EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000001258 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4776 bases
Position: chr4:26662150-26666925
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000001819	zf-C2H2	PF00096.26	8.2e-21	1	4
ENSACLP00000001819	zf-C2H2	PF00096.26	8.2e-21	2	4
ENSACLP00000001819	zf-C2H2	PF00096.26	8.2e-21	3	4
ENSACLP00000001819	zf-C2H2	PF00096.26	8.2e-21	4	4
ENSACLP00000001819	zf-met	PF12874.7	1.7e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000001859	-	390	-	ENSACLP00000001819	129 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000001258	-	94	40.625	ENSACLG00000022475	-	81	40.625
ENSACLG00000001258	-	87	40.541	ENSACLG00000019482	-	72	40.541
ENSACLG00000001258	-	87	41.509	ENSACLG00000006718	-	52	41.509
ENSACLG00000001258	-	94	45.745	ENSACLG00000006697	-	65	45.745
ENSACLG00000001258	-	88	41.121	ENSACLG00000021045	-	76	41.121
ENSACLG00000001258	-	89	41.772	ENSACLG00000017941	-	61	41.772
ENSACLG00000001258	-	98	38.596	ENSACLG00000022482	-	79	37.037
ENSACLG00000001258	-	92	44.737	ENSACLG00000019424	-	87	44.737
ENSACLG00000001258	-	91	46.479	ENSACLG00000028002	-	85	46.479
ENSACLG00000001258	-	88	44.248	ENSACLG00000002844	-	61	44.248
ENSACLG00000001258	-	95	41.509	ENSACLG00000014336	-	93	41.509
ENSACLG00000001258	-	88	46.988	ENSACLG00000024294	-	73	46.988
ENSACLG00000001258	-	88	44.144	ENSACLG00000019499	-	89	44.144
ENSACLG00000001258	-	95	44.578	ENSACLG00000022302	-	93	43.269
ENSACLG00000001258	-	88	37.615	ENSACLG00000018551	snai2	56	37.615
ENSACLG00000001258	-	95	38.532	ENSACLG00000006702	-	69	38.532
ENSACLG00000001258	-	94	44.231	ENSACLG00000005708	-	59	44.231
ENSACLG00000001258	-	87	43.860	ENSACLG00000007888	-	75	43.860
ENSACLG00000001258	-	93	44.898	ENSACLG00000015989	-	67	44.898
ENSACLG00000001258	-	98	48.193	ENSACLG00000020579	znf319b	85	46.154
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ENSACLG00000001258	-	100	42.857	ENSACLG00000018746	-	88	46.512
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ENSACLG00000001258	-	88	42.697	ENSACLG00000000473	-	78	42.697
ENSACLG00000001258	-	88	43.243	ENSACLG00000001045	-	97	43.243
ENSACLG00000001258	-	88	36.264	ENSACLG00000021022	-	71	36.264
ENSACLG00000001258	-	91	42.857	ENSACLG00000020231	-	91	42.857
ENSACLG00000001258	-	89	38.318	ENSACLG00000008624	-	70	38.318
ENSACLG00000001258	-	87	44.444	ENSACLG00000026538	-	83	44.444
ENSACLG00000001258	-	87	41.964	ENSACLG00000019349	-	69	41.964
ENSACLG00000001258	-	94	46.067	ENSACLG00000013935	-	84	46.067
ENSACLG00000001258	-	90	39.080	ENSACLG00000014365	-	90	40.541
ENSACLG00000001258	-	87	40.196	ENSACLG00000001368	-	88	40.196
ENSACLG00000001258	-	91	41.284	ENSACLG00000017996	prdm5	68	41.284
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ENSACLG00000001258	-	94	40.541	ENSACLG00000017411	-	87	40.541
ENSACLG00000001258	-	88	39.423	ENSACLG00000019094	-	62	39.423
ENSACLG00000001258	-	98	43.902	ENSACLG00000000537	-	97	42.342
ENSACLG00000001258	-	89	42.991	ENSACLG00000015843	-	85	42.991
ENSACLG00000001258	-	97	39.024	ENSACLG00000019167	-	85	40.449
ENSACLG00000001258	-	87	40.566	ENSACLG00000006870	-	53	40.566
ENSACLG00000001258	-	88	44.037	ENSACLG00000011642	-	78	44.037
ENSACLG00000001258	-	91	45.238	ENSACLG00000025163	-	82	45.238
ENSACLG00000001258	-	88	42.391	ENSACLG00000013033	-	83	42.391
ENSACLG00000001258	-	87	48.214	ENSACLG00000003332	-	97	48.214
ENSACLG00000001258	-	94	42.308	ENSACLG00000022383	-	95	42.308
ENSACLG00000001258	-	90	36.559	ENSACLG00000003679	-	79	36.559
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ENSACLG00000001258	-	95	45.536	ENSACLG00000003229	-	94	45.536
ENSACLG00000001258	-	89	44.340	ENSACLG00000023963	-	91	44.340
ENSACLG00000001258	-	93	42.056	ENSACLG00000017487	-	62	42.056
ENSACLG00000001258	-	91	39.000	ENSACLG00000011658	-	68	39.000
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ENSACLG00000001258	-	87	45.536	ENSACLG00000020610	-	66	45.536
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ENSACLG00000001258	-	94	47.321	ENSACLG00000019318	-	93	47.321
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ENSACLG00000001258	-	94	42.342	ENSACLG00000001003	-	83	42.342
ENSACLG00000001258	-	88	47.170	ENSACLG00000024647	-	68	47.170
ENSACLG00000001258	-	100	41.121	ENSACLG00000005594	ZNF319	82	41.121
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ENSACLG00000001258	-	88	44.144	ENSACLG00000000411	-	89	44.144
ENSACLG00000001258	-	88	41.964	ENSACLG00000025196	-	75	41.964
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ENSACLG00000001258	-	91	43.103	ENSACLG00000020268	-	66	43.103
ENSACLG00000001258	-	94	42.149	ENSACLG00000022505	-	87	42.149
ENSACLG00000001258	-	94	42.478	ENSACLG00000008821	-	89	42.553
ENSACLG00000001258	-	95	39.640	ENSACLG00000008606	-	80	39.640
ENSACLG00000001258	-	87	42.342	ENSACLG00000000487	-	80	42.342
ENSACLG00000001258	-	88	43.363	ENSACLG00000018700	-	95	43.363
ENSACLG00000001258	-	88	45.536	ENSACLG00000018701	-	76	45.536
ENSACLG00000001258	-	93	46.914	ENSACLG00000018707	-	98	46.914
ENSACLG00000001258	-	87	46.667	ENSACLG00000011710	-	56	46.667
ENSACLG00000001258	-	89	47.321	ENSACLG00000023305	-	75	47.321
ENSACLG00000001258	-	90	47.674	ENSACLG00000024459	-	83	47.674
ENSACLG00000001258	-	88	46.667	ENSACLG00000024670	-	68	46.667
ENSACLG00000001258	-	91	40.404	ENSACLG00000019291	-	88	40.404
ENSACLG00000001258	-	87	44.086	ENSACLG00000018716	-	70	44.086
ENSACLG00000001258	-	92	42.342	ENSACLG00000022439	-	71	42.342
ENSACLG00000001258	-	96	46.729	ENSACLG00000020975	-	85	44.944
ENSACLG00000001258	-	86	37.736	ENSACLG00000013454	-	53	37.736
ENSACLG00000001258	-	97	41.121	ENSACLG00000017925	-	64	41.121
ENSACLG00000001258	-	88	43.810	ENSACLG00000022287	-	59	43.810
ENSACLG00000001258	-	87	46.341	ENSACLG00000024491	-	82	46.341
ENSACLG00000001258	-	87	44.578	ENSACLG00000021056	-	54	44.578
ENSACLG00000001258	-	94	41.250	ENSACLG00000005795	-	57	41.250
ENSACLG00000001258	-	96	48.214	ENSACLG00000011237	-	98	45.783
ENSACLG00000001258	-	88	42.353	ENSACLG00000011239	-	69	42.353

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000001258	-	91	81.416	ENSAMEG00000013858	-	59	81.416	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000001258	-	91	62.500	ENSACIG00000002180	-	99	62.500	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001258	-	91	82.143	ENSCAPG00000016268	-	100	82.143	Cavia_aperea
ENSACLG00000001258	-	91	82.143	ENSCPBG00000015742	-	83	82.143	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000001258	-	91	74.775	ENSCING00000011342	-	90	74.775	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000001258	-	89	75.455	ENSCSAVG00000005904	-	68	75.455	Ciona_savignyi
ENSACLG00000001258	-	91	82.143	ENSCGRG00000013485	-	84	82.143	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000001258	-	91	82.143	ENSDORG00000023443	-	84	82.143	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000001258	-	88	82.407	ENSEBUG00000008075	gfi1ab	57	82.407	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000001258	-	91	82.143	ENSFDAG00000019296	-	84	82.143	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000001258	-	91	82.143	ENSGAGG00000015899	GFI1	83	82.143	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000001258	-	91	82.143	ENSJJAG00000022622	-	100	82.143	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000001258	-	88	84.404	ENSLACG00000017590	-	51	84.404	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000001258	-	91	82.143	ENSMMUG00000005068	GFI1	84	82.143	Macaca_mulatta
ENSACLG00000001258	-	91	82.143	ENSMAUG00000021273	-	84	82.143	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000001258	-	91	82.143	ENSMOCG00000004478	-	84	82.143	Microtus_ochrogaster
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ENSACLG00000001258	-	91	82.143	MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	84	82.143	Mus_pahari
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ENSACLG00000001258	-	88	100.000	ENSNBRG00000010351	-	85	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000001258	-	91	82.143	ENSODEG00000006410	-	84	82.143	Octodon_degus
ENSACLG00000001258	-	97	77.500	ENSOANG00000022289	-	64	77.500	Ornithorhynchus_anatinus
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ENSACLG00000001258	-	91	77.119	ENSXCOG00000009186	-	94	77.119	Xiphophorus_couchianus