EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022810 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp30
Alias: fk66h08|rpp1|wu:fk66h08|zgc:110189
Full Name: ribonuclease P/MRP 30 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11671 bases
Position: chrCCOE01000630.1:42673-54343
Accession: ZDB-GENE-050320-45
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000029489	RNase_P_p30	PF01876.16	1.2e-68	1	1
ENSACIP00000029494	RNase_P_p30	PF01876.16	2.9e-53	1	2
ENSACIP00000029494	RNase_P_p30	PF01876.16	2.9e-53	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000030273	-	711	-	ENSACIP00000029494	236 (aa)	-	-
ENSACIT00000030267	-	837	-	ENSACIP00000029489	278 (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.369	ENSG00000148688	RPP30	100	52.941	Homo_sapiens
ENSACIG00000022810	rpp30	89	80.861	ENSAPOG00000023156	rpp30	87	80.861	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	60.944	ENSAMEG00000016776	RPP30	87	60.944	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000022810	rpp30	99	70.943	ENSAOCG00000016438	rpp30	78	85.652	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022810	rpp30	99	70.566	ENSAPEG00000008697	rpp30	80	85.217	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022810	rpp30	97	71.206	ENSATEG00000015263	rpp30	84	84.348	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022810	rpp30	88	47.479	ENSAPLG00000009959	RPP30	95	52.632	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000022810	rpp30	99	45.660	ENSACAG00000007996	RPP30	99	45.660	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000022810	rpp30	89	46.696	ENSANAG00000009439	RPP30	72	47.210	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000022810	rpp30	99	73.308	ENSACLG00000015389	-	86	89.130	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022810	rpp30	99	55.303	ENSAMXG00000040653	rpp30	97	55.303	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	59.657	ENSBTAG00000002973	RPP30	87	59.657	Bos_taurus
ENSACIG00000022810	rpp30	99	48.872	ENSCJAG00000011045	RPP30	99	48.872	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	59.657	ENSCAFG00000031801	RPP30	87	59.657	Canis_familiaris
ENSACIG00000022810	rpp30	83	59.657	ENSCAFG00020000258	RPP30	87	59.657	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000022810	rpp30	83	55.794	ENSCHIG00000012901	RPP30	86	55.794	Capra_hircus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.369	ENSTSYG00000013903	RPP30	87	58.369	Carlito_syrichta
ENSACIG00000022810	rpp30	77	45.652	ENSCAPG00000001326	RPP30	81	45.652	Cavia_aperea
ENSACIG00000022810	rpp30	89	53.219	ENSCPOG00000033174	RPP30	87	58.798	Cavia_porcellus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	59.227	ENSCCAG00000029514	RPP30	87	59.227	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.798	ENSCATG00000042072	RPP30	87	58.798	Cercocebus_atys
ENSACIG00000022810	rpp30	89	53.219	ENSCLAG00000008595	RPP30	87	58.798	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.369	ENSCSAG00000006694	RPP30	87	58.369	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	31.128	ENSCHOG00000007023	-	100	31.128	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000022810	rpp30	99	50.000	ENSCPBG00000026518	RPP30	98	50.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000022810	rpp30	86	35.021	ENSCSAVG00000011282	-	78	39.662	Ciona_savignyi
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.369	ENSCANG00000041084	RPP30	87	58.369	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000022810	rpp30	90	48.016	ENSCGRG00001000834	-	88	48.016	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000022810	rpp30	91	51.464	ENSCGRG00001017068	-	100	57.322	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000022810	rpp30	90	48.413	ENSCGRG00000006196	-	88	48.413	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000022810	rpp30	83	57.940	ENSCGRG00000002508	-	87	57.940	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000022810	rpp30	83	73.913	ENSCSEG00000001779	rpp30	79	73.913	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000022810	rpp30	99	66.667	ENSCVAG00000003139	rpp30	99	71.053	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022810	rpp30	99	62.774	ENSDARG00000027428	rpp30	99	62.774	Danio_rerio
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.798	ENSDNOG00000010186	RPP30	80	58.798	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	59.227	ENSDORG00000015333	Rpp30	87	59.227	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000022810	rpp30	82	30.769	FBgn0283652	Rpp30	77	30.769	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000022810	rpp30	99	49.438	ENSETEG00000018823	RPP30	99	49.438	Echinops_telfairi
ENSACIG00000022810	rpp30	99	49.064	ENSEASG00005011050	RPP30	99	49.064	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000022810	rpp30	99	49.064	ENSECAG00000021917	RPP30	99	49.064	Equus_caballus
ENSACIG00000022810	rpp30	97	32.950	ENSEEUG00000009986	-	99	32.950	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000022810	rpp30	99	56.015	ENSELUG00000003731	rpp30	94	60.377	Esox_lucius
ENSACIG00000022810	rpp30	83	60.086	ENSFCAG00000029073	RPP30	80	60.086	Felis_catus
ENSACIG00000022810	rpp30	99	48.872	ENSFALG00000007711	RPP30	99	48.872	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.798	ENSFDAG00000019241	RPP30	87	58.798	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000022810	rpp30	83	79.130	ENSFHEG00000014739	rpp30	83	79.612	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	62.288	ENSGMOG00000005379	rpp30	95	62.288	Gadus_morhua
ENSACIG00000022810	rpp30	99	48.302	ENSGALG00000006486	RPP30	89	58.182	Gallus_gallus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	78.261	ENSGAFG00000001445	rpp30	86	78.261	Gambusia_affinis
ENSACIG00000022810	rpp30	99	67.391	ENSGACG00000010285	rpp30	99	67.391	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000022810	rpp30	99	50.379	ENSGAGG00000000980	RPP30	64	56.800	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.798	ENSGGOG00000026917	RPP30	87	58.798	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000022810	rpp30	99	73.684	ENSHBUG00000019332	rpp30	86	89.130	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022810	rpp30	89	53.648	ENSHGLG00000013072	RPP30	87	59.227	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022810	rpp30	89	53.648	ENSHGLG00100017798	RPP30	87	59.227	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022810	rpp30	83	70.000	ENSHCOG00000004763	-	81	70.000	Hippocampus_comes
ENSACIG00000022810	rpp30	99	57.303	ENSIPUG00000003863	rpp30	99	60.440	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000022810	rpp30	99	49.064	ENSSTOG00000027002	RPP30	99	49.064	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000022810	rpp30	99	51.311	ENSJJAG00000020041	Rpp30	99	51.311	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000022810	rpp30	99	69.057	ENSKMAG00000015355	rpp30	86	82.609	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000022810	rpp30	99	58.736	ENSLBEG00000019989	rpp30	99	58.736	Labrus_bergylta
ENSACIG00000022810	rpp30	68	48.182	ENSLACG00000002534	RPP30	96	48.182	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000022810	rpp30	99	56.061	ENSLOCG00000000031	rpp30	98	56.061	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000022810	rpp30	99	49.438	ENSLAFG00000015931	RPP30	99	49.438	Loxodonta_africana
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.369	ENSMFAG00000031109	RPP30	87	58.369	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.369	ENSMMUG00000006628	RPP30	87	58.369	Macaca_mulatta
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.798	ENSMNEG00000033838	RPP30	87	58.798	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.369	ENSMLEG00000037578	RPP30	87	58.369	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000022810	rpp30	99	70.149	ENSMAMG00000010934	rpp30	99	70.149	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000022810	rpp30	99	73.684	ENSMZEG00005018508	-	86	89.130	Maylandia_zebra
ENSACIG00000022810	rpp30	99	48.289	ENSMGAG00000008452	RPP30	99	48.289	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.369	ENSMAUG00000008797	Rpp30	87	58.369	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	59.657	ENSMICG00000012019	RPP30	87	59.657	Microcebus_murinus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	57.511	ENSMOCG00000016872	Rpp30	87	57.511	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000022810	rpp30	97	66.667	ENSMMOG00000009266	rpp30	85	80.000	Mola_mola
ENSACIG00000022810	rpp30	99	48.770	ENSMODG00000009342	-	99	48.770	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000022810	rpp30	99	49.811	ENSMODG00000006863	-	99	49.811	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000022810	rpp30	99	70.260	ENSMALG00000011718	rpp30	99	70.260	Monopterus_albus
ENSACIG00000022810	rpp30	89	51.073	MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	87	56.223	Mus_caroli
ENSACIG00000022810	rpp30	89	51.502	ENSMUSG00000024800	Rpp30	87	56.652	Mus_musculus
ENSACIG00000022810	rpp30	89	51.073	MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	87	56.223	Mus_pahari
ENSACIG00000022810	rpp30	89	51.502	MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	87	56.652	Mus_spretus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	60.944	ENSMPUG00000017258	RPP30	81	60.944	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000022810	rpp30	83	59.657	ENSMLUG00000017169	RPP30	87	59.657	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.798	ENSNGAG00000012018	-	87	58.798	Nannospalax_galili
ENSACIG00000022810	rpp30	64	56.667	ENSNGAG00000014392	-	76	56.667	Nannospalax_galili
ENSACIG00000022810	rpp30	83	74.026	ENSNBRG00000024170	-	86	74.026	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.798	ENSNLEG00000012383	RPP30	87	58.798	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000022810	rpp30	99	43.911	ENSMEUG00000015587	-	100	43.911	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000022810	rpp30	51	64.085	ENSOPRG00000007367	-	100	64.085	Ochotona_princeps
ENSACIG00000022810	rpp30	99	43.697	ENSODEG00000004560	-	99	43.697	Octodon_degus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	60.086	ENSODEG00000004530	-	88	60.086	Octodon_degus
ENSACIG00000022810	rpp30	73	88.235	ENSONIG00000019140	rpp30	100	85.990	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000022810	rpp30	99	48.679	ENSOANG00000003415	RPP30	99	48.679	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000022810	rpp30	89	51.502	ENSOCUG00000006896	RPP30	80	56.652	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000022810	rpp30	97	70.916	ENSORLG00000020420	rpp30	79	84.783	Oryzias_latipes
ENSACIG00000022810	rpp30	83	86.957	ENSORLG00020009037	-	86	86.957	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000022810	rpp30	83	86.957	ENSORLG00015008300	rpp30	80	86.957	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000022810	rpp30	65	82.873	ENSOMEG00000012640	-	98	82.873	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000022810	rpp30	83	59.657	ENSOGAG00000013963	RPP30	87	59.657	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000022810	rpp30	83	54.506	ENSOARG00000015789	RPP30	87	54.506	Ovis_aries
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.798	ENSPPAG00000043779	RPP30	87	58.798	Pan_paniscus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	60.086	ENSPPRG00000000115	RPP30	87	60.086	Panthera_pardus
ENSACIG00000022810	rpp30	83	60.086	ENSPTIG00000014949	RPP30	87	60.086	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.798	ENSPTRG00000002742	RPP30	86	55.365	Pan_troglodytes
ENSACIG00000022810	rpp30	83	58.369	ENSPANG00000021710	RPP30	87	58.369	Papio_anubis
ENSACIG00000022810	rpp30	58	45.985	ENSPKIG00000024858	rpp30	78	45.775	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000022810	rpp30	89	50.579	ENSPSIG00000013213	RPP30	99	48.133	Pelodiscus_sinensis
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