EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022658 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3790 bases
Position: chrCCOE01001638.1:47151-50940
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000029367	zf-C2H2	PF00096.26	4.3e-53	1	9
ENSACIP00000029367	zf-C2H2	PF00096.26	4.3e-53	2	9
ENSACIP00000029367	zf-C2H2	PF00096.26	4.3e-53	3	9
ENSACIP00000029367	zf-C2H2	PF00096.26	4.3e-53	4	9
ENSACIP00000029367	zf-C2H2	PF00096.26	4.3e-53	5	9
ENSACIP00000029367	zf-C2H2	PF00096.26	4.3e-53	6	9
ENSACIP00000029367	zf-C2H2	PF00096.26	4.3e-53	7	9
ENSACIP00000029367	zf-C2H2	PF00096.26	4.3e-53	8	9
ENSACIP00000029367	zf-C2H2	PF00096.26	4.3e-53	9	9
ENSACIP00000029296	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-28	1	5
ENSACIP00000029296	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-28	2	5
ENSACIP00000029296	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-28	3	5
ENSACIP00000029296	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-28	4	5
ENSACIP00000029296	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-28	5	5
ENSACIP00000029367	zf-met	PF12874.7	2.6e-17	1	2
ENSACIP00000029367	zf-met	PF12874.7	2.6e-17	2	2
ENSACIP00000029296	zf-met	PF12874.7	6.7e-13	1	2
ENSACIP00000029296	zf-met	PF12874.7	6.7e-13	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000030073	-	714	-	ENSACIP00000029296	237 (aa)	-	-
ENSACIT00000030146	-	864	-	ENSACIP00000029367	287 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000022658	-	95	48.227	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	89	47.742
ENSACIG00000022658	-	94	44.134	ENSACIG00000013750	-	81	44.134
ENSACIG00000022658	-	94	45.000	ENSACIG00000002190	gfi1b	77	45.000
ENSACIG00000022658	-	94	49.412	ENSACIG00000003515	-	100	49.505
ENSACIG00000022658	-	89	43.580	ENSACIG00000021986	-	100	43.580
ENSACIG00000022658	-	92	34.058	ENSACIG00000011516	-	82	38.053
ENSACIG00000022658	-	95	52.514	ENSACIG00000003720	-	63	53.521
ENSACIG00000022658	-	93	46.701	ENSACIG00000009780	-	85	48.235
ENSACIG00000022658	-	94	60.135	ENSACIG00000022645	-	73	56.757
ENSACIG00000022658	-	93	49.432	ENSACIG00000009755	-	74	49.432
ENSACIG00000022658	-	95	47.297	ENSACIG00000004626	-	89	47.297
ENSACIG00000022658	-	98	60.079	ENSACIG00000019791	-	93	61.538
ENSACIG00000022658	-	96	56.126	ENSACIG00000013604	-	98	61.310
ENSACIG00000022658	-	91	35.211	ENSACIG00000014233	znf407	66	39.062
ENSACIG00000022658	-	94	44.061	ENSACIG00000013163	-	86	44.693
ENSACIG00000022658	-	88	36.641	ENSACIG00000002944	-	90	36.641
ENSACIG00000022658	-	98	43.548	ENSACIG00000007000	-	62	42.857
ENSACIG00000022658	-	91	45.211	ENSACIG00000019815	-	93	45.087
ENSACIG00000022658	-	97	49.714	ENSACIG00000010647	-	99	50.307
ENSACIG00000022658	-	95	38.614	ENSACIG00000009443	-	73	33.594
ENSACIG00000022658	-	89	59.302	ENSACIG00000023162	-	79	54.237
ENSACIG00000022658	-	94	39.062	ENSACIG00000012263	znf319b	88	43.056
ENSACIG00000022658	-	92	61.181	ENSACIG00000018440	-	94	61.181
ENSACIG00000022658	-	91	53.812	ENSACIG00000006806	-	59	53.812
ENSACIG00000022658	-	88	47.727	ENSACIG00000013946	-	50	47.727
ENSACIG00000022658	-	93	40.741	ENSACIG00000008611	-	56	40.741
ENSACIG00000022658	-	98	39.130	ENSACIG00000023049	znf646	99	40.336
ENSACIG00000022658	-	93	65.672	ENSACIG00000010660	-	96	65.672
ENSACIG00000022658	-	90	40.000	ENSACIG00000012604	scrt2	59	40.000
ENSACIG00000022658	-	92	55.357	ENSACIG00000012084	-	98	56.250
ENSACIG00000022658	-	92	57.812	ENSACIG00000018952	-	50	57.812
ENSACIG00000022658	-	91	45.000	ENSACIG00000018404	-	76	45.000
ENSACIG00000022658	-	98	57.312	ENSACIG00000022293	-	96	57.312
ENSACIG00000022658	-	89	52.756	ENSACIG00000011515	-	67	52.632
ENSACIG00000022658	-	92	49.246	ENSACIG00000022330	-	94	50.000
ENSACIG00000022658	-	88	43.103	ENSACIG00000017653	-	93	43.137
ENSACIG00000022658	-	93	49.012	ENSACIG00000011541	-	73	48.485
ENSACIG00000022658	-	84	54.098	ENSACIG00000019804	-	82	54.098
ENSACIG00000022658	-	96	41.048	ENSACIG00000017683	-	76	41.991
ENSACIG00000022658	-	93	45.026	ENSACIG00000017892	-	74	46.980
ENSACIG00000022658	-	95	39.779	ENSACIG00000019534	-	84	39.779
ENSACIG00000022658	-	91	43.878	ENSACIG00000010739	-	79	44.643
ENSACIG00000022658	-	92	37.548	ENSACIG00000001767	zbtb41	63	40.206
ENSACIG00000022658	-	94	52.586	ENSACIG00000018059	-	85	47.619
ENSACIG00000022658	-	94	50.000	ENSACIG00000006755	-	86	44.872
ENSACIG00000022658	-	93	55.431	ENSACIG00000010966	-	54	54.913
ENSACIG00000022658	-	93	40.000	ENSACIG00000014282	znf526	85	34.483
ENSACIG00000022658	-	95	54.874	ENSACIG00000004745	-	96	59.172
ENSACIG00000022658	-	97	54.724	ENSACIG00000004041	-	95	54.724
ENSACIG00000022658	-	91	41.525	ENSACIG00000006377	-	60	41.525
ENSACIG00000022658	-	97	40.000	ENSACIG00000006826	-	69	40.000
ENSACIG00000022658	-	93	53.469	ENSACIG00000003556	-	87	54.335
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ENSACIG00000022658	-	96	48.810	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	100	48.810
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ENSACIG00000022658	-	88	45.238	ENSACIG00000016354	gfi1ab	50	45.000
ENSACIG00000022658	-	92	47.682	ENSACIG00000016117	-	89	46.023
ENSACIG00000022658	-	95	43.874	ENSACIG00000017644	-	91	47.742
ENSACIG00000022658	-	98	41.634	ENSACIG00000012636	ZNF319	97	43.972
ENSACIG00000022658	-	97	57.613	ENSACIG00000017050	-	99	56.757
ENSACIG00000022658	-	98	51.931	ENSACIG00000019447	-	73	51.931
ENSACIG00000022658	-	95	53.922	ENSACIG00000016944	-	97	43.462
ENSACIG00000022658	-	89	43.411	ENSACIG00000008886	znf1164	86	43.411
ENSACIG00000022658	-	96	45.882	ENSACIG00000009717	-	92	50.000
ENSACIG00000022658	-	94	49.275	ENSACIG00000004641	-	67	49.275
ENSACIG00000022658	-	89	51.261	ENSACIG00000006228	-	66	51.261
ENSACIG00000022658	-	97	48.387	ENSACIG00000014123	znf236	65	45.238
ENSACIG00000022658	-	93	56.085	ENSACIG00000000311	-	63	56.085
ENSACIG00000022658	-	94	42.292	ENSACIG00000000406	prdm5	79	44.809
ENSACIG00000022658	-	98	42.857	ENSACIG00000023313	-	90	45.098
ENSACIG00000022658	-	94	42.636	ENSACIG00000002180	-	97	42.636
ENSACIG00000022658	-	95	53.731	ENSACIG00000018022	-	79	50.000
ENSACIG00000022658	-	87	48.387	ENSACIG00000001860	-	51	48.387
ENSACIG00000022658	-	90	42.308	ENSACIG00000001369	-	81	42.308
ENSACIG00000022658	-	94	49.012	ENSACIG00000023212	-	81	50.323
ENSACIG00000022658	-	91	50.787	ENSACIG00000013470	-	64	50.787
ENSACIG00000022658	-	97	56.838	ENSACIG00000017647	-	93	56.962
ENSACIG00000022658	-	89	40.789	ENSACIG00000018641	snai2	82	34.615
ENSACIG00000022658	-	89	42.568	ENSACIG00000015411	-	88	45.000
ENSACIG00000022658	-	87	43.243	ENSACIG00000013613	scrt1b	51	43.243
ENSACIG00000022658	-	95	48.263	ENSACIG00000015429	-	89	46.575
ENSACIG00000022658	-	95	60.364	ENSACIG00000006172	-	99	59.375
ENSACIG00000022658	-	93	61.278	ENSACIG00000011153	-	72	61.278
ENSACIG00000022658	-	94	45.417	ENSACIG00000023794	-	76	45.417
ENSACIG00000022658	-	91	54.217	ENSACIG00000007034	-	82	54.217
ENSACIG00000022658	-	95	52.688	ENSACIG00000000286	-	78	54.074
ENSACIG00000022658	-	90	42.857	ENSACIG00000016133	-	55	43.506
ENSACIG00000022658	-	93	58.209	ENSACIG00000017013	-	80	58.242
ENSACIG00000022658	-	92	61.864	ENSACIG00000022625	-	95	54.098
ENSACIG00000022658	-	92	53.472	ENSACIG00000007096	-	73	53.472
ENSACIG00000022658	-	94	45.399	ENSACIG00000021378	gfi1aa	56	45.399
ENSACIG00000022658	-	93	59.341	ENSACIG00000004666	-	94	58.904
ENSACIG00000022658	-	83	56.303	ENSACIG00000024444	-	69	53.889
ENSACIG00000022658	-	92	43.564	ENSACIG00000009128	-	85	41.791
ENSACIG00000022658	-	89	45.989	ENSACIG00000007882	-	79	45.989
ENSACIG00000022658	-	95	43.956	ENSACIG00000007855	-	95	43.956
ENSACIG00000022658	-	96	41.573	ENSACIG00000020982	znf710b	51	41.573
ENSACIG00000022658	-	89	48.551	ENSACIG00000020938	zbtb47b	67	48.551
ENSACIG00000022658	-	93	52.577	ENSACIG00000019710	-	74	55.597
ENSACIG00000022658	-	95	56.828	ENSACIG00000016182	-	93	56.688
ENSACIG00000022658	-	97	48.299	ENSACIG00000007464	-	63	45.745
ENSACIG00000022658	-	95	55.866	ENSACIG00000022738	-	93	55.866
ENSACIG00000022658	-	92	50.575	ENSACIG00000010637	-	62	50.289
ENSACIG00000022658	-	99	37.217	ENSACIG00000013149	-	82	44.681
ENSACIG00000022658	-	90	52.809	ENSACIG00000015835	-	68	52.809
ENSACIG00000022658	-	93	53.991	ENSACIG00000003754	-	94	50.704
ENSACIG00000022658	-	96	30.539	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	89	41.071

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022658	-	98	60.169	ENSAPOG00000008802	-	100	64.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022658	-	96	42.400	ENSAPOG00000019960	-	99	44.079	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022658	-	94	64.427	ENSAPOG00000006303	-	92	62.428	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022658	-	93	64.427	ENSAOCG00000013130	-	92	61.850	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022658	-	98	55.491	ENSAOCG00000014165	-	92	53.757	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022658	-	93	61.776	ENSAOCG00000013710	-	85	61.776	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022658	-	96	60.000	ENSAPEG00000006650	-	90	60.484	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022658	-	93	64.427	ENSAPEG00000009383	-	89	63.636	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022658	-	88	52.174	ENSATEG00000017618	-	89	52.174	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022658	-	91	52.174	ENSATEG00000015695	-	94	52.174	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022658	-	97	53.589	ENSACLG00000018746	-	93	53.589	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022658	-	97	52.256	ENSACLG00000026703	-	87	53.757	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022658	-	91	61.719	ENSACLG00000023513	-	81	62.555	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022658	-	95	58.291	ENSACLG00000021343	-	98	55.814	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022658	-	91	45.306	ENSACLG00000019291	-	90	45.306	Astatotilapia_calliptera
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