EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Paralogs
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSACLG00000000521 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
-
Alias
-
Full Name
-
Gene Type
protein_coding
Species
Astatotilapia_calliptera
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
107067 bases
Position
chr3:44765323-44872389
Accession
-
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSACLP00000000714zf-C2H2PF00096.268.1e-2414
ENSACLP00000000714zf-C2H2PF00096.268.1e-2424
ENSACLP00000000714zf-C2H2PF00096.268.1e-2434
ENSACLP00000000714zf-C2H2PF00096.268.1e-2444
ENSACLP00000000714zf-metPF12874.74e-0911
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSACLT00000000734-549-ENSACLP00000000714182 (aa)--
Gene Model
Click here to download ENSACLG00000000521's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000000521's network
Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSACLG00000000521-9764.407ENSACLG00000002844-7855.233
ENSACLG00000000521-9937.168ENSACLG00000012712znf6465637.168
ENSACLG00000000521-9536.429ENSACLG00000006702-7536.429
ENSACLG00000000521-9344.330ENSACLG00000005708-6046.512
ENSACLG00000000521-8931.098ENSACLG00000026461-5631.098
ENSACLG00000000521-9736.905ENSACLG00000017996prdm56836.905
ENSACLG00000000521-9636.842ENSACLG00000008606-8836.842
ENSACLG00000000521-9733.136ENSACLG00000005594ZNF3198733.136
ENSACLG00000000521-9341.143ENSACLG00000015989-8841.143
ENSACLG00000000521-9035.583ENSACLG00000019094-8235.583
ENSACLG00000000521-9489.286ENSACLG00000000537-8789.286
ENSACLG00000000521-9775.676ENSACLG00000000473-8375.676
ENSACLG00000000521-9734.409ENSACLG00000000102-5234.409
ENSACLG00000000521-9338.028ENSACLG00000027053gfi1b6038.028
ENSACLG00000000521-9943.103ENSACLG00000025163-7443.103
ENSACLG00000000521-9257.803ENSACLG00000001045-9182.000
ENSACLG00000000521-9239.583ENSACLG00000027692-7239.583
ENSACLG00000000521-9369.565ENSACLG00000022383-9569.565
ENSACLG00000000521-9547.518ENSACLG00000013531-9547.518
ENSACLG00000000521-9339.881ENSACLG00000011642-7839.881
ENSACLG00000000521-9356.000ENSACLG00000003332-9756.000
ENSACLG00000000521-7045.000ENSACLG00000021022-6345.000
ENSACLG00000000521-9945.556ENSACLG00000025251-9543.353
ENSACLG00000000521-9935.260ENSACLG00000020231-8935.260
ENSACLG00000000521-9940.698ENSACLG00000021343-9539.884
ENSACLG00000000521-9667.797ENSACLG00000001507-7467.797
ENSACLG00000000521-9743.750ENSACLG00000013935-9343.750
ENSACLG00000000521-9650.909ENSACLG00000014365-8257.407
ENSACLG00000000521-9764.407ENSACLG00000017411-9064.407
ENSACLG00000000521-9342.735ENSACLG00000020615-5642.735
ENSACLG00000000521-9340.351ENSACLG00000006870-5340.351
ENSACLG00000000521-9643.269ENSACLG00000003679-7143.269
ENSACLG00000000521-9343.820ENSACLG00000027424-5637.572
ENSACLG00000000521-9343.182ENSACLG00000026703-7143.182
ENSACLG00000000521-9372.727ENSACLG00000000487-8572.727
ENSACLG00000000521-9346.809ENSACLG00000017849-7150.769
ENSACLG00000000521-9775.556ENSACLG00000022475-9675.556
ENSACLG00000000521-9756.250ENSACLG00000003229-9756.250
ENSACLG00000000521-9344.643ENSACLG00000024647-6644.643
ENSACLG00000000521-9355.294ENSACLG00000023963-9155.294
ENSACLG00000000521-7636.429ENSACLG00000011658-8236.429
ENSACLG00000000521-9340.805ENSACLG00000017487-5840.805
ENSACLG00000000521-9568.966ENSACLG00000006528-9868.966
ENSACLG00000000521-9352.632ENSACLG00000021846-8652.632
ENSACLG00000000521-9335.669ENSACLG00000022439-7635.669
ENSACLG00000000521-9947.436ENSACLG00000017576-9347.436
ENSACLG00000000521-9351.136ENSACLG00000008821-9347.191
ENSACLG00000000521-9365.714ENSACLG00000014167-6065.714
ENSACLG00000000521-9467.797ENSACLG00000007749-7867.797
ENSACLG00000000521-9346.667ENSACLG00000025196-8246.667
ENSACLG00000000521-9266.379ENSACLG00000001018-8657.895
ENSACLG00000000521-9340.120ENSACLG00000020610-6540.120
ENSACLG00000000521-9936.000ENSACLG00000026103znf5265436.000
ENSACLG00000000521-9757.949ENSACLG00000022360-9757.949
ENSACLG00000000521-9340.244ENSACLG00000020393-8840.244
ENSACLG00000000521-9946.512ENSACLG00000020474-8446.512
ENSACLG00000000521-9845.556ENSACLG00000019318-9345.556
ENSACLG00000000521-9749.383ENSACLG00000019291-9049.383
ENSACLG00000000521-9351.765ENSACLG00000015843-8951.765
ENSACLG00000000521-9337.342ENSACLG00000018700-9837.342
ENSACLG00000000521-7044.304ENSACLG00000018707-7444.304
ENSACLG00000000521-9850.000ENSACLG00000014176-8550.000
ENSACLG00000000521-9769.492ENSACLG00000001003-9069.492
ENSACLG00000000521-9337.791ENSACLG00000019167-8634.884
ENSACLG00000000521-9340.278ENSACLG00000020333-6036.257
ENSACLG00000000521-9341.304ENSACLG00000020339-5341.304
ENSACLG00000000521-9564.407ENSACLG00000019674-8964.407
ENSACLG00000000521-9741.606ENSACLG00000017941-6441.606
ENSACLG00000000521-9942.609ENSACLG00000023513-8442.609
ENSACLG00000000521-9550.867ENSACLG00000023941-8650.867
ENSACLG00000000521-9764.249ENSACLG00000017336-9264.249
ENSACLG00000000521-9776.068ENSACLG00000000411-9276.068
ENSACLG00000000521-9775.385ENSACLG00000018701-7575.385
ENSACLG00000000521-9343.023ENSACLG00000015462-6143.023
ENSACLG00000000521-7547.273ENSACLG00000011710-5147.273
ENSACLG00000000521-9647.222ENSACLG00000019270-8247.222
ENSACLG00000000521-9643.023ENSACLG00000024459-8443.023
ENSACLG00000000521-9944.853ENSACLG00000023305-7144.853
ENSACLG00000000521-9747.778ENSACLG00000017939-9641.618
ENSACLG00000000521-9135.032ENSACLG00000005694-5134.969
ENSACLG00000000521-9140.288ENSACLG00000024670-6640.288
ENSACLG00000000521-9567.797ENSACLG00000014600-9167.797
ENSACLG00000000521-9342.262ENSACLG00000017321-7442.262
ENSACLG00000000521-9393.694ENSACLG00000017329-8693.694
ENSACLG00000000521-9862.590ENSACLG00000018716-7462.590
ENSACLG00000000521-10036.686ENSACLG00000016841-6636.686
ENSACLG00000000521-9743.023ENSACLG00000020260-9943.023
ENSACLG00000000521-9339.286ENSACLG00000020268-5939.286
ENSACLG00000000521-9431.980ENSACLG00000022287-5931.980
ENSACLG00000000521-9946.043ENSACLG00000024957-8345.000
ENSACLG00000000521-9740.667ENSACLG00000017925-6840.667
ENSACLG00000000521-9942.442ENSACLG00000024491-8242.442
ENSACLG00000000521-9843.529ENSACLG00000011237-9841.420
ENSACLG00000000521-9380.180ENSACLG00000011239-7580.180
ENSACLG00000000521-9566.102ENSACLG00000017449-5966.102
ENSACLG00000000521-9856.000ENSACLG00000023979-9656.000
ENSACLG00000000521-9439.496ENSACLG00000022505-8439.496
ENSACLG00000000521-9261.654ENSACLG00000003546-5876.250
ENSACLG00000000521-9361.864ENSACLG00000019482-7361.864
ENSACLG00000000521-9846.465ENSACLG00000004663-7346.465
ENSACLG00000000521-9761.176ENSACLG00000019349-7361.176
ENSACLG00000000521-9745.361ENSACLG00000020975-8545.361
ENSACLG00000000521-9567.797ENSACLG00000013454-6467.797
ENSACLG00000000521-9546.067ENSACLG00000022482-8249.162
ENSACLG00000000521-9948.529ENSACLG00000019424-9748.529
ENSACLG00000000521-9945.536ENSACLG00000024294-7845.536
ENSACLG00000000521-9362.577ENSACLG00000028002-8962.577
ENSACLG00000000521-9341.379ENSACLG00000021056-5441.379
ENSACLG00000000521-9241.250ENSACLG00000008624-7241.250
ENSACLG00000000521-9549.254ENSACLG00000001368-8749.254
ENSACLG00000000521-9444.086ENSACLG00000005615-5144.086
ENSACLG00000000521-9335.632ENSACLG00000022305-8835.632
ENSACLG00000000521-9781.481ENSACLG00000022302-9681.481
ENSACLG00000000521-9342.056ENSACLG00000026538-8141.279
ENSACLG00000000521-9340.541ENSACLG00000005795-5740.541
ENSACLG00000000521-9773.874ENSACLG00000019499-9373.874
ENSACLG00000000521-9735.938ENSACLG00000021184-5035.938
ENSACLG00000000521-9466.102ENSACLG00000014336-9266.102
ENSACLG00000000521-9363.462ENSACLG00000007888-7663.462
ENSACLG00000000521-7543.820ENSACLG00000001258-9443.820
ENSACLG00000000521-9774.775ENSACLG00000022497-9374.775
ENSACLG00000000521-9283.146ENSACLG00000022499-8383.146
ENSACLG00000000521-9733.929ENSACLG00000020579znf319b8933.929
ENSACLG00000000521-9340.278ENSACLG00000006718-6036.257
ENSACLG00000000521-9436.875ENSACLG00000006697-6636.875
ENSACLG00000000521-9743.011ENSACLG00000018746-8939.773
ENSACLG00000000521-9946.591ENSACLG00000024308-9647.368
ENSACLG00000000521-9841.346ENSACLG00000021045-7941.346
ENSACLG00000000521-9338.983ENSACLG00000017801-5538.983
ENSACLG00000000521-9560.305ENSACLG00000015816-9666.364
ENSACLG00000000521-9561.017ENSACLG00000013033-8161.017
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSACLG00000000521-9743.750ENSACIG00000000360si:ch211-241b2.18843.750Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000000521-9937.805ENSACIG00000007882-7937.805Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000000521-9150.562ENSACIG00000008886znf11647750.562Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000000521-9840.625ENSATEG00000008683si:ch211-241b2.17040.625Anabas_testudineus
ENSACLG00000000521-9347.191ENSAMXG00000041650-8547.191Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000000521-9341.584ENSAMXG00000029660-5041.584Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000000521-9646.552ENSAMXG00000043291-6846.552Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000000521-9134.146ENSCSEG00000015585-7734.146Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000000521-9341.860ENSDARG00000116765zgc:1629628241.860Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9343.860ENSDARG00000094736znf11578443.860Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9947.872ENSDARG00000111614znf11838147.872Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9344.444ENSDARG00000103827znf11449956.338Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9743.023ENSDARG00000099731CABZ01066719.19543.023Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9744.643ENSDARG00000092605znf10037044.643Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9840.288ENSDARG00000103530zgc:1131029440.288Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9749.383ENSDARG00000071833znf11628449.383Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9346.512ENSDARG00000111899zgc:1714356046.512Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9744.186ENSDARG00000105056znf45l9944.186Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9943.478ENSDARG00000088507znf9828144.531Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9847.475ENSDARG00000109703FO834825.18145.029Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9842.604ENSDARG00000099890CU207221.29542.604Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9744.186ENSDARG00000115326znf10026944.186Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9346.809ENSDARG00000078814si:dkey-34m19.38542.262Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9745.205ENSDARG00000100882znf11547545.205Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9743.182ENSDARG00000101694znf11848243.182Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9344.915ENSDARG00000073821znf11777644.915Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9344.767ENSDARG00000053165zgc:1133778044.767Danio_rerio
ENSACLG00000000521-9141.830ENSEBUG00000015073-7841.379Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000000521-9341.667ENSFHEG00000018009-5141.667Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000000521-9644.286ENSFHEG00000018209-6244.286Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000000521-9436.047ENSFHEG00000013152-6136.047Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000000521-9347.436ENSHBUG00000009953-5347.436Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000000521-9347.126ENSHBUG00000018916-5947.126Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000000521-8637.113ENSKMAG00000014629-5637.113Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000000521-9342.857ENSKMAG00000009563-6642.857Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000000521-9335.374ENSMAMG00000014743-5035.374Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000000521-9341.420ENSMZEG00005027793-7541.420Maylandia_zebra
ENSACLG00000000521-9575.610ENSMZEG00005022161-7975.610Maylandia_zebra
ENSACLG00000000521-9769.492ENSMZEG00005025568-8269.492Maylandia_zebra
ENSACLG00000000521-9942.169ENSMZEG00005027943-9540.816Maylandia_zebra
ENSACLG00000000521-9345.977ENSMZEG00005007426-6245.977Maylandia_zebra
ENSACLG00000000521-9674.775ENSMZEG00005021426-8174.775Maylandia_zebra
ENSACLG00000000521-10063.415ENSMZEG00005005162-6763.415Maylandia_zebra
ENSACLG00000000521-9543.678ENSMZEG00005026470-5443.678Maylandia_zebra
ENSACLG00000000521-9741.279ENSMZEG00005025729-8741.279Maylandia_zebra
ENSACLG00000000521-9439.024ENSMALG00000008638-5439.024Monopterus_albus
ENSACLG00000000521-9341.143ENSMALG00000018074-5741.143Monopterus_albus
ENSACLG00000000521-9342.045ENSNBRG00000000577-7244.643Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000000521-9268.235ENSONIG00000006585-9968.235Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000000521-9364.615ENSONIG00000013908-9064.615Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000000521-9492.857ENSONIG00000003363-10092.857Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000000521-8243.617ENSORLG00020019341-6350.000Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000000521-9336.667ENSPMGG00000001558znf11745336.667Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000000521-9744.318ENSPFOG00000001144-10048.101Poecilia_formosa
ENSACLG00000000521-9336.111ENSPFOG00000011766-9836.111Poecilia_formosa
ENSACLG00000000521-9737.356ENSPLAG00000016561zgc:1133489334.677Poecilia_latipinna
ENSACLG00000000521-9343.931ENSPMEG00000007573zgc:1133436343.931Poecilia_mexicana
ENSACLG00000000521-9341.221ENSPREG00000014105-7941.221Poecilia_reticulata
ENSACLG00000000521-9344.509ENSPREG00000001514zgc:1133436444.509Poecilia_reticulata
ENSACLG00000000521-9538.462ENSPREG00000005538-7538.462Poecilia_reticulata
ENSACLG00000000521-9569.492ENSPNYG00000024183zgc:1735779769.492Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000000521-7542.391ENSSDUG00000008682-7242.391Seriola_dumerili
ENSACLG00000000521-9538.857ENSSPAG00000013109si:ch211-241b2.16838.857Stegastes_partitus
ENSACLG00000000521-9338.462ENSSPAG00000006539-9338.462Stegastes_partitus
ENSACLG00000000521-9742.353ENSTNIG00000000277-9342.353Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000000521-9743.353ENSXCOG00000017871zgc:1133436643.353Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000000521-9743.353ENSXMAG00000019923zgc:1133436443.353Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us