EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000001308 (Gene tree)
Gene ID: 113033550
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC113033550
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9934 bases
Position: chr12:18906298-18916231
Accession: 113033550
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000001931	MMR_HSR1	PF01926.23	3.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000001974	-	1700	-	ENSACLP00000001931	448 (aa)	XP_026043249	UPI000E3FEADD

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	59.735	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.735

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	94.866	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	94.866	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	58.758	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.758	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	92.857	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	92.857	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Amphiprion_percula
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Amphiprion_percula
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Anabas_testudineus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	99	57.812	ENSACAG00000028632	-	99	57.906	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	59.912	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.912	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	81.069	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.069	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	79	62.360	ENSCING00000020807	-	94	62.360	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	98	56.818	ENSCSAVG00000009987	-	98	57.045	Ciona_savignyi
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	89.286	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	86.792	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	58.444	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	74.490	Danio_rerio
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	98	83.636	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.636	Danio_rerio
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	80	56.546	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	96	56.546	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	99	81.390	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.390	Esox_lucius
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	59.867	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.867	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	89	55.611	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.611	Gadus_morhua
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	91.741	Gambusia_affinis
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Gambusia_affinis
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	58	94.574	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	85	63.874	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.940	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	99.554	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	99.554	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	59.956	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.956	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Hippocampus_comes
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	99	84.910	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	84.910	Hippocampus_comes
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	77.060	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.060	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	84	58.777	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	58.777	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	96	60.277	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	60.277	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Labrus_bergylta
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	99	62.247	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.472	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	99	70.270	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	70.270	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	62.361	ENSLACG00000004899	-	99	62.361	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	99	75.168	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.168	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	96	60.739	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.739	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Maylandia_zebra
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	99.777	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	99.777	Maylandia_zebra
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	57.871	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.871	Mola_mola
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Monopterus_albus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	98	89.977	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	89.977	Monopterus_albus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	98.884	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	98.884	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	96	60.508	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.508	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	59.292	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.292	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	98.438	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	98.438	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Oryzias_latipes
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	86.607	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	86.607	Oryzias_latipes
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	89.732	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	90.179	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	58.575	ENSPKIG00000023918	-	98	58.575	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	77.506	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.506	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	59.956	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	59.956	Periophthalmus_magnuspinnatus
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