EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000023712 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1938 bases
Position: chrCCOE01002090.1:16272-18209
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000030662	MMR_HSR1	PF01926.23	1.2e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000031462	-	1200	-	ENSACIP00000030662	400 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000023712	-	95	65.026	ENSACIG00000014898	-	71	64.962
ENSACIG00000023712	-	88	38.418	ENSACIG00000009814	-	63	38.418
ENSACIG00000023712	-	96	66.839	ENSACIG00000002240	-	72	66.839
ENSACIG00000023712	-	95	35.443	ENSACIG00000022269	-	65	35.443
ENSACIG00000023712	-	96	64.416	ENSACIG00000008246	-	69	64.416
ENSACIG00000023712	-	95	64.323	ENSACIG00000008585	-	74	64.323
ENSACIG00000023712	-	97	66.581	ENSACIG00000003888	-	72	66.581
ENSACIG00000023712	-	97	65.116	ENSACIG00000014973	-	72	65.116
ENSACIG00000023712	-	98	66.667	ENSACIG00000014982	-	74	66.667
ENSACIG00000023712	-	96	70.130	ENSACIG00000021889	-	69	70.130
ENSACIG00000023712	-	97	65.633	ENSACIG00000021882	-	72	65.633
ENSACIG00000023712	-	53	68.246	ENSACIG00000014950	-	88	68.246
ENSACIG00000023712	-	96	69.054	ENSACIG00000012148	-	74	69.309
ENSACIG00000023712	-	97	67.526	ENSACIG00000014961	-	70	67.526
ENSACIG00000023712	-	88	37.867	ENSACIG00000022228	-	61	37.867
ENSACIG00000023712	-	87	38.736	ENSACIG00000009923	-	57	39.835
ENSACIG00000023712	-	97	67.342	ENSACIG00000003168	-	73	67.342
ENSACIG00000023712	-	97	67.526	ENSACIG00000001022	-	72	67.526
ENSACIG00000023712	-	99	67.250	ENSACIG00000010569	-	73	67.250
ENSACIG00000023712	-	97	66.667	ENSACIG00000023726	-	73	66.667
ENSACIG00000023712	-	96	68.286	ENSACIG00000008256	-	72	68.286
ENSACIG00000023712	-	97	69.309	ENSACIG00000021449	-	72	69.309

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000023712	-	87	37.772	ENSAPOG00000016636	-	71	38.315	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023712	-	96	61.719	ENSAPOG00000005749	-	70	61.719	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023712	-	57	67.982	ENSAPOG00000006213	-	77	67.982	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023712	-	96	63.566	ENSAPOG00000005726	-	71	63.566	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023712	-	96	64.767	ENSAPOG00000021040	-	64	64.767	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023712	-	96	63.824	ENSAPEG00000000062	-	71	63.824	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023712	-	96	68.734	ENSATEG00000023346	-	71	68.734	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023712	-	96	67.442	ENSATEG00000019965	-	71	67.442	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023712	-	96	59.585	ENSATEG00000017635	-	70	59.585	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023712	-	96	66.838	ENSATEG00000012558	-	71	66.838	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023712	-	53	44.076	ENSATEG00000008595	-	71	44.076	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023712	-	74	69.492	ENSACLG00000009330	-	60	69.492	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023712	-	98	36.190	ENSACLG00000023468	-	70	36.667	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023712	-	97	67.949	ENSACLG00000006538	-	73	67.949	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023712	-	96	62.953	ENSACLG00000018271	-	71	62.953	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023712	-	97	61.224	ENSACLG00000021761	-	72	61.224	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023712	-	98	61.168	ENSACLG00000015361	-	96	61.168	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023712	-	97	73.177	ENSACLG00000009261	-	74	73.177	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023712	-	96	63.708	ENSACLG00000006543	-	69	63.708	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023712	-	88	68.182	ENSACLG00000017259	-	58	68.182	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023712	-	96	58.824	ENSACLG00000018599	-	76	58.824	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023712	-	78	65.273	ENSACLG00000006285	-	53	65.273	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023712	-	97	60.614	ENSACLG00000010007	-	58	60.614	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023712	-	89	38.684	ENSACLG00000023033	-	92	38.684	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023712	-	98	37.531	ENSACLG00000023126	-	75	37.531	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023712	-	90	43.052	ENSAMXG00000033407	-	69	43.243	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023712	-	98	43.577	ENSAMXG00000037920	-	77	44.275	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023712	-	94	44.675	ENSAMXG00000030535	-	78	50.000	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023712	-	99	45.137	ENSAMXG00000032695	-	71	45.137	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023712	-	96	40.921	ENSAMXG00000041770	-	71	40.921	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023712	-	90	42.781	ENSAMXG00000039672	-	70	42.971	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023712	-	96	35.593	ENSAMXG00000035937	-	71	35.593	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023712	-	96	43.557	ENSAMXG00000034407	-	69	43.557	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023712	-	96	34.729	ENSAMXG00000036353	-	69	35.468	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023712	-	97	45.387	ENSAMXG00000029346	-	74	45.926	Astyanax_mexicanus
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ENSACIG00000023712	-	97	63.427	ENSCVAG00000007251	-	76	63.427	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000023712	-	97	62.532	ENSCVAG00000008134	-	73	62.532	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000023712	-	95	63.255	ENSFHEG00000006385	-	70	63.255	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000023712	-	57	60.000	ENSFHEG00000002160	-	89	51.408	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000023712	-	97	61.381	ENSFHEG00000016342	-	76	61.381	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000023712	-	95	61.358	ENSFHEG00000006425	-	74	61.358	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000023712	-	98	33.586	ENSGMOG00000011319	-	75	33.586	Gadus_morhua
ENSACIG00000023712	-	95	35.627	ENSGMOG00000005680	-	66	35.627	Gadus_morhua
ENSACIG00000023712	-	95	37.626	ENSGMOG00000019330	-	65	37.626	Gadus_morhua
ENSACIG00000023712	-	90	33.333	ENSGMOG00000019825	-	75	33.854	Gadus_morhua
ENSACIG00000023712	-	87	32.479	ENSGMOG00000008232	-	82	35.473	Gadus_morhua
ENSACIG00000023712	-	89	36.220	ENSGMOG00000017552	-	61	36.220	Gadus_morhua
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