EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000024029 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpusd2
Alias: -
Full Name: RNA pseudouridine synthase domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2180 bases
Position: chrCCOE01000631.1:1411885-1414064
Accession: ZDB-GENE-120411-43
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000031075	PseudoU_synth_2	PF00849.22	7.6e-31	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000031886	-	1494	-	ENSACIP00000031075	497 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	58.991	ENSG00000166133	RPUSD2	80	59.909	Homo_sapiens
ENSACIG00000024029	rpusd2	100	78.491	ENSAPOG00000000817	rpusd2	91	78.491	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000024029	rpusd2	91	58.043	ENSAMEG00000016996	RPUSD2	80	58.667	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000024029	rpusd2	100	79.096	ENSAOCG00000015237	rpusd2	91	79.096	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000024029	rpusd2	100	78.531	ENSAPEG00000021763	rpusd2	91	78.531	Amphiprion_percula
ENSACIG00000024029	rpusd2	100	75.413	ENSATEG00000015242	rpusd2	90	75.413	Anabas_testudineus
ENSACIG00000024029	rpusd2	84	61.628	ENSAPLG00000004723	RPUSD2	100	61.268	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000024029	rpusd2	87	60.626	ENSACAG00000013893	RPUSD2	91	60.762	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	55.467	ENSANAG00000009691	RPUSD2	80	60.364	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000024029	rpusd2	100	85.769	ENSACLG00000019531	rpusd2	91	85.769	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000024029	rpusd2	94	65.444	ENSAMXG00000013376	rpusd2	85	65.444	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000024029	rpusd2	91	59.091	ENSBTAG00000003193	RPUSD2	79	59.865	Bos_taurus
ENSACIG00000024029	rpusd2	80	35.678	WBGene00019498	K07E8.7	97	35.678	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	54.600	ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	59.226	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000024029	rpusd2	93	56.900	ENSCAFG00000009165	RPUSD2	83	55.556	Canis_familiaris
ENSACIG00000024029	rpusd2	93	56.900	ENSCAFG00020005849	RPUSD2	83	55.556	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000024029	rpusd2	92	58.105	ENSCHIG00000006152	RPUSD2	79	59.865	Capra_hircus
ENSACIG00000024029	rpusd2	96	56.313	ENSTSYG00000012844	RPUSD2	86	55.400	Carlito_syrichta
ENSACIG00000024029	rpusd2	55	60.357	ENSCAPG00000006895	-	97	60.357	Cavia_aperea
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	59.649	ENSCPOG00000013201	RPUSD2	80	60.455	Cavia_porcellus
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	55.200	ENSCCAG00000024378	RPUSD2	80	59.909	Cebus_capucinus
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	59.211	ENSCATG00000043734	RPUSD2	80	60.000	Cercocebus_atys
ENSACIG00000024029	rpusd2	93	58.051	ENSCLAG00000011862	RPUSD2	80	60.000	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	59.430	ENSCSAG00000007538	RPUSD2	85	60.227	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000024029	rpusd2	68	56.936	ENSCHOG00000004834	RPUSD2	63	57.225	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	60.000	ENSCPBG00000013419	RPUSD2	88	60.554	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	59.211	ENSCANG00000003659	RPUSD2	80	60.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000024029	rpusd2	91	59.477	ENSCGRG00001009839	Rpusd2	76	60.181	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000024029	rpusd2	91	59.477	ENSCGRG00000012348	Rpusd2	78	60.181	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	70.825	ENSCSEG00000001953	rpusd2	88	70.825	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000024029	rpusd2	97	80.448	ENSCVAG00000010848	rpusd2	88	80.448	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000024029	rpusd2	95	68.485	ENSDARG00000060992	rpusd2	84	68.889	Danio_rerio
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	55.382	ENSDNOG00000047745	RPUSD2	81	58.980	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000024029	rpusd2	86	60.317	ENSDORG00000009092	Rpusd2	99	60.317	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000024029	rpusd2	94	44.375	FBgn0032256	RluA-2	80	46.050	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000024029	rpusd2	94	45.383	FBgn0051719	RluA-1	63	47.034	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	56.513	ENSETEG00000008581	RPUSD2	89	55.912	Echinops_telfairi
ENSACIG00000024029	rpusd2	83	34.332	ENSEBUG00000012149	rpusd2	83	34.332	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	55.819	ENSEASG00005016463	RPUSD2	78	59.551	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	56.016	ENSECAG00000024178	RPUSD2	78	59.775	Equus_caballus
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	49.801	ENSEEUG00000005132	RPUSD2	83	53.034	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000024029	rpusd2	97	68.307	ENSELUG00000016786	rpusd2	88	69.512	Esox_lucius
ENSACIG00000024029	rpusd2	94	57.023	ENSFCAG00000040796	RPUSD2	83	56.173	Felis_catus
ENSACIG00000024029	rpusd2	86	62.022	ENSFALG00000001122	RPUSD2	97	62.198	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000024029	rpusd2	92	57.479	ENSFDAG00000003070	RPUSD2	85	59.864	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000024029	rpusd2	96	78.685	ENSFHEG00000007518	rpusd2	89	78.685	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000024029	rpusd2	94	71.926	ENSGMOG00000011014	rpusd2	99	71.926	Gadus_morhua
ENSACIG00000024029	rpusd2	93	58.811	ENSGALG00000041216	RPUSD2	94	60.560	Gallus_gallus
ENSACIG00000024029	rpusd2	95	80.720	ENSGAFG00000003390	rpusd2	85	80.720	Gambusia_affinis
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	74.525	ENSGACG00000008656	rpusd2	99	74.525	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	62.179	ENSGAGG00000013098	RPUSD2	85	62.832	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	58.553	ENSGGOG00000006684	RPUSD2	80	59.453	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000024029	rpusd2	100	85.958	ENSHBUG00000023777	rpusd2	91	85.958	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	58.643	ENSHGLG00000012765	RPUSD2	80	59.410	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	58.643	ENSHGLG00100006653	RPUSD2	80	59.410	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	74.369	ENSHCOG00000015587	rpusd2	87	74.369	Hippocampus_comes
ENSACIG00000024029	rpusd2	94	70.248	ENSIPUG00000021006	rpusd2	82	70.041	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	55.447	ENSSTOG00000025619	RPUSD2	79	60.674	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000024029	rpusd2	88	61.625	ENSJJAG00000023160	Rpusd2	82	61.625	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000024029	rpusd2	97	75.000	ENSKMAG00000006618	rpusd2	89	73.585	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000024029	rpusd2	97	77.344	ENSLBEG00000021571	rpusd2	91	76.571	Labrus_bergylta
ENSACIG00000024029	rpusd2	87	60.659	ENSLACG00000017338	RPUSD2	99	60.220	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000024029	rpusd2	87	70.276	ENSLOCG00000014755	rpusd2	99	67.423	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	59.868	ENSLAFG00000015588	RPUSD2	83	60.497	Loxodonta_africana
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ENSACIG00000024029	rpusd2	90	59.430	ENSMMUG00000001483	RPUSD2	80	60.227	Macaca_mulatta
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	51.620	ENSMNEG00000041429	RPUSD2	80	52.125	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000024029	rpusd2	68	57.558	ENSMLEG00000036551	RPUSD2	80	57.558	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000024029	rpusd2	100	73.309	ENSMAMG00000001077	rpusd2	88	73.309	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000024029	rpusd2	100	85.769	ENSMZEG00005006947	rpusd2	100	85.769	Maylandia_zebra
ENSACIG00000024029	rpusd2	88	61.798	ENSMGAG00000003058	RPUSD2	97	62.077	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000024029	rpusd2	98	56.740	ENSMAUG00000020467	Rpusd2	78	60.449	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	55.336	ENSMICG00000028637	RPUSD2	80	59.276	Microcebus_murinus
ENSACIG00000024029	rpusd2	95	58.212	ENSMOCG00000020061	Rpusd2	79	60.674	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000024029	rpusd2	100	80.583	ENSMMOG00000012020	rpusd2	90	80.777	Mola_mola
ENSACIG00000024029	rpusd2	89	59.823	ENSMODG00000000300	RPUSD2	80	60.592	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000024029	rpusd2	100	72.560	ENSMALG00000010024	rpusd2	90	72.560	Monopterus_albus
ENSACIG00000024029	rpusd2	91	59.259	MGP_CAROLIEiJ_G0024130	Rpusd2	78	59.955	Mus_caroli
ENSACIG00000024029	rpusd2	91	59.259	ENSMUSG00000027324	Rpusd2	78	59.955	Mus_musculus
ENSACIG00000024029	rpusd2	91	59.695	MGP_PahariEiJ_G0025573	Rpusd2	78	60.407	Mus_pahari
ENSACIG00000024029	rpusd2	91	59.259	MGP_SPRETEiJ_G0025046	Rpusd2	79	59.955	Mus_spretus
ENSACIG00000024029	rpusd2	98	55.600	ENSMPUG00000008517	RPUSD2	79	59.637	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000024029	rpusd2	91	59.436	ENSMLUG00000007971	RPUSD2	87	60.090	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	55.599	ENSNGAG00000014126	Rpusd2	80	61.009	Nannospalax_galili
ENSACIG00000024029	rpusd2	100	90.800	ENSNBRG00000010070	rpusd2	91	90.800	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	58.991	ENSNLEG00000035735	RPUSD2	80	59.909	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000024029	rpusd2	95	57.764	ENSMEUG00000008500	RPUSD2	84	60.538	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000024029	rpusd2	91	58.925	ENSOPRG00000014177	-	81	59.688	Ochotona_princeps
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	56.225	ENSODEG00000017193	RPUSD2	81	60.000	Octodon_degus
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	90.946	ENSONIG00000020102	rpusd2	100	90.946	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000024029	rpusd2	52	69.650	ENSOANG00000011262	-	100	69.650	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000024029	rpusd2	91	59.692	ENSOCUG00000015745	RPUSD2	78	60.502	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000024029	rpusd2	96	76.667	ENSORLG00000015516	rpusd2	88	76.667	Oryzias_latipes
ENSACIG00000024029	rpusd2	96	76.458	ENSORLG00020010533	rpusd2	88	76.458	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000024029	rpusd2	96	75.625	ENSORLG00015009206	rpusd2	88	75.625	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	76.506	ENSOMEG00000007355	rpusd2	82	75.502	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000024029	rpusd2	91	59.091	ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	59.865	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000024029	rpusd2	92	58.333	ENSOARG00000020235	RPUSD2	81	59.865	Ovis_aries
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	58.991	ENSPPAG00000032874	RPUSD2	80	59.909	Pan_paniscus
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	54.883	ENSPPRG00000010446	RPUSD2	84	56.173	Panthera_pardus
ENSACIG00000024029	rpusd2	99	54.883	ENSPTIG00000013316	RPUSD2	84	56.173	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	58.991	ENSPTRG00000006924	RPUSD2	80	59.909	Pan_troglodytes
ENSACIG00000024029	rpusd2	90	59.430	ENSPANG00000019339	RPUSD2	80	60.227	Papio_anubis
ENSACIG00000024029	rpusd2	93	79.592	ENSPKIG00000023017	rpusd2	69	81.250	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSACIG00000024029	rpusd2	94	81.624	ENSPMEG00000009835	rpusd2	96	81.624	Poecilia_mexicana
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