EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000001003 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 122772 bases
Position: chr18:32049452-32172223
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACLP00000001442	zf-met	PF12874.7	4.1e-05	1	3
ENSACLP00000001442	zf-met	PF12874.7	4.1e-05	2	3
ENSACLP00000001442	zf-met	PF12874.7	4.1e-05	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000001476	-	1977	-	ENSACLP00000001442	658 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000001003	-	94	45.302	ENSACLG00000017576	-	89	45.302
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ENSACLG00000001003	-	89	41.250	ENSACLG00000026703	-	75	41.250
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ENSACLG00000001003	-	89	43.333	ENSSLDG00000010190	-	95	43.333	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000001003	-	89	39.663	ENSSLDG00000006288	-	97	39.663	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000001003	-	93	48.052	ENSSPAG00000008865	-	89	44.025	Stegastes_partitus
ENSACLG00000001003	-	91	40.541	ENSSSCG00000038009	-	87	40.541	Sus_scrofa
ENSACLG00000001003	-	88	36.957	ENSTNIG00000003979	-	99	36.324	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000001003	-	79	47.436	ENSTNIG00000003479	-	98	47.436	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000001003	-	88	40.135	ENSUMAG00000004051	-	95	39.415	Ursus_maritimus
ENSACLG00000001003	-	94	39.527	ENSVVUG00000002015	-	98	39.492	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000001003	-	90	45.098	ENSXETG00000034213	-	99	45.098	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000001003	-	92	39.568	ENSXETG00000010512	-	99	32.131	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000001003	-	90	39.918	ENSXETG00000030307	-	100	39.918	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000001003	-	89	39.599	ENSXMAG00000000617	-	72	39.599	Xiphophorus_maculatus