EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000001296 (Gene tree)
Gene ID: 113020387
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14322 bases
Position: chr4:7349841-7364162
Accession: 113020387
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000001977	GTP_EFTU	PF00009.27	1.3e-44	1	1
ENSACLP00000001977	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.3e-12	1	1
ENSACLP00000001977	EFG_IV	PF03764.18	1.9e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000002021	-	3831	-	ENSACLP00000001977	971 (aa)	XP_026020099	UPI00022B1B47

Gene Model

Click here to download ENSACLG00000001296's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000001296's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000001296	eftud2	86	37.572	ENSACLG00000003034	eef2b	98	37.572
ENSACLG00000001296	eftud2	74	34.507	ENSACLG00000025780	efl1	72	34.507
ENSACLG00000001296	eftud2	86	37.803	ENSACLG00000023595	-	99	37.803

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSACLG00000001296	eftud2	100	99.073	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	99.073	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	92.181	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000001296	eftud2	100	95.572	ENSACIG00000009096	eftud2	100	95.572	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001296	eftud2	88	92.706	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	92.706	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001296	eftud2	100	99.073	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	99.073	Amphiprion_percula
ENSACLG00000001296	eftud2	100	99.279	ENSATEG00000000457	eftud2	100	99.279	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001296	eftud2	99	88.671	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.877	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.358	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.770	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.284	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000001296	eftud2	100	94.473	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.473	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	92.181	Bos_taurus
ENSACLG00000001296	eftud2	99	71.104	WBGene00001166	eftu-2	99	70.661	Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.284	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	92.181	Canis_familiaris
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.181	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.181	Capra_hircus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.284	Carlito_syrichta
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	92.181	Cavia_aperea
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.181	Cavia_porcellus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	92.284	Cebus_capucinus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.284	Cercocebus_atys
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.872	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.975	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.284	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000001296	eftud2	91	81.081	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.081	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.872	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.078	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000001296	eftud2	100	78.747	ENSCING00000009372	-	100	78.645	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000001296	eftud2	99	78.345	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.953	Ciona_savignyi
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	92.284	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.770	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.872	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.770	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	91.872	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000001296	eftud2	100	98.043	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	98.043	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.631	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.631	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	94.347	ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.347	Danio_rerio
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.770	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	91.975	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.872	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.975	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000001296	eftud2	100	74.923	FBgn0039566	CG4849	100	74.872	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000001296	eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSACLG00000001296	eftud2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	92.181	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.872	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	92.078	Equus_caballus
ENSACLG00000001296	eftud2	83	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	94.439	ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.027	Esox_lucius
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.872	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.078	Felis_catus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.770	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.872	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.181	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.425	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	97.425	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	95.778	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	95.778	Gadus_morhua
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.667	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.696	Gallus_gallus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.734	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	97.734	Gambusia_affinis
ENSACLG00000001296	eftud2	100	98.146	ENSGACG00000009163	eftud2	100	98.146	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	92.284	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000001296	eftud2	100	99.897	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	99.897	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	91.975	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.975	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.119	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.119	Hippocampus_comes
ENSACLG00000001296	eftud2	100	94.542	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.542	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001296	eftud2	91	93.131	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.929	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000001296	eftud2	95	93.804	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.804	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.734	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	97.734	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000001296	eftud2	95	98.164	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	Labrus_bergylta
ENSACLG00000001296	eftud2	100	93.203	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.203	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000001296	eftud2	100	94.748	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	94.439	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.872	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.975	Loxodonta_africana
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	92.284	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	92.284	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	92.284	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	98.352	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	98.352	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	100.000	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.478	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.684	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.872	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	91.975	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	92.284	Microcebus_murinus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.872	ENSMOCG00000009039	-	100	91.975	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000001296	eftud2	92	75.393	ENSMOCG00000017653	-	90	75.506	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000001296	eftud2	88	98.824	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	98.824	Mola_mola
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.284	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000001296	eftud2	88	96.941	ENSMALG00000014501	eftud2	100	96.941	Monopterus_albus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	92.078	Mus_caroli
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.173	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	92.173	Mus_musculus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	92.078	Mus_pahari
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	92.078	Mus_spretus
ENSACLG00000001296	eftud2	97	91.525	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	91.737	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	92.181	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.770	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.872	Nannospalax_galili
ENSACLG00000001296	eftud2	100	99.897	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	99.897	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000001296	eftud2	97	90.011	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.223	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000001296	eftud2	100	88.374	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.580	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000001296	eftud2	100	84.053	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.259	Ochotona_princeps
ENSACLG00000001296	eftud2	94	75.897	ENSODEG00000003385	-	100	76.006	Octodon_degus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSODEG00000018041	-	100	91.461	Octodon_degus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	100.000	ENSONIG00000000912	eftud2	100	100.000	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.181	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.425	ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.425	Oryzias_latipes
ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.528	ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.528	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.425	ENSORLG00015002611	eftud2	100	98.148	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000001296	eftud2	100	90.432	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	90.638	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	92.181	Ovis_aries
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	92.284	Pan_paniscus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	92.181	Panthera_pardus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	92.181	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.284	Pan_troglodytes
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	92.284	Papio_anubis
ENSACLG00000001296	eftud2	93	90.187	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000001296	eftud2	100	89.495	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	89.495	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	92.078	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	92.284	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.940	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	97.940	Poecilia_formosa
ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.940	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	97.940	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.940	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	97.940	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000001296	eftud2	100	90.844	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	91.049	Pongo_abelii
ENSACLG00000001296	eftud2	100	88.272	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.477	Procavia_capensis
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.284	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000001296	eftud2	100	87.757	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.963	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	99.897	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	99.897	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000001296	eftud2	100	94.851	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.851	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.276	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.276	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	92.181	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.181	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000001296	eftud2	97	33.863	YKL173W	SNU114	91	34.538	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.284	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000001296	eftud2	95	93.804	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.804	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000001296	eftud2	100	94.954	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.984	Scleropages_formosus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.940	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	97.940	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	99.279	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	99.279	Seriola_dumerili
ENSACLG00000001296	eftud2	100	99.382	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	99.382	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000001296	eftud2	100	84.053	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.259	Sorex_araneus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.667	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.872	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	99.279	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	99.279	Stegastes_partitus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.872	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.975	Sus_scrofa
ENSACLG00000001296	eftud2	83	92.662	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.662	Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000001296	eftud2	100	96.704	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.704	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.000	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	92.000	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000001296	eftud2	100	86.728	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.934	Tupaia_belangeri
ENSACLG00000001296	eftud2	91	89.898	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.898	Tursiops_truncatus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	90.844	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.049	Ursus_americanus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	92.181	Ursus_maritimus
ENSACLG00000001296	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	92.181	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000001296	eftud2	96	92.834	ENSXETG00000003394	eftud2	98	93.580	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000001296	eftud2	81	98.087	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.087	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.734	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.734	Xiphophorus_maculatus