EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000000487 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 25133 bases
Position: chr3:44711990-44737122
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000000658	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-72	1	10
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ENSACLP00000000658	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-72	3	10
ENSACLP00000000658	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-72	4	10
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ENSACLP00000000658	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-72	7	10
ENSACLP00000000658	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-72	8	10
ENSACLP00000000658	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-72	9	10
ENSACLP00000000658	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-72	10	10
ENSACLP00000000658	zf-met	PF12874.7	2.3e-28	1	2
ENSACLP00000000658	zf-met	PF12874.7	2.3e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000000673	-	1644	-	ENSACLP00000000658	547 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000000487	-	84	53.226	ENSACLG00000001368	-	87	53.226
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ENSACLG00000000487	-	91	65.966	ENSACLG00000022497	-	98	63.655
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ENSACLG00000000487	-	87	31.786	ENSACLG00000014349	znf341	55	31.900
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ENSACLG00000000487	-	85	44.186	ENSACLG00000020615	-	86	40.940
ENSACLG00000000487	-	87	51.256	ENSACLG00000022482	-	80	51.256
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ENSACLG00000000487	-	81	40.828	ENSACLG00000019094	-	74	40.828
ENSACLG00000000487	-	89	51.515	ENSACLG00000017449	-	68	51.515
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ENSACLG00000000487	-	88	48.583	ENSACLG00000020260	-	100	48.583
ENSACLG00000000487	-	88	49.505	ENSACLG00000017939	-	95	49.505
ENSACLG00000000487	-	84	45.732	ENSACLG00000005795	-	58	45.732
ENSACLG00000000487	-	84	44.670	ENSACLG00000017801	-	50	44.670
ENSACLG00000000487	-	91	61.892	ENSACLG00000019499	-	96	61.892
ENSACLG00000000487	-	88	43.304	ENSACLG00000003679	-	81	42.672

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000000487	-	95	56.286	ENSACIG00000017644	-	95	56.286	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000000487	-	87	52.257	ENSHBUG00000006250	-	96	52.466	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000000487	-	92	73.315	ENSMZEG00005021801	-	87	73.315	Maylandia_zebra
ENSACLG00000000487	-	85	69.419	ENSMZEG00005012727	-	69	71.218	Maylandia_zebra
ENSACLG00000000487	-	90	58.354	ENSMZEG00005020759	-	99	58.354	Maylandia_zebra
ENSACLG00000000487	-	91	57.447	ENSNBRG00000009815	-	91	57.447	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000000487	-	92	76.151	ENSNBRG00000002542	-	99	77.741	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000000487	-	87	73.313	ENSNBRG00000001608	-	100	73.313	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000000487	-	85	65.806	ENSONIG00000007886	-	99	65.806	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000000487	-	94	60.149	ENSPNYG00000023637	-	83	60.149	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000000487	-	94	77.465	ENSPNYG00000023916	-	98	77.465	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000000487	-	90	78.171	ENSPNYG00000005777	-	96	78.171	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000000487	-	88	65.909	ENSPNYG00000021571	-	87	65.909	Pundamilia_nyererei