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Ensembl ID: ENSACLG00000001002 (Gene tree)
Gene ID: 113018641
Gene Symbol: ppargc1a
Alias: PGC1|gb:dq017637|ppargc1al
Full Name: PPARG coactivator 1 alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 41584 bases
Position: chr3:12604981-12646564
Accession: 113018641
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000001582	RRM_1	PF00076.22	3.5e-07	1	1
ENSACLP00000001525	RRM_1	PF00076.22	4.9e-07	1	1
ENSACLP00000001514	RRM_1	PF00076.22	7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000001548	-	5717	-	ENSACLP00000001514	1275 (aa)	XP_026017623	UPI000E40D2E3
ENSACLT00000001616	-	2298	-	ENSACLP00000001582	765 (aa)	-	-
ENSACLT00000001559	-	4889	-	ENSACLP00000001525	999 (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSG00000109819	PPARGC1A	96	69.024	Homo_sapiens
ENSACLG00000001002	ppargc1a	98	97.976	ENSAPOG00000018632	ppargc1a	98	97.391	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	78	82.317	ENSAMEG00000010421	PPARGC1A	86	82.759	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000001002	ppargc1a	100	85.335	ENSACIG00000009732	ppargc1a	98	96.983	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	98	97.976	ENSAOCG00000006754	ppargc1a	98	97.391	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001002	ppargc1a	100	85.575	ENSAPEG00000022574	ppargc1a	98	97.391	Amphiprion_percula
ENSACLG00000001002	ppargc1a	97	96.761	ENSATEG00000016702	ppargc1a	98	96.310	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	76	83.030	ENSAPLG00000005303	PPARGC1A	85	83.333	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000001002	ppargc1a	100	53.682	ENSACAG00000000741	PPARGC1A	68	81.034	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	71.239	ENSANAG00000035930	PPARGC1A	70	78.010	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000001002	ppargc1a	91	89.349	ENSAMXG00000002461	ppargc1a	89	89.349	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.796	ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	70	78.534	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	78	82.927	ENSCAFG00000016519	PPARGC1A	87	83.333	Canis_familiaris
ENSACLG00000001002	ppargc1a	77	82.927	ENSCAFG00020027242	PPARGC1A	88	83.333	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	71.239	ENSCHIG00000015991	PPARGC1A	52	77.368	Capra_hircus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	71.556	ENSTSYG00000010439	PPARGC1A	89	78.010	Carlito_syrichta
ENSACLG00000001002	ppargc1a	73	81.707	ENSCAPG00000005150	PPARGC1A	82	77.487	Cavia_aperea
ENSACLG00000001002	ppargc1a	76	81.707	ENSCPOG00000001518	PPARGC1A	89	77.487	Cavia_porcellus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	68	56.489	ENSCCAG00000026909	PPARGC1B	50	56.489	Cebus_capucinus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSCCAG00000024681	PPARGC1A	84	83.234	Cebus_capucinus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.796	ENSCATG00000032575	PPARGC1A	89	78.534	Cercocebus_atys
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	72.124	ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	70	76.963	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSCSAG00000016575	PPARGC1A	89	78.534	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	73	52.985	ENSCPBG00000007891	PPARGC1B	53	52.985	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSCANG00000033426	PPARGC1A	70	78.534	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSCGRG00001015534	Ppargc1a	86	76.440	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSCGRG00000000200	Ppargc1a	86	76.440	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000001002	ppargc1a	99	90.331	ENSCSEG00000006884	ppargc1a	99	89.503	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000001002	ppargc1a	87	75.424	ENSCVAG00000016547	ppargc1a	95	77.656	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	91	89.941	ENSDARG00000067829	ppargc1a	88	89.941	Danio_rerio
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	71.681	ENSDNOG00000041106	PPARGC1A	86	82.759	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	78	80.488	ENSDORG00000016276	Ppargc1a	86	81.034	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000001002	ppargc1a	78	82.317	ENSEASG00005007984	PPARGC1A	87	82.759	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	78	82.317	ENSECAG00000009164	PPARGC1A	86	82.759	Equus_caballus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.796	ENSEEUG00000009219	PPARGC1A	90	74.872	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	99	71.733	ENSELUG00000017027	ppargc1a	100	61.213	Esox_lucius
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.742	ENSFCAG00000000043	PPARGC1A	68	82.659	Felis_catus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	84	74.757	ENSFALG00000009211	PPARGC1A	63	74.757	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000001002	ppargc1a	78	79.878	ENSFDAG00000005659	PPARGC1A	68	80.460	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000001002	ppargc1a	99	95.436	ENSFHEG00000021990	ppargc1a	97	92.704	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	60	74.641	ENSGALG00000042851	PPARGC1A	67	53.403	Gallus_gallus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	99	94.606	ENSGAFG00000015514	ppargc1a	98	93.043	Gambusia_affinis
ENSACLG00000001002	ppargc1a	73	52.555	ENSGAGG00000012870	PPARGC1B	51	52.555	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000001002	ppargc1a	83	74.877	ENSGAGG00000007043	PPARGC1A	69	82.184	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSGGOG00000009810	PPARGC1A	70	78.534	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000001002	ppargc1a	100	99.190	ENSHBUG00000005269	ppargc1a	99	99.448	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	71.111	ENSHGLG00000007022	PPARGC1A	88	80.460	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000001002	ppargc1a	56	50.538	ENSHGLG00000005967	PPARGC1B	51	50.360	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSHGLG00100000133	PPARGC1A	87	80.460	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000001002	ppargc1a	96	93.117	ENSHCOG00000014886	ppargc1a	98	88.148	Hippocampus_comes
ENSACLG00000001002	ppargc1a	92	94.737	ENSIPUG00000020313	ppargc1a	60	94.737	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	71.239	ENSSTOG00000012522	PPARGC1A	89	76.963	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	100	82.097	ENSKMAG00000005390	ppargc1a	92	94.805	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	98	96.680	ENSLBEG00000019562	ppargc1a	98	90.164	Labrus_bergylta
ENSACLG00000001002	ppargc1a	76	87.791	ENSLACG00000014054	PPARGC1A	69	81.538	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000001002	ppargc1a	70	45.113	ENSLOCG00000012195	ppargc1b	56	45.113	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	69.869	ENSLAFG00000012981	PPARGC1A	88	74.747	Loxodonta_africana
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSMFAG00000000534	PPARGC1A	89	78.534	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000001002	ppargc1a	78	82.500	ENSMMUG00000001844	PPARGC1A	89	78.534	Macaca_mulatta
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.796	ENSMNEG00000028682	PPARGC1A	89	78.534	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSMLEG00000034233	PPARGC1A	89	78.534	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	97	97.967	ENSMAMG00000005531	ppargc1a	97	96.310	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	99	99.841	ENSMZEG00005001739	ppargc1a	99	99.685	Maylandia_zebra
ENSACLG00000001002	ppargc1a	59	74.396	ENSMGAG00000012485	PPARGC1A	65	74.396	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSMAUG00000011811	Ppargc1a	86	76.963	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.796	ENSMICG00000015390	PPARGC1A	89	78.010	Microcebus_murinus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	69.869	ENSMOCG00000008765	Ppargc1a	86	76.963	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000001002	ppargc1a	99	95.565	ENSMMOG00000011847	ppargc1a	98	95.572	Mola_mola
ENSACLG00000001002	ppargc1a	99	95.547	ENSMALG00000004625	ppargc1a	92	95.203	Monopterus_albus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	68.559	MGP_CAROLIEiJ_G0027213	Ppargc1a	86	74.869	Mus_caroli
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	69.432	ENSMUSG00000029167	Ppargc1a	86	74.869	Mus_musculus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	69.432	MGP_PahariEiJ_G0016995	Ppargc1a	86	75.393	Mus_pahari
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	69.432	MGP_SPRETEiJ_G0028208	Ppargc1a	86	74.346	Mus_spretus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	50	70.742	ENSMPUG00000016736	PPARGC1A	65	70.742	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSMLUG00000016307	PPARGC1A	87	82.759	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	69.432	ENSNGAG00000015090	Ppargc1a	87	81.034	Nannospalax_galili
ENSACLG00000001002	ppargc1a	100	99.216	ENSNBRG00000023403	ppargc1a	100	99.216	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSNLEG00000016760	PPARGC1A	66	78.534	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	68.996	ENSOPRG00000012899	PPARGC1A	88	75.916	Ochotona_princeps
ENSACLG00000001002	ppargc1a	100	81.455	ENSONIG00000007635	ppargc1a	98	88.053	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	73.362	ENSOANG00000006680	PPARGC1A	87	83.908	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	68.996	ENSOCUG00000014668	PPARGC1A	89	76.440	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	68	51.908	ENSOCUG00000013833	PPARGC1B	51	51.908	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	98	95.547	ENSORLG00000004788	ppargc1a	98	93.991	Oryzias_latipes
ENSACLG00000001002	ppargc1a	99	95.547	ENSORLG00020014690	ppargc1a	95	95.708	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000001002	ppargc1a	98	95.142	ENSORLG00015012206	ppargc1a	95	95.082	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000001002	ppargc1a	100	83.995	ENSOMEG00000000670	ppargc1a	98	94.909	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	69.432	ENSOGAG00000014559	PPARGC1A	89	76.963	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	69.869	ENSPPAG00000034694	PPARGC1A	71	78.534	Pan_paniscus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.742	ENSPPRG00000001711	PPARGC1A	87	82.659	Panthera_pardus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.742	ENSPTIG00000007378	PPARGC1A	87	82.659	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSPTRG00000015954	PPARGC1A	71	78.534	Pan_troglodytes
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSPANG00000005420	PPARGC1A	89	78.534	Papio_anubis
ENSACLG00000001002	ppargc1a	93	75.532	ENSPKIG00000002531	ppargc1a	79	75.532	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000001002	ppargc1a	79	82.759	ENSPSIG00000011790	PPARGC1A	69	82.759	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001002	ppargc1a	75	49.045	ENSPSIG00000008358	PPARGC1B	54	48.101	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	86.975	ENSPMGG00000019204	ppargc1a	91	86.975	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSPEMG00000010892	Ppargc1a	86	76.042	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000001002	ppargc1a	84	75.362	ENSPCIG00000015835	PPARGC1A	63	75.362	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000001002	ppargc1a	96	95.833	ENSPFOG00000001263	ppargc1a	95	94.815	Poecilia_formosa
ENSACLG00000001002	ppargc1a	100	78.003	ENSPLAG00000002827	ppargc1a	93	94.760	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000001002	ppargc1a	99	95.417	ENSPMEG00000000720	ppargc1a	95	94.465	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000001002	ppargc1a	98	95.851	ENSPREG00000019171	ppargc1a	98	94.348	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSPPYG00000014640	PPARGC1A	70	78.534	Pongo_abelii
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.306	ENSPCAG00000016308	PPARGC1A	71	78.736	Procavia_capensis
ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	69.869	ENSPCOG00000022858	PPARGC1A	89	78.010	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000001002	ppargc1a	78	81.707	ENSPVAG00000004965	PPARGC1A	87	82.184	Pteropus_vampyrus
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ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.796	ENSSBOG00000006423	PPARGC1A	70	78.010	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSACLG00000001002	ppargc1a	98	95.142	ENSSMAG00000011571	ppargc1a	94	96.714	Scophthalmus_maximus
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