EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000023986 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: ddx3b|etID309900.24|p110a|pl10|pl10a|wu:fb43h11|wu:fy72b06
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5420 bases
Position: chrCCOE01001648.1:35235-40654
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000031030	DEAD	PF00270.29	2.3e-50	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000031841	-	1980	-	ENSACIP00000031030	659 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000023986	-	61	53.117	ENSACIG00000017623	ddx4	96	54.156
ENSACIG00000023986	-	50	32.934	ENSACIG00000018534	ddx18	51	32.635
ENSACIG00000023986	-	59	31.714	ENSACIG00000000989	eif4a2	90	31.714
ENSACIG00000023986	-	64	32.783	ENSACIG00000009666	ddx59	71	32.783
ENSACIG00000023986	-	91	79.206	ENSACIG00000013354	-	90	87.545
ENSACIG00000023986	-	54	33.684	ENSACIG00000007580	ddx55	61	33.684
ENSACIG00000023986	-	63	43.885	ENSACIG00000022414	ddx5	83	44.125
ENSACIG00000023986	-	61	34.000	ENSACIG00000009719	eif4a3	91	34.000
ENSACIG00000023986	-	62	30.361	ENSACIG00000020898	DDX39A	93	30.361
ENSACIG00000023986	-	64	38.106	ENSACIG00000008618	DDX41	71	38.106
ENSACIG00000023986	-	70	40.987	ENSACIG00000006502	DDX5	68	42.762
ENSACIG00000023986	-	58	30.151	ENSACIG00000016665	zgc:193690	71	30.151
ENSACIG00000023986	-	57	36.939	ENSACIG00000014378	ddx27	95	39.130
ENSACIG00000023986	-	62	38.257	ENSACIG00000012170	ddx43	66	38.215
ENSACIG00000023986	-	61	30.073	ENSACIG00000004534	ddx39b	89	30.221
ENSACIG00000023986	-	56	30.491	ENSACIG00000014804	ddx19	79	30.491
ENSACIG00000023986	-	58	32.524	ENSACIG00000011029	ddx49	82	32.524
ENSACIG00000023986	-	61	44.717	ENSACIG00000001068	-	82	42.857
ENSACIG00000023986	-	70	37.365	ENSACIG00000007376	ddx42	59	37.527
ENSACIG00000023986	-	62	30.383	ENSACIG00000007948	-	93	30.383
ENSACIG00000023986	-	54	44.538	ENSACIG00000007438	-	76	44.538
ENSACIG00000023986	-	60	38.571	ENSACIG00000000022	ddx23	55	38.571
ENSACIG00000023986	-	56	35.695	ENSACIG00000022802	ddx47	89	32.892

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000023986	-	84	80.107	ENSG00000067048	DDX3Y	86	80.212	Homo_sapiens
ENSACIG00000023986	-	86	80.138	ENSG00000215301	DDX3X	91	88.863	Homo_sapiens
ENSACIG00000023986	-	89	89.723	ENSAPOG00000003652	-	85	89.490	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023986	-	83	76.770	ENSAPOG00000019437	-	89	76.732	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000023986	-	86	79.038	ENSAMEG00000006801	DDX3X	84	81.371	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000023986	-	91	89.013	ENSAOCG00000002188	-	88	86.842	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023986	-	78	74.768	ENSAOCG00000018576	-	87	76.796	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000023986	-	91	89.013	ENSAPEG00000020102	-	91	86.842	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023986	-	89	80.227	ENSAPEG00000005976	-	91	86.643	Amphiprion_percula
ENSACIG00000023986	-	89	80.129	ENSATEG00000019608	-	82	80.781	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023986	-	92	88.162	ENSATEG00000019116	-	91	85.736	Anabas_testudineus
ENSACIG00000023986	-	82	82.847	ENSAPLG00000014240	-	85	82.478	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000023986	-	89	78.347	ENSACAG00000017928	-	85	77.404	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000023986	-	84	72.906	ENSANAG00000000067	-	83	74.589	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000023986	-	86	79.828	ENSANAG00000017441	DDX3X	88	81.481	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000023986	-	89	81.037	ENSACLG00000003774	-	89	78.669	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023986	-	92	89.524	ENSACLG00000013517	-	93	93.520	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000023986	-	82	88.582	ENSAMXG00000013396	ddx3xb	89	88.689	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023986	-	94	80.763	ENSAMXG00000032415	ddx3xa	88	81.374	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000023986	-	86	78.291	ENSBTAG00000035907	DDX3X	89	81.514	Bos_taurus
ENSACIG00000023986	-	86	79.346	ENSCJAG00000015787	DDX3X	88	81.481	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000023986	-	86	79.346	ENSCAFG00000014251	DDX3X	86	81.261	Canis_familiaris
ENSACIG00000023986	-	86	79.346	ENSCAFG00020027227	DDX3X	86	81.261	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000023986	-	84	79.012	ENSCHIG00000010585	-	86	79.159	Capra_hircus
ENSACIG00000023986	-	81	63.187	ENSCHIG00000000047	-	92	61.217	Capra_hircus
ENSACIG00000023986	-	86	78.291	ENSCHIG00000024903	-	86	81.371	Capra_hircus
ENSACIG00000023986	-	79	81.168	ENSTSYG00000029157	-	90	80.561	Carlito_syrichta
ENSACIG00000023986	-	86	79.346	ENSTSYG00000003895	DDX3X	78	81.228	Carlito_syrichta
ENSACIG00000023986	-	92	73.906	ENSCAPG00000010945	-	83	80.769	Cavia_aperea
ENSACIG00000023986	-	86	63.149	ENSCAPG00000014373	-	84	64.632	Cavia_aperea
ENSACIG00000023986	-	86	64.014	ENSCPOG00000039190	-	84	65.530	Cavia_porcellus
ENSACIG00000023986	-	86	79.862	ENSCPOG00000013557	-	86	81.053	Cavia_porcellus
ENSACIG00000023986	-	92	73.582	ENSCPOG00000020978	-	83	80.403	Cavia_porcellus
ENSACIG00000023986	-	80	79.554	ENSCCAG00000036904	-	90	78.623	Cebus_capucinus
ENSACIG00000023986	-	86	80.000	ENSCCAG00000023934	DDX3X	89	81.228	Cebus_capucinus
ENSACIG00000023986	-	74	86.735	ENSCCAG00000000872	-	78	85.714	Cebus_capucinus
ENSACIG00000023986	-	86	79.346	ENSCATG00000010148	DDX3X	88	81.481	Cercocebus_atys
ENSACIG00000023986	-	86	77.969	ENSCLAG00000000993	DDX3X	86	79.123	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000023986	-	84	80.927	ENSCSAG00000018317	DDX3Y	86	81.206	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000023986	-	56	71.990	ENSCSAG00000013949	DDX3X	80	75.070	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000023986	-	63	88.136	ENSCHOG00000011076	DDX3X	69	85.864	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000023986	-	89	77.184	ENSCPBG00000019916	-	83	81.129	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000023986	-	86	79.346	ENSCANG00000031127	DDX3X	88	81.481	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000023986	-	73	87.449	ENSCGRG00001002373	D1Pas1	89	86.083	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000023986	-	86	79.002	ENSCGRG00001022185	Ddx3x	86	80.877	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000023986	-	86	79.002	ENSCGRG00000010880	Ddx3x	86	80.877	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000023986	-	92	74.286	ENSCSEG00000003352	-	86	74.429	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000023986	-	91	85.443	ENSCSEG00000000900	-	90	83.231	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000023986	-	91	87.150	ENSCVAG00000001784	-	91	88.816	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000023986	-	89	81.789	ENSCVAG00000011003	-	85	81.111	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000023986	-	92	80.908	ENSDARG00000020573	ddx3xa	88	83.594	Danio_rerio
ENSACIG00000023986	-	89	84.437	ENSDARG00000005774	ddx3xb	99	91.525	Danio_rerio
ENSACIG00000023986	-	86	79.690	ENSDNOG00000007452	-	90	89.532	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000023986	-	86	77.453	ENSDNOG00000005693	-	83	81.159	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000023986	-	86	79.655	ENSDORG00000029882	Ddx3x	86	81.195	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000023986	-	64	88.652	ENSETEG00000006882	DDX3X	67	87.872	Echinops_telfairi
ENSACIG00000023986	-	57	81.365	ENSEBUG00000007692	ddx3xa	84	69.792	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000023986	-	89	77.090	ENSEASG00005012087	DDX3Y	86	80.282	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000023986	-	63	89.474	ENSEASG00005009841	DDX3X	91	88.657	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000023986	-	86	79.346	ENSECAG00000009901	DDX3X	87	82.070	Equus_caballus
ENSACIG00000023986	-	86	79.518	ENSEEUG00000002817	DDX3X	88	81.404	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000023986	-	90	79.936	ENSELUG00000004613	-	89	78.714	Esox_lucius
ENSACIG00000023986	-	89	81.015	ENSELUG00000023518	-	90	77.621	Esox_lucius
ENSACIG00000023986	-	86	79.346	ENSFCAG00000025339	DDX3X	86	81.228	Felis_catus
ENSACIG00000023986	-	74	87.627	ENSFALG00000001530	-	88	86.785	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000023986	-	86	79.174	ENSFDAG00000011500	-	86	80.877	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000023986	-	84	77.321	ENSFDAG00000013328	DDX3Y	88	77.345	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000023986	-	86	53.578	ENSFDAG00000006053	-	77	58.517	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000023986	-	91	86.513	ENSFHEG00000010407	-	87	86.678	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000023986	-	81	79.330	ENSFHEG00000012643	-	87	78.364	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000023986	-	89	72.368	ENSGMOG00000003944	DDX3X	94	71.406	Gadus_morhua
ENSACIG00000023986	-	82	83.242	ENSGALG00000016231	DDX3X	88	82.042	Gallus_gallus
ENSACIG00000023986	-	91	87.007	ENSGAFG00000022047	-	87	88.487	Gambusia_affinis
ENSACIG00000023986	-	89	81.910	ENSGAFG00000003155	ddx3xb	88	81.494	Gambusia_affinis
ENSACIG00000023986	-	89	76.656	ENSGACG00000014407	-	87	75.684	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000023986	-	91	79.370	ENSGACG00000008206	-	88	79.937	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000023986	-	89	78.808	ENSGAGG00000004207	-	85	81.019	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000023986	-	86	79.346	ENSGGOG00000003181	DDX3X	89	81.228	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000023986	-	89	81.037	ENSHBUG00000009486	-	89	78.669	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000023986	-	89	93.174	ENSHBUG00000002311	-	98	93.174	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000023986	-	86	78.657	ENSHGLG00000010084	-	85	80.319	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000023986	-	86	80.172	ENSHGLG00000004805	Ddx3x	86	81.371	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000023986	-	86	79.518	ENSHGLG00100005685	-	86	80.702	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000023986	-	76	91.212	ENSHGLG00100005604	-	93	91.212	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000023986	-	88	57.653	ENSHGLG00100013600	-	87	59.279	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000023986	-	88	74.074	ENSHGLG00100000759	-	88	76.460	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000023986	-	91	89.803	ENSHCOG00000016890	-	87	95.738	Hippocampus_comes
ENSACIG00000023986	-	88	80.713	ENSHCOG00000006275	-	84	81.672	Hippocampus_comes
ENSACIG00000023986	-	91	82.616	ENSIPUG00000009936	ddx3xb	91	81.847	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000023986	-	93	82.316	ENSIPUG00000023024	ddx3xa	88	82.399	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000023986	-	86	79.346	ENSSTOG00000008094	DDX3X	82	81.053	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000023986	-	86	79.518	ENSJJAG00000019645	Ddx3x	86	81.228	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000023986	-	88	80.984	ENSKMAG00000012633	-	89	78.440	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000023986	-	91	88.797	ENSKMAG00000011081	-	87	88.797	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000023986	-	88	79.708	ENSLBEG00000016034	-	89	77.996	Labrus_bergylta
ENSACIG00000023986	-	84	85.946	ENSLBEG00000012311	-	89	85.689	Labrus_bergylta
ENSACIG00000023986	-	87	76.585	ENSLACG00000007753	ddx3xa	92	78.247	Latimeria_chalumnae
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