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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000023553 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: smfn
Alias: zgc:73191
Full Name: small fragment nuclease
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12513 bases
Position: chrCCOE01001646.1:101960-114472
Accession: ZDB-GENE-040426-1709
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000030435	RNase_T	PF00929.24	1.7e-28	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000031230	-	558	-	ENSACIP00000030435	185 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000023553	smfn	90	82.530	ENSG00000076043	REXO2	96	80.663	Homo_sapiens
ENSACIG00000023553	smfn	60	89.286	ENSAPOG00000011971	smfn	97	89.286	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSAMEG00000013263	REXO2	76	80.663	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000023553	smfn	71	87.879	ENSAOCG00000011565	smfn	80	87.879	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023553	smfn	99	90.761	ENSAPEG00000012435	smfn	68	90.761	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023553	smfn	100	87.634	ENSATEG00000015385	smfn	67	87.634	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023553	smfn	100	79.032	ENSAPLG00000005045	REXO2	92	79.032	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000023553	smfn	94	72.989	ENSACAG00000011631	REXO2	81	72.989	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000023553	smfn	63	63.793	ENSANAG00000027457	-	93	60.294	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.215	ENSANAG00000020834	REXO2	76	81.215	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000023553	smfn	100	89.730	ENSACLG00000024566	smfn	95	91.111	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSBTAG00000005843	REXO2	76	80.663	Bos_taurus
ENSACIG00000023553	smfn	92	49.412	WBGene00007429	C08B6.8	93	56.164	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.110	ENSCJAG00000012434	REXO2	76	80.110	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000023553	smfn	97	79.558	ENSCAFG00000013511	REXO2	76	79.558	Canis_familiaris
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSCAFG00020002513	REXO2	76	80.663	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSCHIG00000009264	REXO2	76	80.663	Capra_hircus
ENSACIG00000023553	smfn	97	70.718	ENSTSYG00000027948	-	92	70.718	Carlito_syrichta
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSTSYG00000002237	REXO2	76	80.663	Carlito_syrichta
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.215	ENSCAPG00000006093	REXO2	96	81.215	Cavia_aperea
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.215	ENSCPOG00000010548	REXO2	76	81.215	Cavia_porcellus
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.215	ENSCCAG00000034979	REXO2	76	81.215	Cebus_capucinus
ENSACIG00000023553	smfn	90	82.530	ENSCATG00000015278	REXO2	76	80.663	Cercocebus_atys
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.215	ENSCLAG00000011195	REXO2	77	81.215	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000023553	smfn	90	82.530	ENSCSAG00000002754	REXO2	76	80.663	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.110	ENSCHOG00000000642	-	76	80.110	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000023553	smfn	77	71.329	ENSCPBG00000009359	REXO2	99	71.329	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000023553	smfn	90	59.639	ENSCING00000009858	-	80	59.639	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000023553	smfn	90	82.530	ENSCANG00000034756	REXO2	76	80.663	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSCGRG00001019814	-	76	80.663	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000023553	smfn	97	79.558	ENSCGRG00001013673	-	88	79.558	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000023553	smfn	97	77.901	ENSCGRG00001010922	-	88	77.901	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSCGRG00000006235	Rexo2	76	80.663	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000023553	smfn	97	85.083	ENSCSEG00000007214	smfn	65	85.083	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000023553	smfn	100	80.541	ENSCVAG00000012008	smfn	100	80.541	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000023553	smfn	100	80.541	ENSDARG00000009806	smfn	71	80.541	Danio_rerio
ENSACIG00000023553	smfn	86	83.648	ENSDNOG00000046533	REXO2	76	83.648	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000023553	smfn	90	62.048	ENSDORG00000025142	-	77	61.667	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.215	ENSDORG00000011255	Rexo2	76	81.215	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000023553	smfn	90	54.491	FBgn0039115	CG10214	79	54.491	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000023553	smfn	97	71.667	ENSEBUG00000013964	REXO2	57	76.048	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSEASG00005006674	REXO2	76	80.663	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSECAG00000005988	REXO2	76	80.663	Equus_caballus
ENSACIG00000023553	smfn	99	81.522	ENSELUG00000020072	smfn	64	81.522	Esox_lucius
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSFCAG00000018632	REXO2	76	80.663	Felis_catus
ENSACIG00000023553	smfn	100	79.032	ENSFALG00000010044	REXO2	92	79.032	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.215	ENSFDAG00000011764	REXO2	76	81.215	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000023553	smfn	94	82.759	ENSGMOG00000006370	smfn	90	82.759	Gadus_morhua
ENSACIG00000023553	smfn	100	79.570	ENSGALG00000035980	REXO2	80	79.570	Gallus_gallus
ENSACIG00000023553	smfn	98	84.153	ENSGAFG00000015349	smfn	65	84.153	Gambusia_affinis
ENSACIG00000023553	smfn	96	84.831	ENSGACG00000020096	smfn	88	84.831	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000023553	smfn	100	77.419	ENSGAGG00000021126	REXO2	81	77.419	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000023553	smfn	90	82.530	ENSGGOG00000023267	REXO2	76	80.663	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000023553	smfn	71	89.313	ENSHBUG00000020097	REXO2	64	89.313	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSHGLG00000013556	REXO2	76	80.663	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.215	ENSHGLG00100005257	REXO2	76	81.215	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.006	ENSHCOG00000007122	smfn	98	81.006	Hippocampus_comes
ENSACIG00000023553	smfn	98	84.699	ENSIPUG00000020440	rexo2	68	84.699	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.215	ENSSTOG00000012465	REXO2	76	81.215	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000023553	smfn	97	57.459	ENSJJAG00000022605	-	70	57.459	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.215	ENSJJAG00000013710	-	76	81.215	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000023553	smfn	100	84.865	ENSKMAG00000016795	smfn	66	84.865	Kryptolebias_marmoratus
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ENSACIG00000023553	smfn	97	71.978	ENSLACG00000018623	REXO2	74	71.978	Latimeria_chalumnae
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ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSLAFG00000012451	REXO2	76	80.663	Loxodonta_africana
ENSACIG00000023553	smfn	90	82.530	ENSMFAG00000041155	REXO2	76	80.663	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000023553	smfn	90	82.530	ENSMMUG00000012269	REXO2	76	80.663	Macaca_mulatta
ENSACIG00000023553	smfn	90	82.530	ENSMNEG00000033379	REXO2	76	80.663	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000023553	smfn	90	82.530	ENSMLEG00000036571	REXO2	76	80.663	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000023553	smfn	100	89.189	ENSMAMG00000021209	smfn	67	89.189	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000023553	smfn	100	89.730	ENSMZEG00005020730	REXO2	71	89.730	Maylandia_zebra
ENSACIG00000023553	smfn	100	89.730	ENSMZEG00005023224	-	71	89.730	Maylandia_zebra
ENSACIG00000023553	smfn	85	77.019	ENSMGAG00000003026	REXO2	99	77.019	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSMAUG00000014576	Rexo2	76	80.663	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.215	ENSMICG00000010094	REXO2	76	81.215	Microcebus_murinus
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSMOCG00000009016	Rexo2	76	80.663	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000023553	smfn	100	83.871	ENSMMOG00000006430	smfn	69	83.871	Mola_mola
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.768	ENSMODG00000013913	REXO2	77	81.768	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000023553	smfn	100	86.559	ENSMALG00000018130	smfn	53	86.559	Monopterus_albus
ENSACIG00000023553	smfn	98	79.235	MGP_CAROLIEiJ_G0032166	Rexo2	77	79.235	Mus_caroli
ENSACIG00000023553	smfn	97	79.558	ENSMUSG00000032026	Rexo2	77	78.689	Mus_musculus
ENSACIG00000023553	smfn	97	79.558	MGP_PahariEiJ_G0015034	Rexo2	77	78.689	Mus_pahari
ENSACIG00000023553	smfn	97	79.558	MGP_SPRETEiJ_G0033305	Rexo2	77	78.689	Mus_spretus
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSMPUG00000003947	REXO2	76	80.663	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.110	ENSMLUG00000009030	REXO2	76	80.110	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSNGAG00000008819	Rexo2	88	80.663	Nannospalax_galili
ENSACIG00000023553	smfn	100	88.108	ENSNBRG00000006529	smfn	98	88.108	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000023553	smfn	90	82.530	ENSNLEG00000029745	REXO2	76	80.663	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.215	ENSMEUG00000011558	REXO2	83	81.215	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000023553	smfn	68	76.378	ENSOPRG00000011076	REXO2	54	76.378	Ochotona_princeps
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.215	ENSODEG00000009750	-	96	81.215	Octodon_degus
ENSACIG00000023553	smfn	87	65.217	ENSODEG00000016046	-	79	65.217	Octodon_degus
ENSACIG00000023553	smfn	100	90.811	ENSONIG00000001954	smfn	80	90.811	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000023553	smfn	97	79.006	ENSOANG00000001754	REXO2	76	79.558	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.215	ENSOCUG00000004274	REXO2	72	81.215	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000023553	smfn	99	85.326	ENSORLG00000005119	smfn	60	85.326	Oryzias_latipes
ENSACIG00000023553	smfn	99	85.326	ENSORLG00020010121	smfn	60	85.326	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000023553	smfn	99	85.326	ENSORLG00015015699	smfn	60	85.326	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.768	ENSOMEG00000016878	REXO2	67	81.768	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000023553	smfn	74	78.986	ENSOMEG00000008940	-	97	78.986	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000023553	smfn	97	81.215	ENSOGAG00000016860	REXO2	76	81.215	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSOARG00000001040	REXO2	85	80.663	Ovis_aries
ENSACIG00000023553	smfn	90	82.530	ENSPPAG00000039849	REXO2	76	80.663	Pan_paniscus
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSPPRG00000007255	REXO2	76	80.663	Panthera_pardus
ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	ENSPTIG00000015578	REXO2	96	80.663	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000023553	smfn	90	82.530	ENSPTRG00000004306	REXO2	76	80.663	Pan_troglodytes
ENSACIG00000023553	smfn	90	82.530	ENSPANG00000010675	REXO2	76	80.663	Papio_anubis
ENSACIG00000023553	smfn	97	85.635	ENSPKIG00000000911	smfn	77	88.514	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000023553	smfn	100	78.495	ENSPSIG00000005151	REXO2	68	78.495	Pelodiscus_sinensis
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ENSACIG00000023553	smfn	83	73.377	ENSPEMG00000001421	Rexo2	71	72.078	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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