EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000023049 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: znf646
Alias: si:rp71-1c10.2p|znf646p
Full Name: zinc finger protein 646
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13169 bases
Position: chrCCOE01000244.1:3668966-3682134
Accession: ZDB-GENE-160627-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000029782	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-81	1	12
ENSACIP00000029782	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-81	2	12
ENSACIP00000029782	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-81	3	12
ENSACIP00000029782	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-81	4	12
ENSACIP00000029782	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-81	5	12
ENSACIP00000029782	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-81	6	12
ENSACIP00000029782	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-81	7	12
ENSACIP00000029782	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-81	8	12
ENSACIP00000029782	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-81	9	12
ENSACIP00000029782	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-81	10	12
ENSACIP00000029782	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-81	11	12
ENSACIP00000029782	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-81	12	12
ENSACIP00000029769	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-61	1	11
ENSACIP00000029769	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-61	2	11
ENSACIP00000029769	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-61	3	11
ENSACIP00000029769	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-61	4	11
ENSACIP00000029769	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-61	5	11
ENSACIP00000029769	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-61	6	11
ENSACIP00000029769	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-61	7	11
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ENSACIP00000029769	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-61	9	11
ENSACIP00000029769	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-61	10	11
ENSACIP00000029769	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-61	11	11
ENSACIP00000029778	zf-C2H2	PF00096.26	8.4e-47	1	6
ENSACIP00000029778	zf-C2H2	PF00096.26	8.4e-47	2	6
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ENSACIP00000029778	zf-C2H2	PF00096.26	8.4e-47	4	6
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ENSACIP00000029778	zf-C2H2	PF00096.26	8.4e-47	6	6
ENSACIP00000029800	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-43	1	8
ENSACIP00000029800	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-43	2	8
ENSACIP00000029800	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-43	3	8
ENSACIP00000029800	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-43	4	8
ENSACIP00000029800	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-43	5	8
ENSACIP00000029800	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-43	6	8
ENSACIP00000029800	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-43	7	8
ENSACIP00000029800	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-43	8	8
ENSACIP00000029770	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-33	1	6
ENSACIP00000029770	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-33	2	6
ENSACIP00000029770	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-33	3	6
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ENSACIP00000029770	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-33	5	6
ENSACIP00000029770	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-33	6	6
ENSACIP00000029782	zf-met	PF12874.7	2.2e-17	1	3
ENSACIP00000029782	zf-met	PF12874.7	2.2e-17	2	3
ENSACIP00000029782	zf-met	PF12874.7	2.2e-17	3	3
ENSACIP00000029769	zf-met	PF12874.7	9.9e-13	1	3
ENSACIP00000029769	zf-met	PF12874.7	9.9e-13	2	3
ENSACIP00000029769	zf-met	PF12874.7	9.9e-13	3	3
ENSACIP00000029800	zf-met	PF12874.7	4.8e-11	1	2
ENSACIP00000029800	zf-met	PF12874.7	4.8e-11	2	2
ENSACIP00000029778	zf-met	PF12874.7	4.8e-11	1	3
ENSACIP00000029778	zf-met	PF12874.7	4.8e-11	2	3
ENSACIP00000029778	zf-met	PF12874.7	4.8e-11	3	3
ENSACIP00000029770	zf-met	PF12874.7	1.5e-09	1	3
ENSACIP00000029770	zf-met	PF12874.7	1.5e-09	2	3
ENSACIP00000029770	zf-met	PF12874.7	1.5e-09	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000030581	-	1038	-	ENSACIP00000029800	346 (aa)	-	-
ENSACIT00000030559	-	2214	-	ENSACIP00000029778	737 (aa)	-	-
ENSACIT00000030563	-	4305	-	ENSACIP00000029782	1434 (aa)	-	-
ENSACIT00000030550	-	3459	-	ENSACIP00000029769	1152 (aa)	-	-
ENSACIT00000030551	-	1377	-	ENSACIP00000029770	458 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000023049	znf646	95	47.059	ENSACIG00000019815	-	95	33.544
ENSACIG00000023049	znf646	97	40.541	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	92	45.333
ENSACIG00000023049	znf646	99	42.623	ENSACIG00000000286	-	85	45.349
ENSACIG00000023049	znf646	99	37.553	ENSACIG00000019102	-	54	37.600
ENSACIG00000023049	znf646	100	34.437	ENSACIG00000009128	-	84	40.351
ENSACIG00000023049	znf646	99	39.726	ENSACIG00000022645	-	52	42.353
ENSACIG00000023049	znf646	100	39.416	ENSACIG00000014123	znf236	79	35.897
ENSACIG00000023049	znf646	99	40.336	ENSACIG00000022658	-	98	39.130
ENSACIG00000023049	znf646	99	36.957	ENSACIG00000001296	-	77	42.857
ENSACIG00000023049	znf646	95	35.260	ENSACIG00000006377	-	59	44.737
ENSACIG00000023049	znf646	95	36.429	ENSACIG00000002180	-	97	39.640
ENSACIG00000023049	znf646	100	36.313	ENSACIG00000023513	znf384l	70	39.759
ENSACIG00000023049	znf646	99	33.937	ENSACIG00000007000	-	63	33.603
ENSACIG00000023049	znf646	100	38.655	ENSACIG00000016331	ZBTB14	60	38.400
ENSACIG00000023049	znf646	95	37.662	ENSACIG00000017166	-	90	36.232
ENSACIG00000023049	znf646	93	33.951	ENSACIG00000007096	-	93	43.529
ENSACIG00000023049	znf646	95	33.333	ENSACIG00000002190	gfi1b	62	39.535
ENSACIG00000023049	znf646	86	43.077	ENSACIG00000006826	-	52	43.077
ENSACIG00000023049	znf646	85	32.911	ENSACIG00000002944	-	83	32.911
ENSACIG00000023049	znf646	95	34.524	ENSACIG00000016180	znf341	54	34.524
ENSACIG00000023049	znf646	99	43.284	ENSACIG00000016182	-	90	37.383
ENSACIG00000023049	znf646	95	35.714	ENSACIG00000016117	-	92	35.821
ENSACIG00000023049	znf646	99	34.294	ENSACIG00000017644	-	91	31.538
ENSACIG00000023049	znf646	99	40.164	ENSACIG00000003754	-	98	41.593
ENSACIG00000023049	znf646	99	39.394	ENSACIG00000016944	-	80	48.000
ENSACIG00000023049	znf646	88	33.036	ENSACIG00000013946	-	50	33.036
ENSACIG00000023049	znf646	100	35.674	ENSACIG00000004041	-	96	36.364
ENSACIG00000023049	znf646	99	38.542	ENSACIG00000010637	-	64	38.542
ENSACIG00000023049	znf646	99	42.683	ENSACIG00000019447	-	77	40.237
ENSACIG00000023049	znf646	99	44.000	ENSACIG00000004745	-	89	39.655
ENSACIG00000023049	znf646	96	37.824	ENSACIG00000009755	-	83	41.935
ENSACIG00000023049	znf646	96	31.124	ENSACIG00000012263	znf319b	89	32.278
ENSACIG00000023049	znf646	94	39.706	ENSACIG00000018059	-	50	39.706
ENSACIG00000023049	znf646	100	43.038	ENSACIG00000004666	-	99	42.697
ENSACIG00000023049	znf646	100	31.500	ENSACIG00000023313	-	90	31.500
ENSACIG00000023049	znf646	99	41.176	ENSACIG00000019534	-	90	36.937
ENSACIG00000023049	znf646	99	37.795	ENSACIG00000004641	-	57	40.909
ENSACIG00000023049	znf646	96	40.299	ENSACIG00000007855	-	87	46.970
ENSACIG00000023049	znf646	100	35.556	ENSACIG00000013613	scrt1b	54	41.096
ENSACIG00000023049	znf646	95	39.175	ENSACIG00000003515	-	93	40.385
ENSACIG00000023049	znf646	99	34.091	ENSACIG00000022330	-	93	38.655
ENSACIG00000023049	znf646	95	43.697	ENSACIG00000017647	-	97	35.777
ENSACIG00000023049	znf646	96	35.833	ENSACIG00000018641	snai2	54	45.349
ENSACIG00000023049	znf646	99	39.316	ENSACIG00000007464	-	67	39.316
ENSACIG00000023049	znf646	99	31.765	ENSACIG00000007882	-	85	43.590
ENSACIG00000023049	znf646	99	41.026	ENSACIG00000016932	-	69	41.026
ENSACIG00000023049	znf646	99	36.893	ENSACIG00000006228	-	69	46.835
ENSACIG00000023049	znf646	95	40.385	ENSACIG00000008886	znf1164	87	38.710
ENSACIG00000023049	znf646	95	44.186	ENSACIG00000014282	znf526	85	44.186
ENSACIG00000023049	znf646	98	35.503	ENSACIG00000011515	-	66	35.503
ENSACIG00000023049	znf646	99	35.882	ENSACIG00000023212	-	79	37.778
ENSACIG00000023049	znf646	95	33.852	ENSACIG00000024444	-	63	39.535
ENSACIG00000023049	znf646	96	37.563	ENSACIG00000009717	-	98	32.993
ENSACIG00000023049	znf646	94	41.322	ENSACIG00000011541	-	81	41.322
ENSACIG00000023049	znf646	99	36.181	ENSACIG00000009780	-	93	30.000
ENSACIG00000023049	znf646	99	40.201	ENSACIG00000008448	-	73	40.000
ENSACIG00000023049	znf646	97	35.593	ENSACIG00000018952	-	55	39.024
ENSACIG00000023049	znf646	99	46.000	ENSACIG00000018022	-	51	46.000
ENSACIG00000023049	znf646	99	40.187	ENSACIG00000003720	-	61	40.698
ENSACIG00000023049	znf646	99	36.458	ENSACIG00000006755	-	83	41.593
ENSACIG00000023049	znf646	95	41.379	ENSACIG00000001767	zbtb41	61	30.214
ENSACIG00000023049	znf646	99	37.688	ENSACIG00000015835	-	73	40.260
ENSACIG00000023049	znf646	88	46.939	ENSACIG00000011318	snai1a	50	46.939
ENSACIG00000023049	znf646	100	35.526	ENSACIG00000018404	-	80	35.526
ENSACIG00000023049	znf646	99	36.134	ENSACIG00000019804	-	85	44.318
ENSACIG00000023049	znf646	99	33.333	ENSACIG00000010739	-	91	33.333
ENSACIG00000023049	znf646	95	42.857	ENSACIG00000012084	-	99	45.455
ENSACIG00000023049	znf646	95	35.246	ENSACIG00000001860	-	70	39.130
ENSACIG00000023049	znf646	99	40.000	ENSACIG00000011153	-	78	37.864
ENSACIG00000023049	znf646	99	32.743	ENSACIG00000000406	prdm5	76	30.286
ENSACIG00000023049	znf646	99	32.773	ENSACIG00000009443	-	62	48.101
ENSACIG00000023049	znf646	97	55.072	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	95	48.193
ENSACIG00000023049	znf646	99	37.805	ENSACIG00000022293	-	96	38.068
ENSACIG00000023049	znf646	95	38.596	ENSACIG00000013470	-	69	34.545
ENSACIG00000023049	znf646	98	34.568	ENSACIG00000001369	-	83	39.506
ENSACIG00000023049	znf646	95	42.373	ENSACIG00000019710	-	77	41.026
ENSACIG00000023049	znf646	95	30.137	ENSACIG00000011516	-	79	30.137
ENSACIG00000023049	znf646	95	31.064	ENSACIG00000020938	zbtb47b	77	32.558
ENSACIG00000023049	znf646	99	34.363	ENSACIG00000013163	-	88	34.211
ENSACIG00000023049	znf646	99	36.735	ENSACIG00000013750	-	81	36.735
ENSACIG00000023049	znf646	99	37.607	ENSACIG00000010647	-	99	42.353
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