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Description

Ensembl ID: ENSACLG00000000890 (Gene tree)
Gene ID: 113032486
Gene Symbol: ago1
Alias: Ago1|eif2c1|si:ch211-119n15.3
Full Name: protein argonaute-1
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 20308 bases
Position: chr11:26892477-26912784
Accession: 113032486
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000001346	PAZ	PF02170.22	8.9e-29	1	1
ENSACLP00000001246	PAZ	PF02170.22	9.1e-29	1	1
ENSACLP00000001305	PAZ	PF02170.22	9.4e-29	1	1
ENSACLP00000001346	Piwi	PF02171.17	1.4e-110	1	1
ENSACLP00000001246	Piwi	PF02171.17	2e-110	1	1
ENSACLP00000001305	Piwi	PF02171.17	2e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000001276	-	3176	-	ENSACLP00000001246	858 (aa)	XP_026041213	UPI00032976F3
ENSACLT00000001335	-	3212	-	ENSACLP00000001305	870 (aa)	-	-
ENSACLT00000001378	-	2280	-	ENSACLP00000001346	759 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000000890	ago1	100	83.045	ENSACLG00000000963	ago3a	100	83.145
ENSACLG00000000890	ago1	87	82.216	ENSACLG00000024684	ago2	98	85.714
ENSACLG00000000890	ago1	100	82.202	ENSACLG00000005181	ago4	100	84.527
ENSACLG00000000890	ago1	100	81.693	ENSACLG00000001965	-	100	81.693

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSG00000092847	AGO1	100	97.059	Homo_sapiens
ENSACLG00000000890	ago1	100	99.767	ENSAPOG00000024299	ago1	100	99.767	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	95.921	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000000890	ago1	89	87.607	ENSACIG00000005298	ago1	98	93.305	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000000890	ago1	100	99.767	ENSAOCG00000017727	ago1	100	99.767	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000000890	ago1	100	99.767	ENSAPEG00000004458	ago1	100	99.767	Amphiprion_percula
ENSACLG00000000890	ago1	100	99.767	ENSATEG00000008523	ago1	100	99.767	Anabas_testudineus
ENSACLG00000000890	ago1	99	89.327	ENSAPLG00000010440	AGO1	99	89.327	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000000890	ago1	100	92.092	ENSACAG00000029174	AGO1	100	96.931	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000000890	ago1	99	95.794	ENSANAG00000037711	AGO1	100	95.921	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000000890	ago1	87	94.169	ENSAMXG00000001917	ago1	98	99.708	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.450	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	95.921	Bos_taurus
ENSACLG00000000890	ago1	99	96.340	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	95.921	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	95.921	Canis_familiaris
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.429	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000000890	ago1	99	95.986	ENSCHIG00000011848	-	100	95.133	Capra_hircus
ENSACLG00000000890	ago1	100	75.524	ENSTSYG00000032426	-	99	78.000	Carlito_syrichta
ENSACLG00000000890	ago1	99	96.340	ENSTSYG00000009767	-	100	95.921	Carlito_syrichta
ENSACLG00000000890	ago1	89	92.324	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.649	Cavia_aperea
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	95.921	Cavia_porcellus
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	95.921	Cebus_capucinus
ENSACLG00000000890	ago1	100	95.571	ENSCATG00000031521	AGO1	100	97.059	Cercocebus_atys
ENSACLG00000000890	ago1	99	96.340	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	95.921	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	95.921	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000000890	ago1	85	91.473	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000000890	ago1	100	95.804	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	95.804	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSCANG00000039798	AGO1	100	95.921	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000000890	ago1	99	96.000	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	95.921	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000000890	ago1	99	96.340	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	96.340	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000000890	ago1	99	97.683	ENSCSEG00000001051	ago1	100	97.683	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000000890	ago1	100	99.417	ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.417	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000000890	ago1	100	98.718	ENSDARG00000092644	ago1	100	98.718	Danio_rerio
ENSACLG00000000890	ago1	100	92.219	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	97.059	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000000890	ago1	91	97.087	ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000000890	ago1	74	99.608	ENSETEG00000007626	AGO1	100	88.920	Echinops_telfairi
ENSACLG00000000890	ago1	99	96.340	ENSEASG00005012086	AGO1	100	95.921	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSECAG00000024353	AGO1	100	95.921	Equus_caballus
ENSACLG00000000890	ago1	93	98.853	ENSEEUG00000005349	AGO1	82	98.853	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000000890	ago1	100	94.388	ENSELUG00000016803	ago1	100	99.616	Esox_lucius
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	95.921	Felis_catus
ENSACLG00000000890	ago1	100	87.929	ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.689	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000000890	ago1	100	95.921	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	95.921	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000000890	ago1	99	95.519	ENSFHEG00000017927	ago1	100	95.519	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000000890	ago1	88	99.130	ENSGMOG00000019413	ago1	89	99.130	Gadus_morhua
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.560	ENSGALG00000002249	AGO1	100	95.804	Gallus_gallus
ENSACLG00000000890	ago1	100	99.534	ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.534	Gambusia_affinis
ENSACLG00000000890	ago1	95	94.133	ENSGACG00000012443	ago1	100	99.201	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000000890	ago1	100	92.092	ENSGAGG00000012893	-	100	96.931	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000000890	ago1	100	95.455	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	95.921	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000000890	ago1	100	100.000	ENSHBUG00000010459	ago1	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000000890	ago1	99	96.340	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	95.921	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000000890	ago1	99	96.340	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	95.921	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000000890	ago1	99	99.764	ENSHCOG00000005708	ago1	100	99.764	Hippocampus_comes
ENSACLG00000000890	ago1	100	99.184	ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.184	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	95.921	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000000890	ago1	100	95.921	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	95.921	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000000890	ago1	100	99.650	ENSKMAG00000019464	ago1	100	99.650	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000000890	ago1	100	99.650	ENSLBEG00000007694	ago1	100	99.650	Labrus_bergylta
ENSACLG00000000890	ago1	99	90.588	ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.588	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000000890	ago1	100	94.522	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.522	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000000890	ago1	99	96.000	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.000	Loxodonta_africana
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	95.921	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000000890	ago1	99	91.736	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	91.934	Macaca_mulatta
ENSACLG00000000890	ago1	100	92.219	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	97.059	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	95.921	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000000890	ago1	100	99.767	ENSMAMG00000008381	ago1	100	99.767	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000000890	ago1	100	100.000	ENSMZEG00005007996	ago1	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000000890	ago1	99	90.371	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.371	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	95.921	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000000890	ago1	99	95.794	ENSMICG00000016147	AGO1	100	95.921	Microcebus_murinus
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.560	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	95.804	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000000890	ago1	85	93.731	ENSMMOG00000018459	ago1	93	99.552	Mola_mola
ENSACLG00000000890	ago1	100	95.688	ENSMODG00000023335	AGO1	100	95.688	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000000890	ago1	99	99.646	ENSMALG00000011057	ago1	100	99.646	Monopterus_albus
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	97.830	Mus_caroli
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	97.830	Mus_musculus
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	97.830	Mus_pahari
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	97.830	Mus_spretus
ENSACLG00000000890	ago1	91	92.618	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	97.632	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000000890	ago1	61	94.264	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	94.264	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000000890	ago1	100	95.804	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	95.804	Nannospalax_galili
ENSACLG00000000890	ago1	100	94.643	ENSNBRG00000010867	ago1	100	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000000890	ago1	100	95.921	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	95.921	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000000890	ago1	91	91.429	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	91.429	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000000890	ago1	93	98.480	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	Ochotona_princeps
ENSACLG00000000890	ago1	100	94.688	ENSODEG00000005321	AGO1	100	95.921	Octodon_degus
ENSACLG00000000890	ago1	99	100.000	ENSONIG00000016345	ago1	100	100.000	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000000890	ago1	100	88.037	ENSOANG00000002080	AGO1	100	88.037	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.560	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	95.804	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000000890	ago1	100	99.650	ENSORLG00000014965	ago1	100	99.650	Oryzias_latipes
ENSACLG00000000890	ago1	100	99.650	ENSORLG00020018253	ago1	100	99.650	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000000890	ago1	100	99.650	ENSORLG00015003287	ago1	100	99.650	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000000890	ago1	100	99.650	ENSOMEG00000020528	ago1	100	99.650	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000000890	ago1	99	95.785	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	95.785	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.450	ENSOARG00000019591	AGO1	100	95.921	Ovis_aries
ENSACLG00000000890	ago1	100	95.455	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	95.921	Pan_paniscus
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	95.921	Panthera_pardus
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.441	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	95.688	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000000890	ago1	100	95.455	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	95.921	Pan_troglodytes
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSPANG00000009060	AGO1	100	95.921	Papio_anubis
ENSACLG00000000890	ago1	98	95.724	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.724	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000000890	ago1	87	93.003	ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.401	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	95.921	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000000890	ago1	100	95.688	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.688	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000000890	ago1	100	99.534	ENSPFOG00000005867	ago1	100	99.534	Poecilia_formosa
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