EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022738 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10677 bases
Position: chrCCOE01000630.1:31909-42585
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACIP00000029443	zf-C2H2	PF00096.26	5.4e-54	7	9
ENSACIP00000029443	zf-C2H2	PF00096.26	5.4e-54	8	9
ENSACIP00000029443	zf-C2H2	PF00096.26	5.4e-54	9	9
ENSACIP00000029409	zf-C2H2	PF00096.26	8.6e-46	1	8
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ENSACIP00000029409	zf-C2H2	PF00096.26	8.6e-46	8	8
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ENSACIP00000029398	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-36	1	5
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ENSACIP00000029398	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-36	5	5
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ENSACIP00000029373	zf-C2H2	PF00096.26	5.3e-34	6	6
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ENSACIP00000029409	zf-met	PF12874.7	1.8e-19	1	3
ENSACIP00000029409	zf-met	PF12874.7	1.8e-19	2	3
ENSACIP00000029409	zf-met	PF12874.7	1.8e-19	3	3
ENSACIP00000029425	zf-met	PF12874.7	6.9e-19	1	3
ENSACIP00000029425	zf-met	PF12874.7	6.9e-19	2	3
ENSACIP00000029425	zf-met	PF12874.7	6.9e-19	3	3
ENSACIP00000029398	zf-met	PF12874.7	1.6e-18	1	2
ENSACIP00000029398	zf-met	PF12874.7	1.6e-18	2	2
ENSACIP00000029373	zf-met	PF12874.7	4.4e-14	1	1
ENSACIP00000029398	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	2e-18	1	1

Transcripts

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ENSACIT00000030151	-	600	-	ENSACIP00000029373	199 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000022738	-	95	53.968	ENSACIG00000009755	-	89	53.968
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ENSACIG00000022738	-	98	41.135	ENSACIG00000023313	-	92	41.525
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ENSACIG00000022738	-	97	48.780	ENSACIG00000004626	-	90	50.000
ENSACIG00000022738	-	89	56.452	ENSACIG00000003515	-	99	47.222
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ENSACIG00000022738	-	93	45.370	ENSACIG00000018059	-	67	46.957
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