EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022802 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ddx47
Alias: si:ch1073-304j18.2|zgc:112350
Full Name: DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 47
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5076 bases
Position: chrCCOE01000097.1:1338144-1343219
Accession: ZDB-GENE-050522-359
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000029479	ResIII	PF04851.15	1.2e-06	1	1
ENSACIP00000029479	DEAD	PF00270.29	6.4e-48	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000030257	-	1452	-	ENSACIP00000029479	483 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000022802	ddx47	71	36.023	ENSACIG00000020898	DDX39A	81	36.023
ENSACIG00000022802	ddx47	59	32.646	ENSACIG00000018355	-	63	32.646
ENSACIG00000022802	ddx47	74	31.135	ENSACIG00000006429	ddx21	50	31.135
ENSACIG00000022802	ddx47	71	38.920	ENSACIG00000006502	DDX5	60	37.093
ENSACIG00000022802	ddx47	78	32.095	ENSACIG00000009719	eif4a3	92	32.353
ENSACIG00000022802	ddx47	77	35.121	ENSACIG00000000989	eif4a2	91	35.121
ENSACIG00000022802	ddx47	67	39.640	ENSACIG00000018534	ddx18	62	37.113
ENSACIG00000022802	ddx47	70	36.011	ENSACIG00000007580	ddx55	61	36.490
ENSACIG00000022802	ddx47	75	35.949	ENSACIG00000000022	ddx23	52	35.949
ENSACIG00000022802	ddx47	81	39.055	ENSACIG00000014378	ddx27	96	43.750
ENSACIG00000022802	ddx47	69	33.526	ENSACIG00000017623	ddx4	87	33.526
ENSACIG00000022802	ddx47	66	32.240	ENSACIG00000006033	ddx31	60	33.243
ENSACIG00000022802	ddx47	77	31.830	ENSACIG00000012170	ddx43	63	31.500
ENSACIG00000022802	ddx47	70	32.102	ENSACIG00000002843	ddx52	62	32.578
ENSACIG00000022802	ddx47	72	38.592	ENSACIG00000022414	ddx5	73	38.592
ENSACIG00000022802	ddx47	72	34.501	ENSACIG00000013354	-	62	34.501
ENSACIG00000022802	ddx47	64	35.535	ENSACIG00000007438	-	71	35.849
ENSACIG00000022802	ddx47	67	35.674	ENSACIG00000024338	ddx24	63	35.674
ENSACIG00000022802	ddx47	89	32.892	ENSACIG00000023986	-	56	35.695
ENSACIG00000022802	ddx47	72	34.903	ENSACIG00000008618	DDX41	61	34.903
ENSACIG00000022802	ddx47	71	35.447	ENSACIG00000007948	-	81	35.447
ENSACIG00000022802	ddx47	82	45.146	ENSACIG00000011029	ddx49	86	45.388
ENSACIG00000022802	ddx47	71	36.311	ENSACIG00000004534	ddx39b	80	36.311
ENSACIG00000022802	ddx47	72	38.375	ENSACIG00000001068	-	72	35.933
ENSACIG00000022802	ddx47	54	42.623	ENSACIG00000013747	ddx56	95	39.205
ENSACIG00000022802	ddx47	69	34.897	ENSACIG00000009666	ddx59	59	34.897
ENSACIG00000022802	ddx47	80	30.216	ENSACIG00000021615	ddx28	74	30.216

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.028	ENSG00000213782	DDX47	92	84.450	Homo_sapiens
ENSACIG00000022802	ddx47	100	93.168	ENSAPOG00000021751	ddx47	94	94.013	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022802	ddx47	89	83.683	ENSAMEG00000010740	DDX47	92	84.211	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000022802	ddx47	100	92.784	ENSAOCG00000015213	ddx47	93	94.457	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022802	ddx47	100	92.828	ENSAPEG00000014476	ddx47	99	94.824	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022802	ddx47	94	92.982	ENSATEG00000010277	ddx47	94	92.936	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022802	ddx47	86	85.132	ENSAPLG00000015324	DDX47	89	85.266	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.848	ENSACAG00000010648	DDX47	94	85.203	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000022802	ddx47	72	87.143	ENSANAG00000025235	DDX47	95	87.143	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000022802	ddx47	93	85.495	ENSAMXG00000010727	ddx47	93	86.530	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022802	ddx47	88	84.543	ENSBTAG00000019608	DDX47	91	84.892	Bos_taurus
ENSACIG00000022802	ddx47	86	66.986	WBGene00012059	T26G10.1	90	64.270	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000022802	ddx47	88	84.434	ENSCJAG00000021633	DDX47	99	80.769	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022802	ddx47	92	80.942	ENSCAFG00000013224	DDX47	91	81.093	Canis_familiaris
ENSACIG00000022802	ddx47	88	84.235	ENSCAFG00020006612	DDX47	92	84.450	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000022802	ddx47	88	84.778	ENSCHIG00000026011	DDX47	91	85.132	Capra_hircus
ENSACIG00000022802	ddx47	92	82.697	ENSTSYG00000002978	DDX47	95	82.989	Carlito_syrichta
ENSACIG00000022802	ddx47	55	86.986	ENSCAPG00000002814	DDX47	92	86.986	Cavia_aperea
ENSACIG00000022802	ddx47	90	83.066	ENSCPOG00000035172	DDX47	94	83.256	Cavia_porcellus
ENSACIG00000022802	ddx47	92	81.208	ENSCCAG00000025717	DDX47	96	81.465	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022802	ddx47	92	80.984	ENSCATG00000014281	-	92	84.450	Cercocebus_atys
ENSACIG00000022802	ddx47	50	83.750	ENSCATG00000038188	-	92	84.848	Cercocebus_atys
ENSACIG00000022802	ddx47	92	81.614	ENSCLAG00000015856	DDX47	96	81.881	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.112	ENSCSAG00000008569	DDX47	92	84.450	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000022802	ddx47	89	53.738	ENSCHOG00000010943	DDX47	91	53.349	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000022802	ddx47	90	84.828	ENSCPBG00000020967	-	94	84.977	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000022802	ddx47	89	71.329	ENSCING00000002081	-	95	71.329	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000022802	ddx47	87	74.762	ENSCSAVG00000011566	-	93	74.762	Ciona_savignyi
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.112	ENSCANG00000040222	DDX47	92	84.450	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000022802	ddx47	88	85.142	ENSCGRG00001014927	Ddx47	92	84.928	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000022802	ddx47	88	85.142	ENSCGRG00000010351	Ddx47	94	84.928	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000022802	ddx47	88	90.164	ENSCSEG00000007687	ddx47	97	90.164	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000022802	ddx47	89	78.372	ENSDNOG00000040799	DDX47	92	78.571	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000022802	ddx47	93	71.812	FBgn0032919	CG9253	88	71.047	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000022802	ddx47	67	83.721	ENSETEG00000011487	DDX47	78	83.721	Echinops_telfairi
ENSACIG00000022802	ddx47	92	81.208	ENSEASG00005014653	DDX47	96	81.465	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000022802	ddx47	92	81.208	ENSECAG00000023622	DDX47	96	81.465	Equus_caballus
ENSACIG00000022802	ddx47	76	83.758	ENSEEUG00000008639	DDX47	78	84.211	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000022802	ddx47	92	90.022	ENSELUG00000009495	ddx47	92	86.242	Esox_lucius
ENSACIG00000022802	ddx47	88	84.309	ENSFCAG00000013990	DDX47	92	84.652	Felis_catus
ENSACIG00000022802	ddx47	87	86.124	ENSFALG00000011391	DDX47	90	85.851	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000022802	ddx47	67	65.000	ENSFDAG00000004127	-	70	64.286	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.112	ENSFDAG00000014635	-	92	84.450	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000022802	ddx47	93	92.205	ENSFHEG00000011435	ddx47	93	92.152	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022802	ddx47	79	91.384	ENSGMOG00000010290	ddx47	100	91.384	Gadus_morhua
ENSACIG00000022802	ddx47	86	85.372	ENSGALG00000011794	DDX47	91	85.132	Gallus_gallus
ENSACIG00000022802	ddx47	100	89.669	ENSGAFG00000017403	ddx47	95	91.150	Gambusia_affinis
ENSACIG00000022802	ddx47	98	88.773	ENSGACG00000007092	ddx47	97	90.359	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000022802	ddx47	88	84.778	ENSGAGG00000023801	DDX47	84	84.689	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.259	ENSGGOG00000005882	DDX47	92	84.689	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000022802	ddx47	100	95.859	ENSHBUG00000022213	ddx47	94	96.674	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.346	ENSHGLG00000007623	DDX47	92	84.689	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.346	ENSHGLG00100009764	DDX47	92	84.689	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022802	ddx47	95	90.217	ENSHCOG00000005496	ddx47	94	90.088	Hippocampus_comes
ENSACIG00000022802	ddx47	93	87.111	ENSIPUG00000023788	ddx47	91	88.967	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000022802	ddx47	87	84.450	ENSSTOG00000027266	DDX47	93	84.804	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000022802	ddx47	88	84.543	ENSJJAG00000000118	Ddx47	92	84.892	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000022802	ddx47	94	92.308	ENSKMAG00000013071	ddx47	92	92.274	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000022802	ddx47	99	89.300	ENSLBEG00000028348	ddx47	93	91.630	Labrus_bergylta
ENSACIG00000022802	ddx47	87	86.256	ENSLACG00000013814	DDX47	95	83.683	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.346	ENSLAFG00000015474	DDX47	92	84.689	Loxodonta_africana
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.112	ENSMFAG00000042577	DDX47	92	84.450	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.112	ENSMMUG00000017993	DDX47	92	84.450	Macaca_mulatta
ENSACIG00000022802	ddx47	89	73.832	ENSMNEG00000044164	DDX47	91	73.923	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000022802	ddx47	50	84.583	ENSMLEG00000037204	-	83	84.583	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.112	ENSMLEG00000040358	-	92	84.450	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000022802	ddx47	94	93.363	ENSMAMG00000008915	ddx47	94	93.318	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000022802	ddx47	93	81.978	ENSMZEG00005004902	DDX47	94	81.978	Maylandia_zebra
ENSACIG00000022802	ddx47	88	56.000	ENSMZEG00005022989	-	98	56.000	Maylandia_zebra
ENSACIG00000022802	ddx47	85	85.645	ENSMGAG00000011857	DDX47	94	85.784	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000022802	ddx47	92	81.655	ENSMAUG00000012214	Ddx47	96	81.922	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000022802	ddx47	72	83.607	ENSMICG00000010086	DDX47	94	84.880	Microcebus_murinus
ENSACIG00000022802	ddx47	91	82.500	ENSMOCG00000003693	Ddx47	92	84.928	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000022802	ddx47	92	90.045	ENSMMOG00000008610	ddx47	95	89.977	Mola_mola
ENSACIG00000022802	ddx47	91	83.790	ENSMODG00000018223	DDX47	93	83.916	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000022802	ddx47	93	92.699	ENSMALG00000002420	ddx47	94	92.699	Monopterus_albus
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.112	MGP_CAROLIEiJ_G0028986	Ddx47	95	81.558	Mus_caroli
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.346	ENSMUSG00000030204	Ddx47	95	81.818	Mus_musculus
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.579	MGP_PahariEiJ_G0022748	Ddx47	95	82.078	Mus_pahari
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.346	MGP_SPRETEiJ_G0030034	Ddx47	95	81.818	Mus_spretus
ENSACIG00000022802	ddx47	92	82.022	ENSMPUG00000011726	DDX47	92	84.086	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000022802	ddx47	89	85.280	ENSMLUG00000003163	DDX47	92	85.646	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.579	ENSNGAG00000020166	Ddx47	92	84.928	Nannospalax_galili
ENSACIG00000022802	ddx47	93	96.896	ENSNBRG00000001394	ddx47	95	96.896	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000022802	ddx47	89	84.346	ENSNLEG00000003605	DDX47	92	84.689	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000022802	ddx47	80	75.648	ENSMEUG00000005930	DDX47	95	75.798	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000022802	ddx47	72	84.247	ENSOPRG00000014446	DDX47	75	84.752	Ochotona_princeps
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