EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000024513 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2715 bases
Position: chrCCOE01000650.1:1517718-1520432
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000031732	MMR_HSR1	PF01926.23	7.1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000032564	-	597	-	ENSACIP00000031732	198 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000024513's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000024513's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000024513	-	64	34.091	ENSACIG00000000949	-	66	34.091
ENSACIG00000024513	-	58	38.655	ENSACIG00000009110	arl4aa	60	38.655
ENSACIG00000024513	-	66	36.765	ENSACIG00000024420	-	69	36.765
ENSACIG00000024513	-	100	78.283	ENSACIG00000019827	sar1ab	100	78.283
ENSACIG00000024513	-	92	31.694	ENSACIG00000000612	arl2	93	31.694
ENSACIG00000024513	-	64	37.795	ENSACIG00000017582	arl13b	52	37.795
ENSACIG00000024513	-	88	30.286	ENSACIG00000022896	arf3b	90	30.286
ENSACIG00000024513	-	89	31.111	ENSACIG00000000945	-	92	31.111
ENSACIG00000024513	-	87	31.214	ENSACIG00000000467	-	89	31.214
ENSACIG00000024513	-	100	84.343	ENSACIG00000013634	sar1b	100	84.343
ENSACIG00000024513	-	88	32.000	ENSACIG00000014610	zgc:110286	91	32.000
ENSACIG00000024513	-	59	37.190	ENSACIG00000013359	arl4d	60	37.190
ENSACIG00000024513	-	88	32.418	ENSACIG00000018839	-	84	32.418
ENSACIG00000024513	-	71	34.932	ENSACIG00000000312	arl4cb	73	34.932
ENSACIG00000024513	-	89	32.022	ENSACIG00000012912	arf2b	75	32.022
ENSACIG00000024513	-	86	30.814	ENSACIG00000023231	arl11	91	30.814
ENSACIG00000024513	-	68	35.507	ENSACIG00000013244	arl14	67	35.507
ENSACIG00000024513	-	88	30.286	ENSACIG00000016782	-	93	30.286
ENSACIG00000024513	-	88	31.429	ENSACIG00000012192	-	91	31.429
ENSACIG00000024513	-	90	32.240	ENSACIG00000019050	-	96	32.240

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000024513	-	100	83.333	ENSAPOG00000007186	sar1b	100	83.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000024513	-	100	97.475	ENSAPOG00000017891	-	100	97.475	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000024513	-	100	82.828	ENSAOCG00000005888	sar1b	100	82.828	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000024513	-	100	97.475	ENSAOCG00000002627	-	100	97.475	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000024513	-	100	97.475	ENSAPEG00000019680	-	100	97.475	Amphiprion_percula
ENSACIG00000024513	-	100	82.828	ENSAPEG00000022771	sar1b	100	82.828	Amphiprion_percula
ENSACIG00000024513	-	100	81.818	ENSATEG00000012904	sar1b	100	81.818	Anabas_testudineus
ENSACIG00000024513	-	100	94.444	ENSATEG00000023368	-	100	94.444	Anabas_testudineus
ENSACIG00000024513	-	100	82.828	ENSACAG00000001470	-	100	82.828	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000024513	-	100	83.838	ENSACLG00000014649	sar1b	100	83.838	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000024513	-	100	98.485	ENSACLG00000005011	-	100	98.485	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000024513	-	100	88.889	ENSAMXG00000034192	-	91	88.889	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000024513	-	59	89.744	ENSAMXG00000018108	sar1b	84	89.744	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000024513	-	100	91.919	ENSCSEG00000016976	-	100	91.919	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000024513	-	92	84.066	ENSCSEG00000015238	sar1b	90	84.066	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000024513	-	100	85.354	ENSCVAG00000022959	sar1b	100	85.354	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000024513	-	100	84.848	ENSDARG00000103403	sar1b	100	84.848	Danio_rerio
ENSACIG00000024513	-	99	67.857	FBgn0038947	Sar1	99	67.857	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000024513	-	97	79.688	ENSEBUG00000011723	sar1b	97	79.688	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000024513	-	100	85.859	ENSELUG00000020912	sar1b	100	85.859	Esox_lucius
ENSACIG00000024513	-	100	84.343	ENSFHEG00000019865	sar1b	100	84.343	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000024513	-	100	84.343	ENSGMOG00000008023	sar1b	100	84.343	Gadus_morhua
ENSACIG00000024513	-	100	82.828	ENSGAFG00000007081	sar1b	100	82.828	Gambusia_affinis
ENSACIG00000024513	-	100	81.313	ENSGACG00000001474	sar1b	100	81.313	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000024513	-	100	83.838	ENSHBUG00000000915	sar1b	100	83.838	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000024513	-	100	98.485	ENSHBUG00000018397	-	100	98.485	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000024513	-	100	82.828	ENSHCOG00000010953	sar1b	100	82.828	Hippocampus_comes
ENSACIG00000024513	-	100	83.333	ENSIPUG00000020925	sar1b	100	83.333	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000024513	-	100	87.879	ENSIPUG00000010046	sar1b	100	87.879	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000024513	-	100	83.333	ENSKMAG00000019693	sar1b	100	83.333	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000024513	-	100	90.404	ENSKMAG00000014875	-	100	90.404	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000024513	-	100	80.303	ENSLBEG00000027550	sar1b	100	80.303	Labrus_bergylta
ENSACIG00000024513	-	100	96.970	ENSLBEG00000016945	-	100	96.970	Labrus_bergylta
ENSACIG00000024513	-	100	67.337	ENSLACG00000017029	-	100	67.337	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000024513	-	100	80.303	ENSLACG00000010795	sar1b	100	80.303	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000024513	-	100	84.848	ENSLOCG00000010197	sar1b	100	84.848	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000024513	-	100	86.869	ENSLOCG00000005214	-	100	86.869	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000024513	-	100	82.828	ENSMAMG00000021732	sar1b	100	82.828	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000024513	-	100	98.485	ENSMZEG00005001012	-	100	98.485	Maylandia_zebra
ENSACIG00000024513	-	100	83.838	ENSMZEG00005008942	sar1b	100	83.838	Maylandia_zebra
ENSACIG00000024513	-	90	85.475	ENSMGAG00000005387	-	91	85.475	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000024513	-	100	95.455	ENSMMOG00000013803	-	100	95.455	Mola_mola
ENSACIG00000024513	-	100	82.323	ENSMALG00000016635	sar1b	97	81.868	Monopterus_albus
ENSACIG00000024513	-	100	98.990	ENSNBRG00000014004	-	100	98.990	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000024513	-	100	83.838	ENSNBRG00000008013	sar1b	100	83.838	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000024513	-	100	83.838	ENSONIG00000017278	sar1b	100	83.838	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000024513	-	100	84.343	ENSORLG00000000932	sar1b	100	84.343	Oryzias_latipes
ENSACIG00000024513	-	100	84.343	ENSORLG00020021985	sar1b	100	84.343	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000024513	-	100	84.343	ENSORLG00015007044	sar1b	100	84.343	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000024513	-	100	82.828	ENSOMEG00000001052	sar1b	100	82.828	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000024513	-	100	82.828	ENSPKIG00000010688	sar1b	100	82.828	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000024513	-	100	85.354	ENSPKIG00000017353	-	100	85.354	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000024513	-	59	87.931	ENSPMGG00000001234	sar1b	91	87.931	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000024513	-	100	79.602	ENSPMAG00000003593	sar1b	100	79.602	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000024513	-	100	82.828	ENSPFOG00000005666	sar1b	100	82.828	Poecilia_formosa
ENSACIG00000024513	-	59	92.308	ENSPLAG00000001016	-	75	92.308	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000024513	-	100	83.333	ENSPLAG00000012223	sar1b	100	83.333	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000024513	-	100	82.828	ENSPMEG00000016831	sar1b	100	82.828	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000024513	-	60	92.373	ENSPREG00000002020	-	87	92.373	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000024513	-	100	82.828	ENSPREG00000005312	sar1b	90	82.828	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000024513	-	100	83.838	ENSPNYG00000012440	sar1b	100	83.838	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000024513	-	100	97.980	ENSPNYG00000021357	-	100	97.980	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000024513	-	100	85.354	ENSPNAG00000014683	sar1b	100	85.354	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000024513	-	100	89.899	ENSPNAG00000001123	-	100	89.899	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000024513	-	100	85.354	ENSSFOG00015018128	-	100	85.354	Scleropages_formosus
ENSACIG00000024513	-	100	85.859	ENSSFOG00015020051	sar1b	100	85.859	Scleropages_formosus
ENSACIG00000024513	-	100	93.939	ENSSMAG00000002165	-	100	93.939	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000024513	-	100	81.313	ENSSMAG00000007106	sar1b	80	81.313	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000024513	-	100	97.475	ENSSDUG00000019629	-	100	97.475	Seriola_dumerili
ENSACIG00000024513	-	100	83.838	ENSSDUG00000020926	sar1b	100	83.838	Seriola_dumerili
ENSACIG00000024513	-	100	97.475	ENSSLDG00000024197	-	100	97.475	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000024513	-	100	83.838	ENSSLDG00000017052	sar1b	94	90.741	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000024513	-	100	82.828	ENSSPUG00000010247	-	100	82.828	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000024513	-	100	97.475	ENSSPAG00000015626	-	100	97.475	Stegastes_partitus
ENSACIG00000024513	-	100	83.838	ENSSPAG00000017634	sar1b	100	83.838	Stegastes_partitus
ENSACIG00000024513	-	100	81.313	ENSTRUG00000023908	sar1b	100	81.313	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000024513	-	100	81.313	ENSTNIG00000016097	sar1b	100	81.313	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000024513	-	59	90.598	ENSXCOG00000006154	-	79	90.598	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000024513	-	99	77.665	ENSXCOG00000004160	sar1b	96	77.665	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000024513	-	100	82.828	ENSXMAG00000008294	sar1b	100	82.828	Xiphophorus_maculatus