EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000024420 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1213 bases
Position: chrCCOE01000638.1:146573-147785
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000031616	MMR_HSR1	PF01926.23	6.8e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000032444	-	591	-	ENSACIP00000031616	196 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000024420	-	90	33.152	ENSACIG00000022050	ARL6	75	32.609
ENSACIG00000024420	-	97	68.421	ENSACIG00000009110	arl4aa	88	69.492
ENSACIG00000024420	-	88	46.512	ENSACIG00000016782	-	94	46.512
ENSACIG00000024420	-	90	48.295	ENSACIG00000014610	zgc:110286	94	48.295
ENSACIG00000024420	-	84	47.273	ENSACIG00000019050	-	88	47.273
ENSACIG00000024420	-	95	59.043	ENSACIG00000018839	-	87	58.857
ENSACIG00000024420	-	88	47.093	ENSACIG00000012192	-	92	47.093
ENSACIG00000024420	-	89	42.286	ENSACIG00000016407	arl3l2	88	42.690
ENSACIG00000024420	-	87	38.235	ENSACIG00000007953	arl1	91	38.235
ENSACIG00000024420	-	86	38.462	ENSACIG00000023231	arl11	91	38.323
ENSACIG00000024420	-	62	35.537	ENSACIG00000019827	sar1ab	58	35.537
ENSACIG00000024420	-	89	42.614	ENSACIG00000013244	arl14	84	42.614
ENSACIG00000024420	-	91	47.486	ENSACIG00000005843	arf5	92	48.256
ENSACIG00000024420	-	86	36.313	ENSACIG00000009740	arfrp1	84	36.723
ENSACIG00000024420	-	89	31.818	ENSACIG00000008614	arl8ba	72	34.286
ENSACIG00000024420	-	89	36.782	ENSACIG00000019225	-	89	37.654
ENSACIG00000024420	-	88	37.288	ENSACIG00000016662	arl8	93	37.288
ENSACIG00000024420	-	88	47.674	ENSACIG00000012912	arf2b	75	47.093
ENSACIG00000024420	-	99	67.010	ENSACIG00000000949	-	90	66.851
ENSACIG00000024420	-	84	34.320	ENSACIG00000000945	-	89	34.320
ENSACIG00000024420	-	91	46.629	ENSACIG00000000467	-	92	47.674
ENSACIG00000024420	-	96	84.127	ENSACIG00000000312	arl4cb	92	83.616
ENSACIG00000024420	-	74	34.694	ENSACIG00000000868	arl8a	75	34.694
ENSACIG00000024420	-	68	33.094	ENSACIG00000013634	sar1b	67	33.094
ENSACIG00000024420	-	74	34.694	ENSACIG00000009595	arl8bb	76	34.694
ENSACIG00000024420	-	69	36.765	ENSACIG00000024513	-	66	36.765
ENSACIG00000024420	-	88	44.253	ENSACIG00000000612	arl2	88	44.444
ENSACIG00000024420	-	88	46.512	ENSACIG00000022896	arf3b	91	46.512
ENSACIG00000024420	-	95	61.497	ENSACIG00000013359	arl4d	86	63.793
ENSACIG00000024420	-	68	30.216	ENSACIG00000019049	rab1ab	91	30.216
ENSACIG00000024420	-	85	40.476	ENSACIG00000008975	arl5c	88	40.476
ENSACIG00000024420	-	82	38.323	ENSACIG00000003228	arl5a	89	38.788

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSG00000188042	ARL4C	91	83.523	Homo_sapiens
ENSACIG00000024420	-	96	83.598	ENSAPOG00000023273	arl4cb	92	83.051	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSAMEG00000016052	ARL4C	73	83.523	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000024420	-	96	83.598	ENSAPEG00000019862	arl4cb	92	83.051	Amphiprion_percula
ENSACIG00000024420	-	96	83.598	ENSATEG00000019469	arl4cb	92	83.051	Anabas_testudineus
ENSACIG00000024420	-	97	97.895	ENSATEG00000013007	-	98	97.895	Anabas_testudineus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSAPLG00000015708	ARL4C	91	83.523	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000024420	-	96	85.106	ENSACAG00000010087	ARL4C	91	84.659	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSANAG00000038361	ARL4C	87	83.523	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000024420	-	97	98.947	ENSACLG00000014159	-	98	98.947	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000024420	-	96	82.979	ENSACLG00000014218	arl4cb	91	82.386	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000024420	-	98	72.917	ENSAMXG00000024897	-	93	72.222	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000024420	-	96	85.185	ENSAMXG00000024926	arl4cb	92	85.311	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSCJAG00000042179	ARL4C	87	83.523	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000024420	-	92	84.444	ENSCAFG00000012001	ARL4C	93	83.929	Canis_familiaris
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSCAFG00020024408	ARL4C	91	83.523	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSCHIG00000008457	ARL4C	91	83.523	Capra_hircus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSTSYG00000033922	ARL4C	87	83.523	Carlito_syrichta
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSCCAG00000024558	ARL4C	87	83.523	Cebus_capucinus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSCATG00000041801	ARL4C	87	83.523	Cercocebus_atys
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSCLAG00000010525	ARL4C	90	83.523	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSCSAG00000018795	ARL4C	91	83.523	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSCPBG00000024707	ARL4C	91	84.091	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSCANG00000035065	ARL4C	87	83.523	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSCGRG00001010866	Arl4c	91	83.523	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSCGRG00000018449	Arl4c	91	83.523	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000024420	-	93	98.361	ENSCSEG00000005387	-	96	98.361	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000024420	-	96	85.638	ENSCSEG00000000838	arl4cb	81	85.227	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000024420	-	96	85.638	ENSCVAG00000020902	arl4cb	92	84.746	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000024420	-	98	93.750	ENSCVAG00000023139	-	92	94.413	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000024420	-	96	85.714	ENSDARG00000057606	arl4ca	92	85.311	Danio_rerio
ENSACIG00000024420	-	96	83.598	ENSDARG00000032708	arl4cb	92	83.051	Danio_rerio
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSDNOG00000045362	ARL4C	91	83.523	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSDORG00000028955	Arl4c	91	83.523	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000024420	-	80	66.667	ENSEBUG00000004741	arl4cb	75	66.667	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSEASG00005019989	ARL4C	91	83.523	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000024420	-	95	83.957	ENSEEUG00000012728	ARL4C	92	82.955	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000024420	-	96	83.598	ENSELUG00000004400	arl4cb	92	83.051	Esox_lucius
ENSACIG00000024420	-	94	86.486	ENSELUG00000015699	arl4ca	91	86.127	Esox_lucius
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSFCAG00000033226	ARL4C	87	83.523	Felis_catus
ENSACIG00000024420	-	96	84.574	ENSFALG00000015098	ARL4C	91	84.091	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSFDAG00000000777	ARL4C	91	83.523	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000024420	-	97	92.632	ENSFHEG00000013017	-	91	93.220	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000024420	-	97	84.737	ENSFHEG00000009894	arl4cb	89	84.746	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000024420	-	96	84.656	ENSGMOG00000020467	arl4cb	92	84.181	Gadus_morhua
ENSACIG00000024420	-	90	84.659	ENSGALG00000052743	ARL4C	93	84.146	Gallus_gallus
ENSACIG00000024420	-	97	84.737	ENSGAFG00000020556	arl4cb	91	84.746	Gambusia_affinis
ENSACIG00000024420	-	96	83.598	ENSGACG00000008143	arl4cb	92	83.051	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSGAGG00000013550	ARL4C	91	84.091	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSGGOG00000023462	ARL4C	87	83.523	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000024420	-	96	82.979	ENSHBUG00000002490	arl4cb	91	82.386	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000024420	-	97	98.947	ENSHBUG00000009561	-	98	98.947	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSHGLG00000020294	ARL4C	91	83.523	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000024420	-	97	93.684	ENSHCOG00000008233	arl4cb	88	93.785	Hippocampus_comes
ENSACIG00000024420	-	96	77.249	ENSIPUG00000006298	-	91	77.273	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000024420	-	96	85.185	ENSIPUG00000002122	arl4cb	92	85.311	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSSTOG00000023217	ARL4C	91	83.523	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000024420	-	96	84.574	ENSJJAG00000010006	Arl4c	91	84.091	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000024420	-	96	84.656	ENSKMAG00000011334	arl4cb	92	84.181	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000024420	-	97	96.842	ENSLBEG00000010335	-	98	96.842	Labrus_bergylta
ENSACIG00000024420	-	96	84.127	ENSLBEG00000012677	arl4cb	92	83.616	Labrus_bergylta
ENSACIG00000024420	-	96	86.702	ENSLACG00000015350	ARL4C	87	86.364	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000024420	-	96	83.598	ENSLOCG00000017842	arl4cb	90	83.051	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSLAFG00000028097	ARL4C	91	83.523	Loxodonta_africana
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSMFAG00000045232	ARL4C	87	83.523	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSMMUG00000011516	ARL4C	91	83.523	Macaca_mulatta
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSMNEG00000031224	ARL4C	87	83.523	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSMLEG00000027620	ARL4C	87	83.523	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000024420	-	97	97.895	ENSMAMG00000022482	-	95	97.895	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000024420	-	96	83.598	ENSMAMG00000013367	arl4cb	92	83.051	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000024420	-	96	82.979	ENSMZEG00005020500	arl4cb	91	82.386	Maylandia_zebra
ENSACIG00000024420	-	88	84.393	ENSMGAG00000016127	ARL4C	92	83.851	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSMICG00000017503	ARL4C	86	83.523	Microcebus_murinus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSMOCG00000006232	Arl4c	91	83.523	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000024420	-	96	85.106	ENSMODG00000023112	ARL4C	91	84.659	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000024420	-	97	97.895	ENSMALG00000006786	-	95	97.895	Monopterus_albus
ENSACIG00000024420	-	96	84.127	ENSMALG00000011378	arl4cb	92	83.616	Monopterus_albus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	MGP_CAROLIEiJ_G0014402	Arl4c	91	83.523	Mus_caroli
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSMUSG00000049866	Arl4c	91	83.523	Mus_musculus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	MGP_PahariEiJ_G0027638	Arl4c	91	83.523	Mus_pahari
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	MGP_SPRETEiJ_G0015206	Arl4c	91	83.523	Mus_spretus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSMPUG00000019267	ARL4C	91	83.523	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSNGAG00000012405	Arl4c	91	83.523	Nannospalax_galili
ENSACIG00000024420	-	96	82.979	ENSNBRG00000020745	arl4cb	88	82.386	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000024420	-	97	98.947	ENSNBRG00000015182	-	96	98.947	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSMEUG00000006551	ARL4C	87	83.523	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSODEG00000019668	ARL4C	91	83.523	Octodon_degus
ENSACIG00000024420	-	97	98.947	ENSONIG00000021039	arl4ca	97	98.947	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSOANG00000011765	ARL4C	91	83.523	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000024420	-	96	84.043	ENSOCUG00000005758	ARL4C	91	83.523	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000024420	-	91	72.626	ENSORLG00000026726	-	94	72.626	Oryzias_latipes
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ENSACIG00000024420	-	91	73.743	ENSORLG00020011692	-	94	73.743	Oryzias_latipes_hni
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