EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022689 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: snrpd2
Alias: im:6908977|si:dkey-113g17.2|zgc:110732
Full Name: small nuclear ribonucleoprotein D2 polypeptide
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 871 bases
Position: chrCCOE01000725.1:48310-49180
Accession: ZDB-GENE-040914-10
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000029292	LSM	PF01423.22	6.8e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000030069	-	327	-	ENSACIP00000029292	108 (aa)	-	UPI0002518A6E

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000022689	snrpd2	76	32.927	ENSACIG00000004574	lsm3	60	33.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSG00000125743	SNRPD2	100	99.074	Homo_sapiens
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSAPOG00000012310	snrpd2	92	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSAMEG00000000818	-	92	99.074	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSAOCG00000024413	snrpd2	92	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSAPEG00000021711	snrpd2	92	100.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSATEG00000000868	snrpd2	90	100.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSACAG00000016779	-	92	99.074	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	97.222	ENSANAG00000017079	-	92	97.222	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	88.889	ENSANAG00000018193	-	91	87.963	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	98.148	ENSANAG00000001612	-	91	98.148	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000022689	snrpd2	50	98.148	ENSANAG00000019777	-	100	98.148	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000022689	snrpd2	50	98.148	ENSANAG00000005642	-	100	98.148	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	96.296	ENSANAG00000003063	-	92	96.296	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSACLG00000001746	snrpd2	92	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSAMXG00000033526	snrpd2	92	100.000	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSBTAG00000012177	SNRPD2	92	99.074	Bos_taurus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	80.556	WBGene00004917	snr-4	92	80.556	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	95.370	ENSCJAG00000047147	-	92	95.370	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022689	snrpd2	50	94.444	ENSCJAG00000044478	-	100	94.444	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	98.148	ENSCJAG00000019291	-	92	98.148	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	97.222	ENSCJAG00000047157	-	92	97.222	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	97.222	ENSCJAG00000041687	-	92	97.222	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSCJAG00000044723	-	92	99.074	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	97.222	ENSCJAG00000044646	-	92	97.222	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSCJAG00000012413	-	92	99.074	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSCAFG00000004403	SNRPD2	92	99.074	Canis_familiaris
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	88.889	ENSCAFG00000000634	-	91	88.889	Canis_familiaris
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	88.889	ENSCAFG00020002921	-	91	88.889	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSCAFG00020003532	-	96	99.074	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSCHIG00000015755	-	91	99.074	Capra_hircus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSTSYG00000011207	-	92	99.074	Carlito_syrichta
ENSACIG00000022689	snrpd2	97	80.000	ENSTSYG00000031156	-	76	72.826	Carlito_syrichta
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	84.259	ENSCAPG00000006559	-	91	83.333	Cavia_aperea
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSCAPG00000011695	-	91	99.074	Cavia_aperea
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	87.037	ENSCPOG00000025735	-	91	87.037	Cavia_porcellus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSCPOG00000035154	-	92	99.074	Cavia_porcellus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSCCAG00000035396	SNRPD2	92	99.074	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022689	snrpd2	50	94.444	ENSCCAG00000018327	-	100	94.444	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022689	snrpd2	50	94.444	ENSCCAG00000007393	-	100	94.444	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022689	snrpd2	50	98.148	ENSCCAG00000007464	-	100	98.148	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	98.148	ENSCCAG00000011183	-	92	98.148	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	73.148	ENSCCAG00000020956	-	89	73.148	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022689	snrpd2	72	89.744	ENSCCAG00000030191	-	75	90.909	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	96.296	ENSCCAG00000012011	-	92	96.296	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	98.148	ENSCATG00000005272	-	92	98.148	Cercocebus_atys
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	97.222	ENSCATG00000031591	-	91	97.222	Cercocebus_atys
ENSACIG00000022689	snrpd2	86	98.925	ENSCATG00000040410	-	84	100.000	Cercocebus_atys
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	76.852	ENSCLAG00000001183	-	91	76.852	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	84.259	ENSCLAG00000017381	-	97	84.259	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSCLAG00000000931	-	92	99.074	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSCSAG00000003157	SNRPD2	92	99.074	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSCPBG00000007259	SNRPD2	92	99.074	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000022689	snrpd2	88	84.211	ENSCING00000020031	-	81	84.211	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000022689	snrpd2	82	87.640	ENSCSAVG00000003527	-	72	87.640	Ciona_savignyi
ENSACIG00000022689	snrpd2	50	98.148	ENSCANG00000002575	-	100	98.148	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	98.148	ENSCANG00000038535	-	92	98.148	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000022689	snrpd2	93	77.000	ENSCANG00000035956	-	88	77.895	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	87.037	ENSCGRG00001003078	-	91	87.037	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	93.519	ENSCGRG00000011635	-	92	93.519	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSCSEG00000002230	snrpd2	92	100.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSCVAG00000014834	snrpd2	92	100.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSCVAG00000010204	SNRPD2	89	100.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSDARG00000040440	snrpd2	92	100.000	Danio_rerio
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSDNOG00000002365	-	85	99.074	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSDORG00000001729	Snrpd2	92	99.074	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000022689	snrpd2	99	88.785	FBgn0261789	SmD2	90	88.785	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	78.704	ENSETEG00000002893	-	91	75.000	Echinops_telfairi
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	95.370	ENSEBUG00000002144	snrpd2	91	95.370	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSEASG00005014210	-	92	99.074	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000022689	snrpd2	99	72.222	ENSEASG00005016910	-	81	67.593	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSECAG00000007824	SNRPD2	94	99.074	Equus_caballus
ENSACIG00000022689	snrpd2	99	99.065	ENSELUG00000020393	snrpd2	60	99.065	Esox_lucius
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSFCAG00000022530	-	92	99.074	Felis_catus
ENSACIG00000022689	snrpd2	90	88.660	ENSFCAG00000024879	-	54	93.902	Felis_catus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSFDAG00000015792	SNRPD2	92	99.074	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSFHEG00000015591	snrpd2	92	100.000	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSGMOG00000013857	snrpd2	92	100.000	Gadus_morhua
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSGAFG00000001246	snrpd2	92	100.000	Gambusia_affinis
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	98.148	ENSGACG00000006697	snrpd2	92	98.148	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000022689	snrpd2	68	100.000	ENSGAGG00000017944	SNRPD2	51	100.000	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSGGOG00000002350	SNRPD2	92	99.074	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSHBUG00000004073	snrpd2	92	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSHGLG00000015364	SNRPD2	92	99.074	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	77.778	ENSHGLG00000017154	-	91	77.778	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSHGLG00100015694	SNRPD2	92	99.074	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	91.667	ENSHGLG00100020606	-	59	91.667	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSHCOG00000010973	snrpd2	92	99.074	Hippocampus_comes
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSIPUG00000001053	snrpd2	92	99.074	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSSTOG00000024377	SNRPD2	92	99.074	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSJJAG00000002622	Snrpd2	92	99.074	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSKMAG00000001539	snrpd2	92	100.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSLBEG00000019436	snrpd2	92	99.074	Labrus_bergylta
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSLACG00000004720	SNRPD2	100	100.000	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSLOCG00000014824	snrpd2	92	100.000	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSLAFG00000004205	-	92	99.074	Loxodonta_africana
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	97.222	ENSMFAG00000009957	-	92	97.222	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSMFAG00000045767	-	92	99.074	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	98.148	ENSMFAG00000020148	-	92	98.148	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000022689	snrpd2	94	92.157	ENSMMUG00000030518	-	86	92.157	Macaca_mulatta
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	97.222	ENSMMUG00000032525	-	92	97.222	Macaca_mulatta
ENSACIG00000022689	snrpd2	50	98.148	ENSMMUG00000006937	SNRPD2	100	98.148	Macaca_mulatta
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	98.148	ENSMMUG00000032370	-	92	98.148	Macaca_mulatta
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	96.296	ENSMNEG00000010649	-	92	96.296	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000022689	snrpd2	98	88.679	ENSMNEG00000039787	-	81	89.474	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	97.222	ENSMNEG00000021599	-	92	97.222	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	96.296	ENSMLEG00000008325	-	92	96.296	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSMAMG00000013925	snrpd2	92	100.000	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	100.000	ENSMZEG00005013054	snrpd2	92	100.000	Maylandia_zebra
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSMAUG00000018849	Snrpd2	92	99.074	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000022689	snrpd2	100	99.074	ENSMICG00000031545	SNRPD2	92	99.074	Microcebus_murinus
ENSACIG00000022689	snrpd2	50	98.148	ENSMOCG00000006567	-	100	98.148	Microtus_ochrogaster
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