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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000024504 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: polr3a
Alias: fb81e09|im:7139382|wu:fb81e09
Full Name: polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide A
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22157 bases
Position: chrCCOE01000650.1:1299502-1321658
Accession: ZDB-GENE-050208-103
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000031719	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	2.7e-85	1	1
ENSACIP00000031719	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	5.2e-32	1	1
ENSACIP00000031719	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	1.8e-73	1	1
ENSACIP00000031719	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	1.1e-40	1	1
ENSACIP00000031719	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	5.9e-92	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000032551	-	4017	-	ENSACIP00000031719	1338 (aa)	-	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000024504	polr3a	89	37.665	ENSACIG00000015982	polr2a	64	37.665

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.517	ENSG00000148606	POLR3A	93	90.517	Homo_sapiens
ENSACIG00000024504	polr3a	64	93.728	ENSAPOG00000022727	polr3a	99	93.728	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.231	ENSAMEG00000017801	POLR3A	93	90.231	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000024504	polr3a	97	97.231	ENSAOCG00000002071	polr3a	94	97.231	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000024504	polr3a	97	93.692	ENSAOCG00000003949	-	93	93.692	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000024504	polr3a	97	97.000	ENSAPEG00000001966	-	94	97.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000024504	polr3a	97	97.231	ENSAPEG00000013351	polr3a	94	97.231	Amphiprion_percula
ENSACIG00000024504	polr3a	97	96.923	ENSATEG00000023277	polr3a	94	96.923	Anabas_testudineus
ENSACIG00000024504	polr3a	96	91.108	ENSAPLG00000015878	POLR3A	92	91.108	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000024504	polr3a	97	89.389	ENSACAG00000007985	POLR3A	99	89.389	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000024504	polr3a	97	87.683	ENSANAG00000028922	POLR3A	93	87.683	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000024504	polr3a	97	98.000	ENSACLG00000005914	polr3a	96	97.057	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000024504	polr3a	97	89.308	ENSAMXG00000018852	polr3a	93	89.308	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.671	ENSBTAG00000013259	POLR3A	93	90.671	Bos_taurus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	56.335	WBGene00004411	rpc-1	94	56.335	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.439	ENSCJAG00000001015	POLR3A	93	90.439	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.517	ENSCAFG00000015546	POLR3A	93	90.517	Canis_familiaris
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.517	ENSCAFG00020014711	POLR3A	93	90.517	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.362	ENSCHIG00000000352	POLR3A	93	90.362	Capra_hircus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	89.900	ENSTSYG00000006671	POLR3A	93	89.900	Carlito_syrichta
ENSACIG00000024504	polr3a	96	90.172	ENSCAPG00000016031	POLR3A	93	90.172	Cavia_aperea
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.208	ENSCPOG00000022387	POLR3A	93	90.208	Cavia_porcellus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	88.897	ENSCCAG00000032995	POLR3A	93	88.897	Cebus_capucinus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.517	ENSCATG00000035842	POLR3A	93	90.517	Cercocebus_atys
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.285	ENSCLAG00000009629	POLR3A	93	90.285	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.517	ENSCSAG00000009292	POLR3A	93	90.517	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000024504	polr3a	84	81.818	ENSCHOG00000008368	POLR3A	95	81.818	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.748	ENSCPBG00000002079	POLR3A	93	90.748	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000024504	polr3a	97	68.745	ENSCSAVG00000009925	-	93	68.745	Ciona_savignyi
ENSACIG00000024504	polr3a	83	85.825	ENSCANG00000041071	POLR3A	92	85.825	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000024504	polr3a	81	91.667	ENSCGRG00001015599	-	92	91.667	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000024504	polr3a	88	89.345	ENSCGRG00000001019	Polr3a	96	89.345	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000024504	polr3a	97	96.000	ENSCSEG00000016653	polr3a	94	96.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000024504	polr3a	97	96.000	ENSCVAG00000023049	polr3a	94	96.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	92.769	ENSDARG00000102569	polr3a	94	92.769	Danio_rerio
ENSACIG00000024504	polr3a	97	89.514	ENSDNOG00000010194	POLR3A	93	89.514	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.594	ENSDORG00000000184	Polr3a	93	90.594	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000024504	polr3a	97	56.495	FBgn0030687	CG17209	93	56.495	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000024504	polr3a	84	92.208	ENSETEG00000007477	POLR3A	82	92.208	Echinops_telfairi
ENSACIG00000024504	polr3a	61	76.319	ENSEBUG00000013761	polr3a	98	76.319	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.517	ENSEASG00005023053	POLR3A	93	90.517	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.362	ENSECAG00000019416	POLR3A	97	90.362	Equus_caballus
ENSACIG00000024504	polr3a	95	87.165	ENSEEUG00000001774	POLR3A	95	87.165	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	91.404	ENSELUG00000014016	polr3a	94	91.404	Esox_lucius
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.594	ENSFCAG00000000843	POLR3A	93	90.594	Felis_catus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.678	ENSFALG00000006913	POLR3A	93	90.678	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.517	ENSFDAG00000007813	POLR3A	93	90.517	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000024504	polr3a	91	95.672	ENSFHEG00000011922	polr3a	92	95.672	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	88.320	ENSGMOG00000000291	polr3a	93	88.320	Gadus_morhua
ENSACIG00000024504	polr3a	97	91.133	ENSGALG00000004947	POLR3A	93	91.133	Gallus_gallus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	95.769	ENSGAFG00000005112	polr3a	94	95.769	Gambusia_affinis
ENSACIG00000024504	polr3a	97	95.462	ENSGACG00000002304	polr3a	94	95.462	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000024504	polr3a	95	90.204	ENSGAGG00000010386	POLR3A	95	90.204	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000024504	polr3a	96	89.311	ENSGGOG00000027729	POLR3A	92	91.590	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000024504	polr3a	97	97.923	ENSHBUG00000018098	polr3a	94	97.923	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.517	ENSHGLG00000017899	POLR3A	93	90.517	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.517	ENSHGLG00100008483	POLR3A	93	90.517	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000024504	polr3a	97	94.923	ENSHCOG00000001075	polr3a	94	94.923	Hippocampus_comes
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.439	ENSSTOG00000012983	POLR3A	93	90.439	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	95.923	ENSKMAG00000015290	polr3a	94	95.923	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	94.769	ENSLBEG00000017214	polr3a	93	94.769	Labrus_bergylta
ENSACIG00000024504	polr3a	97	88.000	ENSLACG00000018557	POLR3A	96	88.000	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000024504	polr3a	97	92.786	ENSLOCG00000004942	polr3a	94	92.786	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	88.983	ENSLAFG00000016719	POLR3A	93	88.983	Loxodonta_africana
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.439	ENSMFAG00000032218	POLR3A	93	90.439	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.439	ENSMMUG00000005514	POLR3A	93	90.439	Macaca_mulatta
ENSACIG00000024504	polr3a	96	83.538	ENSMNEG00000035163	POLR3A	99	89.858	Macaca_nemestrina
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ENSACIG00000024504	polr3a	97	97.077	ENSMAMG00000017497	polr3a	94	97.077	Mastacembelus_armatus
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ENSACIG00000024504	polr3a	97	72.624	ENSMGAG00000005713	-	93	72.624	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000024504	polr3a	97	88.126	ENSMAUG00000016247	Polr3a	93	88.126	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.517	ENSMICG00000005937	POLR3A	92	91.682	Microcebus_murinus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.517	ENSMOCG00000012185	Polr3a	93	90.517	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000024504	polr3a	97	96.154	ENSMMOG00000013822	polr3a	94	96.154	Mola_mola
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.517	ENSMODG00000001036	POLR3A	93	90.517	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000024504	polr3a	97	96.462	ENSMALG00000001249	polr3a	94	96.462	Monopterus_albus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.439	MGP_CAROLIEiJ_G0019016	Polr3a	93	90.439	Mus_caroli
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.517	ENSMUSG00000025280	Polr3a	98	88.697	Mus_musculus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.439	MGP_PahariEiJ_G0030029	Polr3a	93	90.439	Mus_pahari
ENSACIG00000024504	polr3a	97	87.664	MGP_SPRETEiJ_G0019894	Polr3a	97	95.050	Mus_spretus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	89.763	ENSMPUG00000003790	POLR3A	93	89.763	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000024504	polr3a	97	89.283	ENSMLUG00000011522	POLR3A	93	89.283	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	88.897	ENSNGAG00000015863	Polr3a	93	88.897	Nannospalax_galili
ENSACIG00000024504	polr3a	97	95.308	ENSNBRG00000014262	polr3a	93	95.308	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000024504	polr3a	85	83.278	ENSNLEG00000010501	POLR3A	85	83.278	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000024504	polr3a	96	77.127	ENSMEUG00000012446	POLR3A	93	77.127	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000024504	polr3a	97	85.351	ENSOPRG00000001880	-	93	85.351	Ochotona_princeps
ENSACIG00000024504	polr3a	97	89.746	ENSODEG00000015146	POLR3A	93	89.746	Octodon_degus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	98.308	ENSONIG00000016129	polr3a	94	98.308	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000024504	polr3a	95	89.969	ENSOANG00000007013	POLR3A	93	89.969	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.208	ENSOCUG00000012450	POLR3A	93	90.208	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000024504	polr3a	97	96.308	ENSORLG00000008958	polr3a	94	96.308	Oryzias_latipes
ENSACIG00000024504	polr3a	97	96.308	ENSORLG00020007525	polr3a	95	96.308	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000024504	polr3a	97	96.308	ENSORLG00015006633	polr3a	94	96.308	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000024504	polr3a	97	95.385	ENSOMEG00000012865	polr3a	93	95.385	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.362	ENSOGAG00000010995	POLR3A	93	90.362	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.300	ENSOARG00000009656	POLR3A	93	90.300	Ovis_aries
ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.594	ENSPPRG00000002128	POLR3A	93	90.594	Panthera_pardus
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ENSACIG00000024504	polr3a	97	90.439	ENSPCIG00000015842	POLR3A	93	90.439	Phascolarctos_cinereus
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