EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000001096 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2934 bases
Position: chr23:15991069-15994002
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000001553	RVT_1	PF00078.27	5.2e-36	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000001587	-	2934	-	ENSACLP00000001553	977 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000001096	-	50	60.241	ENSACLG00000027079	-	99	60.241
ENSACLG00000001096	-	62	97.876	ENSACLG00000008103	-	100	97.876
ENSACLG00000001096	-	88	56.428	ENSACLG00000016323	-	99	56.428
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ENSACLG00000001096	-	61	54.896	ENSACLG00000007604	-	98	54.896
ENSACLG00000001096	-	53	98.252	ENSACLG00000001010	-	100	98.252
ENSACLG00000001096	-	89	56.507	ENSACLG00000017636	-	96	56.507
ENSACLG00000001096	-	66	54.925	ENSACLG00000017812	-	99	54.925
ENSACLG00000001096	-	79	55.063	ENSACLG00000009381	-	98	55.063
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ENSACLG00000001096	-	99	48.163	ENSACLG00000011355	-	89	50.339
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ENSACLG00000001096	-	99	48.061	ENSACLG00000014031	-	90	50.226
ENSACLG00000001096	-	82	55.448	ENSACLG00000009552	-	99	55.448
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ENSACLG00000001096	-	54	55.744	ENSACLG00000010340	-	99	55.744
ENSACLG00000001096	-	63	51.351	ENSACLG00000013012	-	98	51.675
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Orthologs

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ENSACLG00000001096	-	53	59.961	ENSATEG00000010371	-	99	59.961	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001096	-	96	51.706	ENSATEG00000010928	-	99	51.696	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001096	-	56	55.898	ENSATEG00000011431	-	98	55.898	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001096	-	80	53.585	ENSATEG00000001703	-	99	53.585	Anabas_testudineus
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