EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000024376 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4635 bases
Position: chrCCOE01000632.1:773141-777775
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000031552	MMR_HSR1	PF01926.23	3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000032380	-	657	-	ENSACIP00000031552	218 (aa)	-	UPI00022B0D84

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000024376	-	100	85.780	ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780
ENSACIG00000024376	-	79	40.449	ENSACIG00000007739	rab9b	86	40.449
ENSACIG00000024376	-	72	35.669	ENSACIG00000007154	rab6ba	74	35.669
ENSACIG00000024376	-	72	48.408	ENSACIG00000019251	rab5aa	74	48.408
ENSACIG00000024376	-	70	34.839	ENSACIG00000000100	kras	54	35.928
ENSACIG00000024376	-	78	41.040	ENSACIG00000021459	zgc:101559	76	41.040
ENSACIG00000024376	-	82	38.043	ENSACIG00000022520	rab33a	80	38.043
ENSACIG00000024376	-	77	46.154	ENSACIG00000000154	RAB39B	79	46.154
ENSACIG00000024376	-	72	42.331	ENSACIG00000022208	-	78	42.331
ENSACIG00000024376	-	72	51.282	ENSACIG00000003157	-	83	51.282
ENSACIG00000024376	-	79	50.581	ENSACIG00000019049	rab1ab	90	51.880
ENSACIG00000024376	-	74	32.759	ENSACIG00000004859	rab34b	72	32.759
ENSACIG00000024376	-	78	38.043	ENSACIG00000021855	rab33ba	75	38.043
ENSACIG00000024376	-	89	33.500	ENSACIG00000014605	rab6a	92	33.500
ENSACIG00000024376	-	83	41.530	ENSACIG00000003102	rab42a	84	41.530
ENSACIG00000024376	-	100	86.239	ENSACIG00000003092	rab11a	100	86.239
ENSACIG00000024376	-	74	47.826	ENSACIG00000010896	rab5c	75	47.826
ENSACIG00000024376	-	74	41.718	ENSACIG00000023222	-	71	41.718
ENSACIG00000024376	-	75	42.424	ENSACIG00000020616	rab12	83	37.736
ENSACIG00000024376	-	99	64.384	ENSACIG00000019803	rab25a	99	64.384
ENSACIG00000024376	-	99	82.949	ENSACIG00000017403	rab11al	99	82.949
ENSACIG00000024376	-	72	30.675	ENSACIG00000006211	-	76	30.675
ENSACIG00000024376	-	58	32.283	ENSACIG00000015128	si:ch73-116o1.2	67	34.532
ENSACIG00000024376	-	72	35.443	ENSACIG00000014094	rab6bb	77	35.443
ENSACIG00000024376	-	75	38.690	ENSACIG00000006558	-	83	38.690
ENSACIG00000024376	-	53	39.316	ENSACIG00000008620	rab34a	52	39.316
ENSACIG00000024376	-	76	37.647	ENSACIG00000018043	rab9a	84	37.647
ENSACIG00000024376	-	77	43.195	ENSACIG00000006949	RAB17	74	43.195
ENSACIG00000024376	-	74	43.478	ENSACIG00000014012	rab22a	83	43.478
ENSACIG00000024376	-	72	39.877	ENSACIG00000013630	RAB7A	78	39.877
ENSACIG00000024376	-	68	35.333	ENSACIG00000000699	hrasb	85	36.420
ENSACIG00000024376	-	86	90.374	ENSACIG00000024374	rab11ba	77	90.374
ENSACIG00000024376	-	59	31.206	ENSACIG00000018839	-	69	31.206
ENSACIG00000024376	-	95	44.928	ENSACIG00000014625	-	97	44.928
ENSACIG00000024376	-	54	31.405	ENSACIG00000013359	arl4d	59	31.405
ENSACIG00000024376	-	80	41.143	ENSACIG00000009306	RAB15	82	41.143
ENSACIG00000024376	-	93	33.981	ENSACIG00000017824	rras	95	33.981
ENSACIG00000024376	-	94	32.850	ENSACIG00000000642	rab36	78	32.850
ENSACIG00000024376	-	53	30.252	ENSACIG00000000312	arl4cb	60	30.252
ENSACIG00000024376	-	75	46.951	ENSACIG00000008102	rab18b	80	46.951
ENSACIG00000024376	-	77	51.786	ENSACIG00000009006	zgc:171927	79	51.786
ENSACIG00000024376	-	67	42.763	ENSACIG00000013119	-	75	42.763
ENSACIG00000024376	-	79	45.977	ENSACIG00000023837	-	82	45.977
ENSACIG00000024376	-	72	34.591	ENSACIG00000000670	rabl2	69	34.591
ENSACIG00000024376	-	95	32.883	ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	97	32.883
ENSACIG00000024376	-	83	72.928	ENSACIG00000017414	rab25b	87	72.928
ENSACIG00000024376	-	66	36.111	ENSACIG00000020496	rab23	80	35.583
ENSACIG00000024376	-	74	34.132	ENSACIG00000011024	si:dkey-13a21.4	80	34.132
ENSACIG00000024376	-	74	38.889	ENSACIG00000009617	rab18a	76	38.889
ENSACIG00000024376	-	74	32.759	ENSACIG00000018406	rasl11a	69	32.759
ENSACIG00000024376	-	72	39.877	ENSACIG00000022381	-	78	39.877
ENSACIG00000024376	-	76	43.373	ENSACIG00000010619	rab15	78	43.373
ENSACIG00000024376	-	72	36.306	ENSACIG00000010914	RAB41	74	36.306
ENSACIG00000024376	-	81	46.591	ENSACIG00000008584	rab13	85	46.591

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSAPOG00000023455	rab11bb	100	97.706	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000024376	-	100	100.000	ENSAOCG00000018849	-	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSAOCG00000018239	rab11bb	100	97.706	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSAPEG00000016590	rab11bb	100	97.706	Amphiprion_percula
ENSACIG00000024376	-	100	99.541	ENSATEG00000023725	-	100	99.541	Anabas_testudineus
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSATEG00000017696	rab11bb	100	97.706	Anabas_testudineus
ENSACIG00000024376	-	94	98.544	ENSAPLG00000011046	-	94	98.544	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000024376	-	100	100.000	ENSACLG00000005446	-	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSACLG00000007076	rab11bb	100	97.706	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000024376	-	100	96.789	ENSAMXG00000037623	-	100	96.789	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000024376	-	100	99.083	ENSAMXG00000042655	rab11bb	100	99.083	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000024376	-	100	96.789	ENSBTAG00000002475	RAB11B	100	96.789	Bos_taurus
ENSACIG00000024376	-	96	95.215	ENSCHIG00000022426	-	93	95.215	Capra_hircus
ENSACIG00000024376	-	100	96.789	ENSCATG00000029188	-	100	96.789	Cercocebus_atys
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSCPBG00000017056	-	100	97.706	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSCSEG00000012149	rab11bb	100	97.706	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000024376	-	100	99.541	ENSCSEG00000007239	-	100	99.541	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000024376	-	100	95.872	ENSCVAG00000019751	-	100	95.872	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSCVAG00000017021	-	100	97.706	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000024376	-	100	99.083	ENSCVAG00000019718	-	100	99.083	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSDARG00000090086	rab11bb	100	97.706	Danio_rerio
ENSACIG00000024376	-	99	94.470	ENSETEG00000000905	-	99	94.470	Echinops_telfairi
ENSACIG00000024376	-	99	94.419	ENSEASG00005003708	-	99	94.419	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000024376	-	99	94.419	ENSECAG00000000716	RAB11B	99	94.419	Equus_caballus
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSELUG00000021148	rab11bb	100	97.706	Esox_lucius
ENSACIG00000024376	-	100	98.624	ENSELUG00000020948	-	98	100.000	Esox_lucius
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSELUG00000000916	-	100	97.706	Esox_lucius
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSFALG00000011828	-	100	97.706	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000024376	-	100	99.541	ENSFHEG00000022676	-	100	99.541	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSFHEG00000018353	rab11bb	100	97.706	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000024376	-	99	95.370	ENSGMOG00000009668	-	99	95.370	Gadus_morhua
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSGMOG00000009211	rab11bb	100	97.706	Gadus_morhua
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSGALG00000000613	RAB11B	100	97.706	Gallus_gallus
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSGAFG00000007102	rab11bb	100	97.706	Gambusia_affinis
ENSACIG00000024376	-	100	95.413	ENSGACG00000013297	-	99	95.413	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000024376	-	100	97.248	ENSGACG00000015479	rab11bb	100	97.248	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000024376	-	100	96.789	ENSGGOG00000014516	RAB11B	100	96.789	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSHBUG00000014777	rab11bb	100	97.706	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000024376	-	100	100.000	ENSHBUG00000009947	-	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000024376	-	100	98.165	ENSHCOG00000002423	rab11bb	100	98.165	Hippocampus_comes
ENSACIG00000024376	-	100	96.789	ENSHCOG00000000954	-	100	96.789	Hippocampus_comes
ENSACIG00000024376	-	100	93.578	ENSHCOG00000000985	-	100	93.578	Hippocampus_comes
ENSACIG00000024376	-	100	98.624	ENSIPUG00000019927	rab11bb	100	98.624	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000024376	-	100	96.789	ENSIPUG00000025100	rab11b	100	96.789	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSKMAG00000009033	rab11bb	100	97.706	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000024376	-	100	100.000	ENSKMAG00000006170	-	100	100.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000024376	-	100	91.743	ENSLBEG00000005981	-	100	91.743	Labrus_bergylta
ENSACIG00000024376	-	100	99.083	ENSLBEG00000004172	-	100	99.083	Labrus_bergylta
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSLBEG00000015248	rab11bb	100	97.706	Labrus_bergylta
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSLACG00000016857	-	100	97.706	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000024376	-	100	96.789	ENSMFAG00000003654	RAB11B	100	96.789	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000024376	-	100	96.789	ENSMLEG00000030601	-	100	96.789	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000024376	-	100	98.624	ENSMAMG00000018533	-	100	98.624	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000024376	-	100	97.248	ENSMAMG00000006378	rab11bb	100	97.248	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSMZEG00005003352	rab11bb	100	97.706	Maylandia_zebra
ENSACIG00000024376	-	100	100.000	ENSMZEG00005010975	-	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACIG00000024376	-	100	96.789	ENSMICG00000034065	-	100	96.789	Microcebus_murinus
ENSACIG00000024376	-	99	95.853	ENSMMOG00000001238	-	99	95.853	Mola_mola
ENSACIG00000024376	-	100	100.000	ENSMMOG00000001250	-	100	100.000	Mola_mola
ENSACIG00000024376	-	94	97.561	ENSMMOG00000007917	rab11bb	100	97.561	Mola_mola
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSMODG00000003841	-	100	97.706	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	Monopterus_albus
ENSACIG00000024376	-	94	88.889	ENSMLUG00000006677	-	100	88.889	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000024376	-	100	100.000	ENSNBRG00000023885	-	100	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSNBRG00000000372	rab11bb	100	97.706	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSMEUG00000003686	-	100	97.706	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSONIG00000010435	rab11bb	100	97.706	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000024376	-	100	100.000	ENSONIG00000002544	-	100	100.000	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000024376	-	52	94.737	ENSOANG00000031567	-	82	94.737	Ornithorhynchus_anatinus
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ENSACIG00000024376	-	99	98.157	ENSORLG00000015284	-	72	98.157	Oryzias_latipes
ENSACIG00000024376	-	99	98.157	ENSORLG00020020844	RAB11B	99	98.157	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000024376	-	100	97.248	ENSORLG00020019393	rab11bb	100	97.248	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000024376	-	100	97.248	ENSORLG00015020173	rab11bb	100	97.248	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000024376	-	99	98.157	ENSORLG00015016999	RAB11B	99	98.157	Oryzias_latipes_hsok
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ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSOMEG00000017806	-	100	97.706	Oryzias_melastigma
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ENSACIG00000024376	-	98	97.196	ENSPKIG00000001389	-	69	97.196	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000024376	-	98	93.607	ENSPSIG00000010242	-	85	93.607	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSPMGG00000009435	rab11bb	100	97.706	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSACIG00000024376	-	97	97.170	ENSPCIG00000020371	-	99	97.170	Phascolarctos_cinereus
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ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSPNYG00000004098	rab11bb	100	97.706	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000024376	-	100	100.000	ENSPNYG00000019611	-	100	100.000	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000024376	-	100	96.789	ENSRROG00000037812	-	100	96.789	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000024376	-	97	96.698	ENSSHAG00000006816	-	97	96.698	Sarcophilus_harrisii
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ENSACIG00000024376	-	100	96.330	ENSSMAG00000018613	-	100	96.330	Scophthalmus_maximus
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ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSSLDG00000020676	rab11bb	100	97.706	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSACIG00000024376	-	100	100.000	ENSSPAG00000014559	-	100	100.000	Stegastes_partitus
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSTGUG00000000084	-	100	97.706	Taeniopygia_guttata
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ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSTRUG00000022029	rab11bb	100	97.706	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000024376	-	93	97.044	ENSTNIG00000002003	-	100	97.044	Tetraodon_nigroviridis
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ENSACIG00000024376	-	99	95.392	ENSTNIG00000013184	-	99	95.392	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000024376	-	100	96.789	ENSTNIG00000011081	rab11bb	100	96.789	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000024376	-	94	97.561	ENSUAMG00000006639	-	99	97.561	Ursus_americanus
ENSACIG00000024376	-	100	96.804	ENSXETG00000025484	rab11b.1	99	96.804	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSXCOG00000008042	-	100	97.706	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000024376	-	100	100.000	ENSXCOG00000009190	-	100	100.000	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000024376	-	100	97.706	ENSXMAG00000011926	rab11bb	100	97.706	Xiphophorus_maculatus
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