EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000023177 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8271 bases
Position: chrCCOE01000727.1:117297-125567
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000029953	Endonuclease_NS	PF01223.23	1.1e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000030738	-	819	-	ENSACIP00000029953	272 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000023177	-	69	32.432	ENSACIG00000012712	-	68	32.432
ENSACIG00000023177	-	71	31.489	ENSACIG00000009432	-	82	31.489
ENSACIG00000023177	-	80	54.667	ENSACIG00000008317	-	87	54.667
ENSACIG00000023177	-	91	48.339	ENSACIG00000008299	-	93	48.339
ENSACIG00000023177	-	81	51.822	ENSACIG00000007813	-	87	52.814
ENSACIG00000023177	-	63	31.818	ENSACIG00000001431	-	70	32.323
ENSACIG00000023177	-	75	31.466	ENSACIG00000006055	-	72	31.197
ENSACIG00000023177	-	77	63.507	ENSACIG00000023171	-	86	62.844
ENSACIG00000023177	-	76	31.707	ENSACIG00000015751	-	82	31.707
ENSACIG00000023177	-	54	32.240	ENSACIG00000016021	si:dkey-243k1.3	66	32.065

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000023177	-	63	32.323	ENSAPOG00000008291	-	66	32.323	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023177	-	85	51.464	ENSAPOG00000022953	-	87	51.464	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023177	-	61	35.417	ENSAPOG00000008666	-	64	35.417	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023177	-	78	30.769	ENSAPOG00000023293	-	78	30.769	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023177	-	79	32.456	ENSAPOG00000006928	si:dkey-243k1.3	92	31.641	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023177	-	85	52.033	ENSAPOG00000022923	-	92	52.033	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023177	-	85	51.681	ENSAPOG00000013654	-	84	51.681	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023177	-	89	57.708	ENSAPOG00000012244	-	96	56.343	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023177	-	71	31.674	ENSAPOG00000022205	-	68	31.390	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023177	-	68	30.804	ENSAPOG00000010331	si:dkey-85k7.11	72	30.804	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023177	-	62	32.673	ENSAOCG00000015199	-	81	30.579	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023177	-	61	34.375	ENSAOCG00000013137	-	66	33.838	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023177	-	71	31.222	ENSAOCG00000000850	-	67	30.942	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023177	-	63	31.818	ENSAOCG00000005015	-	65	31.818	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023177	-	68	33.803	ENSAOCG00000021316	si:dkey-85k7.11	69	33.803	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023177	-	92	53.516	ENSAOCG00000008016	si:ch211-133n4.4	85	58.222	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023177	-	78	31.174	ENSAOCG00000007227	-	78	31.174	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023177	-	71	31.222	ENSAPEG00000018986	-	67	30.942	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023177	-	63	31.818	ENSAPEG00000008708	-	65	31.818	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023177	-	63	32.663	ENSAPEG00000018889	si:dkey-85k7.11	71	32.663	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023177	-	50	58.993	ENSAPEG00000017445	-	83	58.993	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023177	-	71	31.222	ENSAPEG00000012445	-	67	30.942	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023177	-	61	34.375	ENSAPEG00000007291	-	66	33.838	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023177	-	78	30.769	ENSAPEG00000013928	-	78	30.769	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023177	-	63	32.195	ENSAPEG00000024409	si:dkey-243k1.3	81	30.579	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023177	-	88	54.656	ENSAPEG00000023828	-	96	54.656	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023177	-	83	56.034	ENSATEG00000014542	-	81	56.612	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	92	48.327	ENSATEG00000014512	-	73	50.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	88	44.898	ENSATEG00000014380	-	76	45.490	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	88	43.802	ENSATEG00000014466	-	85	44.355	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	83	52.400	ENSATEG00000014635	-	89	52.290	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	85	59.302	ENSATEG00000014701	-	64	59.302	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	83	49.020	ENSATEG00000014514	-	75	49.421	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	71	34.081	ENSATEG00000011941	-	73	33.750	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	86	49.231	ENSATEG00000014502	-	62	49.231	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	81	30.638	ENSATEG00000021350	-	73	30.638	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	72	32.000	ENSATEG00000017500	si:dkey-85k7.11	71	32.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	86	51.230	ENSATEG00000014652	-	99	51.230	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	85	53.527	ENSATEG00000014686	-	70	53.527	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	87	47.547	ENSATEG00000014477	-	70	47.955	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	76	31.224	ENSATEG00000009957	-	72	31.224	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	80	43.265	ENSATEG00000014672	-	85	43.750	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	81	52.743	ENSATEG00000014589	-	86	52.743	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	82	30.800	ENSATEG00000019243	-	64	33.854	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	83	53.488	ENSATEG00000014459	-	55	53.817	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	81	53.648	ENSATEG00000014621	-	90	53.648	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	66	31.776	ENSATEG00000022068	si:dkey-243k1.3	81	30.041	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	83	49.804	ENSATEG00000014526	-	72	50.193	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	83	49.020	ENSATEG00000014520	-	76	49.434	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	77	52.804	ENSATEG00000014488	-	76	52.336	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	83	46.988	ENSATEG00000014484	-	77	47.431	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	89	49.398	ENSATEG00000014579	-	87	49.802	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	83	50.199	ENSATEG00000014573	-	79	50.575	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	88	46.296	ENSATEG00000014430	-	70	46.715	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	63	31.818	ENSATEG00000008791	-	64	31.818	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023177	-	69	32.127	ENSAPLG00000004064	-	75	32.127	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000023177	-	76	31.224	ENSACAG00000005752	-	82	30.802	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000023177	-	82	36.293	ENSACAG00000005411	-	87	35.521	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000023177	-	69	31.944	ENSACLG00000013353	-	67	31.944	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023177	-	73	31.878	ENSACLG00000026586	-	74	31.878	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023177	-	87	52.091	ENSACLG00000015425	-	75	52.091	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023177	-	83	55.823	ENSACLG00000017798	-	85	54.545	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023177	-	72	30.804	ENSACLG00000018957	si:dkey-85k7.11	71	31.250	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023177	-	74	31.535	ENSACLG00000001104	-	80	31.120	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023177	-	91	55.720	ENSACLG00000017733	-	71	59.023	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023177	-	73	58.824	ENSACLG00000017744	-	79	58.824	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023177	-	74	31.224	ENSACLG00000011404	si:dkey-243k1.3	73	32.569	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023177	-	72	30.453	ENSACLG00000016915	-	75	30.453	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023177	-	72	32.143	ENSACLG00000021771	-	66	32.143	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023177	-	78	68.372	ENSACLG00000017724	-	90	65.948	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023177	-	68	30.660	ENSAMXG00000019995	zgc:172339	69	30.660	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023177	-	86	31.136	ENSAMXG00000040657	-	91	31.136	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023177	-	66	31.925	ENSAMXG00000007611	si:dkey-243k1.3	70	32.710	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023177	-	72	32.787	ENSAMXG00000010981	-	87	31.734	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023177	-	63	31.313	ENSAMXG00000032585	-	68	31.313	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023177	-	63	30.653	ENSAMXG00000037726	si:dkey-85k7.10	67	30.653	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023177	-	75	33.740	ENSAMXG00000019466	-	79	33.333	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023177	-	68	31.481	ENSAMXG00000040929	-	79	31.579	Astyanax_mexicanus
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ENSACIG00000023177	-	63	31.373	ENSAMXG00000034695	-	88	31.890	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023177	-	79	32.927	ENSAMXG00000038214	-	93	31.429	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023177	-	64	33.838	ENSAMXG00000030013	-	80	33.838	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023177	-	57	36.310	ENSAMXG00000037387	-	78	32.710	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023177	-	78	30.544	ENSAMXG00000036738	si:dkey-85k7.11	76	30.544	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023177	-	71	30.802	ENSAMXG00000036403	-	80	31.579	Astyanax_mexicanus
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ENSACIG00000023177	-	76	32.068	ENSCVAG00000002820	-	72	30.380	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000023177	-	61	31.771	ENSCVAG00000007343	-	64	31.771	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000023177	-	68	31.507	ENSCVAG00000006246	si:dkey-243k1.3	75	31.507	Cyprinodon_variegatus
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