EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000001204 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2493 bases
Position: chr7:62594553-62597045
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000001709	RVT_1	PF00078.27	1.8e-33	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000001747	-	2493	-	ENSACLP00000001709	830 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000001204	-	85	40.108	ENSACLG00000025005	-	83	40.108
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ENSACLG00000001204	-	81	49.477	ENSACLG00000014396	-	81	49.477
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ENSACLG00000001204	-	58	51.148	ENSACLG00000008650	-	76	51.148
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ENSACLG00000001204	-	63	48.588	ENSACLG00000026062	-	76	48.588
ENSACLG00000001204	-	73	48.339	ENSACLG00000026562	-	81	48.339
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ENSACLG00000001204	-	82	74.711	ENSACLG00000007871	-	83	74.711
ENSACLG00000001204	-	87	51.227	ENSACLG00000002513	-	77	51.227
ENSACLG00000001204	-	66	54.364	ENSACLG00000021352	-	79	54.364
ENSACLG00000001204	-	59	55.828	ENSACLG00000016439	-	78	55.828
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ENSACLG00000001204	-	82	75.145	ENSACLG00000002641	-	83	75.145
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ENSACLG00000001204	-	52	52.414	ENSACLG00000022810	-	65	52.414
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ENSACLG00000001204	-	87	75.650	ENSACLG00000017643	-	84	75.650
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ENSACLG00000001204	-	87	56.250	ENSACLG00000005338	-	84	56.250
ENSACLG00000001204	-	82	74.711	ENSACLG00000000479	-	83	74.711
ENSACLG00000001204	-	66	47.292	ENSACLG00000002858	-	79	47.292
ENSACLG00000001204	-	82	71.965	ENSACLG00000004681	-	82	71.965
ENSACLG00000001204	-	58	51.566	ENSACLG00000006947	-	77	51.566
ENSACLG00000001204	-	91	56.201	ENSACLG00000001096	-	82	54.390
ENSACLG00000001204	-	82	74.855	ENSACLG00000018888	-	83	74.855
ENSACLG00000001204	-	58	72.336	ENSACLG00000020343	-	72	72.336
ENSACLG00000001204	-	80	74.222	ENSACLG00000004669	-	83	74.222
ENSACLG00000001204	-	82	74.422	ENSACLG00000009552	-	83	74.422
ENSACLG00000001204	-	59	56.237	ENSACLG00000002457	-	78	56.237
ENSACLG00000001204	-	86	43.709	ENSACLG00000004816	-	83	43.709
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ENSACLG00000001204	-	73	46.743	ENSACLG00000015421	-	81	46.743
ENSACLG00000001204	-	90	97.584	ENSACLG00000016323	-	85	97.584
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ENSACLG00000001204	-	86	47.486	ENSACLG00000026665	-	83	47.486
ENSACLG00000001204	-	91	56.596	ENSACLG00000023605	-	82	54.756
ENSACLG00000001204	-	52	74.371	ENSACLG00000006203	-	67	74.371
ENSACLG00000001204	-	79	61.061	ENSACLG00000009381	-	82	61.061
ENSACLG00000001204	-	64	75.000	ENSACLG00000017812	-	79	75.000
ENSACLG00000001204	-	97	45.189	ENSACLG00000008405	-	84	45.432
ENSACLG00000001204	-	98	45.433	ENSACLG00000011375	-	86	45.433
ENSACLG00000001204	-	82	74.855	ENSACLG00000009208	-	83	74.855
ENSACLG00000001204	-	91	47.361	ENSACLG00000020939	-	83	47.128
ENSACLG00000001204	-	53	51.818	ENSACLG00000012608	-	72	51.818
ENSACLG00000001204	-	63	48.479	ENSACLG00000011875	-	78	48.479
ENSACLG00000001204	-	59	74.849	ENSACLG00000023986	-	78	74.849
ENSACLG00000001204	-	58	98.745	ENSACLG00000013125	-	78	98.745
ENSACLG00000001204	-	82	75.145	ENSACLG00000018019	-	83	75.145
ENSACLG00000001204	-	66	47.112	ENSACLG00000000769	-	79	47.112
ENSACLG00000001204	-	63	48.106	ENSACLG00000025590	-	78	48.106
ENSACLG00000001204	-	66	46.920	ENSACLG00000018203	-	78	46.920
ENSACLG00000001204	-	86	47.765	ENSACLG00000018205	-	83	47.765
ENSACLG00000001204	-	67	47.247	ENSACLG00000022197	-	76	46.935
ENSACLG00000001204	-	92	48.642	ENSACLG00000017960	-	79	48.539
ENSACLG00000001204	-	95	76.131	ENSACLG00000017636	-	85	76.131
ENSACLG00000001204	-	51	51.054	ENSACLG00000022645	-	74	51.054
ENSACLG00000001204	-	77	74.923	ENSACLG00000013943	-	82	74.923
ENSACLG00000001204	-	76	39.608	ENSACLG00000015560	-	82	39.608
ENSACLG00000001204	-	58	43.954	ENSACLG00000008268	-	78	43.643
ENSACLG00000001204	-	58	51.357	ENSACLG00000019303	-	76	51.357
ENSACLG00000001204	-	54	51.991	ENSACLG00000004081	-	74	51.991
ENSACLG00000001204	-	74	60.940	ENSACLG00000007501	-	81	60.940
ENSACLG00000001204	-	97	47.375	ENSACLG00000026772	-	82	47.375
ENSACLG00000001204	-	63	48.964	ENSACLG00000001588	-	77	48.964
ENSACLG00000001204	-	63	43.617	ENSACLG00000020682	-	80	43.333
ENSACLG00000001204	-	55	50.000	ENSACLG00000017793	-	76	50.000
ENSACLG00000001204	-	98	45.531	ENSACLG00000005844	-	78	45.531
ENSACLG00000001204	-	91	43.829	ENSACLG00000013429	-	86	43.896
ENSACLG00000001204	-	64	56.262	ENSACLG00000018185	-	78	56.262

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000001204	-	92	49.803	ENSATEG00000011112	-	78	49.680	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001204	-	52	53.704	ENSATEG00000004858	-	76	53.704	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001204	-	65	49.632	ENSATEG00000023008	-	80	49.632	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001204	-	93	48.129	ENSATEG00000013982	-	82	47.713	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001204	-	65	49.449	ENSATEG00000018786	-	80	49.449	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001204	-	64	47.932	ENSATEG00000018148	-	77	47.932	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001204	-	81	48.373	ENSATEG00000001703	-	83	48.373	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001204	-	65	49.632	ENSATEG00000005419	-	80	49.632	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001204	-	93	48.129	ENSATEG00000006850	-	82	47.713	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001204	-	93	48.129	ENSATEG00000010928	-	82	47.713	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001204	-	53	52.360	ENSATEG00000011431	-	77	52.360	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001204	-	91	49.150	ENSAMXG00000030165	-	77	48.148	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	90	48.280	ENSAMXG00000041236	-	92	48.413	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	68	44.834	ENSAMXG00000035500	-	79	44.834	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	92	45.537	ENSAMXG00000035504	-	79	44.296	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	59	52.041	ENSAMXG00000035870	-	64	52.041	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	99	45.886	ENSAMXG00000032751	-	87	45.771	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	68	48.517	ENSAMXG00000042554	-	81	48.517	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	63	48.964	ENSAMXG00000043263	-	76	48.964	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	91	49.150	ENSAMXG00000031337	-	77	48.492	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	92	39.503	ENSAMXG00000029120	-	81	39.826	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	91	54.684	ENSAMXG00000033217	-	83	52.797	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	54	50.331	ENSAMXG00000042018	-	76	50.331	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	89	36.253	ENSAMXG00000029598	-	83	36.658	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	64	49.814	ENSAMXG00000042380	-	79	49.814	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	64	51.115	ENSAMXG00000040828	-	79	51.115	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	60	48.718	ENSAMXG00000042631	-	73	48.718	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	92	48.568	ENSAMXG00000030734	-	84	48.045	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	64	49.442	ENSAMXG00000035394	-	79	49.442	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	99	46.002	ENSAMXG00000032042	-	81	45.655	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	91	44.603	ENSAMXG00000043219	-	83	44.053	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	92	48.454	ENSAMXG00000041792	-	80	46.659	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	94	48.920	ENSAMXG00000033720	-	88	48.618	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001204	-	92	48.761	ENSCSEG00000020682	-	82	46.909	Cynoglossus_semilaevis
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