EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000023037 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: zmat3
Alias: zmp:0000000878
Full Name: zinc finger%2C matrin-type 3
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8917 bases
Position: chrCCOE01000608.1:40769-49685
Accession: ZDB-GENE-130530-881
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000029755	zf-met	PF12874.7	5.3e-24	1	3
ENSACIP00000029755	zf-met	PF12874.7	5.3e-24	2	3
ENSACIP00000029755	zf-met	PF12874.7	5.3e-24	3	3
ENSACIP00000029755	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	2.5e-21	1	3
ENSACIP00000029755	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	2.5e-21	2	3
ENSACIP00000029755	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	2.5e-21	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000030536	-	861	-	ENSACIP00000029755	286 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000023037's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000023037's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.882	ENSG00000172667	ZMAT3	97	68.966	Homo_sapiens
ENSACIG00000023037	zmat3	100	87.153	ENSAPOG00000015037	zmat3	100	88.194	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023037	zmat3	82	66.406	ENSAMEG00000010742	ZMAT3	88	66.406	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000023037	zmat3	100	83.019	ENSAOCG00000017955	zmat3	94	89.888	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023037	zmat3	88	87.879	ENSAPEG00000014553	zmat3	97	87.879	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023037	zmat3	90	83.333	ENSATEG00000022244	zmat3	98	83.333	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023037	zmat3	91	62.366	ENSAPLG00000013292	ZMAT3	96	62.366	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000023037	zmat3	88	65.660	ENSACAG00000005005	ZMAT3	97	63.860	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000023037	zmat3	86	61.397	ENSANAG00000035673	ZMAT3	96	61.029	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000023037	zmat3	93	86.496	ENSACLG00000026272	zmat3	94	86.496	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023037	zmat3	100	64.935	ENSAMXG00000009798	zmat3	83	64.935	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023037	zmat3	82	66.667	ENSBTAG00000012463	ZMAT3	99	62.759	Bos_taurus
ENSACIG00000023037	zmat3	88	63.082	ENSCJAG00000013399	ZMAT3	97	63.441	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000023037	zmat3	92	61.856	ENSCAFG00000011081	ZMAT3	96	63.669	Canis_familiaris
ENSACIG00000023037	zmat3	92	61.856	ENSCAFG00020023107	ZMAT3	96	63.669	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000023037	zmat3	82	66.142	ENSCHIG00000025074	ZMAT3	98	62.807	Capra_hircus
ENSACIG00000023037	zmat3	88	63.082	ENSTSYG00000026546	ZMAT3	97	62.724	Carlito_syrichta
ENSACIG00000023037	zmat3	92	62.284	ENSCAPG00000014645	ZMAT3	99	62.284	Cavia_aperea
ENSACIG00000023037	zmat3	92	62.284	ENSCPOG00000003865	ZMAT3	99	62.284	Cavia_porcellus
ENSACIG00000023037	zmat3	92	63.322	ENSCCAG00000036721	ZMAT3	99	63.322	Cebus_capucinus
ENSACIG00000023037	zmat3	92	59.712	ENSCATG00000025137	ZMAT3	99	59.712	Cercocebus_atys
ENSACIG00000023037	zmat3	92	61.592	ENSCLAG00000013464	ZMAT3	99	61.592	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.748	ENSCSAG00000012935	ZMAT3	99	61.938	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000023037	zmat3	82	67.451	ENSCHOG00000005591	ZMAT3	97	63.669	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000023037	zmat3	91	61.733	ENSCPBG00000026917	ZMAT3	96	61.733	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.882	ENSCANG00000029476	ZMAT3	99	61.724	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000023037	zmat3	89	63.121	ENSCGRG00001012339	Zmat3	96	63.121	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000023037	zmat3	89	63.121	ENSCGRG00000011491	Zmat3	96	63.121	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000023037	zmat3	100	78.188	ENSCSEG00000019463	zmat3	96	78.188	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000023037	zmat3	99	86.056	ENSCVAG00000011847	zmat3	100	80.282	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000023037	zmat3	100	64.379	ENSDARG00000080021	zmat3	96	66.019	Danio_rerio
ENSACIG00000023037	zmat3	76	70.563	ENSDNOG00000012284	ZMAT3	97	63.441	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000023037	zmat3	82	66.008	ENSDORG00000011801	Zmat3	97	63.345	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000023037	zmat3	70	62.791	ENSETEG00000008883	ZMAT3	74	62.791	Echinops_telfairi
ENSACIG00000023037	zmat3	76	69.130	ENSEASG00005016887	ZMAT3	96	62.950	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000023037	zmat3	76	69.565	ENSECAG00000012784	ZMAT3	96	63.309	Equus_caballus
ENSACIG00000023037	zmat3	92	55.326	ENSEEUG00000001126	ZMAT3	99	55.326	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000023037	zmat3	81	73.913	ENSELUG00000010132	zmat3	84	64.417	Esox_lucius
ENSACIG00000023037	zmat3	76	69.264	ENSFCAG00000014578	ZMAT3	80	69.264	Felis_catus
ENSACIG00000023037	zmat3	88	63.774	ENSFALG00000008403	ZMAT3	89	63.774	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000023037	zmat3	92	62.069	ENSFDAG00000013376	ZMAT3	99	62.069	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000023037	zmat3	91	86.182	ENSFHEG00000003221	zmat3	99	86.909	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000023037	zmat3	80	77.273	ENSGMOG00000008558	zmat3	100	77.273	Gadus_morhua
ENSACIG00000023037	zmat3	88	64.394	ENSGALG00000040948	ZMAT3	98	64.173	Gallus_gallus
ENSACIG00000023037	zmat3	70	87.097	ENSGAFG00000010485	zmat3	55	87.097	Gambusia_affinis
ENSACIG00000023037	zmat3	86	82.759	ENSGACG00000006175	zmat3	100	82.759	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000023037	zmat3	91	61.733	ENSGAGG00000009275	ZMAT3	96	61.733	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.748	ENSGGOG00000009975	ZMAT3	99	61.592	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000023037	zmat3	96	90.545	ENSHBUG00000004401	zmat3	100	90.545	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000023037	zmat3	92	61.938	ENSHGLG00000011523	ZMAT3	99	61.938	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000023037	zmat3	92	61.938	ENSHGLG00100012235	ZMAT3	99	61.938	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000023037	zmat3	99	67.628	ENSHCOG00000010624	zmat3	97	68.269	Hippocampus_comes
ENSACIG00000023037	zmat3	97	59.202	ENSIPUG00000003043	zmat3	84	72.103	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.882	ENSSTOG00000028436	ZMAT3	97	62.278	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000023037	zmat3	75	69.469	ENSJJAG00000004288	Zmat3	97	62.278	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000023037	zmat3	100	87.302	ENSKMAG00000008962	zmat3	94	86.400	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000023037	zmat3	91	84.173	ENSLBEG00000001993	zmat3	99	84.173	Labrus_bergylta
ENSACIG00000023037	zmat3	94	56.849	ENSLACG00000015780	ZMAT3	78	56.849	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000023037	zmat3	100	60.248	ENSLOCG00000001108	zmat3	80	65.320	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000023037	zmat3	83	66.154	ENSLAFG00000000897	ZMAT3	99	62.543	Loxodonta_africana
ENSACIG00000023037	zmat3	83	65.251	ENSMFAG00000021292	ZMAT3	99	62.069	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000023037	zmat3	83	65.251	ENSMMUG00000003216	ZMAT3	99	62.069	Macaca_mulatta
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.882	ENSMNEG00000036725	ZMAT3	99	62.069	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000023037	zmat3	92	61.938	ENSMLEG00000026279	ZMAT3	99	61.938	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000023037	zmat3	88	84.766	ENSMAMG00000012349	zmat3	99	77.926	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000023037	zmat3	93	88.043	ENSMZEG00005015427	zmat3	94	88.406	Maylandia_zebra
ENSACIG00000023037	zmat3	88	64.394	ENSMGAG00000009873	ZMAT3	90	64.394	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000023037	zmat3	89	62.278	ENSMAUG00000001986	Zmat3	96	62.278	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000023037	zmat3	94	62.329	ENSMICG00000049501	ZMAT3	98	62.329	Microcebus_murinus
ENSACIG00000023037	zmat3	89	62.633	ENSMOCG00000018844	Zmat3	97	62.633	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000023037	zmat3	100	75.556	ENSMMOG00000001603	zmat3	99	77.170	Mola_mola
ENSACIG00000023037	zmat3	73	65.000	ENSMODG00000021308	ZMAT3	74	65.158	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000023037	zmat3	89	84.211	ENSMALG00000019683	zmat3	95	84.211	Monopterus_albus
ENSACIG00000023037	zmat3	85	62.593	MGP_CAROLIEiJ_G0024914	Zmat3	93	62.593	Mus_caroli
ENSACIG00000023037	zmat3	85	62.593	ENSMUSG00000027663	Zmat3	93	62.593	Mus_musculus
ENSACIG00000023037	zmat3	85	61.624	MGP_PahariEiJ_G0026359	Zmat3	93	61.624	Mus_pahari
ENSACIG00000023037	zmat3	85	62.593	MGP_SPRETEiJ_G0025848	Zmat3	93	62.593	Mus_spretus
ENSACIG00000023037	zmat3	92	61.592	ENSMPUG00000017206	ZMAT3	99	61.592	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000023037	zmat3	92	60.959	ENSMLUG00000013074	ZMAT3	99	60.959	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.613	ENSNGAG00000023602	Zmat3	96	62.989	Nannospalax_galili
ENSACIG00000023037	zmat3	96	90.545	ENSNBRG00000020886	zmat3	100	90.545	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.882	ENSNLEG00000005658	ZMAT3	99	61.724	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000023037	zmat3	94	58.131	ENSMEUG00000015724	ZMAT3	99	58.478	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000023037	zmat3	93	60.573	ENSODEG00000003313	ZMAT3	99	60.554	Octodon_degus
ENSACIG00000023037	zmat3	99	80.328	ENSONIG00000008388	zmat3	99	80.328	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000023037	zmat3	89	53.991	ENSOANG00000009901	ZMAT3	80	53.991	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000023037	zmat3	76	68.261	ENSOCUG00000004658	ZMAT3	98	60.702	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000023037	zmat3	99	68.314	ENSORLG00000011575	zmat3	80	69.811	Oryzias_latipes
ENSACIG00000023037	zmat3	99	68.023	ENSORLG00020005858	zmat3	80	66.575	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000023037	zmat3	99	68.314	ENSORLG00015003707	zmat3	80	67.403	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000023037	zmat3	85	88.525	ENSOMEG00000011303	zmat3	95	73.585	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.625	ENSOGAG00000003252	ZMAT3	98	62.238	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000023037	zmat3	82	66.275	ENSOARG00000020713	ZMAT3	98	62.937	Ovis_aries
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.882	ENSPPAG00000035483	ZMAT3	99	61.724	Pan_paniscus
ENSACIG00000023037	zmat3	92	62.199	ENSPPRG00000004407	ZMAT3	99	62.199	Panthera_pardus
ENSACIG00000023037	zmat3	92	62.199	ENSPTIG00000009929	ZMAT3	99	62.199	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.882	ENSPTRG00000015641	ZMAT3	99	61.724	Pan_troglodytes
ENSACIG00000023037	zmat3	92	61.724	ENSPANG00000023167	ZMAT3	99	61.724	Papio_anubis
ENSACIG00000023037	zmat3	100	63.576	ENSPKIG00000023370	zmat3	83	64.026	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000023037	zmat3	90	60.638	ENSPSIG00000014839	ZMAT3	97	60.638	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000023037	zmat3	92	73.993	ENSPMGG00000023924	zmat3	99	73.993	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000023037	zmat3	89	62.411	ENSPEMG00000019154	Zmat3	96	62.411	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000023037	zmat3	81	86.508	ENSPFOG00000019206	zmat3	83	75.389	Poecilia_formosa
ENSACIG00000023037	zmat3	91	84.477	ENSPLAG00000022572	zmat3	99	84.477	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000023037	zmat3	91	76.923	ENSPMEG00000004131	-	98	77.656	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000023037	zmat3	91	87.778	ENSPREG00000022632	zmat3	99	87.778	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.882	ENSPPYG00000014315	ZMAT3	99	61.724	Pongo_abelii
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.234	ENSPCAG00000008585	ZMAT3	89	65.234	Procavia_capensis
ENSACIG00000023037	zmat3	88	63.177	ENSPCOG00000022835	ZMAT3	96	63.177	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000023037	zmat3	82	66.016	ENSPVAG00000004489	ZMAT3	88	66.016	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000023037	zmat3	96	90.545	ENSPNYG00000014350	zmat3	100	90.545	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000023037	zmat3	100	64.725	ENSPNAG00000015664	zmat3	83	64.725	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000023037	zmat3	98	58.054	ENSRNOG00000010119	Zmat3	98	58.054	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.882	ENSRBIG00000029622	ZMAT3	99	61.379	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.882	ENSRROG00000038345	ZMAT3	99	61.379	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000023037	zmat3	84	65.517	ENSSBOG00000033332	ZMAT3	97	63.082	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000023037	zmat3	94	58.621	ENSSHAG00000016154	ZMAT3	82	65.289	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000023037	zmat3	100	66.438	ENSSFOG00015006984	zmat3	100	66.438	Scleropages_formosus
ENSACIG00000023037	zmat3	100	78.873	ENSSMAG00000019540	-	87	77.358	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000023037	zmat3	99	72.866	ENSSDUG00000016188	zmat3	97	75.000	Seriola_dumerili
ENSACIG00000023037	zmat3	99	72.866	ENSSLDG00000018611	zmat3	97	75.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000023037	zmat3	56	60.894	ENSSARG00000004901	ZMAT3	94	56.667	Sorex_araneus
ENSACIG00000023037	zmat3	86	62.879	ENSSPUG00000014753	ZMAT3	96	61.511	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000023037	zmat3	89	88.722	ENSSPAG00000011062	zmat3	98	81.046	Stegastes_partitus
ENSACIG00000023037	zmat3	92	62.587	ENSSSCG00000033860	ZMAT3	99	62.587	Sus_scrofa
ENSACIG00000023037	zmat3	88	63.774	ENSTGUG00000010765	-	89	63.774	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000023037	zmat3	79	89.270	ENSTRUG00000004788	zmat3	96	82.222	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000023037	zmat3	81	83.936	ENSTNIG00000006781	zmat3	99	76.596	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000023037	zmat3	62	76.000	ENSTBEG00000012359	ZMAT3	94	76.000	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000023037	zmat3	90	59.058	ENSTTRG00000004923	ZMAT3	98	56.856	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.625	ENSUAMG00000007623	ZMAT3	88	65.625	Ursus_americanus
ENSACIG00000023037	zmat3	82	65.490	ENSUMAG00000007847	ZMAT3	88	65.490	Ursus_maritimus
ENSACIG00000023037	zmat3	76	68.398	ENSVPAG00000006611	ZMAT3	99	60.690	Vicugna_pacos
ENSACIG00000023037	zmat3	92	61.856	ENSVVUG00000004729	ZMAT3	88	66.406	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000023037	zmat3	75	65.333	ENSXETG00000007251	zmat3	77	65.333	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000023037	zmat3	96	80.565	ENSXCOG00000008397	zmat3	100	80.565	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000023037	zmat3	98	69.653	ENSXMAG00000015188	zmat3	82	70.588	Xiphophorus_maculatus