EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000023222 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8316 bases
Position: chrCCOE01001065.1:511228-519543
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000030021	MMR_HSR1	PF01926.23	0.00013	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000030809	-	654	-	ENSACIP00000030021	217 (aa)	-	-
ENSACIT00000030815	-	606	-	ENSACIP00000030027	201 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000023222's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000023222's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000023222	-	84	37.745	ENSACIG00000017403	rab11al	94	37.745
ENSACIG00000023222	-	61	31.111	ENSACIG00000009071	rheb	75	31.111
ENSACIG00000023222	-	71	38.095	ENSACIG00000007739	rab9b	82	38.095
ENSACIG00000023222	-	69	40.000	ENSACIG00000006949	RAB17	70	40.000
ENSACIG00000023222	-	94	38.426	ENSACIG00000019251	rab5aa	99	38.426
ENSACIG00000023222	-	78	35.870	ENSACIG00000011024	si:dkey-13a21.4	90	35.870
ENSACIG00000023222	-	55	37.500	ENSACIG00000008620	rab34a	53	37.500
ENSACIG00000023222	-	71	41.463	ENSACIG00000010619	rab15	77	41.463
ENSACIG00000023222	-	83	37.186	ENSACIG00000019803	rab25a	93	37.186
ENSACIG00000023222	-	70	36.145	ENSACIG00000014012	rab22a	83	36.145
ENSACIG00000023222	-	70	39.157	ENSACIG00000013630	RAB7A	80	39.157
ENSACIG00000023222	-	68	41.139	ENSACIG00000014094	rab6bb	77	41.139
ENSACIG00000023222	-	76	34.857	ENSACIG00000009617	rab18a	81	34.857
ENSACIG00000023222	-	55	47.059	ENSACIG00000019631	rab11bb	62	47.059
ENSACIG00000023222	-	54	31.092	ENSACIG00000008975	arl5c	62	31.092
ENSACIG00000023222	-	85	35.749	ENSACIG00000013119	-	88	35.749
ENSACIG00000023222	-	79	30.168	ENSACIG00000000670	rabl2	78	30.168
ENSACIG00000023222	-	72	43.976	ENSACIG00000009006	zgc:171927	77	43.976
ENSACIG00000023222	-	84	39.286	ENSACIG00000014625	-	96	39.286
ENSACIG00000023222	-	70	40.854	ENSACIG00000000154	RAB39B	77	40.854
ENSACIG00000023222	-	69	41.509	ENSACIG00000014605	rab6a	76	41.509
ENSACIG00000023222	-	78	30.769	ENSACIG00000017824	rras	94	31.443
ENSACIG00000023222	-	70	37.349	ENSACIG00000006558	-	82	37.349
ENSACIG00000023222	-	79	37.838	ENSACIG00000000642	rab36	68	37.838
ENSACIG00000023222	-	70	41.718	ENSACIG00000020616	rab12	66	41.718
ENSACIG00000023222	-	62	30.147	ENSACIG00000008614	arl8ba	70	30.147
ENSACIG00000023222	-	65	31.788	ENSACIG00000000100	kras	54	32.738
ENSACIG00000023222	-	72	40.588	ENSACIG00000017414	rab25b	80	40.588
ENSACIG00000023222	-	74	42.690	ENSACIG00000007154	rab6ba	77	42.690
ENSACIG00000023222	-	71	41.718	ENSACIG00000024376	-	74	41.718
ENSACIG00000023222	-	82	38.660	ENSACIG00000024374	rab11ba	79	38.660
ENSACIG00000023222	-	62	30.216	ENSACIG00000000868	arl8a	70	30.216
ENSACIG00000023222	-	84	34.000	ENSACIG00000018043	rab9a	97	34.000
ENSACIG00000023222	-	63	43.624	ENSACIG00000021855	rab33ba	62	43.624
ENSACIG00000023222	-	67	39.744	ENSACIG00000009306	RAB15	73	39.744
ENSACIG00000023222	-	69	40.881	ENSACIG00000010914	RAB41	75	40.881
ENSACIG00000023222	-	81	40.541	ENSACIG00000010896	rab5c	76	42.771
ENSACIG00000023222	-	94	30.837	ENSACIG00000004859	rab34b	83	31.683
ENSACIG00000023222	-	70	39.634	ENSACIG00000003102	rab42a	75	39.634
ENSACIG00000023222	-	62	30.667	ENSACIG00000023481	rasl11b	60	30.667
ENSACIG00000023222	-	73	37.356	ENSACIG00000021459	zgc:101559	76	37.356
ENSACIG00000023222	-	84	41.026	ENSACIG00000008584	rab13	89	41.026
ENSACIG00000023222	-	70	39.759	ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	74	39.759
ENSACIG00000023222	-	70	40.854	ENSACIG00000023837	-	77	40.854
ENSACIG00000023222	-	62	30.147	ENSACIG00000009595	arl8bb	70	30.147
ENSACIG00000023222	-	84	38.071	ENSACIG00000019049	rab1ab	98	37.313
ENSACIG00000023222	-	73	38.506	ENSACIG00000022208	-	84	38.506
ENSACIG00000023222	-	71	39.053	ENSACIG00000022520	rab33a	75	39.053
ENSACIG00000023222	-	60	30.000	ENSACIG00000020496	rab23	75	30.519
ENSACIG00000023222	-	66	47.712	ENSACIG00000003157	-	80	47.712
ENSACIG00000023222	-	84	37.931	ENSACIG00000003092	rab11a	94	37.931
ENSACIG00000023222	-	55	30.827	ENSACIG00000018406	rasl11a	51	30.827
ENSACIG00000023222	-	70	39.157	ENSACIG00000022381	-	80	39.157
ENSACIG00000023222	-	87	38.119	ENSACIG00000008102	rab18b	96	38.119

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000023222	-	86	77.041	ENSG00000172794	RAB37	89	82.099	Homo_sapiens
ENSACIG00000023222	-	88	75.369	ENSCPOG00000025645	RAB37	94	75.369	Cavia_porcellus
ENSACIG00000023222	-	85	76.410	ENSCLAG00000008913	RAB37	90	76.410	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000023222	-	87	85.149	ENSCVAG00000014416	-	96	85.149	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000023222	-	85	84.409	ENSELUG00000023120	-	93	84.409	Esox_lucius
ENSACIG00000023222	-	85	76.923	ENSFDAG00000015285	RAB37	90	76.923	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000023222	-	87	85.427	ENSGAFG00000014730	-	99	85.427	Gambusia_affinis
ENSACIG00000023222	-	85	76.410	ENSHGLG00000004384	RAB37	90	76.410	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000023222	-	85	76.410	ENSHGLG00100012557	-	90	76.410	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000023222	-	84	86.458	ENSLBEG00000027539	-	88	86.458	Labrus_bergylta
ENSACIG00000023222	-	82	77.249	ENSMAMG00000020286	-	91	77.249	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000023222	-	85	76.923	MGP_CAROLIEiJ_G0017386	Rab37	90	76.923	Mus_caroli
ENSACIG00000023222	-	85	76.923	ENSMUSG00000020732	Rab37	90	76.923	Mus_musculus
ENSACIG00000023222	-	85	76.923	MGP_PahariEiJ_G0018517	Rab37	90	76.923	Mus_pahari
ENSACIG00000023222	-	85	76.923	MGP_SPRETEiJ_G0018231	Rab37	90	76.923	Mus_spretus
ENSACIG00000023222	-	89	79.798	ENSNBRG00000011872	-	97	79.798	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000023222	-	84	83.938	ENSORLG00000024558	-	79	83.938	Oryzias_latipes
ENSACIG00000023222	-	84	83.938	ENSORLG00020015717	-	79	83.938	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000023222	-	84	84.456	ENSORLG00015013564	-	97	84.456	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000023222	-	84	84.456	ENSOMEG00000018494	-	79	84.456	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000023222	-	84	77.202	ENSPCIG00000004450	-	89	77.202	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000023222	-	95	80.645	ENSPFOG00000006314	-	89	80.645	Poecilia_formosa
ENSACIG00000023222	-	95	80.645	ENSPFOG00000019144	-	89	80.645	Poecilia_formosa
ENSACIG00000023222	-	95	80.184	ENSPMEG00000017161	-	89	80.184	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000023222	-	95	80.184	ENSPMEG00000002564	-	89	80.184	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000023222	-	85	70.588	ENSPPYG00000008601	-	89	70.588	Pongo_abelii
ENSACIG00000023222	-	84	77.083	ENSPNAG00000021675	-	89	77.083	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000023222	-	92	80.465	ENSXMAG00000021303	-	89	80.465	Xiphophorus_maculatus