EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000000734 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2622 bases
Position: chr11:26445433-26448054
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000001005	RVT_1	PF00078.27	5.8e-42	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000001033	-	2622	-	ENSACLP00000001005	873 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000000734	-	60	44.444	ENSACLG00000009903	-	94	44.444
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ENSACLG00000000734	-	75	45.877	ENSACLG00000005212	-	99	45.877
ENSACLG00000000734	-	73	45.455	ENSACLG00000014915	-	99	45.455
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ENSACLG00000000734	-	50	49.773	ENSACLG00000020601	-	99	49.773
ENSACLG00000000734	-	67	45.840	ENSACLG00000015659	-	99	45.840
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ENSACLG00000000734	-	99	43.523	ENSACLG00000005662	-	96	43.523
ENSACLG00000000734	-	53	43.487	ENSACLG00000012094	-	98	43.487

Orthologs

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ENSACLG00000000734	-	57	37.000	ENSATEG00000014055	-	84	34.773	Anabas_testudineus
ENSACLG00000000734	-	58	53.242	ENSATEG00000014607	-	98	53.242	Anabas_testudineus
ENSACLG00000000734	-	70	50.000	ENSATEG00000002739	-	99	50.000	Anabas_testudineus
ENSACLG00000000734	-	70	49.837	ENSATEG00000015490	-	99	49.837	Anabas_testudineus
ENSACLG00000000734	-	96	48.174	ENSATEG00000010674	-	99	48.174	Anabas_testudineus
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ENSACLG00000000734	-	96	48.174	ENSATEG00000019512	-	99	48.174	Anabas_testudineus
ENSACLG00000000734	-	93	36.811	ENSATEG00000005707	-	99	36.811	Anabas_testudineus
ENSACLG00000000734	-	99	37.050	ENSATEG00000012907	-	89	37.050	Anabas_testudineus
ENSACLG00000000734	-	92	44.580	ENSAMXG00000039914	-	99	44.634	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000000734	-	54	50.000	ENSAMXG00000043740	-	96	49.894	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000000734	-	85	36.497	ENSAMXG00000036646	-	85	36.706	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000000734	-	65	34.188	ENSAMXG00000041363	-	98	34.701	Astyanax_mexicanus
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