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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000000117 (Gene tree)
Gene ID: 113033633
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17763 bases
Position: chr12:3910864-3928626
Accession: 113033633
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000000153	RRM_1	PF00076.22	7.3e-33	1	2
ENSACLP00000000153	RRM_1	PF00076.22	7.3e-33	2	2
ENSACLP00000000141	RRM_1	PF00076.22	8.9e-33	1	2
ENSACLP00000000141	RRM_1	PF00076.22	8.9e-33	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000000144	-	2792	XM_026187620	ENSACLP00000000141	348 (aa)	XP_026043405	UPI00025FAAE4
ENSACLT00000000157	-	2778	-	ENSACLP00000000153	327 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000000117	-	55	41.436	ENSACLG00000008532	hnrnpa3	67	38.197
ENSACLG00000000117	-	52	43.590	ENSACLG00000023187	dazap1	51	43.038
ENSACLG00000000117	-	61	32.911	ENSACLG00000008973	HNRNPA0	65	32.911
ENSACLG00000000117	-	53	39.655	ENSACLG00000008978	-	90	41.361
ENSACLG00000000117	-	54	46.067	ENSACLG00000026497	hnrnpd	86	41.126
ENSACLG00000000117	-	53	40.541	ENSACLG00000006940	-	58	39.896
ENSACLG00000000117	-	54	46.524	ENSACLG00000007827	hnrnpaba	75	45.333
ENSACLG00000000117	-	57	44.444	ENSACLG00000025213	hnrnpd	77	40.239
ENSACLG00000000117	-	51	47.619	ENSACLG00000024583	-	78	44.000
ENSACLG00000000117	-	54	45.989	ENSACLG00000007958	hnrnpaba	74	45.333
ENSACLG00000000117	-	100	93.598	ENSACLG00000011230	MSI1	100	92.593
ENSACLG00000000117	-	97	72.908	ENSACLG00000007752	msi2a	100	67.429
ENSACLG00000000117	-	51	34.940	ENSACLG00000013961	tardbp	55	34.940

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSG00000135097	MSI1	100	83.978	Homo_sapiens
ENSACLG00000000117	-	100	99.390	ENSAPOG00000023458	-	100	98.854	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000000117	-	100	93.578	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.571	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000000117	-	100	67.192	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	64.567	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000000117	-	96	87.789	ENSACIG00000017754	-	72	93.069	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000000117	-	100	89.602	ENSAOCG00000009031	-	95	89.634	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000000117	-	100	93.578	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	92.571	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000000117	-	100	99.390	ENSAPEG00000006857	-	84	98.854	Amphiprion_percula
ENSACLG00000000117	-	100	93.578	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	92.571	Amphiprion_percula
ENSACLG00000000117	-	100	99.684	ENSATEG00000017059	MSI1	100	94.930	Anabas_testudineus
ENSACLG00000000117	-	100	85.455	ENSATEG00000023779	-	100	84.463	Anabas_testudineus
ENSACLG00000000117	-	100	85.841	ENSACAG00000002762	MSI1	99	86.726	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSANAG00000027151	MSI1	100	83.978	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000000117	-	81	86.415	ENSANAG00000027901	-	88	86.415	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000000117	-	100	93.730	ENSAMXG00000038960	msi1	76	93.730	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	85.337	Bos_taurus
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	83.978	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000000117	-	100	85.044	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	83.702	Canis_familiaris
ENSACLG00000000117	-	100	85.531	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	85.531	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000000117	-	100	82.948	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	81.744	Capra_hircus
ENSACLG00000000117	-	100	84.709	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	Carlito_syrichta
ENSACLG00000000117	-	100	76.358	ENSCAPG00000003919	MSI1	78	84.615	Cavia_aperea
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	85.380	Cavia_porcellus
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	83.978	Cebus_capucinus
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.978	Cercocebus_atys
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	85.380	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000000117	-	78	84.116	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	84.116	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000000117	-	100	88.485	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	87.464	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000000117	-	100	84.756	ENSCANG00000040651	MSI1	100	84.756	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.978	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000000117	-	100	84.802	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000000117	-	100	89.602	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	89.602	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000000117	-	100	98.777	ENSCSEG00000008352	-	100	98.563	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000000117	-	100	92.661	ENSCSEG00000005834	-	100	91.714	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000000117	-	100	99.388	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	98.851	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000000117	-	66	74.654	ENSCVAG00000017463	-	89	74.654	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000000117	-	51	66.418	ENSCVAG00000017430	zgc:110796	94	66.418	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000000117	-	100	89.206	ENSDARG00000010710	msi1	100	94.860	Danio_rerio
ENSACLG00000000117	-	84	92.558	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	98	92.558	Danio_rerio
ENSACLG00000000117	-	100	82.278	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	82.278	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000000117	-	100	84.132	ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000000117	-	100	81.707	ENSETEG00000004756	MSI1	100	81.707	Echinops_telfairi
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSEASG00005004736	MSI1	100	83.978	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSECAG00000017526	MSI1	100	83.978	Equus_caballus
ENSACLG00000000117	-	100	87.462	ENSELUG00000023280	-	100	87.156	Esox_lucius
ENSACLG00000000117	-	100	90.517	ENSELUG00000023219	MSI1	92	90.544	Esox_lucius
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.978	Felis_catus
ENSACLG00000000117	-	100	89.333	ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.333	Ficedula_albicollis
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ENSACLG00000000117	-	100	93.578	ENSFHEG00000003560	-	100	92.571	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000000117	-	100	99.085	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	98.281	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000000117	-	100	83.133	ENSGMOG00000017838	-	100	83.051	Gadus_morhua
ENSACLG00000000117	-	100	96.330	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.977	Gadus_morhua
ENSACLG00000000117	-	100	88.931	ENSGALG00000007227	MSI1	98	75.959	Gallus_gallus
ENSACLG00000000117	-	100	92.355	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	92.378	Gambusia_affinis
ENSACLG00000000117	-	100	75.499	ENSGAFG00000005860	-	100	75.499	Gambusia_affinis
ENSACLG00000000117	-	100	84.765	ENSGACG00000008674	-	100	84.765	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000000117	-	100	98.171	ENSGACG00000012679	MSI1	100	97.708	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000000117	-	100	88.485	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	87.464	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000000117	-	100	85.350	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	85.350	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000000117	-	100	100.000	ENSHBUG00000011841	-	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000000117	-	100	93.598	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	92.593	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000000117	-	100	85.044	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	83.702	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000000117	-	100	84.451	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000000117	-	100	98.095	ENSHCOG00000012067	-	100	92.614	Hippocampus_comes
ENSACLG00000000117	-	96	91.083	ENSHCOG00000012019	MSI1	95	91.083	Hippocampus_comes
ENSACLG00000000117	-	100	94.207	ENSIPUG00000001976	msi1	100	91.977	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000000117	-	100	85.531	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.531	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000000117	-	100	73.529	ENSJJAG00000010643	-	100	74.138	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	83.978	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000000117	-	100	87.156	ENSKMAG00000019877	-	100	87.156	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000000117	-	100	98.471	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	98.276	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000000117	-	100	93.578	ENSLBEG00000001375	-	100	92.571	Labrus_bergylta
ENSACLG00000000117	-	100	99.085	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	98.567	Labrus_bergylta
ENSACLG00000000117	-	100	83.871	ENSLACG00000018287	MSI1	100	83.965	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000000117	-	52	79.091	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	79.091	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000000117	-	96	75.529	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	75.529	Loxodonta_africana
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	85.380	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	85.337	Macaca_mulatta
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	83.978	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000000117	-	100	84.756	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	84.756	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000000117	-	100	92.966	ENSMAMG00000018426	-	100	92.000	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000000117	-	100	99.138	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	99.138	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000000117	-	100	93.598	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	92.593	Maylandia_zebra
ENSACLG00000000117	-	100	100.000	ENSMZEG00005000340	-	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000000117	-	67	94.083	ENSMGAG00000016518	-	100	94.083	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000000117	-	74	89.256	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.300	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000000117	-	100	85.337	ENSMICG00000033181	MSI1	100	83.978	Microcebus_murinus
ENSACLG00000000117	-	100	85.044	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.702	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000000117	-	100	85.759	ENSMMOG00000012265	-	99	85.759	Mola_mola
ENSACLG00000000117	-	100	86.544	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	86.585	Mola_mola
ENSACLG00000000117	-	96	57.831	ENSMODG00000003189	-	100	57.831	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000000117	-	100	92.661	ENSMALG00000001426	-	100	92.661	Monopterus_albus
ENSACLG00000000117	-	100	100.000	ENSMALG00000017889	MSI1	100	99.713	Monopterus_albus
ENSACLG00000000117	-	100	84.751	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	100	83.425	Mus_caroli
ENSACLG00000000117	-	100	87.346	ENSMUSG00000054256	Msi1	99	87.346	Mus_musculus
ENSACLG00000000117	-	100	87.842	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	100	86.286	Mus_pahari
ENSACLG00000000117	-	100	84.751	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	100	83.425	Mus_spretus
ENSACLG00000000117	-	100	85.531	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	85.531	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000000117	-	96	76.190	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	76.190	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000000117	-	100	84.802	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	Nannospalax_galili
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ENSACLG00000000117	-	94	84.836	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	84.836	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000000117	-	96	75.305	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.305	Nomascus_leucogenys
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ENSACLG00000000117	-	96	77.778	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	Ochotona_princeps
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ENSACLG00000000117	-	51	85.965	ENSPSIG00000016295	-	95	84.615	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000000117	-	100	85.933	ENSPSIG00000011608	-	93	85.976	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000000117	-	84	81.140	ENSPSIG00000009621	-	100	81.140	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000000117	-	100	74.468	ENSPMGG00000007743	-	98	68.768	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSACLG00000000117	-	81	89.848	ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.848	Procavia_capensis
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ENSACLG00000000117	-	54	85.000	ENSSPAG00000015573	zgc:110796	82	85.000	Stegastes_partitus
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ENSACLG00000000117	-	100	75.229	ENSXCOG00000017605	MSI1	89	75.305	Xiphophorus_couchianus
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ENSACLG00000000117	-	100	92.661	ENSXMAG00000018237	-	100	91.714	Xiphophorus_maculatus