EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000001035 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1545 bases
Position: chr3:45535836-45537380
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000001456	RVT_1	PF00078.27	4.3e-40	1	1

Transcripts

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ENSACLT00000001489	-	1545	-	ENSACLP00000001456	391 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSACLG00000001035	-	83	33.923	ENSACLG00000000505	-	76	36.232
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ENSACLG00000001035	-	97	53.003	ENSACLG00000019194	-	50	53.003
ENSACLG00000001035	-	98	46.835	ENSACLG00000008859	-	58	46.819
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ENSACLG00000001035	-	97	43.669	ENSACLG00000014911	-	59	43.669
ENSACLG00000001035	-	99	44.020	ENSACLG00000014915	-	60	44.020
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Orthologs

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ENSACLG00000001035	-	99	48.974	ENSATEG00000015490	-	63	48.974	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001035	-	98	40.568	ENSATEG00000023197	-	60	40.885	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001035	-	84	42.553	ENSATEG00000004798	-	58	42.216	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001035	-	84	50.000	ENSATEG00000008662	-	100	50.000	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001035	-	71	55.596	ENSATEG00000015931	-	55	55.596	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001035	-	70	46.909	ENSATEG00000002253	-	82	46.909	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001035	-	70	55.273	ENSATEG00000014313	-	80	55.273	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001035	-	73	54.930	ENSATEG00000014607	-	55	54.930	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001035	-	99	48.718	ENSATEG00000002739	-	63	48.718	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001035	-	98	39.806	ENSAMXG00000037974	-	77	40.049	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001035	-	92	45.628	ENSAMXG00000041791	-	59	44.081	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001035	-	91	43.014	ENSAMXG00000032548	-	74	43.526	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001035	-	92	42.091	ENSAMXG00000040733	-	82	42.359	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001035	-	91	41.848	ENSAMXG00000035634	-	76	41.848	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001035	-	74	50.347	ENSAMXG00000038571	-	67	50.347	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001035	-	100	42.211	ENSAMXG00000040860	-	70	42.211	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001035	-	82	41.329	ENSAMXG00000041299	-	82	41.040	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001035	-	64	35.798	ENSAMXG00000033695	-	55	35.798	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001035	-	62	46.694	ENSAMXG00000029786	-	62	46.694	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001035	-	77	45.079	ENSAMXG00000031724	-	73	45.079	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001035	-	91	42.466	ENSAMXG00000034041	-	84	42.975	Astyanax_mexicanus
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