EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000023313 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 25058 bases
Position: chrCCOE01000789.1:69949-95006
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACIP00000030122	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-54	10	10
ENSACIP00000030122	zf-met	PF12874.7	1.2e-26	1	2
ENSACIP00000030122	zf-met	PF12874.7	1.2e-26	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000030915	-	1539	-	ENSACIP00000030122	512 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000023313	-	88	44.262	ENSACIG00000016944	-	81	44.262
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ENSACIG00000023313	-	89	33.333	ENSACIG00000013613	scrt1b	59	33.333
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ENSACIG00000023313	-	88	35.862	ENSACIG00000000406	prdm5	82	33.495
ENSACIG00000023313	-	87	36.527	ENSACIG00000016779	patz1	51	34.615
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ENSACIG00000023313	-	91	37.931	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	90	37.931

Orthologs

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ENSACIG00000023313	-	92	39.597	ENSG00000267041	ZNF850	88	40.045	Homo_sapiens
ENSACIG00000023313	-	96	42.308	ENSAPOG00000004628	-	99	42.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023313	-	97	36.935	ENSAPOG00000007596	-	92	36.935	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023313	-	92	37.945	ENSAPOG00000007629	-	95	37.945	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023313	-	92	36.316	ENSAPOG00000008386	-	86	36.316	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023313	-	97	40.346	ENSAPOG00000003666	-	99	40.346	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023313	-	88	33.083	ENSAPOG00000022113	-	82	34.339	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023313	-	94	37.124	ENSAPOG00000004417	-	95	35.913	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023313	-	96	48.246	ENSAMEG00000007611	-	99	45.968	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000023313	-	90	39.456	ENSAOCG00000022283	-	90	37.868	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023313	-	99	38.137	ENSAOCG00000001341	-	91	37.251	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023313	-	88	34.862	ENSAOCG00000001327	-	90	34.862	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023313	-	89	36.336	ENSAOCG00000004559	-	89	36.336	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023313	-	92	37.132	ENSAOCG00000004564	-	100	37.132	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000023313	-	91	33.117	ENSXETG00000010512	-	99	32.314	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000023313	-	93	39.145	ENSXETG00000034213	-	99	39.145	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000023313	-	94	38.116	ENSXETG00000030307	-	100	39.198	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000023313	-	90	36.364	ENSXMAG00000000617	-	74	36.364	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000023313	-	94	34.171	ENSXMAG00000021642	-	50	34.171	Xiphophorus_maculatus