EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000023130 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: kpnb1
Alias: wu:fc12b10|zgc:123184
Full Name: karyopherin (importin) beta 1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9220 bases
Position: chrCCOE01000786.1:193427-202646
Accession: ZDB-GENE-030131-2579
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000029895	IBN_N	PF03810.19	1.7e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000030678	-	2574	-	ENSACIP00000029895	857 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.757	ENSG00000108424	KPNB1	99	94.521	Homo_sapiens
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	99.416	ENSAPOG00000020572	kpnb1	98	99.416	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023130	kpnb1	98	93.009	ENSAMEG00000004613	KPNB1	100	93.009	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	99.416	ENSAOCG00000007048	kpnb1	98	99.416	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	99.416	ENSAPEG00000008270	kpnb1	98	99.416	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	98.715	ENSATEG00000015139	kpnb1	98	98.715	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023130	kpnb1	98	92.663	ENSAPLG00000010177	KPNB1	96	92.663	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	93.458	ENSACAG00000007097	KPNB1	98	93.458	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	89.965	ENSANAG00000024932	-	98	89.965	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	99.650	ENSACLG00000015070	kpnb1	98	99.650	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	97.664	ENSAMXG00000041903	kpnb1	98	97.664	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	93.107	ENSBTAG00000006586	KPNB1	98	93.107	Bos_taurus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	47.907	WBGene00002075	imb-1	96	47.907	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.874	ENSCJAG00000007834	KPNB1	98	92.874	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	93.107	ENSCAFG00000016678	KPNB1	98	93.107	Canis_familiaris
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	93.116	ENSCAFG00020023205	KPNB1	98	93.116	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	93.116	ENSCHIG00000014896	KPNB1	98	93.116	Capra_hircus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.908	ENSTSYG00000014472	KPNB1	98	92.908	Carlito_syrichta
ENSACIG00000023130	kpnb1	98	93.238	ENSCAPG00000014185	KPNB1	100	93.238	Cavia_aperea
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	93.107	ENSCPOG00000006566	KPNB1	98	93.107	Cavia_porcellus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	70.266	ENSCCAG00000018551	-	95	72.015	Cebus_capucinus
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	86.380	ENSCCAG00000029263	-	98	86.380	Cebus_capucinus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.757	ENSCATG00000037124	KPNB1	98	92.757	Cercocebus_atys
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.991	ENSCLAG00000017091	KPNB1	98	92.991	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.757	ENSCSAG00000002605	KPNB1	98	92.757	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000023130	kpnb1	71	84.906	ENSCHOG00000010604	KPNB1	69	84.906	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	93.692	ENSCPBG00000027423	KPNB1	94	93.692	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	65.228	ENSCING00000004639	-	97	65.228	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	62.890	ENSCSAVG00000008624	-	98	62.890	Ciona_savignyi
ENSACIG00000023130	kpnb1	98	93.722	ENSCANG00000013489	KPNB1	100	93.722	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.991	ENSCGRG00001016042	Kpnb1	98	92.991	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000023130	kpnb1	98	93.128	ENSCGRG00000013910	Kpnb1	100	93.120	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	95.188	ENSCSEG00000007991	kpnb1	100	95.188	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	96.963	ENSDARG00000104889	kpnb1	98	96.963	Danio_rerio
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	62.500	FBgn0262743	Fs(2)Ket	97	62.500	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	80.863	ENSEBUG00000013869	kpnb1	98	80.863	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	93.107	ENSEASG00005000805	KPNB1	98	93.107	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	93.116	ENSECAG00000014560	KPNB1	98	93.116	Equus_caballus
ENSACIG00000023130	kpnb1	87	93.467	ENSEEUG00000005046	KPNB1	88	93.467	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	98.131	ENSELUG00000015847	kpnb1	98	98.131	Esox_lucius
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	93.107	ENSFCAG00000023994	KPNB1	98	93.107	Felis_catus
ENSACIG00000023130	kpnb1	98	93.476	ENSFDAG00000019923	KPNB1	100	93.476	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	98.131	ENSFHEG00000020199	kpnb1	98	98.131	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.874	ENSGMOG00000011607	kpnb1	97	92.874	Gadus_morhua
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.991	ENSGALG00000036962	KPNB1	98	92.991	Gallus_gallus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	98.131	ENSGAFG00000000783	kpnb1	98	98.131	Gambusia_affinis
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	93.988	ENSGACG00000014765	kpnb1	98	93.988	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000023130	kpnb1	98	93.103	ENSGAGG00000023737	KPNB1	92	93.103	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.757	ENSGGOG00000008089	KPNB1	98	92.757	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	99.650	ENSHBUG00000016826	kpnb1	98	99.650	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	93.349	ENSHGLG00000014138	KPNB1	98	93.349	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000023130	kpnb1	98	93.483	ENSHGLG00100006572	KPNB1	100	93.476	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	95.210	ENSHCOG00000002084	kpnb1	98	95.210	Hippocampus_comes
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	92.765	ENSIPUG00000012402	kpnb1	95	92.765	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	93.116	ENSSTOG00000007896	KPNB1	98	93.116	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.991	ENSJJAG00000010909	Kpnb1	98	92.991	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	97.780	ENSKMAG00000001547	kpnb1	98	97.780	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	98.347	ENSLBEG00000025794	kpnb1	99	96.383	Labrus_bergylta
ENSACIG00000023130	kpnb1	89	92.408	ENSLACG00000017620	KPNB1	98	92.408	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	97.783	ENSLOCG00000013753	kpnb1	98	97.783	Lepisosteus_oculatus
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ENSACIG00000023130	kpnb1	98	92.891	ENSMLEG00000038185	KPNB1	97	92.891	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	99.299	ENSMAMG00000011036	kpnb1	98	99.299	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	99.650	ENSMZEG00005004564	kpnb1	98	99.650	Maylandia_zebra
ENSACIG00000023130	kpnb1	56	92.754	ENSMGAG00000002770	-	100	92.754	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.991	ENSMAUG00000006211	Kpnb1	98	92.991	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	93.107	ENSMICG00000012059	KPNB1	82	93.107	Microcebus_murinus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.991	ENSMOCG00000003683	Kpnb1	98	92.991	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	93.575	ENSMODG00000012505	KPNB1	98	93.575	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	99.300	ENSMALG00000000863	kpnb1	98	99.299	Monopterus_albus
ENSACIG00000023130	kpnb1	94	93.392	MGP_CAROLIEiJ_G0017050	Kpnb1	98	93.392	Mus_caroli
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.874	ENSMUSG00000001440	Kpnb1	98	92.874	Mus_musculus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.065	ENSMPUG00000015220	KPNB1	98	92.065	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	88.112	ENSMLUG00000014522	KPNB1	98	88.112	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000023130	kpnb1	98	93.128	ENSNGAG00000017610	Kpnb1	100	93.120	Nannospalax_galili
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	99.650	ENSNBRG00000019305	kpnb1	98	99.650	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.757	ENSNLEG00000001446	KPNB1	98	92.757	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	87.850	ENSMEUG00000014284	KPNB1	98	87.850	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.991	ENSODEG00000017287	KPNB1	98	92.991	Octodon_degus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	99.766	ENSONIG00000009269	kpnb1	98	99.766	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	93.107	ENSOCUG00000015425	KPNB1	98	93.107	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	98.598	ENSORLG00000019936	kpnb1	98	98.598	Oryzias_latipes
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	98.598	ENSORLG00020021181	kpnb1	98	98.598	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	98.481	ENSORLG00015012177	kpnb1	98	98.481	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	98.715	ENSOMEG00000021022	kpnb1	98	98.715	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.991	ENSOGAG00000006153	KPNB1	98	92.991	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.389	ENSOARG00000008469	KPNB1	99	92.389	Ovis_aries
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.757	ENSPPAG00000028842	KPNB1	98	92.757	Pan_paniscus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.925	ENSPPRG00000022879	KPNB1	97	92.925	Panthera_pardus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.925	ENSPTIG00000006870	KPNB1	97	92.925	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.757	ENSPTRG00000009333	KPNB1	98	92.757	Pan_troglodytes
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	92.765	ENSPANG00000022099	KPNB1	98	92.765	Papio_anubis
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	97.316	ENSPKIG00000017563	kpnb1	98	97.316	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000023130	kpnb1	98	93.713	ENSPSIG00000009775	KPNB1	100	93.713	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000023130	kpnb1	100	90.676	ENSPMGG00000001041	kpnb1	91	90.676	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	92.991	ENSPEMG00000017783	Kpnb1	98	92.991	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	85.198	ENSPMAG00000007117	kpnb1	98	85.198	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000023130	kpnb1	99	93.575	ENSPCIG00000001034	KPNB1	98	93.575	Phascolarctos_cinereus
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ENSACIG00000023130	kpnb1	99	98.131	ENSPREG00000012268	kpnb1	98	98.131	Poecilia_reticulata
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