EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000023688 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA-splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10698 bases
Position: chrCCOE01001306.1:411205-421902
Accession: ZDB-GENE-040801-170
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000030632	SYF2	PF08231.12	1.5e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000031431	-	753	-	ENSACIP00000030632	250 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000023688's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000023688's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000023688	syf2	86	82.326	ENSG00000117614	SYF2	99	74.699	Homo_sapiens
ENSACIG00000023688	syf2	94	91.489	ENSAPOG00000001174	syf2	99	91.489	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023688	syf2	88	80.822	ENSAMEG00000010115	-	90	80.822	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000023688	syf2	78	81.538	ENSAMEG00000010134	-	100	81.538	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000023688	syf2	87	90.367	ENSAOCG00000010912	syf2	68	90.367	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023688	syf2	94	91.064	ENSAOCG00000022046	syf2	99	91.810	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023688	syf2	94	91.064	ENSAPEG00000018858	syf2	91	91.064	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023688	syf2	87	95.392	ENSATEG00000007745	syf2	99	92.340	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023688	syf2	80	83.417	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.417	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000023688	syf2	82	81.373	ENSACAG00000013653	-	100	81.373	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000023688	syf2	66	67.066	ENSACAG00000026777	-	100	67.066	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000023688	syf2	86	82.791	ENSANAG00000032473	SYF2	93	80.087	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000023688	syf2	94	94.043	ENSACLG00000019916	syf2	99	94.043	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023688	syf2	90	85.268	ENSAMXG00000004051	syf2	94	85.268	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023688	syf2	93	79.399	ENSBTAG00000001651	SYF2	97	79.399	Bos_taurus
ENSACIG00000023688	syf2	83	50.952	WBGene00019402	syf-2	90	50.476	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000023688	syf2	86	82.791	ENSCJAG00000046570	SYF2	99	75.100	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000023688	syf2	84	77.512	ENSCAFG00000030331	-	92	77.512	Canis_familiaris
ENSACIG00000023688	syf2	86	81.395	ENSCAFG00000012895	-	92	78.112	Canis_familiaris
ENSACIG00000023688	syf2	72	72.527	ENSCAFG00020021094	-	95	72.527	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000023688	syf2	86	81.395	ENSCAFG00020021091	-	92	78.112	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000023688	syf2	93	78.970	ENSCHIG00000020874	SYF2	95	78.970	Capra_hircus
ENSACIG00000023688	syf2	99	73.896	ENSTSYG00000005114	SYF2	99	73.896	Carlito_syrichta
ENSACIG00000023688	syf2	79	81.818	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.818	Cavia_aperea
ENSACIG00000023688	syf2	88	82.192	ENSCPOG00000005326	SYF2	90	82.192	Cavia_porcellus
ENSACIG00000023688	syf2	86	82.791	ENSCCAG00000022459	SYF2	93	80.087	Cebus_capucinus
ENSACIG00000023688	syf2	88	80.822	ENSCATG00000026917	SYF2	90	80.822	Cercocebus_atys
ENSACIG00000023688	syf2	89	81.532	ENSCLAG00000008474	SYF2	91	81.532	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000023688	syf2	94	76.170	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	80.822	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000023688	syf2	66	63.253	ENSCHOG00000005273	-	91	63.253	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000023688	syf2	89	81.778	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	79.915	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000023688	syf2	84	55.399	ENSCING00000003017	-	89	55.869	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000023688	syf2	84	51.643	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.643	Ciona_savignyi
ENSACIG00000023688	syf2	88	71.233	ENSCANG00000037322	SYF2	89	71.233	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000023688	syf2	92	79.399	ENSCGRG00001020733	Syf2	96	79.399	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000023688	syf2	78	82.653	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.412	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000023688	syf2	87	89.450	ENSCSEG00000000117	syf2	98	85.532	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000023688	syf2	89	91.928	ENSCVAG00000019543	syf2	96	91.739	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000023688	syf2	92	87.391	ENSDARG00000004706	syf2	97	87.391	Danio_rerio
ENSACIG00000023688	syf2	99	75.502	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	75.502	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000023688	syf2	91	80.087	ENSDORG00000001274	Syf2	95	80.087	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000023688	syf2	86	56.481	FBgn0033556	CG12343	94	56.481	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000023688	syf2	83	68.116	ENSETEG00000015729	SYF2	90	68.116	Echinops_telfairi
ENSACIG00000023688	syf2	79	57.868	ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.868	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000023688	syf2	92	78.723	ENSEASG00005004224	-	96	78.723	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000023688	syf2	94	70.042	ENSEASG00005004232	-	98	69.748	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000023688	syf2	93	79.399	ENSECAG00000012023	-	93	79.399	Equus_caballus
ENSACIG00000023688	syf2	93	78.970	ENSECAG00000010440	-	95	78.970	Equus_caballus
ENSACIG00000023688	syf2	67	68.235	ENSEEUG00000015084	SYF2	93	67.836	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000023688	syf2	93	84.914	ENSELUG00000003465	syf2	97	84.914	Esox_lucius
ENSACIG00000023688	syf2	94	78.571	ENSFCAG00000010324	-	81	78.571	Felis_catus
ENSACIG00000023688	syf2	93	78.112	ENSFCAG00000043095	-	93	78.112	Felis_catus
ENSACIG00000023688	syf2	82	80.882	ENSFALG00000000460	SYF2	90	77.056	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000023688	syf2	89	80.631	ENSFDAG00000008310	SYF2	90	81.735	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000023688	syf2	90	76.991	ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.991	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000023688	syf2	86	88.837	ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.837	Gadus_morhua
ENSACIG00000023688	syf2	91	80.617	ENSGALG00000013639	SYF2	90	80.617	Gallus_gallus
ENSACIG00000023688	syf2	94	87.234	ENSGAFG00000019435	syf2	99	87.234	Gambusia_affinis
ENSACIG00000023688	syf2	89	91.892	ENSGACG00000007305	syf2	98	88.936	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000023688	syf2	89	82.222	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	80.342	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000023688	syf2	86	82.326	ENSGGOG00000012796	SYF2	99	74.699	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000023688	syf2	93	95.279	ENSHBUG00000020477	syf2	100	95.279	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000023688	syf2	88	71.946	ENSHGLG00000004304	-	92	72.398	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000023688	syf2	89	81.532	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	81.532	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000023688	syf2	89	81.532	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	81.532	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000023688	syf2	93	87.983	ENSHCOG00000012904	syf2	76	87.983	Hippocampus_comes
ENSACIG00000023688	syf2	94	82.627	ENSIPUG00000019859	syf2	95	84.649	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000023688	syf2	58	76.027	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	76.027	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000023688	syf2	80	82.412	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	82.412	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000023688	syf2	94	91.489	ENSKMAG00000013856	syf2	99	91.489	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000023688	syf2	88	92.694	ENSLBEG00000014425	syf2	99	89.362	Labrus_bergylta
ENSACIG00000023688	syf2	88	79.638	ENSLACG00000012064	SYF2	93	79.638	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000023688	syf2	94	83.333	ENSLOCG00000002728	syf2	93	83.333	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000023688	syf2	73	54.348	ENSLAFG00000030814	-	100	54.348	Loxodonta_africana
ENSACIG00000023688	syf2	92	79.149	ENSLAFG00000023150	-	96	79.149	Loxodonta_africana
ENSACIG00000023688	syf2	88	80.822	ENSMFAG00000041831	SYF2	90	80.822	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000023688	syf2	86	81.395	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	80.822	Macaca_mulatta
ENSACIG00000023688	syf2	88	80.822	ENSMNEG00000030180	SYF2	90	80.822	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000023688	syf2	88	80.822	ENSMLEG00000030248	SYF2	90	80.822	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000023688	syf2	87	94.931	ENSMAMG00000010403	syf2	99	90.833	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000023688	syf2	94	93.617	ENSMZEG00005006429	syf2	99	93.617	Maylandia_zebra
ENSACIG00000023688	syf2	80	82.915	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.915	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000023688	syf2	92	80.258	ENSMAUG00000018974	Syf2	96	80.258	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000023688	syf2	80	82.412	ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.412	Microcebus_murinus
ENSACIG00000023688	syf2	94	78.814	ENSMOCG00000022938	Syf2	96	79.828	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000023688	syf2	94	88.136	ENSMMOG00000002396	syf2	99	88.136	Mola_mola
ENSACIG00000023688	syf2	89	77.232	ENSMODG00000013951	-	98	77.232	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000023688	syf2	94	89.076	ENSMALG00000010706	syf2	99	89.496	Monopterus_albus
ENSACIG00000023688	syf2	92	80.258	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	96	80.258	Mus_caroli
ENSACIG00000023688	syf2	92	80.258	ENSMUSG00000028821	Syf2	96	80.258	Mus_musculus
ENSACIG00000023688	syf2	92	80.258	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	96	80.258	Mus_pahari
ENSACIG00000023688	syf2	92	80.258	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	96	80.258	Mus_spretus
ENSACIG00000023688	syf2	88	81.279	ENSMPUG00000015801	-	89	81.279	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000023688	syf2	86	81.395	ENSMPUG00000015802	-	93	78.112	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000023688	syf2	93	78.541	ENSMLUG00000001885	SYF2	93	78.541	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000023688	syf2	94	76.667	ENSNGAG00000007912	Syf2	98	76.667	Nannospalax_galili
ENSACIG00000023688	syf2	94	82.008	ENSNBRG00000010720	syf2	98	82.008	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000023688	syf2	86	82.326	ENSNLEG00000035185	SYF2	99	74.699	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000023688	syf2	94	78.059	ENSOPRG00000012870	SYF2	98	78.059	Ochotona_princeps
ENSACIG00000023688	syf2	89	80.180	ENSODEG00000017664	-	93	80.180	Octodon_degus
ENSACIG00000023688	syf2	89	71.171	ENSODEG00000014338	-	92	71.171	Octodon_degus
ENSACIG00000023688	syf2	94	94.894	ENSONIG00000008213	syf2	99	94.894	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000023688	syf2	81	81.683	ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000023688	syf2	86	82.791	ENSOCUG00000013050	SYF2	91	81.532	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000023688	syf2	92	90.435	ENSORLG00000028820	syf2	99	90.435	Oryzias_latipes
ENSACIG00000023688	syf2	93	90.086	ENSORLG00020018333	syf2	98	90.086	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000023688	syf2	93	90.086	ENSORLG00015014665	syf2	97	90.086	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000023688	syf2	94	89.744	ENSOMEG00000013911	syf2	98	89.744	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000023688	syf2	94	78.723	ENSOGAG00000009962	SYF2	95	78.723	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000023688	syf2	93	78.298	ENSOARG00000006348	-	93	78.298	Ovis_aries
ENSACIG00000023688	syf2	78	55.385	ENSOARG00000006269	-	100	55.385	Ovis_aries
ENSACIG00000023688	syf2	86	82.326	ENSPPAG00000036579	SYF2	99	74.699	Pan_paniscus
ENSACIG00000023688	syf2	94	78.571	ENSPPRG00000001638	-	95	78.571	Panthera_pardus
ENSACIG00000023688	syf2	93	78.112	ENSPPRG00000001651	-	93	78.112	Panthera_pardus
ENSACIG00000023688	syf2	93	78.112	ENSPTIG00000007036	-	93	78.112	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000023688	syf2	86	82.791	ENSPTIG00000005711	-	81	79.221	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000023688	syf2	86	82.326	ENSPTRG00000000352	SYF2	99	74.699	Pan_troglodytes
ENSACIG00000023688	syf2	88	80.822	ENSPANG00000008139	SYF2	90	80.822	Papio_anubis
ENSACIG00000023688	syf2	88	87.330	ENSPKIG00000008130	syf2	94	87.330	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000023688	syf2	100	76.400	ENSPSIG00000011816	SYF2	95	76.400	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000023688	syf2	96	86.364	ENSPMGG00000008755	syf2	95	86.364	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000023688	syf2	94	78.390	ENSPEMG00000008283	Syf2	96	79.399	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000023688	syf2	89	80.631	ENSPCIG00000014235	SYF2	88	80.995	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000023688	syf2	96	87.603	ENSPFOG00000004116	syf2	100	87.603	Poecilia_formosa
ENSACIG00000023688	syf2	100	84.800	ENSPLAG00000006691	syf2	100	89.270	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000023688	syf2	94	86.752	ENSPMEG00000011684	syf2	98	87.773	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000023688	syf2	94	88.511	ENSPREG00000003009	syf2	99	88.511	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000023688	syf2	88	81.735	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	81.735	Pongo_abelii
ENSACIG00000023688	syf2	92	54.274	ENSPCOG00000027011	SYF2	95	54.274	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000023688	syf2	99	66.667	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	66.667	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000023688	syf2	89	95.964	ENSPNYG00000004979	syf2	98	94.421	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000023688	syf2	90	86.222	ENSPNAG00000015570	syf2	95	86.222	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000023688	syf2	92	80.258	ENSRNOG00000060597	Syf2	96	80.258	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000023688	syf2	88	78.539	ENSRBIG00000042970	SYF2	90	78.539	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000023688	syf2	88	80.822	ENSRROG00000001347	SYF2	90	80.822	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000023688	syf2	86	82.326	ENSSBOG00000020184	SYF2	93	79.654	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000023688	syf2	82	81.553	ENSSHAG00000007152	-	100	81.553	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000023688	syf2	89	80.180	ENSSHAG00000015630	-	89	80.543	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000023688	syf2	92	84.716	ENSSFOG00015023647	syf2	97	84.716	Scleropages_formosus
ENSACIG00000023688	syf2	94	88.085	ENSSMAG00000009867	syf2	99	88.085	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000023688	syf2	87	93.119	ENSSDUG00000013072	syf2	97	90.000	Seriola_dumerili
ENSACIG00000023688	syf2	87	93.119	ENSSLDG00000012677	syf2	97	90.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000023688	syf2	91	61.207	ENSSARG00000012889	SYF2	95	61.207	Sorex_araneus
ENSACIG00000023688	syf2	89	81.982	ENSSPUG00000005251	SYF2	88	81.982	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000023688	syf2	94	91.064	ENSSPAG00000009626	syf2	99	91.064	Stegastes_partitus
ENSACIG00000023688	syf2	92	78.879	ENSSSCG00000037481	SYF2	95	78.879	Sus_scrofa
ENSACIG00000023688	syf2	60	52.318	ENSTGUG00000001126	SYF2	84	52.353	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000023688	syf2	90	89.333	ENSTRUG00000001499	syf2	90	89.333	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000023688	syf2	89	88.288	ENSTNIG00000016912	syf2	99	88.288	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000023688	syf2	99	56.225	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	56.225	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000023688	syf2	86	81.860	ENSTTRG00000003550	SYF2	99	75.502	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000023688	syf2	93	77.682	ENSUAMG00000002897	SYF2	93	77.682	Ursus_americanus
ENSACIG00000023688	syf2	86	80.930	ENSUMAG00000013108	SYF2	93	77.253	Ursus_maritimus
ENSACIG00000023688	syf2	99	75.502	ENSVPAG00000005705	SYF2	99	75.502	Vicugna_pacos
ENSACIG00000023688	syf2	86	81.395	ENSVVUG00000027175	-	92	78.112	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000023688	syf2	82	80.976	ENSVVUG00000027181	-	92	77.682	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000023688	syf2	89	80.180	ENSXETG00000022797	syf2	89	80.180	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000023688	syf2	94	87.660	ENSXMAG00000022698	syf2	99	87.660	Xiphophorus_maculatus