EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000024374 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rab11ba
Alias: rab11b|wu:fb07g11|zgc:55760
Full Name: RAB11B%2C member RAS oncogene family%2C a
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5787 bases
Position: chrCCOE01000632.1:754300-760086
Accession: ZDB-GENE-040426-2860
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000031550	MMR_HSR1	PF01926.23	2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000032378	-	732	-	ENSACIP00000031550	243 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000024374	rab11ba	79	38.660	ENSACIG00000023222	-	82	38.660
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	90.058	ENSACIG00000017403	rab11al	79	90.058
ENSACIG00000024374	rab11ba	74	39.785	ENSACIG00000022208	-	89	39.785
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	48.428	ENSACIG00000008584	rab13	76	48.428
ENSACIG00000024374	rab11ba	52	33.071	ENSACIG00000015128	si:ch73-116o1.2	67	35.252
ENSACIG00000024374	rab11ba	72	40.110	ENSACIG00000021459	zgc:101559	80	40.110
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	45.283	ENSACIG00000010619	rab15	75	45.283
ENSACIG00000024374	rab11ba	63	32.515	ENSACIG00000023481	rasl11b	64	31.677
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	48.408	ENSACIG00000019251	rab5aa	74	48.408
ENSACIG00000024374	rab11ba	64	33.974	ENSACIG00000000100	kras	53	35.119
ENSACIG00000024374	rab11ba	64	51.923	ENSACIG00000003157	-	83	51.923
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	38.650	ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	79	37.288
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	47.170	ENSACIG00000008102	rab18b	77	47.170
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	74.706	ENSACIG00000017414	rab25b	82	74.706
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	90.374	ENSACIG00000024376	-	86	90.374
ENSACIG00000024374	rab11ba	63	33.333	ENSACIG00000018406	rasl11a	65	33.333
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	35.032	ENSACIG00000000670	rabl2	69	35.032
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	36.943	ENSACIG00000014605	rab6a	75	36.943
ENSACIG00000024374	rab11ba	71	43.429	ENSACIG00000003102	rab42a	80	43.429
ENSACIG00000024374	rab11ba	66	53.125	ENSACIG00000014625	-	79	53.125
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	48.447	ENSACIG00000023837	-	76	48.447
ENSACIG00000024374	rab11ba	68	51.515	ENSACIG00000019049	rab1ab	90	52.632
ENSACIG00000024374	rab11ba	64	48.734	ENSACIG00000000154	RAB39B	74	48.734
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	35.669	ENSACIG00000007154	rab6ba	74	35.669
ENSACIG00000024374	rab11ba	64	45.860	ENSACIG00000006949	RAB17	69	45.860
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	40.491	ENSACIG00000022520	rab33a	72	40.491
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	49.045	ENSACIG00000010896	rab5c	73	49.045
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	36.306	ENSACIG00000010914	RAB41	74	36.306
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	38.983	ENSACIG00000013119	-	85	38.983
ENSACIG00000024374	rab11ba	68	38.824	ENSACIG00000013630	RAB7A	82	38.824
ENSACIG00000024374	rab11ba	58	36.879	ENSACIG00000020496	rab23	78	36.250
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	43.038	ENSACIG00000020616	rab12	65	43.038
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	35.220	ENSACIG00000014094	rab6bb	78	35.220
ENSACIG00000024374	rab11ba	63	37.419	ENSACIG00000017824	rras	78	37.419
ENSACIG00000024374	rab11ba	59	97.917	ENSACIG00000019631	rab11bb	75	97.917
ENSACIG00000024374	rab11ba	64	39.752	ENSACIG00000018043	rab9a	79	39.752
ENSACIG00000024374	rab11ba	85	63.850	ENSACIG00000019803	rab25a	99	63.850
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	43.949	ENSACIG00000014012	rab22a	81	43.949
ENSACIG00000024374	rab11ba	66	34.731	ENSACIG00000011024	si:dkey-13a21.4	80	34.731
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	42.593	ENSACIG00000007739	rab9b	79	42.593
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	34.591	ENSACIG00000000699	hrasb	89	35.673
ENSACIG00000024374	rab11ba	96	73.391	ENSACIG00000003092	rab11a	99	78.505
ENSACIG00000024374	rab11ba	67	39.535	ENSACIG00000006558	-	86	39.306
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	42.138	ENSACIG00000009306	RAB15	75	42.138
ENSACIG00000024374	rab11ba	67	37.870	ENSACIG00000000642	rab36	71	35.294
ENSACIG00000024374	rab11ba	74	38.172	ENSACIG00000022381	-	89	38.172
ENSACIG00000024374	rab11ba	60	42.177	ENSACIG00000021855	rab33ba	61	42.177
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	39.623	ENSACIG00000009617	rab18a	74	39.623
ENSACIG00000024374	rab11ba	67	30.357	ENSACIG00000009139	dnajc27	62	30.357
ENSACIG00000024374	rab11ba	76	46.970	ENSACIG00000009006	zgc:171927	93	46.500
ENSACIG00000024374	rab11ba	65	30.675	ENSACIG00000006211	-	76	30.675

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.076	ENSG00000185236	RAB11B	100	97.826	Homo_sapiens
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	95.376	ENSAMEG00000004955	RAB11B	78	95.376	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	91.444	ENSAOCG00000018050	rab11ba	86	91.444	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000024374	rab11ba	71	97.674	ENSAPEG00000009177	rab11ba	86	90.909	Amphiprion_percula
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	90.909	ENSATEG00000023730	rab11ba	86	90.909	Anabas_testudineus
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.076	ENSANAG00000037616	RAB11B	96	97.076	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	85.561	ENSACLG00000018852	-	85	85.561	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	91.979	ENSACLG00000005420	rab11ba	86	91.979	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000024374	rab11ba	84	76.442	WBGene00004274	rab-11.1	99	76.442	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.076	ENSCJAG00000010778	RAB11B	96	97.076	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSCAFG00000032060	RAB11B	83	92.265	Canis_familiaris
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSCAFG00020022184	RAB11B	83	92.265	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSTSYG00000014758	RAB11B	83	92.265	Carlito_syrichta
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSCPOG00000030154	RAB11B	83	92.265	Cavia_porcellus
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.076	ENSCCAG00000031042	RAB11B	95	97.076	Cebus_capucinus
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSCLAG00000003207	RAB11B	83	92.265	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSCSAG00000008024	RAB11B	83	92.265	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000024374	rab11ba	74	76.536	ENSCHOG00000013525	RAB11B	82	76.536	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	94.118	ENSCING00000009526	-	78	94.118	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSCANG00000040517	RAB11B	83	92.265	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSCGRG00001013827	Rab11b	83	92.265	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSCGRG00000010967	Rab11b	83	92.265	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	90.909	ENSCSEG00000007121	rab11ba	72	90.909	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	90.374	ENSDARG00000041878	rab11ba	86	90.374	Danio_rerio
ENSACIG00000024374	rab11ba	74	90.055	ENSDNOG00000004134	-	83	90.055	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSDNOG00000014618	RAB11B	76	97.059	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSDORG00000006304	Rab11b	83	92.265	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000024374	rab11ba	74	90.608	ENSEBUG00000011775	rab11ba	82	90.608	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	87.647	ENSEBUG00000015447	-	78	87.647	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000024374	rab11ba	59	97.902	ENSEEUG00000009165	-	100	97.902	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000024374	rab11ba	74	90.608	ENSELUG00000019240	-	93	90.608	Esox_lucius
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSFCAG00000015216	RAB11B	83	92.265	Felis_catus
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSFDAG00000019872	RAB11B	83	92.265	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	90.374	ENSFHEG00000022642	rab11ba	86	90.374	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	89.305	ENSGMOG00000007390	rab11ba	85	89.305	Gadus_morhua
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.647	ENSGAFG00000005679	rab11ba	78	97.647	Gambusia_affinis
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	90.374	ENSGAGG00000012557	-	86	90.374	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSHGLG00000014984	RAB11B	83	92.265	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSHGLG00100003638	RAB11B	83	92.265	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSSTOG00000031571	RAB11B	83	92.265	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSJJAG00000018891	Rab11b	83	92.265	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	98.235	ENSKMAG00000006082	-	78	98.235	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	90.909	ENSLBEG00000006087	rab11ba	86	90.909	Labrus_bergylta
ENSACIG00000024374	rab11ba	71	97.093	ENSLACG00000016974	RAB11B	100	97.093	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSLAFG00000013598	RAB11B	83	92.265	Loxodonta_africana
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSMNEG00000039759	-	83	92.265	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	89.840	ENSMAMG00000018556	rab11ba	86	89.840	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	91.979	ENSMZEG00005010947	rab11ba	86	91.979	Maylandia_zebra
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	85.561	ENSMZEG00005019251	-	85	85.561	Maylandia_zebra
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSMAUG00000021579	Rab11b	83	92.265	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSMOCG00000012667	Rab11b	83	92.265	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	94.706	ENSMALG00000021949	rab11ba	78	94.706	Monopterus_albus
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	MGP_CAROLIEiJ_G0021415	Rab11b	99	95.946	Mus_caroli
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSMUSG00000077450	Rab11b	99	95.946	Mus_musculus
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	MGP_PahariEiJ_G0020420	Rab11b	83	92.265	Mus_pahari
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	MGP_SPRETEiJ_G0022327	Rab11b	99	95.946	Mus_spretus
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSMPUG00000007263	RAB11B	83	92.265	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	91.908	ENSMLUG00000002308	-	78	91.908	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSNGAG00000015757	Rab11b	83	92.265	Nannospalax_galili
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	92.513	ENSNBRG00000023898	rab11ba	72	92.513	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSNLEG00000001733	RAB11B	83	92.265	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	ENSODEG00000011371	RAB11B	83	92.265	Octodon_degus
ENSACIG00000024374	rab11ba	77	91.979	ENSONIG00000002535	rab11ba	86	91.979	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000024374	rab11ba	79	83.854	ENSOCUG00000028208	RAB11B	76	83.854	Oryctolagus_cuniculus
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ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.647	ENSORLG00020020816	rab11ba	78	97.647	Oryzias_latipes_hni
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ENSACIG00000024374	rab11ba	55	96.992	ENSXCOG00000009194	-	98	96.992	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000024374	rab11ba	72	96.000	ENSXMAG00000013416	rab11ba	78	97.647	Xiphophorus_maculatus