ENSACIP00000029247	zf-met	PF12874.7	1e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000030022	-	1104	-	ENSACIP00000029247	367 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000022645	-	58	43.750	ENSACIG00000015429	-	82	49.180
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ENSACIG00000022645	-	95	54.348	ENSACIG00000017647	-	97	56.688
ENSACIG00000022645	-	61	48.276	ENSACIG00000013163	-	79	48.276
ENSACIG00000022645	-	77	54.610	ENSACIG00000004745	-	94	54.610
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ENSACIG00000022645	-	71	39.286	ENSACIG00000008448	-	94	39.935
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ENSACIG00000022645	-	73	50.000	ENSACIG00000023212	-	89	50.000
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ENSACIG00000022645	-	84	58.140	ENSACIG00000004666	-	99	54.194
ENSACIG00000022645	-	65	41.045	ENSACIG00000016133	-	80	41.045
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ENSACIG00000022645	-	69	35.294	ENSACIG00000009717	-	89	49.032
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ENSACIG00000022645	-	78	54.194	ENSACIG00000019710	-	94	54.194
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ENSACIG00000022645	-	57	47.926	ENSACIG00000018952	-	80	47.926
ENSACIG00000022645	-	98	46.269	ENSACIG00000015835	-	97	50.943
ENSACIG00000022645	-	57	50.000	ENSACIG00000019804	-	92	50.000
ENSACIG00000022645	-	66	46.721	ENSACIG00000017892	-	78	46.721
ENSACIG00000022645	-	95	48.485	ENSACIG00000016932	-	95	45.690
ENSACIG00000022645	-	72	57.419	ENSACIG00000010966	-	69	57.419
ENSACIG00000022645	-	66	50.633	ENSACIG00000019447	-	83	50.633
ENSACIG00000022645	-	73	56.757	ENSACIG00000022658	-	94	60.135
ENSACIG00000022645	-	70	47.619	ENSACIG00000023162	-	78	47.619
ENSACIG00000022645	-	52	44.231	ENSACIG00000007882	-	79	44.231
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ENSACIG00000022645	-	78	60.000	ENSACIG00000016182	-	98	60.000
ENSACIG00000022645	-	80	45.847	ENSACIG00000018022	-	96	46.512
ENSACIG00000022645	-	82	45.349	ENSACIG00000003556	-	92	54.839
ENSACIG00000022645	-	70	51.773	ENSACIG00000019102	-	60	51.773
ENSACIG00000022645	-	50	50.000	ENSACIG00000009128	-	90	50.000
ENSACIG00000022645	-	60	44.643	ENSACIG00000014123	znf236	61	44.643
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ENSACIG00000022645	-	58	56.140	ENSACIG00000003720	-	76	56.140
ENSACIG00000022645	-	70	52.060	ENSACIG00000017013	-	75	52.060
ENSACIG00000022645	-	77	58.571	ENSACIG00000017050	-	100	57.627
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ENSACIG00000022645	-	80	51.014	ENSACIG00000006172	-	99	54.867
ENSACIG00000022645	-	78	45.247	ENSACIG00000018059	-	91	44.867
ENSACIG00000022645	-	76	52.857	ENSACIG00000006806	-	86	52.857
ENSACIG00000022645	-	78	50.877	ENSACIG00000013470	-	96	49.682
ENSACIG00000022645	-	51	36.471	ENSACIG00000019534	-	85	36.471
ENSACIG00000022645	-	71	46.931	ENSACIG00000022625	-	98	47.414

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022645	-	75	50.000	ENSAPOG00000000503	-	97	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	78	49.662	ENSAPOG00000023479	-	84	49.662	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	59	44.595	ENSAPOG00000007955	-	77	44.595	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	89	55.652	ENSAPOG00000002691	-	90	55.652	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	96	51.695	ENSAPOG00000020864	-	97	51.695	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	51	56.962	ENSAPOG00000004878	-	90	56.962	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	95	51.786	ENSAPOG00000005986	-	99	51.786	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	97	53.977	ENSAPOG00000013125	-	97	53.977	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	96	61.905	ENSAPOG00000014378	-	99	61.905	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	51	54.348	ENSAPOG00000006282	-	91	54.348	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	96	72.289	ENSAPOG00000001742	-	97	72.289	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	95	57.391	ENSAPOG00000022234	-	99	57.391	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	72	57.143	ENSAPOG00000008053	-	70	57.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	91	52.817	ENSAPOG00000007528	-	96	52.817	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	92	54.839	ENSAPOG00000024332	-	93	54.839	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	55	52.143	ENSAPOG00000020343	-	97	52.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	70	53.390	ENSAPOG00000014714	-	98	53.390	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	98	57.485	ENSAPOG00000001725	-	98	58.571	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	90	53.913	ENSAPOG00000018127	-	85	53.913	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022645	-	51	50.000	ENSAOCG00000016088	-	84	49.721	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000022645	-	80	55.000	ENSAOCG00000016287	-	94	55.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022645	-	62	55.085	ENSAOCG00000016737	-	99	55.085	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022645	-	78	54.688	ENSAOCG00000014651	-	86	54.688	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022645	-	79	60.000	ENSAOCG00000002585	-	93	60.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022645	-	71	56.051	ENSAOCG00000015586	-	97	56.250	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022645	-	73	54.688	ENSAOCG00000022375	-	98	52.427	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022645	-	80	56.780	ENSAOCG00000018307	-	99	57.265	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022645	-	69	57.343	ENSAOCG00000006793	-	99	57.343	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022645	-	72	52.500	ENSAOCG00000011204	-	71	52.500	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022645	-	79	55.484	ENSAOCG00000018543	-	98	55.484	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022645	-	77	58.140	ENSAOCG00000020830	-	99	59.355	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022645	-	79	53.521	ENSAOCG00000009970	-	94	53.521	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000022645	-	93	44.590	ENSAPEG00000005592	-	87	44.590	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022645	-	72	55.556	ENSAPEG00000014415	-	92	55.556	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022645	-	73	57.447	ENSAPEG00000005462	-	99	57.447	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022645	-	96	50.694	ENSATEG00000014239	-	98	50.694	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022645	-	95	48.509	ENSATEG00000008761	-	96	48.767	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022645	-	95	48.780	ENSATEG00000008649	-	99	49.593	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022645	-	96	52.836	ENSACLG00000021184	-	94	52.836	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000022645	-	72	54.867	ENSACLG00000025163	-	99	54.867	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022645	-	75	54.762	ENSACLG00000025196	-	99	54.762	Astatotilapia_calliptera
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